Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0462
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0462, 976 aa
1>>>pF1KB0462 976 - 976 aa - 976 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9073+/-0.000817; mu= 14.7316+/- 0.050
mean_var=108.8742+/-21.833, 0's: 0 Z-trim(110.3): 14 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.122917
statistics sampled from 11488 (11501) to 11488 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 5.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56492.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 ( 976) 6524 1168.1 0
CCDS47613.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 ( 944) 5729 1027.1 0
CCDS5571.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 ( 959) 3821 688.7 1.4e-197
CCDS47614.1 GTF2I gene_id:2969|Hs108|chr7 ( 957) 355 74.1 1.5e-12
CCDS5575.1 GTF2I gene_id:2969|Hs108|chr7 ( 977) 355 74.1 1.5e-12
CCDS5574.1 GTF2I gene_id:2969|Hs108|chr7 ( 978) 355 74.1 1.5e-12
CCDS5573.1 GTF2I gene_id:2969|Hs108|chr7 ( 998) 355 74.1 1.6e-12
CCDS34659.1 GTF2IRD2B gene_id:389524|Hs108|chr7 ( 949) 343 72.0 6.5e-12
CCDS5576.1 GTF2IRD2 gene_id:84163|Hs108|chr7 ( 949) 343 72.0 6.5e-12
>>CCDS56492.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 (976 aa)
initn: 6524 init1: 6524 opt: 6524 Z-score: 6250.9 bits: 1168.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6524; 100.0% identity (100.0% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCLSAAQHRAATSQLEGRVVRRVLTVASRALCPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCLSAAQHRAATSQLEGRVVRRVLTVASRALCPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 GGPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GGPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQERDSGDPLVDESLKRQGFQENYDARLSRIDIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQERDSGDPLVDESLKRQGFQENYDARLSRIDIAN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 TLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPPGIPFRKPCTFGSQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPPGIPFRKPCTFGSQNL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 ERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKELFNEKYGEALGLNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKELFNEKYGEALGLNRP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 VLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKAREHVRMVIINQLQPFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKAREHVRMVIINQLQPFAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 ICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSVASANQISLVQWPMYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSVASANQISLVQWPMYM
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB0 VDYAGLNVQLPGPLNY
::::::::::::::::
CCDS56 VDYAGLNVQLPGPLNY
970
>>CCDS47613.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 (944 aa)
initn: 6306 init1: 5729 opt: 5729 Z-score: 5489.2 bits: 1027.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6243; 96.6% identity (96.6% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-944)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCLSAAQHRAATSQLEGRVVRRVLTVASRALCPT
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCR-------------------------------
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 GGPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -GPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQERDSGDPLVDESLKRQGFQENYDARLSRIDIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQERDSGDPLVDESLKRQGFQENYDARLSRIDIAN
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 TLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPPGIPFRKPCTFGSQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPPGIPFRKPCTFGSQNL
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 ERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKELFNEKYGEALGLNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKELFNEKYGEALGLNRP
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 VLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKAREHVRMVIINQLQPFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKAREHVRMVIINQLQPFAE
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 ICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSVASANQISLVQWPMYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSVASANQISLVQWPMYM
870 880 890 900 910 920
970
pF1KB0 VDYAGLNVQLPGPLNY
::::::::::::::::
CCDS47 VDYAGLNVQLPGPLNY
930 940
>>CCDS5571.1 GTF2IRD1 gene_id:9569|Hs108|chr7 (959 aa)
initn: 6292 init1: 3821 opt: 3821 Z-score: 3660.5 bits: 688.7 E(32554): 1.4e-197
Smith-Waterman score: 6203; 95.2% identity (95.2% similar) in 991 aa overlap (1-976:1-959)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNAEVACVAVHDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCLSAAQHRAATSQLEGRVVRRVLTVASRALCPT
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCR-------------------------------
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 GGPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 -GPPWKDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRAS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVPLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLEDGG
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATSSSMASFLYSTALPNHAIR
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQDFSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SIVHDKSEKWDAFIKETEDINTLRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IVGIPDKIPFKRPCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPAS
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPEDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPEDLDIIQVTV
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPEERPVEDSHGDVIRPLRKQ
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILE
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700
pF1KB0 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQ---------------ERDSGDPLVDESLKRQGF
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS55 ASNSIQFVIKRPELLTEGVKEPIMDSQGTASSLGFSPPALPPERDSGDPLVDESLKRQGF
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KB0 QENYDARLSRIDIANTLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QENYDARLSRIDIANTLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPP
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KB0 GIPFRKPCTFGSQNLERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GIPFRKPCTFGSQNLERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKVILREQVKE
750 760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KB0 LFNEKYGEALGLNRPVLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LFNEKYGEALGLNRPVLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFRNPNTYDIHRLEKILKARE
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KB0 HVRMVIINQLQPFAEICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HVRMVIINQLQPFAEICNDAKVPAKDSSIPKRKRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSV
870 880 890 900 910 920
950 960 970
pF1KB0 ASANQISLVQWPMYMVDYAGLNVQLPGPLNY
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASANQISLVQWPMYMVDYAGLNVQLPGPLNY
930 940 950
>>CCDS47614.1 GTF2I gene_id:2969|Hs108|chr7 (957 aa)
initn: 1286 init1: 355 opt: 355 Z-score: 338.8 bits: 74.1 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 1096; 31.2% identity (56.5% similar) in 859 aa overlap (156-915:108-921)
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 KDPEAEHPKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRASVVPLP
.. ::: ::. : :..:::...:::.:
CCDS47 KYCVEEEEKAAEMHKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVP
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 YERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKLKRPLED-----GG
::..::. . ..:::::::.::..: .:: .: :::.. : : .:::. . ::
CCDS47 YEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHVGG
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... : . .. : .: .:.: ...: . : :. . ..:
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:... . : :::::: .:: ..:.:.:..: ::::: : .:: :.: :::::: .:
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: .. .. : .: . ...: ..: . :...
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:::: . .: :. : :. :. .::
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CCDS55 KYCVEEEEKAAEMHKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVP
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CCDS55 TQPRTNTPVKEDWNVRITKLRKQVEEIFNLKFAQALGLTEAVKVPYPVFESNPEFLYVEG
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CCDS55 PRSPGSNSKVPEIEVTVEGPNNNNPQTSAVRTPTQTNGSNVPFKPRGREFSFEAWNAKI-
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. :...:..:::.: :::::.: :.::. ..: : . .:::: :.:::.: :::
CCDS55 --TDLKQKVENLFNEKCGEALGLKQAVKVPFALFESFPEDFYVEGLPEGVPFRRPSTFGI
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pF1KB0 QNLERILAVADKIKFTVTRP--FQGLI---------PK-----PD---------------
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CCDS55 PRLEKILRNKAKIKFIIKKPEMFETAIKESTSSKSPPRKINSSPNVNTTASGVEDLNIIQ
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CCDS55 MPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVI---RPFPGLVINNQLVDQSESEGPVIQ
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CCDS55 ESAEPSQLEVPATEEIKETDGSSQIKQEPDPTW
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CCDS55 KAAEMHKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQ
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CCDS55 SAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHVGGRVMVTDAD
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. : .: .:.:: . . :.: . .. :.. .
CCDS55 RSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGISLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQAGPSETDDVDE
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CCDS55 KQPLSKPLQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDSTQHVPSE---TSEDPEVEVTIEDDDYSPPS
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CCDS55 KRPKANELPQPPVPEPANAGKR---KVREFNFEKWNARITD------LRKQVEELFERKY
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CCDS55 AQAIKAKGPVTIPYPLFQSHVEDLYVEGLPEGIPFRRPSTYGIPRLERILLAKERIRFVI
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CCDS55 KK--HELL---NSTREDLQLDKPASGVKEEWYARITK--LRKMVDQLFCKK--FAEALG-
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CCDS55 STEAKAVPYQKFEAHPNDLYV--EGLPENIPFRSPSWYGIPRLEKIIQVGNRIKFVIKRP
490 500 510 520 530 540
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CCDS55 ELLT-HSTTEVTQPRTNTPVKEDWNVRITKLRKQVEEIFNLKFAQALGLTEAVKVPYPVF
550 560 570 580 590 600
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]