FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0455, 505 aa 1>>>pF1KB0455 505 - 505 aa - 505 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1096+/-0.000532; mu= 2.8011+/- 0.032 mean_var=716.2122+/-165.288, 0's: 0 Z-trim(118.7): 1236 B-trim: 1803 in 1/56 Lambda= 0.047924 statistics sampled from 30046 (31837) to 30046 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16 Scan time: 10.030 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein k ( 505) 3430 253.2 1.3e-66 NP_001317394 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protei ( 434) 2931 218.6 2.9e-56 NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 2187 167.3 9.4e-41 NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 2187 167.3 9.5e-41 NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2185 167.2 1e-40 NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 2185 167.2 1e-40 NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 2185 167.2 1e-40 NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 2185 167.2 1.1e-40 XP_011542126 (OMIM: 191305,613375) PREDICTED: tyro ( 531) 2160 165.5 3.5e-40 XP_011542127 (OMIM: 191305,613375) PREDICTED: tyro ( 531) 2160 165.5 3.5e-40 NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 2127 163.2 1.7e-39 NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 2124 163.0 1.9e-39 NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 2124 163.0 1.9e-39 NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 2117 162.4 2.7e-39 XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 2117 162.4 2.7e-39 XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 2112 162.4 3.9e-39 XP_016866139 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 NP_002028 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 XP_016866141 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 XP_016866140 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 XP_016866143 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1916 148.6 4.2e-35 XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 1879 146.1 2.5e-34 NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 1879 146.1 2.5e-34 XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 1871 145.5 3.6e-34 NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 1871 145.5 3.6e-34 NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1861 144.8 5.9e-34 NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1861 144.8 5.9e-34 XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 1861 144.8 5.9e-34 XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1830 142.7 2.6e-33 XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1830 142.7 2.6e-33 NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1830 142.7 2.6e-33 NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 1830 142.7 2.6e-33 NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1830 142.7 2.6e-33 XP_016883515 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1782 139.4 2.6e-32 XP_016883513 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1782 139.4 2.6e-32 XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1782 139.4 2.6e-32 XP_016883516 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1782 139.4 2.6e-32 XP_011542131 (OMIM: 191305,613375) PREDICTED: tyro ( 344) 1773 138.4 3.3e-32 XP_011542130 (OMIM: 191305,613375) PREDICTED: tyro ( 345) 1773 138.4 3.3e-32 XP_011542129 (OMIM: 191305,613375) PREDICTED: tyro ( 460) 1661 130.9 8e-30 XP_011539313 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 460) 1457 116.8 1.4e-25 XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_011533957 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_011533955 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1431 115.0 5.1e-25 >>NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein kinas (505 aa) initn: 3430 init1: 3430 opt: 3430 Z-score: 1317.1 bits: 253.2 E(85289): 1.3e-66 Smith-Waterman score: 3430; 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NP_001 RVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDT 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 IKHYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVRPAPQNPWAQDE .:::::: ::.::.::::: :: .:: ::.::.: .:::::.:..::. ::.:: .: NP_001 VKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDA 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 WEIPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVMKALQH :::::.::.: .:::.::::::::. :... :::.::.: :.:: ::::.::::::.::: NP_001 WEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQH 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 ERLVRLYAVVTKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIER ..::.:.::::::::::.::.::.: ::::::.::::. ::.:::.:::::::::.::. 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NP_001 SEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 SLEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVTT-QGELIKH ::: :.:::.. .::.:::::::: : :::.::.:::.::..::::.: ::. .:: NP_001 SLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 YKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVRPAPQNPWAQDEWEI :::: ::.::.::::: :: .:: ::.::.: .:::::.:..::. ::.:: .: ::: NP_001 YKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 PRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVMKALQHERL ::.::.: .:::.::::::::. :... :::.::.: :.:: ::::.::::::.:::..: NP_001 PRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 VRLYAVVTKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIERMNS :.:.::::::::::.::.::.: ::::::.::::. ::.:::.:::::::::.::. : NP_001 VKLHAVVTKEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 IHRDLRAANILVSEALCCKIADFGLARII-DSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIK ::::::::::::: .: ::::::::::.: :.::::.:::::::::::::::.:: :::: NP_001 IHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 ADVWSFGVLLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRMPRPDTCPPELYRGVIAECWRS .::::::.::::.:::::.:::::::::::: ::::::::::..:: ::: ... .::.. NP_001 SDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELY-NIMMRCWKN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 RPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP :::::::::..::::.::::::: ::. :: NP_001 RPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP 480 490 500 >>NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase HC (506 aa) initn: 1581 init1: 1146 opt: 2185 Z-score: 851.9 bits: 167.2 E(85289): 1e-40 Smith-Waterman score: 2185; 65.4% identity (85.3% similar) in 483 aa overlap (25-505:29-506) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MGLVSSKKPDKEKPIKEKDKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPPDEHL :. : . : : .: . : .. NP_001 MMGCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPN----SHNSNTPGIREA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 DEDKHFVVALYDYTAMNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGDWWLARSLVTGREGYVPSNFVARV . .::::::: :.. .::.. ::... ::. .:.:: ::::.: .:::.:::.:::: NP_001 GSEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 ESLEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVTT-QGELIK .::: :.:::.. .::.:::::::: : :::.::.:::.::..::::.: ::. .: NP_001 DSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 HYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVRPAPQNPWAQDEWE ::::: ::.::.::::: :: .:: ::.::.: .:::::.:..::. ::.:: .: :: NP_001 HYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 IPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVMKALQHER :::.::.: .:::.::::::::. :... :::.::.: :.:: ::::.::::::.:::.. NP_001 IPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 LVRLYAVVTKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIERMN ::.:.::::::::::.::.::.: ::::::.::::. ::.:::.:::::::::.::. : NP_001 LVKLHAVVTKEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 SIHRDLRAANILVSEALCCKIADFGLARII-DSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTI ::::::::::::: .: ::::::::::.: :.::::.:::::::::::::::.:: ::: NP_001 YIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 KADVWSFGVLLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRMPRPDTCPPELYRGVIAECWR :.::::::.::::.:::::.:::::::::::: ::::::::::..:: ::: ... .::. NP_001 KSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELY-NIMMRCWK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 SRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP .:::::::::..::::.::::::: ::. :: NP_001 NRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP 480 490 500 >>NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase HCK i (526 aa) initn: 1581 init1: 1146 opt: 2185 Z-score: 851.8 bits: 167.2 E(85289): 1.1e-40 Smith-Waterman score: 2185; 65.4% identity (85.3% similar) in 483 aa overlap (25-505:49-526) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MGLVSSKKPDKEKPIKEKDKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPPDE :. : . : : .: . : . NP_002 APRMGCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPN----SHNSNTPGIR 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 HLDEDKHFVVALYDYTAMNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGDWWLARSLVTGREGYVPSNFVA . . .::::::: :.. .::.. ::... ::. .:.:: ::::.: .:::.:::.:: NP_002 EAGSEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVA 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 RVESLEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVTT-QGEL ::.::: :.:::.. .::.:::::::: : :::.::.:::.::..::::.: ::. 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