FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0459, 508 aa 1>>>pF1KB0459 508 - 508 aa - 508 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9288+/-0.00122; mu= 6.5051+/- 0.071 mean_var=322.5094+/-73.449, 0's: 0 Z-trim(110.5): 600 B-trim: 124 in 1/50 Lambda= 0.071417 statistics sampled from 11073 (11813) to 11073 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16 Scan time: 1.630 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 508) 3446 369.6 4.7e-102 CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 507) 3268 351.3 1.6e-96 CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 466) 3138 337.8 1.6e-92 CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs109|chr15 ( 450) 1621 181.5 1.8e-45 CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 822) 926 110.3 9e-24 CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 453) 916 108.9 1.3e-23 CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs109|chr20 ( 451) 914 108.6 1.5e-23 CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 ( 434) 897 106.9 5e-23 CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 ( 505) 898 107.1 5e-23 CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20 ( 488) 893 106.5 7.1e-23 CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs109|chr1 ( 509) 875 104.7 2.6e-22 CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 504) 853 102.4 1.3e-21 CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 505) 853 102.4 1.3e-21 CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 525) 853 102.5 1.3e-21 CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 526) 853 102.5 1.3e-21 CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs109|chr18 ( 543) 834 100.5 5.1e-21 CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs109|chr20 ( 536) 829 100.0 7.2e-21 CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 534) 814 98.5 2.1e-20 CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 491) 813 98.3 2.1e-20 CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 512) 813 98.3 2.2e-20 CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 537) 809 97.9 3e-20 CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs109|chr1 ( 529) 786 95.6 1.5e-19 CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1130) 749 92.2 3.3e-18 CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1149) 749 92.2 3.4e-18 CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 ( 542) 743 91.1 3.4e-18 CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 764) 744 91.5 3.8e-18 CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 822) 744 91.5 4e-18 CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1043) 744 91.7 4.5e-18 CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1058) 744 91.7 4.6e-18 CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1064) 744 91.7 4.6e-18 CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1079) 744 91.7 4.6e-18 CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1161) 744 91.7 4.8e-18 CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1167) 744 91.7 4.8e-18 CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1182) 744 91.7 4.9e-18 CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 659) 727 89.6 1.2e-17 CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs109|chrX ( 675) 727 89.6 1.2e-17 CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 693) 727 89.6 1.2e-17 CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs109|chr5 ( 620) 700 86.8 7.8e-17 CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs109|chr4 ( 631) 694 86.2 1.2e-16 CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 694) 694 86.3 1.3e-16 CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 752) 694 86.3 1.3e-16 CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs109|chr4 ( 527) 680 84.6 3e-16 CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 482) 678 84.4 3.3e-16 CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs109|chr7 ( 976) 639 80.8 7.9e-15 CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs109|chr3 ( 983) 622 79.1 2.7e-14 CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1 ( 976) 620 78.8 3.1e-14 CCDS86924.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 949) 613 78.1 5e-14 CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 986) 613 78.1 5.1e-14 CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs109|chr1 (1005) 606 77.4 8.5e-14 CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs109|chr6 ( 998) 605 77.3 9.1e-14 >>CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 (508 aa) initn: 3446 init1: 3446 opt: 3446 Z-score: 1945.8 bits: 369.6 E(33420): 4.7e-102 Smith-Waterman score: 3446; 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CCDS10 NKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVD 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 FLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLA .::.:::.... ::.::: : :.:::::....:::::::::.::::: :::::::::. CCDS10 YLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLT 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 KAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVS : . :...:::::::::::.. ::..::::::::.::::..:.::.:::.. ::.: CCDS10 KEASSTQDTGKLPVKWTAPEALREKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVV 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 EAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQ :::::.:. :.::: :. .:..::. . : :: : .: :.: CCDS10 PRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL 400 410 420 430 440 450 500 pF1KB0 DADGSTSPRSQEP >>CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 (822 aa) initn: 703 init1: 376 opt: 926 Z-score: 540.5 bits: 110.3 E(33420): 9e-24 Smith-Waterman score: 926; 37.4% identity (63.9% similar) in 441 aa overlap (53-479:386-814) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 QLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEAC : . . . .: : . . :: .: CCDS40 QKQALEELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERK 360 370 380 390 400 410 90 100 110 120 130 pF1KB0 ENKSWYR-VKHHTSG----QEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQL : : .. ..: .: .. :...:: . ..: : :. . :.:: : :: . : CCDS40 ERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKP-LAEQDWYHGAIPRIEAQELL 420 430 440 450 460 470 140 150 160 170 180 190 pF1KB0 QPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHY . ..: :::::: .::.::: : . :. . . :. . :.. : :. ....:. CCDS40 K--KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRF-EGTGFSNIPQLIDHH 480 490 500 510 520 530 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLG : .: .: :. . :.:. . . :: .:.:.:: : .: CCDS40 YTTKQVI-------TKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLKD 540 550 560 570 580 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 Q-KVAVKNIKCDVTAQ---AFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILH-QGLYIVMEHVSKGN . .::::. : :. . ::.:. .. ...: :.:.:.:: . : .::.:: :: :. CCDS40 KTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGD 590 600 610 620 630 640 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 LVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDF ...::: : . .. ::..::: .: :: :::::. .:::::::: ::.:. : :.::: CCDS40 FLTFLR-RKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDF 650 660 670 680 690 700 380 390 400 410 420 pF1KB0 GLAKAERKGLDSS----RLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPK :... : :. :: ..:.::::::::..:...:.:::::::.::::.:: : ::: CCDS40 GMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPG 710 720 730 740 750 760 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 MSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGA :. ... : ::.:::: :. :: . .: .::. .: :: : .: ..: CCDS40 MTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT 770 780 790 800 810 820 490 500 pF1KB0 PASVSGQDADGSTSPRSQEP >>CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 (453 aa) initn: 703 init1: 376 opt: 916 Z-score: 537.5 bits: 108.9 E(33420): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 916; 39.0% identity (65.8% similar) in 403 aa overlap (90-479:55-445) 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 HTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG----QEGLLAAGALREREALSAD ..: .: .. :...:: . ..: CCDS78 TCALMFSSEPSTSEVHRDQERKERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEK 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 PKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHR : :. . :.:: : :: . :. ..: :::::: .::.::: : . :. . . CCDS78 P-LAEQDWYHGAIPRIEAQELLK--KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYV 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 DGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQH :. . :.. : :. ....:. : .: .: :. . :.:. . CCDS78 DNMYRF-EGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVIT-------KKSGVVLLNPIPKDKKWILSHED 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 LTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCDVTAQ---AFLDETAVMTKMQHENLVR . :: .:.:.:: : .: . .::::. : :. . ::.:. .. ...: :.:. CCDS78 VILGELLGKGNFGEVYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVK 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 LLGVILH-QGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLV :.:: . : .::.:: :: :....::: : . .. ::..::: .: :: :::::. . CCDS78 LIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLR-RKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCI 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 pF1KB0 HRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSS----RLPVKWTAPEALKHGKFTSKS :::::::: ::.:. : :.::::... : :. :: ..:.::::::::..:...:.: CCDS78 HRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSES 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB0 DVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEP ::::::.::::.:: : ::: :. ... : ::.:::: :. :: . .: .::. .: CCDS78 DVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKP 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 pF1KB0 ARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP :: : .: ..: CCDS78 ENRPKFSELQKELTIIKRKLT 440 450 >>CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs109|chr20 (451 aa) initn: 753 init1: 358 opt: 914 Z-score: 536.5 bits: 108.6 E(33420): 1.5e-23 Smith-Waterman score: 914; 38.9% identity (66.3% similar) in 427 aa overlap (67-480:26-442) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 PPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG ::.:: ::: . . :. : . ...: CCDS13 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGG 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 Q--EGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPED--GLFLVRESAR .: . . : :::.. ..: :: : :: .:::..:: . : ::.: : . CCDS13 AVAQGYVPHNYLAERETVESEP------WFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEK 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KB0 HPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHR-DGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRP .:::: : . : ::.. .: :.: ..::: : .: ..:... .. . .:. : CCDS13 PSADYVLSVRDTQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAP 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 pF1KB0 KRKHGTKSAEEELAR-AGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD- ::: : : . : ...:: ..: : :: :..: . . .::.: :. : CCDS13 CRKH----EPEPLPHWDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDN 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 -VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVI-LHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVN . : . .: .: :..:.... : .:. . . .::. : ..::.:...:: . .. CCDS13 LLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSDEKVLP 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KB0 TAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSR ...::... .::::: ::::.. .:::::::::::.:. . ::.:::::. .. . :. CCDS13 VSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKEDVYLSH 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 440 pF1KB0 ---LPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYR .: ::::::::..:....::::::::.:: :.:: :..::: :: .:. :. ::: CCDS13 DHNIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNHEAFLRVDAGYR 350 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 MEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSP : : :: :: :: .:: .: .:: :. : :.:. CCDS13 MPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT 410 420 430 440 450 pF1KB0 RSQEP >>CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 (434 aa) initn: 721 init1: 315 opt: 897 Z-score: 527.2 bits: 106.9 E(33420): 5e-23 Smith-Waterman score: 897; 37.2% identity (65.2% similar) in 422 aa overlap (67-475:5-415) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 PPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG .: . ::. . .:.. . :. .. ..: CCDS83 MNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGD--WWLARSLVTG 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 QEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPP--EDGLFLVRESARHP .:: . .. . . :. : . :: . . .:: .:: : . : ::.::: . CCDS83 REGYVPSNFVARVES------LEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNK 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 pF1KB0 GDYVLCV----SFGRDVIHYRVLHRD-GHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLV : . : : . :. . ::.. : : :. . : .:. .:.:::: ..: .:. CCDS83 GAFSLSVKDVTTQGELIKHYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLT 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 RPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD : . . .. :. : . : : : ..: :.:: : .: : .. :::.:..: CCDS83 LPCVR---PAPQNPWAQDEWEIPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 -VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNT .. .::: :. :: .::: :::: .:. .. .::: :....: :..::.: . .. CCDS83 TMSPEAFLGEANVMKALQHERLVRLYAVVTKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSL 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KB0 AQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAK---AERKGLDS .:...: ..:::: :.: . .:::: : :::::: : :..:::::. .: . .. CCDS83 PRLIDMSAQIAEGMAYIERMNSIHRDLRAANILVSEALCCKIADFGLARIIDSEYTAQEG 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KB0 SRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRM ...:.:::::::.. : :: :.::::::::: :: .:::.::: :: :: . .:.:::: CCDS83 AKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGVLLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRM 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 EPPEGCPGPVHV-LMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSP :. :: .. ... ::...: .:: :. : CCDS83 PRPDTCPPELYRGVIAECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP 390 400 410 420 430 pF1KB0 RSQEP >>CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 (505 aa) initn: 721 init1: 315 opt: 898 Z-score: 527.0 bits: 107.1 E(33420): 5e-23 Smith-Waterman score: 898; 35.5% identity (63.8% similar) in 453 aa overlap (36-475:49-486) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 PAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKP ::: . .. . .. ..: . CCDS59 DKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPPDEHLDEDKHF----VVALYDYTAMND 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 GELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFH .: . ::. . .:.. . .:. .. ..:.:: . .. . . :. : . :: CCDS59 RDLQMLKGEKLQVLKG--TGDWWLARSLVTGREGYVPSNFVARVES------LEMERWFF 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 GKISGQEAVQQLQPP--EDGLFLVRESARHPGDYVLCV----SFGRDVIHYRVLHRD-GH . . .:: .:: : . : ::.::: . : . : : . :. . ::.. : : CCDS59 RSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVTTQGELIKHYKIRCLDEGG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 LTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTL :. . : .:. .:.:::: ..: .:. : . . .. :. : . : : : CCDS59 YYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVR---PAPQNPWAQDEWEIPRQSLRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 GAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD-VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVI ..: :.:: : .: : .. :::.:..: .. .::: :. :: .::: :::: .:. CCDS59 VRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVMKALQHERLVRLYAVV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 LHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAA .. .::: :....: :..::.: . .. .:...: ..:::: :.: . .:::: : CCDS59 TKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIERMNSIHRDLRA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 RNILVSEDLVAKVSDFGLAK---AERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGV :::::: : :..:::::. .: . .....:.:::::::.. : :: :.::::::: CCDS59 ANILVSEALCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 LLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHV-LMSSCWEAEPARRPPF :: :: .:::.::: :: :: . .:.:::: :. :: .. ... ::...: .:: : CCDS59 LLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRMPRPDTCPPELYRGVIAECWRSRPEERPTF 430 440 450 460 470 480 480 490 500 pF1KB0 RKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP . : CCDS59 EFLQSVLEDFYTATERQYELQP 490 500 >>CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20 (488 aa) initn: 744 init1: 375 opt: 893 Z-score: 524.4 bits: 106.5 E(33420): 7.1e-23 Smith-Waterman score: 895; 38.5% identity (62.0% similar) in 481 aa overlap (12-479:24-480) 10 20 30 40 pF1KB0 MQGHFPAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRW :.: .:: :. ..: . :: . .:.. CCDS13 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGS----LDP------NTDPVPT-LPAEPC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 APGTQCITKC-EHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALR .: : . . : :::. :.:: : : :. . : .. ::: .:: . CCDS13 SPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDR---LCALEEGGGYIFARRLSGQP---SAGLVP 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 EREALSADPK-LSLMPWFHGKISGQEAVQQL-QPP-EDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFG .. .:.:. :: .::. . .: .: : : .:: : : ::.: : : : : : CCDS13 ITHVAKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 RDVIHYRV-LHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEE : :::: . :: : .... .: .: ... .:. . : . :..: . :. ... CCDS13 AKVCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQ--KAPRQD 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 LARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKC-DVTAQAFLDETAVM . : ....:: ..::: :: : .: .::. ::.: :: .. . : .. CCDS13 V----WERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTL 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 pF1KB0 TKMQHENLVRLLGVILH-QGLYIVMEHVSKGNLVNFLRT-RGRALVNTAQLLQFSLHVAE ..:: :.:: .: . .::: : . :::: :: : .:::: :: :. .::: CCDS13 KGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRAL-RLPPLLGFACQVAE 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 GMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGL----DSSRLPVKWTAPE :: ::: ...:::::::::.::.. :. ::.:::::. . . .::..:::::::: CCDS13 GMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPE 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB0 ALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVH : .. :..::::::::::: :::.::. :: :. .:. . . .:::. : .::. :. CCDS13 AANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVY 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 VLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP ::: ::.. : .:: : : ::: CCDS13 VLMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP 460 470 480 508 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Oct 24 21:48:12 2019 done: Thu Oct 24 21:48:13 2019 Total Scan time: 1.630 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]