FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0470, 991 aa 1>>>pF1KB0470 991 - 991 aa - 991 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5667+/-0.00094; mu= -1.8337+/- 0.057 mean_var=267.2823+/-53.300, 0's: 0 Z-trim(115.0): 38 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.078449 statistics sampled from 15532 (15564) to 15532 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16 Scan time: 4.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 991) 6783 781.4 0 CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 974) 6629 764.0 0 CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 954) 4732 549.3 1.3e-155 CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2 (1084) 2278 271.6 6.1e-72 CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1122) 2042 244.9 6.9e-64 CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1123) 2042 244.9 6.9e-64 CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025) 1937 233.0 2.4e-60 CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066) 1936 232.9 2.7e-60 CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069) 1936 232.9 2.7e-60 CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1011) 1849 223.0 2.4e-57 CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215) 738 97.3 2e-19 CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 ( 669) 717 94.8 6.2e-19 >>CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 (991 aa) initn: 6783 init1: 6783 opt: 6783 Z-score: 4161.2 bits: 781.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6783; 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96.3% identity (96.3% similar) in 991 aa overlap (1-991:1-954) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP :::::::::::::::::::::::::: CCDS41 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEA---------------------------------- 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 ---DSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB0 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB0 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KB0 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KB0 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 pF1KB0 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 900 pF1KB0 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG 810 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE 870 880 890 900 910 920 970 980 990 pF1KB0 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL 930 940 950 >>CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2 (1084 aa) initn: 2652 init1: 1650 opt: 2278 Z-score: 1405.1 bits: 271.6 E(32554): 6.1e-72 Smith-Waterman score: 2894; 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CCDS25 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLD-VTDSA--CSSAPGSGPSSPNN 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 pF1KB0 S------EHGPNPILGS---EALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA--PA- : :.: : . : :. :..:: .: :.::. : : :: ::::::: :. CCDS25 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 pF1KB0 ----RADSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS . :..: : :.: : .. . : :: . :: ..:.. :: ..::. . CCDS25 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA 370 380 390 400 410 420 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGP .:::.: ::: ::.: ::::. ..:.: : : ::.::.: ::: .: : CCDS25 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI 430 440 450 460 470 480 420 430 440 450 460 pF1KB0 MQPRLEQLKTHVQ-----------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD .: . . :. : : .: . ..:...:. . . :.:. . . : CCDS25 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD 490 500 510 520 530 540 470 480 490 pF1KB0 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL : .. .:.: : ::. : : :..: :.:: ::::. CCDS25 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART .. ... .:.. :::::::::::::: : .:. :: .. : CCDS25 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR----------- 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE :::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.:: CCDS25 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE 660 670 680 690 700 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS :::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::. CCDS25 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA 710 720 730 740 750 760 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ .::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::. CCDS25 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR 770 780 790 800 810 820 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF ..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : :: CCDS25 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF 830 840 850 860 870 880 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV :::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::.. CCDS25 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL 890 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 910 pF1KB0 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK ::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :. .:. CCDS25 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR 950 960 970 980 990 1000 920 930 940 950 960 970 pF1KB0 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL- :: ::.::.: :...::::: :.:: .: . .. ..::.:.:::.::::::. CCDS25 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 980 990 pF1KB0 AEDRPSEQLVEEEEPMNL :: ::.:. .::: :. CCDS25 AEKRPDEEPMEEEPPL 1070 1080 >>CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1122 aa) initn: 2406 init1: 2006 opt: 2042 Z-score: 1260.5 bits: 244.9 E(32554): 6.9e-64 Smith-Waterman score: 2462; 44.0% identity (67.1% similar) in 1024 aa overlap (58-989:123-1122) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL .:: .. :.. :.:::. : .: CCDS45 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR- 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT . ::. ::.: : .:.:::.::.::. :: .: : .:.:.. ..:... CCDS45 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL . ::. : . .:. ... . :. :.:. : : . ::::::.::::::. CCDS45 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 pF1KB0 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS : . :... :::..::::.... ....: .: : . .:: :.:.:: ::::.: CCDS45 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 pF1KB0 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA------- . : : . .: : .: ..: :.: : :: :.::: : CCDS45 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 pF1KB0 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR : .. ...:.. .: : . :. . .: :. :. :. : : CCDS45 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 400 pF1KB0 LQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS-GLHWPLSRTRSEPLPPS :: .:::. . ... :..:: : :. .. . :. : :. : :::::.: ::: : CCDS45 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS 450 460 470 480 490 500 410 420 430 440 450 pF1KB0 ATAPPP---PGPMQPRLEQLKTH-VQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLET--------- : : ::. : . .:. : .: .: :: : : CCDS45 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLL 510 520 530 540 550 560 460 470 480 490 pF1KB0 ---------DGGGPGQVVDDGLEHR-ELGHGQPEA--------RGPAPLQQHPQVLLWEQ .:. .. ... ::.. : :. : .: . .. :.. . CCDS45 GEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDL----E 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 pF1KB0 QRLAGRLPRGSTGDTVL--------LPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARV . :: : .. . : :: :. :.:.:::::::.....: : CCDS45 EPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQSSPAAPGGMKSP-P------ 630 640 650 660 670 550 560 570 580 590 600 pF1KB0 LSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCE . :.. : ::::..::. :::::: ::.. ::::::::::::::::: :: :.:: CCDS45 ----DQPVKHL-FTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCE 680 690 700 710 720 610 620 630 640 650 660 pF1KB0 CLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDT .:::::.:.:.:.:::: :.:::::.::.: :::. :: : ..:.:...:::::.:::. CCDS45 RIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDS 730 740 750 760 770 780 670 680 690 700 710 720 pF1KB0 DTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSV ::.:::.:::.:.: :.: . .::::::. :::::::..:::::::..:::::::::::: CCDS45 DTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSV 790 800 810 820 830 840 730 740 750 760 770 780 pF1KB0 AIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVD ::. . :::. ...:.::::::.::::::::.::.:::::::::::.:.::::::::: . CCDS45 AITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPE 850 860 870 880 890 900 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 EVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEG :::.: : :.::::::.::.:::.:: :::.::: ::::::.:::::.:::::::::.:: CCDS45 EVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEG 910 920 930 940 950 960 850 860 870 880 890 900 pF1KB0 HPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVD : .::::: :.:.:::..:.:::.:::: ::::::::::::::::::::::.:::. ... CCDS45 HLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQ 970 980 990 1000 1010 1020 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 PLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTA ::.: .::::.::. .:: ::...::.:.:.:..:. . .. ... ::.:.:.: CCDS45 PLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 970 980 990 pF1KB0 LASLSVGILAED---------RPSEQLVEEEEPMNL .: :::: . ::.:. .:.: . CCDS45 MALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL 1090 1100 1110 1120 >>CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1123 aa) initn: 2406 init1: 2006 opt: 2042 Z-score: 1260.5 bits: 244.9 E(32554): 6.9e-64 Smith-Waterman score: 2462; 44.0% identity (67.1% similar) in 1024 aa overlap (58-989:124-1123) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL .:: .. :.. :.:::. : .: CCDS32 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR- 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT . ::. ::.: : .:.:::.::.::. :: .: : .:.:.. ..:... CCDS32 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL . ::. : . .:. ... . :. :.:. : : . ::::::.::::::. CCDS32 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 pF1KB0 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS : . :... :::..::::.... ....: .: : . .:: :.:.:: ::::.: CCDS32 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 pF1KB0 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA------- . : : . .: : .: ..: :.: : :: :.::: : CCDS32 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS 330 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 pF1KB0 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR : .. ...:.. .: : . :. . .: :. :. :. : : CCDS32 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 400 pF1KB0 LQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS-GLHWPLSRTRSEPLPPS :: .:::. . ... :..:: : :. .. . :. : :. : :::::.: ::: : CCDS32 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS 450 460 470 480 490 500 410 420 430 440 450 pF1KB0 ATAPPP---PGPMQPRLEQLKTH-VQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLET--------- : : ::. : . .:. : .: .: :: : : CCDS32 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLL 510 520 530 540 550 560 460 470 480 490 pF1KB0 ---------DGGGPGQVVDDGLEHR-ELGHGQPEA--------RGPAPLQQHPQVLLWEQ .:. .. ... ::.. : :. : .: . .. :.. . CCDS32 GEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDL----E 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 pF1KB0 QRLAGRLPRGSTGDTVL--------LPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARV . :: : .. . : :: :. :.:.:::::::.....: : CCDS32 EPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQSSPAAPGGMKSP-P------ 630 640 650 660 670 550 560 570 580 590 600 pF1KB0 LSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCE . :.. : ::::..::. :::::: ::.. ::::::::::::::::: :: :.:: CCDS32 ----DQPVKHL-FTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCE 680 690 700 710 720 610 620 630 640 650 660 pF1KB0 CLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDT .:::::.:.:.:.:::: :.:::::.::.: :::. :: : ..:.:...:::::.:::. CCDS32 RIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDS 730 740 750 760 770 780 670 680 690 700 710 720 pF1KB0 DTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSV ::.:::.:::.:.: :.: . .::::::. :::::::..:::::::..:::::::::::: CCDS32 DTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSV 790 800 810 820 830 840 730 740 750 760 770 780 pF1KB0 AIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVD ::. . :::. ...:.::::::.::::::::.::.:::::::::::.:.::::::::: . CCDS32 AITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPE 850 860 870 880 890 900 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 EVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEG :::.: : :.::::::.::.:::.:: :::.::: ::::::.:::::.:::::::::.:: CCDS32 EVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEG 910 920 930 940 950 960 850 860 870 880 890 900 pF1KB0 HPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVD : .::::: :.:.:::..:.:::.:::: ::::::::::::::::::::::.:::. ... CCDS32 HLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQ 970 980 990 1000 1010 1020 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 PLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTA ::.: .::::.::. .:: ::...::.:.:.:..:. . .. ... ::.:.:.: CCDS32 PLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 970 980 990 pF1KB0 LASLSVGILAED---------RPSEQLVEEEEPMNL .: :::: . ::.:. .:.: . CCDS32 MALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL 1090 1100 1110 1120 >>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025 aa) initn: 2220 init1: 1879 opt: 1937 Z-score: 1196.9 bits: 233.0 E(32554): 2.4e-60 Smith-Waterman score: 2191; 43.8% identity (63.9% similar) in 998 aa overlap (61-988:83-1023) 40 50 60 70 80 pF1KB0 DTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEP-MRLSM ::. .:...: :: :::. .: ..: . CCDS83 IQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQEL-LAIKQQQELLEKEQKLEQ 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 DTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSP . :.. .::.: : ::.... ::::. ::::: : .:.: .: . : :.. CCDS83 QRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSK--SATKDT--PTNG 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 GIPYRTLEP-LETEGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSL . .: : .: .. :.. ::. . ..: .. : : . CCDS83 KNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSG--TSPSYKYTL--------------PGAQD 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 ERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALL . :: . ::. : :. :.::: .. .: . :.. : : .: .. CCDS83 AKDDFPLRKTESSVSS--SSPG-----SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLP-PTPHAEQMV 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 GQ-RLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-PARADSDRRTHPTLGPRGPIL--GSPH .: :. ..: :. ..: : :: ::::::: :.. ... . . : : : CCDS83 SQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVP- 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 TPLFLPHGLEPEAGGTLP-SRLQPILLLD---PSGSHAPLLTVPGL------------GP :: . ::..: : .: . :. :..:: :: : : CCDS83 ----LPG----QYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGG 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 pF1KB0 LPFHFAQSLMTTERLSGSGL--------HWPLSRTRSEPLPPSATAP-PPPGPMQPRLEQ .:.: . : : ::.: :. : ::.::.: ::: :. : : ::. CCDS83 VPLHPQSPLATKERIS-PGIRGTHKLPRHRPLNRTQSAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEK 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 pF1KB0 LKTHVQ------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETD----------GGGPGQVVDDGL : . : ....: . ..: . . :.:. : .:. . ... CCDS83 QKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSAC 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 pF1KB0 EHRELGH-GQPEARG-PAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRL------PRGSTGDTV-LLPLAQ ::. : ... :. .. :. :. . :. . : . . .: ::: CCDS83 VDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAA 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 pF1KB0 GG------HRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVML : :: .::..::::: . :.:: .. :. . ::. :: .:: CCDS83 VGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASV---LPHPA-----MDRPLQPGSA----TGIAYDPLML 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KB0 KHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLY :::: ::... ::::::::::::::::: :: ..:: ..::::::::.: ::::.: ::: CCDS83 KHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLY 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 pF1KB0 GTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLA :::::. ::: : : .:..: :::::.:::.::::::::::.::: :.: : .:: CCDS83 GTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELA 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 pF1KB0 FKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVH :::: ::::::::::::::::..::::::::::::::. . :..: . ::::::: ::: CCDS83 SKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVH 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 pF1KB0 HGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPM :::::::.:: :::.:::::::.:.::::::::: .:::.: :::.:.:.::.::::::: CCDS83 HGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPM 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 860 pF1KB0 GDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMN :: ::: ::: .: :.:.::.::.::::::::: ::: :::::.:.:::::..:.:::. CCDS83 GDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMT 850 860 870 880 890 900 870 880 890 900 910 920 pF1KB0 LAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIR :: : :::::::::::::::::::::: :::::...::.:. .:.::.::. ::. .:. CCDS83 LADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIE 910 920 930 940 950 960 930 940 950 960 970 980 pF1KB0 VHSKYWGCMQRLASCPDSWVPR---VPGAD-KEEVEAVTALASLSVGI----LAEDRPSE ..:::: .. .: ::: . ::. .::.:.:.:::::.: . :: . CCDS83 IQSKYWKSVRMVA------VPRGCALAGAQLQEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTA 970 980 990 1000 1010 990 pF1KB0 QLVEEEEPMNL :::: CCDS83 GEPMEEEPAL 1020 >>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066 aa) initn: 2265 init1: 1879 opt: 1936 Z-score: 1196.0 bits: 232.9 E(32554): 2.7e-60 Smith-Waterman score: 2350; 45.4% identity (65.5% similar) in 1027 aa overlap (59-988:75-1064) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL--FLAGLQQQRSVEP-M :. :. .:..:. .:: :::. .: . CCDS47 QLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKELLAIKQQQELLEKEQ 50 60 70 80 90 100 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 RLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVH .: .. :.. .::.: : ::.... ::::. ::::: : .:.: .: . : CCDS47 KLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSK--SATKDT-- 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 pF1KB0 PNSPGIPYRTLEP-LETEGATRSMLSSFLPPV----PS----LPS--DPPEHFPLRKTVS :.. . .: : .: .. :.. ::. :: ::. : . ::::::.: CCDS47 PTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTAS 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 EPNLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSP :::::.: . :... :::..::::.... :...: : . .:: :::: :.:: ::: CCDS47 EPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFE-VTESSVSSSS-PGSGPSSP 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 pF1KB0 NDSEHGP---------NPILGSEALLGQ-RLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-P :.. : : .: ...: :. ..: :. ..: : :: ::::::: : CCDS47 NNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVP 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPIL--GSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLP-SRLQPILLLD---PS .. ... . . : : : :: . ::..: : .: . :. :. CCDS47 SQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVP-----LPG----QYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN 340 350 360 370 380 360 370 380 390 pF1KB0 GSHAPLLTVPGL------------GPLPFHFAQSLMTTERLSGSGL--------HWPLSR .:: :: : : .:.: . : : ::.: :. : ::.: CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERIS-PGIRGTHKLPRHRPLNR 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 pF1KB0 TRSEPLPPSATAP-PPPGPMQPRLEQLKTHVQ------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAED :.: ::: :. : : ::. : . : ....: . ..: . . :. CCDS47 TQSAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEE 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 pF1KB0 LETDGG-----GPGQ----------VVDDGLEHRELGHGQPEARGPAPLQQHPQVLLWEQ :. : . .:.. ::: : ..: . . . :. .. :. :. CCDS47 LQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLG--QVGAVKVKEE-PVDSDEDAQIQEMES 510 520 530 540 550 560 500 510 520 530 pF1KB0 QRLAGRL------PRGSTGDTV-LLPLAQGG------HRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPA . :. . : . . .: ::: : :: .::..::::: . :.:: CCDS47 GEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASV---LPHPA 570 580 590 600 610 620 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 SQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGL .. :. . ::. :: .:::::: ::... ::::::::::::::::: :: CCDS47 -----MDRPLQPGSA----TGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGL 630 640 650 660 670 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 RSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGG ..:: ..::::::::.: ::::.: ::::::::. ::: : : .:..: ::::: CCDS47 LNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGG 680 690 700 710 720 730 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 VGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFC .:::.::::::::::.::: :.: : .:: :::: ::::::::::::::::..::::::: CCDS47 LGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFC 740 750 760 770 780 790 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 FFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPG :::::::. . :..: . ::::::: ::::::::::.:: :::.:::::::.:.:::::: CCDS47 FFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPG 800 810 820 830 840 850 780 790 800 810 820 830 pF1KB0 SGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGF ::: .:::.: :::.:.:.::.::::::::: ::: ::: .: :.:.::.::.::::::: CCDS47 SGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGF 860 870 880 890 900 910 840 850 860 870 880 890 pF1KB0 DAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALL :: ::: :::::.:.:::::..:.:::.:: : :::::::::::::::::::::: ::: CCDS47 DALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALL 920 930 940 950 960 970 900 910 920 930 940 950 pF1KB0 GNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPR---VPGAD- ::...::.:. .:.::.::. ::. .:...:::: .. .: ::: . ::. CCDS47 GNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVA------VPRGCALAGAQL 980 990 1000 1010 1020 960 970 980 990 pF1KB0 KEEVEAVTALASLSVGI----LAEDRPSEQLVEEEEPMNL .::.:.:.:::::.: . :: . :::: CCDS47 QEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL 1030 1040 1050 1060 >>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069 aa) initn: 2281 init1: 1879 opt: 1936 Z-score: 1196.0 bits: 232.9 E(32554): 2.7e-60 Smith-Waterman score: 2347; 45.5% identity (65.7% similar) in 1020 aa overlap (61-988:83-1067) 40 50 60 70 80 pF1KB0 DTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEP-MRLSM ::. .:...: :: :::. .: ..: . CCDS47 IQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQEL-LAIKQQQELLEKEQKLEQ 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 DTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSP . :.. .::.: : ::.... ::::. ::::: : .:.: .: . : :.. 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