Result of FASTA (ccds) for pF1KB0459
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0459, 508 aa
  1>>>pF1KB0459     508 - 508 aa - 508 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9288+/-0.00122; mu= 6.5051+/- 0.071
 mean_var=322.5094+/-73.449, 0's: 0 Z-trim(110.5): 600  B-trim: 124 in 1/50
 Lambda= 0.071417
 statistics sampled from 11073 (11813) to 11073 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  1.630

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19          ( 508) 3446 369.6 4.7e-102
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19          ( 507) 3268 351.3 1.6e-96
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19          ( 466) 3138 337.8 1.6e-92
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs109|chr15           ( 450) 1621 181.5 1.8e-45
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5             ( 822)  926 110.3   9e-24
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5            ( 453)  916 108.9 1.3e-23
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs109|chr20          ( 451)  914 108.6 1.5e-23
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8             ( 434)  897 106.9   5e-23
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8              ( 505)  898 107.1   5e-23
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20          ( 488)  893 106.5 7.1e-23
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs109|chr1              ( 509)  875 104.7 2.6e-22
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20           ( 504)  853 102.4 1.3e-21
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20           ( 505)  853 102.4 1.3e-21
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20           ( 525)  853 102.5 1.3e-21
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20           ( 526)  853 102.5 1.3e-21
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs109|chr18          ( 543)  834 100.5 5.1e-21
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs109|chr20           ( 536)  829 100.0 7.2e-21
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6             ( 534)  814 98.5 2.1e-20
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8            ( 491)  813 98.3 2.1e-20
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8             ( 512)  813 98.3 2.2e-20
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6             ( 537)  809 97.9   3e-20
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs109|chr1              ( 529)  786 95.6 1.5e-19
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9             (1130)  749 92.2 3.3e-18
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9             (1149)  749 92.2 3.4e-18
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             ( 542)  743 91.1 3.4e-18
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15           ( 764)  744 91.5 3.8e-18
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15           ( 822)  744 91.5   4e-18
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1043)  744 91.7 4.5e-18
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1058)  744 91.7 4.6e-18
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1064)  744 91.7 4.6e-18
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1079)  744 91.7 4.6e-18
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1161)  744 91.7 4.8e-18
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1167)  744 91.7 4.8e-18
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1             (1182)  744 91.7 4.9e-18
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX             ( 659)  727 89.6 1.2e-17
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs109|chrX             ( 675)  727 89.6 1.2e-17
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX             ( 693)  727 89.6 1.2e-17
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs109|chr5             ( 620)  700 86.8 7.8e-17
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs109|chr4             ( 631)  694 86.2 1.2e-16
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15           ( 694)  694 86.3 1.3e-16
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15           ( 752)  694 86.3 1.3e-16
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs109|chr4             ( 527)  680 84.6   3e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6             ( 482)  678 84.4 3.3e-16
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs109|chr7           ( 976)  639 80.8 7.9e-15
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs109|chr3           ( 983)  622 79.1 2.7e-14
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1            ( 976)  620 78.8 3.1e-14
CCDS86924.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2          ( 949)  613 78.1   5e-14
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2           ( 986)  613 78.1 5.1e-14
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs109|chr1            (1005)  606 77.4 8.5e-14
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs109|chr6           ( 998)  605 77.3 9.1e-14


>>CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19               (508 aa)
 initn: 3446 init1: 3446 opt: 3446  Z-score: 1945.8  bits: 369.6 E(33420): 4.7e-102
Smith-Waterman score: 3446; 100.0% identity (100.0% similar) in 508 aa overlap (1-508:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MQGHFPAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQGHFPAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 TRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 MPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 QIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 LYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 VSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 YGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLA
              430       440       450       460       470       480

              490       500        
pF1KB0 RELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
              490       500        

>>CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19               (507 aa)
 initn: 3267 init1: 3267 opt: 3268  Z-score: 1846.7  bits: 351.3 E(33420): 1.6e-96
Smith-Waterman score: 3268; 97.8% identity (98.6% similar) in 497 aa overlap (13-508:11-507)

               10        20         30        40        50         
pF1KB0 MQGHFPAERREGRPRRGTRGQQQL-LVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCE
                   :  .:  . ..:  ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12   MAGRGSLVSWRAFHGCDSAEELPRVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCE
                 10        20        30        40        50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 HTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB0 LMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHL
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 TIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLG
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 AQIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQ
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 GLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNI
      300       310       320       330       340       350        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB0 LVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVF
      360       370       380       390       400       410        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB0 SYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKL
      420       430       440       450       460       470        

     480       490       500        
pF1KB0 ARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
      480       490       500       

>>CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19               (466 aa)
 initn: 3138 init1: 3138 opt: 3138  Z-score: 1774.7  bits: 337.8 E(33420): 1.6e-92
Smith-Waterman score: 3138; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (43-508:1-466)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KB0 RPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42                               MPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRK
                                             10        20        30

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB0 GDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQE
               40        50        60        70        80        90

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB0 AVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMD
              100       110       120       130       140       150

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB0 MVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQ
              160       170       180       190       200       210

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB0 GEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQGLYIVMEHVSKGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQGLYIVMEHVSKGN
              220       230       240       250       260       270

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB0 LVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDF
              280       290       300       310       320       330

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB0 GLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLK
              340       350       360       370       380       390

            440       450       460       470       480       490  
pF1KB0 EVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASV
              400       410       420       430       440       450

            500        
pF1KB0 SGQDADGSTSPRSQEP
       ::::::::::::::::
CCDS42 SGQDADGSTSPRSQEP
              460      

>>CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs109|chr15                (450 aa)
 initn: 1597 init1: 764 opt: 1621  Z-score: 930.1  bits: 181.5 E(33420): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 1621; 54.1% identity (81.3% similar) in 434 aa overlap (48-479:8-440)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB0 TRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVT
                                     :  ::.::.: .       .: : ::::.:
CCDS10                        MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLT
                                      10        20        30       

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB0 ILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQL
       :. . .. .::..:... :.::.. :. ...::...:  ::::::::::::. ..: . :
CCDS10 IVAVTKDPNWYKAKNKV-GREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLL
        40        50         60        70        80        90      

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB0 QPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHY
        ::: ::::::::. .::::.::::    : :::.... ..:.::: :.: :::..::::
CCDS10 YPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHY
        100       110       120       130       140       150      

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB0 SKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLG
       ..:  ..::.:..::  .:: .:..:. :.:: ::...: :   ::.:::: :. :.: :
CCDS10 TSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRG
        160       170       180       190       200       210      

       260       270       280       290         300       310     
pF1KB0 QKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQ--GLYIVMEHVSKGNLVN
       .::::: :: :.:::::: :..:::...: :::.:::::...  ::::: :...::.::.
CCDS10 NKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVD
        220       230       240       250       260       270      

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB0 FLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLA
       .::.:::....   ::.::: : :.:::::....:::::::::.::::: :::::::::.
CCDS10 YLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLT
        280       290       300       310       320       330      

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB0 KAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVS
       :   .  :...:::::::::::.. ::..::::::::.::::..:.::.:::.. ::.: 
CCDS10 KEASSTQDTGKLPVKWTAPEALREKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVV
        340       350       360       370       380       390      

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB0 EAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQ
         :::::.:. :.:::  :. .:..::. . : :: : .: :.:                
CCDS10 PRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL      
        400       410       420       430       440       450      

         500        
pF1KB0 DADGSTSPRSQEP

>>CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5                  (822 aa)
 initn: 703 init1: 376 opt: 926  Z-score: 540.5  bits: 110.3 E(33420): 9e-24
Smith-Waterman score: 926; 37.4% identity (63.9% similar) in 441 aa overlap (53-479:386-814)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB0 QLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEAC
                                     : . . .  .: :     . .  :: .:  
CCDS40 QKQALEELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERK
         360       370       380       390       400       410     

              90           100       110       120       130       
pF1KB0 ENKSWYR-VKHHTSG----QEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQL
       :  : .. ..:  .:     .. :...:: .  ..:  : :. . :.:: :   :: . :
CCDS40 ERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKP-LAEQDWYHGAIPRIEAQELL
         420       430       440       450        460       470    

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB0 QPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHY
       .  ..: ::::::  .::.::: :    .  :. . . :.   . :.. : :. ....:.
CCDS40 K--KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRF-EGTGFSNIPQLIDHH
            480       490       500       510        520       530 

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB0 SKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLG
          : .:        .: :.   .       :.:. . . ::  .:.:.:: : .:    
CCDS40 YTTKQVI-------TKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLKD
                    540       550       560       570       580    

        260       270          280       290        300       310  
pF1KB0 Q-KVAVKNIKCDVTAQ---AFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILH-QGLYIVMEHVSKGN
       . .::::. : :.  .    ::.:. .. ...: :.:.:.::  . : .::.:: :: :.
CCDS40 KTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGD
          590       600       610       620       630       640    

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB0 LVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDF
       ...::: : .  ..  ::..::: .: :: :::::. .:::::::: ::.:. : :.:::
CCDS40 FLTFLR-RKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDF
          650        660       670       680       690       700   

            380           390       400       410       420        
pF1KB0 GLAKAERKGLDSS----RLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPK
       :... :  :. ::    ..:.::::::::..:...:.:::::::.::::.:: :  ::: 
CCDS40 GMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPG
           710       720       730       740       750       760   

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB0 MSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGA
       :. ... : ::.::::  :. ::  .  .: .::. .:  :: : .: ..:         
CCDS40 MTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT 
           770       780       790       800       810       820   

      490       500        
pF1KB0 PASVSGQDADGSTSPRSQEP

>>CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5                 (453 aa)
 initn: 703 init1: 376 opt: 916  Z-score: 537.5  bits: 108.9 E(33420): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 916; 39.0% identity (65.8% similar) in 403 aa overlap (90-479:55-445)

      60        70        80        90           100       110     
pF1KB0 HTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG----QEGLLAAGALREREALSAD
                                     ..:  .:     .. :...:: .  ..:  
CCDS78 TCALMFSSEPSTSEVHRDQERKERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEK
           30        40        50        60        70        80    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB0 PKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHR
       : :. . :.:: :   :: . :.  ..: ::::::  .::.::: :    .  :. . . 
CCDS78 P-LAEQDWYHGAIPRIEAQELLK--KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYV
            90       100         110       120       130       140 

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB0 DGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQH
       :.   . :.. : :. ....:.   : .:        .: :.   .       :.:. . 
CCDS78 DNMYRF-EGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVIT-------KKSGVVLLNPIPKDKKWILSHED
              150       160       170              180       190   

         240       250        260       270          280       290 
pF1KB0 LTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCDVTAQ---AFLDETAVMTKMQHENLVR
       . ::  .:.:.:: : .:    . .::::. : :.  .    ::.:. .. ...: :.:.
CCDS78 VILGELLGKGNFGEVYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVK
           200       210       220       230       240       250   

              300       310       320       330       340       350
pF1KB0 LLGVILH-QGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLV
       :.::  . : .::.:: :: :....::: : .  ..  ::..::: .: :: :::::. .
CCDS78 LIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLR-RKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCI
           260       270       280        290       300       310  

              360       370       380           390       400      
pF1KB0 HRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSS----RLPVKWTAPEALKHGKFTSKS
       :::::::: ::.:. : :.::::... :  :. ::    ..:.::::::::..:...:.:
CCDS78 HRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSES
            320       330       340       350       360       370  

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB0 DVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEP
       ::::::.::::.:: :  ::: :. ... : ::.::::  :. ::  .  .: .::. .:
CCDS78 DVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKP
            380       390       400       410       420       430  

        470       480       490       500        
pF1KB0 ARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
         :: : .: ..:                             
CCDS78 ENRPKFSELQKELTIIKRKLT                     
            440       450                        

>>CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs109|chr20               (451 aa)
 initn: 753 init1: 358 opt: 914  Z-score: 536.5  bits: 108.6 E(33420): 1.5e-23
Smith-Waterman score: 914; 38.9% identity (66.3% similar) in 427 aa overlap (67-480:26-442)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB0 PPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG
                                     ::.:: :::  . .  :.  :  .  ...:
CCDS13      MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGG
                    10        20        30        40        50     

          100       110       120       130       140         150  
pF1KB0 Q--EGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPED--GLFLVRESAR
          .: .  . : :::.. ..:      :: : :: .:::..::   .  : ::.: : .
CCDS13 AVAQGYVPHNYLAERETVESEP------WFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEK
          60        70              80        90       100         

            160       170        180       190       200       210 
pF1KB0 HPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHR-DGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRP
         .:::: :   . : ::.. .:  :.: ..::: : .: ..:...  .. .   .:. :
CCDS13 PSADYVLSVRDTQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAP
     110       120       130       140       150       160         

             220        230       240       250        260         
pF1KB0 KRKHGTKSAEEELAR-AGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD-
        :::      : : .   :    ...::  ..: : :: :..: .  . .::.: :. : 
CCDS13 CRKH----EPEPLPHWDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDN
     170           180       190       200       210       220     

       270       280       290        300       310       320      
pF1KB0 -VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVI-LHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVN
        .  : . .:  .: :..:.... : .:. . . .::. : ..::.:...::   . .. 
CCDS13 LLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSDEKVLP
         230       240       250       260       270       280     

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB0 TAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSR
       ...::... .::::: ::::.. .:::::::::::.:. . ::.:::::.  .. .  :.
CCDS13 VSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKEDVYLSH
         290       300       310       320       330       340     

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB0 ---LPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYR
          .: ::::::::..:....::::::::.:: :.:: :..::: :: .:.   :. :::
CCDS13 DHNIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNHEAFLRVDAGYR
         350       360       370       380       390       400     

           450       460       470       480       490       500   
pF1KB0 MEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSP
       :  :  ::  :: :: .::  .: .:: :. : :.:.                       
CCDS13 MPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT              
         410       420       430       440       450               

            
pF1KB0 RSQEP

>>CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8                  (434 aa)
 initn: 721 init1: 315 opt: 897  Z-score: 527.2  bits: 106.9 E(33420): 5e-23
Smith-Waterman score: 897; 37.2% identity (65.2% similar) in 422 aa overlap (67-475:5-415)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB0 PPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSG
                                     .: . ::. . .:..  .  :. ..  ..:
CCDS83                           MNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGD--WWLARSLVTG
                                         10        20          30  

        100       110       120       130       140         150    
pF1KB0 QEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPP--EDGLFLVRESARHP
       .:: . .. . . :.      : .  ::  . . .:: .::  :  . : ::.:::  . 
CCDS83 REGYVPSNFVARVES------LEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNK
             40              50        60        70        80      

          160           170        180       190       200         
pF1KB0 GDYVLCV----SFGRDVIHYRVLHRD-GHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLV
       : . : :    . :. . ::..   : :   :.  . : .:. .:.::::   ..: .:.
CCDS83 GAFSLSVKDVTTQGELIKHYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLT
         90       100       110       120       130       140      

     210       220       230       240       250        260        
pF1KB0 RPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD
        :  .    . ..  :.  : .  : : :  ..: :.:: : .: : .. :::.:..:  
CCDS83 LPCVR---PAPQNPWAQDEWEIPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEG
        150          160       170       180       190       200   

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB0 -VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNT
        .. .::: :. ::  .::: :::: .:. .. .::: :....: :..::.:   . .. 
CCDS83 TMSPEAFLGEANVMKALQHERLVRLYAVVTKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSL
           210       220       230       240       250       260   

       330       340       350       360       370          380    
pF1KB0 AQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAK---AERKGLDS
        .:...: ..:::: :.:  . .:::: : :::::: :  :..:::::.   .:  . ..
CCDS83 PRLIDMSAQIAEGMAYIERMNSIHRDLRAANILVSEALCCKIADFGLARIIDSEYTAQEG
           270       280       290       300       310       320   

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB0 SRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRM
       ...:.:::::::.. : :: :.::::::::: :: .:::.::: ::  :: . .:.::::
CCDS83 AKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGVLLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRM
           330       340       350       360       370       380   

          450        460       470       480       490       500   
pF1KB0 EPPEGCPGPVHV-LMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSP
         :. ::  ..  ... ::...: .:: :. :                            
CCDS83 PRPDTCPPELYRGVIAECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP         
           390       400       410       420       430             

            
pF1KB0 RSQEP

>>CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8                   (505 aa)
 initn: 721 init1: 315 opt: 898  Z-score: 527.0  bits: 107.1 E(33420): 5e-23
Smith-Waterman score: 898; 35.5% identity (63.8% similar) in 453 aa overlap (36-475:49-486)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB0 PAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKP
                                     ::: . ..   .       ..  ..:  . 
CCDS59 DKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPPDEHLDEDKHF----VVALYDYTAMND
       20        30        40        50        60            70    

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB0 GELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFH
        .: . ::. . .:..  . .:. ..  ..:.:: . .. . . :.      : .  :: 
CCDS59 RDLQMLKGEKLQVLKG--TGDWWLARSLVTGREGYVPSNFVARVES------LEMERWFF
           80        90         100       110             120      

         130       140         150       160           170         
pF1KB0 GKISGQEAVQQLQPP--EDGLFLVRESARHPGDYVLCV----SFGRDVIHYRVLHRD-GH
        . . .:: .::  :  . : ::.:::  . : . : :    . :. . ::..   : : 
CCDS59 RSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVTTQGELIKHYKIRCLDEGG
        130       140       150       160       170       180      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB0 LTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTL
         :.  . : .:. .:.::::   ..: .:. :  .    . ..  :.  : .  : : :
CCDS59 YYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVR---PAPQNPWAQDEWEIPRQSLRL
        190       200       210       220          230       240   

      240       250        260        270       280       290      
pF1KB0 GAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKCD-VTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVI
         ..: :.:: : .: : .. :::.:..:   .. .::: :. ::  .::: :::: .:.
CCDS59 VRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVMKALQHERLVRLYAVV
           250       260       270       280       290       300   

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB0 LHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAA
        .. .::: :....: :..::.:   . ..  .:...: ..:::: :.:  . .:::: :
CCDS59 TKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIERMNSIHRDLRA
           310       320       330       340       350       360   

        360       370          380       390       400       410   
pF1KB0 RNILVSEDLVAKVSDFGLAK---AERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGV
        :::::: :  :..:::::.   .:  . .....:.:::::::.. : :: :.:::::::
CCDS59 ANILVSEALCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGV
           370       380       390       400       410       420   

           420       430       440       450        460       470  
pF1KB0 LLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHV-LMSSCWEAEPARRPPF
       :: :: .:::.::: ::  :: . .:.::::  :. ::  ..  ... ::...: .:: :
CCDS59 LLMEVVTYGRVPYPGMSNPEVIRNLERGYRMPRPDTCPPELYRGVIAECWRSRPEERPTF
           430       440       450       460       470       480   

            480       490       500        
pF1KB0 RKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
       . :                                 
CCDS59 EFLQSVLEDFYTATERQYELQP              
           490       500                   

>>CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20               (488 aa)
 initn: 744 init1: 375 opt: 893  Z-score: 524.4  bits: 106.5 E(33420): 7.1e-23
Smith-Waterman score: 895; 38.5% identity (62.0% similar) in 481 aa overlap (12-479:24-480)

                           10        20        30        40        
pF1KB0             MQGHFPAERREGRPRRGTRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRW
                              :.: .:: :.    ..:      .  :: . .:..  
CCDS13 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGS----LDP------NTDPVPT-LPAEPC
               10        20        30                  40          

       50         60        70        80        90       100       
pF1KB0 APGTQCITKC-EHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALR
       .:  : .    . :    :::. :.::    : : :. . :   .. :::    .:: . 
CCDS13 SPFPQLFLALYDFTARCGGELSVRRGDR---LCALEEGGGYIFARRLSGQP---SAGLVP
      50        60        70           80        90          100   

       110        120       130        140        150       160    
pF1KB0 EREALSADPK-LSLMPWFHGKISGQEAVQQL-QPP-EDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFG
         .. .:.:. :: .::. . .:  .: : : .:: : : ::.: :    : : : :   
CCDS13 ITHVAKASPETLSDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQ
           110       120       130       140       150       160   

          170        180       190       200       210       220   
pF1KB0 RDVIHYRV-LHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEE
         : :::: .  :: : .... .: .: ... .:. .   : . :..:   .  :. ...
CCDS13 AKVCHYRVSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQ--KAPRQD
           170       180       190       200       210         220 

           230       240       250        260        270       280 
pF1KB0 LARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQ-KVAVKNIKC-DVTAQAFLDETAVM
       .    :    ....:: ..::: :: : .: .::.  ::.: ::  ..    .  :  ..
CCDS13 V----WERPHSEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTL
                 230       240       250       260       270       

             290        300       310        320       330         
pF1KB0 TKMQHENLVRLLGVILH-QGLYIVMEHVSKGNLVNFLRT-RGRALVNTAQLLQFSLHVAE
         ..:: :.:: .:    . .::: : . ::::  :: : .::::     :: :. .:::
CCDS13 KGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRAL-RLPPLLGFACQVAE
       280       290       300       310       320        330      

     340       350       360       370       380           390     
pF1KB0 GMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGL----DSSRLPVKWTAPE
       :: ::: ...:::::::::.::.. :. ::.:::::.  .  .    .::..::::::::
CCDS13 GMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPE
        340       350       360       370       380       390      

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB0 ALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVH
       : ..  :..::::::::::: :::.::. ::  :. .:. . . .:::.  : .::. :.
CCDS13 AANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVY
        400       410       420       430       440       450      

         460       470       480       490       500        
pF1KB0 VLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
       :::  ::.. : .:: :  : :::                             
CCDS13 VLMLECWRSSPEERPSFATLREKLHAIHRCHP                     
        460       470       480                             




508 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Oct 24 21:48:12 2019 done: Thu Oct 24 21:48:13 2019
 Total Scan time:  1.630 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com