Result of FASTA (omim) for
pF1KB0463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0463, 509 aa
1>>>pF1KB0463 509 - 509 aa - 509 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1293+/-0.000353; mu= 19.7033+/- 0.022
mean_var=73.6663+/-15.482, 0's: 0 Z-trim(114.0): 164 B-trim: 227 in 1/49
Lambda= 0.149431
statistics sampled from 23463 (23637) to 23463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 10.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001033 (OMIM: 138190) solute carrier family 2, ( 509) 3285 717.7 1.9e-206
NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carr ( 492) 2133 469.4 1.1e-131
NP_008862 (OMIM: 138170) solute carrier family 2, ( 496) 1876 414.0 5.3e-115
XP_011518864 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
XP_016874336 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
XP_011518865 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
NP_001273163 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
XP_016874335 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
XP_005253372 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
XP_005253374 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
NP_001273164 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 1822 402.3 1.7e-111
NP_703150 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, ( 520) 1819 401.7 2.7e-111
NP_001273162 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 520) 1819 401.7 2.7e-111
XP_016874331 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1818 401.5 3.2e-111
XP_016874333 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1818 401.5 3.2e-111
XP_016874334 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1818 401.5 3.2e-111
XP_016874332 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1818 401.5 3.2e-111
XP_016874330 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 1818 401.5 3.2e-111
NP_001273166 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 535) 1817 401.3 3.8e-111
NP_000331 (OMIM: 125853,138160,227810) solute carr ( 524) 1651 365.5 2.2e-100
XP_011511389 (OMIM: 125853,138160,227810) PREDICTE ( 509) 1643 363.7 7.1e-100
XP_011518867 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 411) 1557 345.1 2.3e-94
XP_011518866 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 411) 1557 345.1 2.3e-94
NP_001273165 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 411) 1557 345.1 2.3e-94
NP_001265587 (OMIM: 125853,138160,227810) solute c ( 405) 1538 341.0 3.9e-93
NP_001265588 (OMIM: 125853,138160,227810) solute c ( 351) 1382 307.3 4.6e-83
XP_011511391 (OMIM: 125853,138160,227810) PREDICTE ( 351) 1382 307.3 4.6e-83
XP_016857627 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_005263548 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857624 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857622 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857629 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857625 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857623 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857626 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
NP_003030 (OMIM: 138230) solute carrier family 2, ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
NP_001315548 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
XP_016857630 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1331 296.5 1.2e-79
NP_997303 (OMIM: 610371) solute carrier family 2, ( 512) 1300 289.8 1.3e-77
NP_001315549 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 457) 1204 269.1 2e-71
XP_011539126 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 517) 1186 265.2 3.3e-70
NP_001001290 (OMIM: 606142,612076) solute carrier ( 511) 1158 259.2 2.1e-68
XP_011512162 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 537) 1157 259.0 2.6e-68
XP_011512161 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 538) 1157 259.0 2.6e-68
NP_064425 (OMIM: 606142,612076) solute carrier fam ( 540) 1157 259.0 2.6e-68
XP_006714031 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 563) 1157 259.0 2.7e-68
XP_016863946 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 609) 1157 259.0 2.8e-68
XP_016857631 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 442) 1103 247.3 7e-65
XP_016863947 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 487) 1057 237.4 7.3e-62
NP_110434 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, ( 503) 1054 236.7 1.2e-61
>>NP_001033 (OMIM: 138190) solute carrier family 2, faci (509 aa)
initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 3827.2 bits: 717.7 E(85289): 1.9e-206
Smith-Waterman score: 3285; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSAVLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNETW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSAVLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNETW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RKSLKRLTGWADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHRQPLIIAVVLQLSQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKSLKRLTGWADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHRQPLIIAVVLQLSQQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 SGINAVFYYSTSIFETAGVGQPAYATIGAGVVNTVFTLVSVLLVERAGRRTLHLLGLAGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGINAVFYYSTSIFETAGVGQPAYATIGAGVVNTVFTLVSVLLVERAGRRTLHLLGLAGM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 CGCAILMTVALLLLERVPAMSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGCAILMTVALLLLERVPAMSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQIS
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB0 AAFHRTPSLLEQEVKPSTELEYLGPDEND
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAFHRTPSLLEQEVKPSTELEYLGPDEND
490 500
>>NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carrier (492 aa)
initn: 2129 init1: 1905 opt: 2133 Z-score: 2485.2 bits: 469.4 E(85289): 1.1e-131
Smith-Waterman score: 2133; 65.5% identity (86.8% similar) in 493 aa overlap (14-506:2-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSAVLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNETW
:: ....:: :.::: .::::::::::: :::::::::::. ::.::
NP_006 MEPSSKKLTGRLMLAVGGAVLGSLQFGYNTGVINAPQKVIEEFYNQTW
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLAV
. : : :: : ::::::.::::::::::::.:: .:.. . .::. .::. :.::
NP_006 VHRYGE----SILPTTLTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLMMNLLAF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLAI
... :::... . :.::::::::.::.: :::.:.:::::::..:: ::::::::.::.:
NP_006 VSAVLMGFSKLGKSFEMLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGTLHQLGI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGPA
:.:::::::.::.:..:. .::::::.. .::::: ..:::::::::.: : .: :. :
NP_006 VVGILIAQVFGLDSIMGNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RKSLKRLTGWADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHRQPLIIAVVLQLSQQL
.. ::.: : :::. : :.:.:.:.. ::. ...:.:. : ..:::..:::::::::::
NP_006 KSVLKKLRGTADVTHDLQEMKEESRQMMREKKVTILELFRSPAYRQPILIAVVLQLSQQL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 SGINAVFYYSTSIFETAGVGQPAYATIGAGVVNTVFTLVSVLLVERAGRRTLHLLGLAGM
::::::::::::::: ::: ::.:::::.:.:::.::.::...:::::::::::.:::::
NP_006 SGINAVFYYSTSIFEKAGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHLIGLAGM
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 CGCAILMTVALLLLERVPAMSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
:::::::.:: :::..: :::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::.
NP_006 AGCAILMTIALALLEQLPWMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAI
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQIS
:::::::::::::.:: :::: . :::::..:.:::. :::::...::::.:::::.:.
NP_006 AVAGFSNWTSNFIVGMCFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVLFFIFTYFKVPETKGRTFDEIA
410 420 430 440 450 460
490 500
pF1KB0 AAFHRTPSLLEQEVKPSTELEYLGPDEND
..: : . ... : .. :: :
NP_006 SGF-RQGGASQSDKTPEELFHPLGADSQV
470 480 490
>>NP_008862 (OMIM: 138170) solute carrier family 2, faci (496 aa)
initn: 1857 init1: 1721 opt: 1876 Z-score: 2185.7 bits: 414.0 E(85289): 5.3e-115
Smith-Waterman score: 1876; 60.9% identity (83.5% similar) in 466 aa overlap (18-483:4-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSAVLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNETW
:.:: .:..:. :..::.::::: ::::::.:.:.. :.:
NP_008 MGTQKVTPALIFAITVATIGSFQFGYNTGVINAPEKIIKEFINKT-
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLAV
: .: :: . ::.::.::::::::::::.:: .:.. . .::. .::. :.:::
NP_008 LTDKGNAPPSEV---LLTSLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNLLAV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLAI
:: .::: ..: : :::::::..:: . :: .:.::::.:::.:: ::::.::::::.:
NP_008 TGGCFMGLCKVAKSVEMLILGRLVIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGPA
:.:::.::..::: .::. :::::::.:.:::.:: . :::::::::.: : .. : :
NP_008 VVGILVAQIFGLEFILGSEELWPLLLGFTILPAILQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RKSLKRLTGWADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHRQPLIIAVVLQLSQQL
.. :.:: : ::: . :.:::. .. .:. ...:.:. ..:::.::..::::::::
NP_008 KQILQRLWGTQDVSQDIQEMKDESARMSQEKQVTVLELFRVSSYRQPIIISIVLQLSQQL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 SGINAVFYYSTSIFETAGVGQPAYATIGAGVVNTVFTLVSVLLVERAGRRTLHLLGLAGM
:::::::::::.::. ::: .: :::::::::::.::.::..:::::::::::..::.::
NP_008 SGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTIFTVVSLFLVERAGRRTLHMIGLGGM
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 CGCAILMTVALLLLERVPAMSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
:. ::::.::: . .::.: : ::. ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AFCSTLMTVSLLLKDNYNGMSFVCIGAILVFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 AVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQIS
:::: :::::::..:. : .:. .: :::..:. .:. :. :::..:::::::::..:.
NP_008 AVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAAHYLGAYVFIIFTGFLITFLAFTFFKVPETRGRTFEDIT
410 420 430 440 450 460
490 500
pF1KB0 AAFHRTPSLLEQEVKPSTELEYLGPDEND
::
NP_008 RAFEGQAHGADRSGKDGVMEMNSIEPAKETTTNV
470 480 490
>>XP_011518864 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carrier (497 aa)
initn: 1814 init1: 1685 opt: 1822 Z-score: 2122.8 bits: 402.3 E(85289): 1.7e-111
Smith-Waterman score: 1822; 60.0% identity (82.2% similar) in 467 aa overlap (17-483:4-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSAVLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNETW
.: :: .:..:. :..::.::::: ::::::. .:.. :.:
XP_011 MDNRQNVTPALIFAITVATIGSFQFGYNTGVINAPETIIKEFINKT-
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLAV
: .. :: . ::.::.::::::::::::.:: .:.. . .::. .::. :.::.
XP_011 LTDKANAPPSEV---LLTNLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNLLAA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLAI
:: :::: . : : :::::::..:: . :: .:.::::.:::.:: ::::.::::::.:
XP_011 TGGCLMGLCKIAESVEMLILGRLVIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGPA
:::::.::..::: .::. :::.:::.:.:::.:: . :: ::::::.: : .. : :
XP_011 VIGILVAQIFGLELILGSEELWPVLLGFTILPAILQSAALPCCPESPRFLLINRKKEENA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
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XP_005 AFCSTLMTVSLLLKNHYNGMSFVCIGAILVFVACFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAM
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pF1KB0 AVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQIS
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XP_005 AVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAAYYLGAYVFIIFTGFLITFLAFTFFKVPETRGRTFEDIT
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XP_005 RAFEGQAHGADRSGKDGVMGMNSIEPAKETTTNV
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