Result of FASTA (ccds) for pF1KB0465
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0465, 478 aa
  1>>>pF1KB0465 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9701+/-0.000766; mu= 15.6370+/- 0.047
 mean_var=86.2726+/-17.123, 0's: 0 Z-trim(110.5): 78  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.138082
 statistics sampled from 11553 (11631) to 11553 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.357), width:  16
 Scan time:  3.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11          ( 484) 3217 650.5 1.1e-186
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11         ( 463) 3082 623.6 1.3e-178
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11          ( 516) 2043 416.7  3e-116
CCDS8364.1 HTR3B gene_id:9177|Hs108|chr11          ( 441) 1135 235.8 7.4e-62
CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3        ( 456)  957 200.3 3.6e-51
CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3         ( 471)  957 200.3 3.7e-51
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3         ( 447)  929 194.7 1.7e-49
CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3        ( 441)  856 180.2   4e-45
CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3        ( 456)  856 180.2 4.1e-45
CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs108|chr11       ( 450)  776 164.2 2.5e-40
CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20        ( 627)  737 156.6 7.3e-38
CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs108|chr8          ( 458)  734 155.9 8.5e-38
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4         ( 479)  730 155.1 1.5e-37
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8          ( 494)  724 153.9 3.6e-37
CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8          ( 529)  715 152.1 1.3e-36
CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15        ( 502)  714 151.9 1.5e-36
CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15        ( 531)  714 151.9 1.5e-36
CCDS58871.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3        ( 482)  712 151.5 1.8e-36
CCDS10304.1 CHRNA5 gene_id:1138|Hs108|chr15        ( 468)  698 148.7 1.2e-35
CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2          ( 457)  686 146.3 6.4e-35
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15        ( 489)  683 145.7   1e-34
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15        ( 505)  683 145.7 1.1e-34
CCDS1070.1 CHRNB2 gene_id:1141|Hs108|chr1          ( 502)  682 145.5 1.2e-34
CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs108|chr15        ( 498)  671 143.3 5.5e-34
CCDS64856.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8         ( 514)  670 143.2 6.4e-34
CCDS56536.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8         ( 479)  586 126.4 6.6e-29
CCDS33331.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2         ( 482)  559 121.0 2.8e-27
CCDS33400.1 CHRNG gene_id:1146|Hs108|chr2          ( 517)  525 114.3 3.2e-25
CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs108|chr15     ( 412)  482 105.6   1e-22
CCDS11058.1 CHRNE gene_id:1145|Hs108|chr17         ( 493)  449 99.1 1.1e-20
CCDS42008.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs108|chr15     ( 321)  375 84.3 2.1e-16
CCDS11106.1 CHRNB1 gene_id:1140|Hs108|chr17        ( 501)  366 82.6 1.1e-15
CCDS54685.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3        ( 454)  349 79.2   1e-14
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5          ( 474)  342 77.8 2.8e-14
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5          ( 512)  342 77.8   3e-14
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15        ( 473)  337 76.8 5.6e-14
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3       ( 467)  333 76.0 9.6e-14
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5           ( 440)  328 75.0 1.8e-13
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5          ( 456)  327 74.8 2.2e-13
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15        ( 473)  321 73.6 5.1e-13
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6         ( 462)  320 73.4 5.7e-13
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6          ( 479)  320 73.4 5.9e-13
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4            ( 497)  319 73.2   7e-13
CCDS46966.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3        ( 404)  317 72.8 7.8e-13
CCDS58754.1 CHRND gene_id:1144|Hs108|chr2          ( 502)  318 73.0 8.1e-13
CCDS2494.1 CHRND gene_id:1144|Hs108|chr2           ( 517)  318 73.0 8.3e-13
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6          ( 465)  315 72.4 1.2e-12
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15        ( 467)  314 72.2 1.3e-12
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4          ( 451)  312 71.8 1.7e-12
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4         ( 511)  312 71.8 1.9e-12


>>CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11               (484 aa)
 initn: 3217 init1: 3217 opt: 3217  Z-score: 3464.9  bits: 650.5 E(32554): 1.1e-186
Smith-Waterman score: 3217; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:7-484)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB0       MLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRD
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MLGKLAMLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRD
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB0 WRKPTTVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WRKPTTVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDS
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB0 IWVPDILINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IWVPDILINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLT
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB0 FTSWLHTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FTSWLHTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKF
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB0 YVVIRRRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YVVIRRRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDT
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB0 LPATAIGTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LPATAIGTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWL
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB0 LCLREQSTSQRPPATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LCLREQSTSQRPPATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLA
              370       380       390       400       410       420

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB0 VCGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VCGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSI
              430       440       450       460       470       480

           
pF1KB0 WQYA
       ::::
CCDS83 WQYA
           

>>CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11              (463 aa)
 initn: 3082 init1: 3082 opt: 3082  Z-score: 3319.9  bits: 623.6 E(32554): 1.3e-178
Smith-Waterman score: 3082; 99.8% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (22-478:7-463)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTT
                            .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53                MHRSFLQARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTT
                              10        20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDI
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 LINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLH
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 TIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRR
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 RPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAI
         230       240       250       260       270       280     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 GTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWLLCLREQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWLLCLREQ
         290       300       310       320       330       340     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 STSQRPPATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STSQRPPATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQ
         350       360       370       380       390       400     

              430       440       450       460       470        
pF1KB0 ELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
         410       420       430       440       450       460   

>>CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11               (516 aa)
 initn: 2099 init1: 2043 opt: 2043  Z-score: 2200.6  bits: 416.7 E(32554): 3e-116
Smith-Waterman score: 3143; 93.7% identity (93.7% similar) in 510 aa overlap (1-478:7-516)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB0       MLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRD
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MLGKLAMLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRD
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB0 WRKPTTVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WRKPTTVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDS
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB0 IWVPDILINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IWVPDILINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLT
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB0 FTSWLHTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FTSWLHTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKF
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB0 YVVIRRRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YVVIRRRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDT
              250       260       270       280       290       300

          300                                       310       320  
pF1KB0 LPATAIGTPLIG--------------------------------VYFVVCMALLVISLAE
       ::::::::::::                                ::::::::::::::::
CCDS83 LPATAIGTPLIGKAPPGSRAQSGEKPAPSHLLHVSLASALGCTGVYFVVCMALLVISLAE
              310       320       330       340       350       360

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB0 TIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQATKTDDCSAMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQATKTDDCSAMG
              370       380       390       400       410       420

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB0 NHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDW
              430       440       450       460       470       480

            450       460       470        
pF1KB0 LRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
              490       500       510      

>>CCDS8364.1 HTR3B gene_id:9177|Hs108|chr11               (441 aa)
 initn: 1293 init1: 758 opt: 1135  Z-score: 1224.0  bits: 235.8 E(32554): 7.4e-62
Smith-Waterman score: 1245; 42.2% identity (70.7% similar) in 464 aa overlap (17-475:14-438)

               10        20         30        40        50         
pF1KB0 MLLWVQQALLALLLPTLLAQG-EARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPT
                       :.: :  :  ...    :: .::  :: .:.: :::: .: : :
CCDS83    MLSSVMAPLWACILVAAGILATDTHHPQDSALYHLSKQLLQKYHKEVRPVYNWTKAT
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 TVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPD
       :: .:..:.:::.:: .::.: : .::.. :.::::.::   ::.: ..:.: ..::.::
CCDS83 TVYLDLFVHAILDVDAENQILKTSVWYQEVWNDEFLSWNSSMFDEIREISLPLSAIWAPD
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB0 ILINEFVDVGKSPNIPYVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWL
       :.::::::. . :..::::.  .: ..::::.:::.::::. : :::::::::::: : :
CCDS83 IIINEFVDIERYPDLPYVYVNSSGTIENYKPIQVVSACSLETYAFPFDVQNCSLTFKSIL
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 HTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIR
       ::..:..... : :: .. :...:.:..:::::.:   .  ..  :.. .:...: ::.:
CCDS83 HTVEDVDLAFLRSPEDIQHDKKAFLNDSEWELLSVSSTYSILQ-SSAGGFAQIQFNVVMR
       180       190       200       210       220        230      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 RRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATA
       :.:: ::::::.::::::..:. .::::::   :. :: ..:.::.:: . .:. .: ..
CCDS83 RHPLVYVVSLLIPSIFLMLVDLGSFYLPPNCRARIVFKTSVLVGYTVFRVNMSNQVPRSV
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330        340       350        
pF1KB0 IGTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVH-KQDLQQPVPAWLRHLVLERIAWLLCLR
        .::::: .:..:::.::.:::..: .:...: .:   :  :             .::::
CCDS83 GSTPLIGHFFTICMAFLVLSLAKSIVLVKFLHDEQRGGQEQP-------------FLCLR
        300       310       320       330                    340   

      360          370       380       390       400       410     
pF1KB0 EQSTSQRP---PATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAV
        .. ..::   : ...:. :.. : .:.: .. :  ..                      
CCDS83 GDTDADRPRVEPRAQRAVVTES-SLYGEHLAQPGTLKE----------------------
           350       360        370       380                      

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB0 CGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIW
         . ..:.:: ..:. .:.  .   .:: . : .:.:::. ::. .  :.:::  ::..:
CCDS83 --VWSQLQSISNYLQTQDQTDQQEAEWLVLLSRFDRLLFQSYLFMLGIYTITLCSLWALW
                390       400       410       420       430        

          
pF1KB0 QYA
          
CCDS83 GGV
      440 

>>CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3             (456 aa)
 initn: 1008 init1: 706 opt: 957  Z-score: 1032.2  bits: 200.3 E(32554): 3.6e-51
Smith-Waterman score: 1019; 39.0% identity (70.2% similar) in 433 aa overlap (46-473:51-455)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB0 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
                                     ::  ::: .   :: :.:.  . :::.:.:
CCDS58 LQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDVNE
               30        40        50        60        70        80

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB0 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
       . ..:....: .. : . :..::::. ..:::.:. . ..:.:::.: :..:: :.:.  
CCDS58 QLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGL
               90       100       110       120       130       140

         140       150       160       170       180           190 
pF1KB0 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQ----DINISLWR
        .:. ..:...  ::..: . :.:::. :::: :::.:::.:.:.:..    :..  .:.
CCDS58 TAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWE
              150       160       170       180       190       200

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB0 LPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLL
       . .   ..:......:::::::.     ..: ...: : .. :::.::::: .::..::.
CCDS58 ITD---ASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLS-RGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLV
                 210       220        230       240       250      

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB0 PSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVV
       :: ::...: ..:::: .::.:: :::::::::.:::...:: ::..  :::::::::..
CCDS58 PSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTS--GTPLIGVYFAL
        260       270       280       290       300         310    

             320       330        340       350       360       370
pF1KB0 CMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATS
       :..:.: :: :::::..:.:    : : .: ::. :.:.      :   .: ..  :.. 
CCDS58 CLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLH------C---NSPGRCCPTAP
          320       330       340       350                360     

              380       390       400       410       420       430
pF1KB0 QATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLE
       :     . .. :   .:. :     : :.   .  : : :: :.  :  .   . :.   
CCDS58 QK----ENKGPGLTPTHLPGV----KEPEVSAGQMPGPAEAELT--GGSEWTRAQREHEA
             370       380           390       400         410     

              440       450       460       470        
pF1KB0 KRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ....  :.   ::. . ..: .::..::: . .  ::.. ::.     
CCDS58 QKQHSVEL---WLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT    
         420          430       440       450          

>>CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3              (471 aa)
 initn: 1039 init1: 706 opt: 957  Z-score: 1032.0  bits: 200.3 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 1019; 39.0% identity (70.2% similar) in 433 aa overlap (46-473:66-470)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB0 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
                                     ::  ::: .   :: :.:.  . :::.:.:
CCDS32 TTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDVNE
          40        50        60        70        80        90     

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB0 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
       . ..:....: .. : . :..::::. ..:::.:. . ..:.:::.: :..:: :.:.  
CCDS32 QLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGL
         100       110       120       130       140       150     

         140       150       160       170       180           190 
pF1KB0 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQ----DINISLWR
        .:. ..:...  ::..: . :.:::. :::: :::.:::.:.:.:..    :..  .:.
CCDS32 TAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWE
         160       170       180       190       200       210     

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB0 LPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLL
       . .   ..:......:::::::.     ..: ...: : .. :::.::::: .::..::.
CCDS32 ITD---ASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLS-RGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLV
            220       230       240        250       260       270 

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB0 PSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVV
       :: ::...: ..:::: .::.:: :::::::::.:::...:: ::..  :::::::::..
CCDS32 PSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTS--GTPLIGVYFAL
             280       290       300       310         320         

             320       330        340       350       360       370
pF1KB0 CMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATS
       :..:.: :: :::::..:.:    : : .: ::. :.:.      :   .: ..  :.. 
CCDS32 CLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLH------C---NSPGRCCPTAP
     330       340       350       360                370       380

              380       390       400       410       420       430
pF1KB0 QATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLE
       :     . .. :   .:. :     : :.   .  : : :: :.  :  .   . :.   
CCDS32 QK----ENKGPGLTPTHLPGV----KEPEVSAGQMPGPAEAELT--GGSEWTRAQREHEA
                  390           400       410         420       430

              440       450       460       470        
pF1KB0 KRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ....  :.   ::. . ..: .::..::: . .  ::.. ::.     
CCDS32 QKQHSVEL---WLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT    
                 440       450       460       470     

>>CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3              (447 aa)
 initn: 968 init1: 667 opt: 929  Z-score: 1002.1  bits: 194.7 E(32554): 1.7e-49
Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (46-473:51-446)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB0 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
                                     ::. ::  ..  :: :.:.  . :::.:: 
CCDS32 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA
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pF1KB0 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
       . :.::...:.   : . :..:::..  .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:.  
CCDS32 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL
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pF1KB0 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE
        .::  .:...  ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . :
CCDS32 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE
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pF1KB0 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI
        . ..:.:...::::::::.     ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.:: 
CCDS32 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS
              210       220        230       240       250         

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pF1KB0 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA
       ::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::.  :::::.:::..:..
CCDS32 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS
     260       270       280       290       300         310       

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pF1KB0 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT
       :.:.:: ::.::. :.:    : : .: ::. :.:.  .   :         : : ....
CCDS32 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN
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pF1KB0 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR
       :     ..:   .:. ::    : : .  .    :::.   .  :  .      :..:  
CCDS32 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTK-----TQLMEL-
     370            380           390       400            410     

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pF1KB0 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
                :.. . ..: :::..::: . .  .:...::.     
CCDS32 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT    
                   420       430       440           

>>CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3             (441 aa)
 initn: 933 init1: 575 opt: 856  Z-score: 923.6  bits: 180.2 E(32554): 4e-45
Smith-Waterman score: 942; 38.3% identity (67.2% similar) in 433 aa overlap (46-473:51-440)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB0 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
                                     ::  ::: .   :: :.:.  . :::.:  
CCDS58 LQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDV--
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pF1KB0 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
                     : . :..::::. ..:::.:. . ..:.:::.: :..:: :.:.  
CCDS58 -------------VWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGL
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pF1KB0 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQ----DINISLWR
        .:. ..:...  ::..: . :.:::. :::: :::.:::.:.:.:..    :..  .:.
CCDS58 TAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWE
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pF1KB0 LPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLL
       . .   ..:......:::::::.     ..: ...: : .. :::.::::: .::..::.
CCDS58 ITD---ASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLS-RGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLV
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pF1KB0 PSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVV
       :: ::...: ..:::: .::.:: :::::::::.:::...:: ::..  :::::::::..
CCDS58 PSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTS--GTPLIGVYFAL
             250       260       270       280         290         

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pF1KB0 CMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATS
       :..:.: :: :::::..:.:    : : .: ::. :.:.      :   .: ..  :.. 
CCDS58 CLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLH------C---NSPGRCCPTAP
     300       310       320       330                340       350

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pF1KB0 QATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLE
       :     . .. :   .:. :     : :.   .  : : :: :.  :  .   . :.   
CCDS58 QK----ENKGPGLTPTHLPGV----KEPEVSAGQMPGPAEAELT--GGSEWTRAQREHEA
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pF1KB0 KRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ....  :.   ::. . ..: .::..::: . .  ::.. ::.     
CCDS58 QKQHSVEL---WLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT    
                 410       420       430       440     

>>CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3             (456 aa)
 initn: 964 init1: 575 opt: 856  Z-score: 923.4  bits: 180.2 E(32554): 4.1e-45
Smith-Waterman score: 942; 38.3% identity (67.2% similar) in 433 aa overlap (46-473:66-455)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB0 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
                                     ::  ::: .   :: :.:.  . :::.:  
CCDS58 TTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDV--
          40        50        60        70        80        90     

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pF1KB0 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
                     : . :..::::. ..:::.:. . ..:.:::.: :..:: :.:.  
CCDS58 -------------VWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGL
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pF1KB0 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQ----DINISLWR
        .:. ..:...  ::..: . :.:::. :::: :::.:::.:.:.:..    :..  .:.
CCDS58 TAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWE
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             200       210       220       230       240       250 
pF1KB0 LPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLL
       . .   ..:......:::::::.     ..: ...: : .. :::.::::: .::..::.
CCDS58 ITD---ASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLS-RGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLV
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pF1KB0 PSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVV
       :: ::...: ..:::: .::.:: :::::::::.:::...:: ::..  :::::::::..
CCDS58 PSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTS--GTPLIGVYFAL
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pF1KB0 CMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATS
       :..:.: :: :::::..:.:    : : .: ::. :.:.      :   .: ..  :.. 
CCDS58 CLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLH------C---NSPGRCCPTAP
          320       330       340       350                360     

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pF1KB0 QATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLE
       :     . .. :   .:. :     : :.   .  : : :: :.  :  .   . :.   
CCDS58 QK----ENKGPGLTPTHLPGV----KEPEVSAGQMPGPAEAELT--GGSEWTRAQREHEA
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pF1KB0 KRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
       ....  :.   ::. . ..: .::..::: . .  ::.. ::.     
CCDS58 QKQHSVEL---WLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT    
         420          430       440       450          

>>CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs108|chr11            (450 aa)
 initn: 723 init1: 272 opt: 776  Z-score: 837.4  bits: 164.2 E(32554): 2.5e-40
Smith-Waterman score: 825; 31.2% identity (64.2% similar) in 475 aa overlap (9-474:13-450)

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pF1KB0     MLLWVQQALLALLLPTLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWR
                   :: .:::.    .:.: .        :.:   :..:: ...::: :  
CCDS77 MGLRSHHLSLGLLLLFLLPAECLGAEGRLA--------LKLFRDLFANYTSALRPVADTD
               10        20        30                40        50  

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pF1KB0 KPTTVSIDVIVYAILNVDEKNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIW
       .  .:...: .  :...::.::::: :.: :: ::: .:.:.:. . ..  . ::.. .:
CCDS77 QTLNVTLEVTLSQIIDMDERNQVLTLYLWIRQEWTDAYLRWDPNAYGGLDAIRIPSSLVW
             60        70        80        90       100       110  

        120       130         140       150       160       170    
pF1KB0 VPDILINEFVDVGKSPNIPY--VYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLT
        :::.. . .:. . :.     : .::.: :.   :  . ..: .:.  ::::.:.:.::
CCDS77 RPDIVLYNKADA-QPPGSASTNVVLRHDGAVRWDAPAITRSSCRVDVAAFPFDAQHCGLT
            120        130       140       150       160       170 

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pF1KB0 FTSWLHTIQDINISLWRLPEKVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMES-SNYYAEMK
       : :: :  .....     :. . .. . :... ::..::.    : ...   :. : .. 
CCDS77 FGSWTHGGHQLDVR----PRGAAASLADFVENVEWRVLGMPARRRVLTYGCCSEPYPDVT
             180           190       200       210       220       

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pF1KB0 FYVVIRRRPLFYVVSLLLPSIFLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSD
       : ...:::   :: .:::: ... ..  ..:.:: .:::.::. .:.::. .:: .....
CCDS77 FTLLLRRRAAAYVCNLLLPCVLISLLAPLAFHLPADSGEKVSLGVTVLLALTVFQLLLAE
       230       240       250       260       270       280       

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB0 TLPATAIGTPLIGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQPVPAWLRHLVLERIAW
       ..:  : ..:::: :... :.....: : ::.:. : .     .::::: : :.: ..: 
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