Result of FASTA (ccds) for pF1KB0470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0470, 991 aa
  1>>>pF1KB0470 991 - 991 aa - 991 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5667+/-0.00094; mu= -1.8337+/- 0.057
 mean_var=267.2823+/-53.300, 0's: 0 Z-trim(115.0): 38  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.078449
 statistics sampled from 15532 (15564) to 15532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.478), width:  16
 Scan time:  4.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12         ( 991) 6783 781.4       0
CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 974) 6629 764.0       0
CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 954) 4732 549.3 1.3e-155
CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2           (1084) 2278 271.6 6.1e-72
CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1122) 2042 244.9 6.9e-64
CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1123) 2042 244.9 6.9e-64
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1025) 1937 233.0 2.4e-60
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1066) 1936 232.9 2.7e-60
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1069) 1936 232.9 2.7e-60
CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1011) 1849 223.0 2.4e-57
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX         (1215)  738 97.3   2e-19
CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22       ( 669)  717 94.8 6.2e-19


>>CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12              (991 aa)
 initn: 6783 init1: 6783 opt: 6783  Z-score: 4161.2  bits: 781.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6783; 100.0% identity (100.0% similar) in 991 aa overlap (1-991:1-991)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990 
pF1KB0 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
              970       980       990 

>>CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (974 aa)
 initn: 6626 init1: 6626 opt: 6629  Z-score: 4067.1  bits: 764.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6629; 99.9% identity (99.9% similar) in 973 aa overlap (19-991:3-974)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
                         :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81                 MHSP-GAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
                                10        20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP
           230       240       250       260       270       280   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
           290       300       310       320       330       340   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
           350       360       370       380       390       400   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
           410       420       430       440       450       460   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
           470       480       490       500       510       520   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
           530       540       550       560       570       580   

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
           590       600       610       620       630       640   

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
           650       660       670       680       690       700   

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
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              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
           770       780       790       800       810       820   

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pF1KB0 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
           830       840       850       860       870       880   

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
           890       900       910       920       930       940   

              970       980       990 
pF1KB0 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
           950       960       970    

>>CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (954 aa)
 initn: 4729 init1: 4729 opt: 4732  Z-score: 2906.9  bits: 549.3 E(32554): 1.3e-155
Smith-Waterman score: 6469; 96.3% identity (96.3% similar) in 991 aa overlap (1-991:1-954)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MHSPGADGTQVSPGAHYCSPTGAGCPRPCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLA
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pF1KB0 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVA
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pF1KB0 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLP
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB0 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSS
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pF1KB0 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAP
       ::::::::::::::::::::::::::                                  
CCDS41 SSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEA----------------------------------
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              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ---DSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPL
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              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQL
           330       340       350       360       370       380   

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pF1KB0 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAP
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pF1KB0 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPAS
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pF1KB0 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLR
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pF1KB0 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGV
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pF1KB0 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCF
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pF1KB0 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGS
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pF1KB0 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFD
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pF1KB0 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLG
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pF1KB0 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVE
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              970       980       990 
pF1KB0 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNL
           930       940       950    

>>CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2                (1084 aa)
 initn: 2652 init1: 1650 opt: 2278  Z-score: 1405.1  bits: 271.6 E(32554): 6.1e-72
Smith-Waterman score: 2894; 50.6% identity (71.7% similar) in 1006 aa overlap (59-989:100-1084)

       30        40        50        60        70             80   
pF1KB0 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
                                     :. :.  .::.:.     .::  .::. .:
CCDS25 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
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pF1KB0 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
        .: :       ::.   .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..:  .:
CCDS25 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
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               150         160       170        180       190      
pF1KB0 TVH---PNSPGIPYRTLE--PLETEGATRSMLS-SFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEP
       ...    ..:   :   .   :.  .  .: .: :.  :: ..  :  . ::::::.:::
CCDS25 NLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGM-YDAKDDFPLRKTASEP
     190       200       210       220       230        240        

        200        210       220         230       240       250   
pF1KB0 NLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPND
       ::::: . :... :::..::::....:   .:..:: . . ::.   ::.:.:: ::::.
CCDS25 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLD-VTDSA--CSSAPGSGPSSPNN
      250       260       270       280        290         300     

                 260          270       280       290         300  
pF1KB0 S------EHGPNPILGS---EALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA--PA-
       :      :.:  : . :   :. :..::  .: :.::. : :   :: :::::::  :. 
CCDS25 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA
         310       320       330       340       350       360     

                 310       320        330       340       350      
pF1KB0 ----RADSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS
           . :..: : :.:  :  .. . : :: .    :: ..:..    :: ..::.   .
CCDS25 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA
         370       380       390       400       410       420     

        360       370       380           390       400       410  
pF1KB0 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGP
       .:::.:  ::: ::.: ::::. ..:.: :      : ::.::.: ::: .: :      
CCDS25 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI
         430          440       450       460       470       480  

            420                  430       440       450       460 
pF1KB0 MQPRLEQLKTHVQ-----------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD
       .: . . :. : :           .: . ..:...:. .   . :.:.   .   .   :
CCDS25 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD
            490       500       510       520       530       540  

             470                        480                490     
pF1KB0 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL
        :  .. .:.:        :      ::. :    : :..:         :.:: ::::.
CCDS25 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI
            550       560       570       580       590       600  

         500       510       520        530       540       550    
pF1KB0 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART
              .. ... .:.. :::::::::::::: :   .:. :: .. :           
CCDS25 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR-----------
            610       620       630       640       650            

          560       570       580       590       600       610    
pF1KB0 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE
         :::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
CCDS25 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE
               660       670       680       690       700         

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB0 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS
       :::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
CCDS25 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA
     710       720       730       740        750       760        

          680       690       700       710       720       730    
pF1KB0 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ
       .::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
CCDS25 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR
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pF1KB0 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF
        ..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
CCDS25 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF
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pF1KB0 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
       :::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS25 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL
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pF1KB0 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK
       ::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :.  .:.
CCDS25 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR
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pF1KB0 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
       :: ::.::.: :...::::: :.:: .:     . ..   ..::.:.:::.::::::.  
CCDS25 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP
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pF1KB0 AEDRPSEQLVEEEEPMNL
       :: ::.:. .::: :.  
CCDS25 AEKRPDEEPMEEEPPL  
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>>CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1122 aa)
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CCDS45 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR-
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pF1KB0 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT
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CCDS45 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS
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pF1KB0 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL
       .  ::.  :  . .:.     ...  .   :.  :.:. : :  . ::::::.::::::.
CCDS45 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV
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pF1KB0 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS
       : . :... :::..::::....    ....: .:  : .  .::   :.:.:: ::::.:
CCDS45 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS
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pF1KB0 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-------
       .         :  : . .: :  .:    ..:   :.: :   :: :.::: :       
CCDS45 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS
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pF1KB0 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR
            :   .. ...:..  .:   : . :.  .   .:    :.  :. :. :    : 
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       :: .:::. . ... :..::  :  :.  .. . :. :  :.   : :::::.: ::: :
CCDS45 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS
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pF1KB0 ATAPPP---PGPMQPRLEQLKTH-VQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLET---------
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pF1KB0 ---------DGGGPGQVVDDGLEHR-ELGHGQPEA--------RGPAPLQQHPQVLLWEQ
                .:.  .. ... ::.. :   :. :         .: .  .. :..    .
CCDS45 GEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDL----E
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pF1KB0 QRLAGRLPRGSTGDTVL--------LPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARV
       .  ::     : .. .         : ::   :. :.:.:::::::.....: :      
CCDS45 EPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQSSPAAPGGMKSP-P------
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pF1KB0 LSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCE
           . :.. : ::::..::. :::::: ::..  ::::::::::::::::: :: :.::
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pF1KB0 CLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDT
        .:::::.:.:.:.:::: :.:::::.::.: :::. :: : ..:.:...:::::.:::.
CCDS45 RIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDS
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       ::.:::.:::.:.: :.: . .::::::. :::::::..:::::::..::::::::::::
CCDS45 DTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSV
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pF1KB0 AIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVD
       ::. . :::. ...:.::::::.::::::::.::.:::::::::::.:.::::::::: .
CCDS45 AITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPE
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pF1KB0 EVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEG
       :::.: : :.::::::.::.:::.:: :::.::: ::::::.:::::.:::::::::.::
CCDS45 EVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEG
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pF1KB0 HPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVD
       : .::::: :.:.:::..:.:::.:::: ::::::::::::::::::::::.:::. ...
CCDS45 HLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQ
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pF1KB0 PLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTA
       ::.:   .::::.::. .:: ::...::.:.:.:..:.     . .. ... ::.:.:.:
CCDS45 PLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSA
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pF1KB0 LASLSVGILAED---------RPSEQLVEEEEPMNL
       .: ::::    .         ::.:. .:.:  .  
CCDS45 MALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL  
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>>CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1123 aa)
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pF1KB0 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL
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CCDS32 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR-
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pF1KB0 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT
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CCDS32 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS
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pF1KB0 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL
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CCDS32 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV
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CCDS32 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS
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pF1KB0 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-------
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CCDS32 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS
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pF1KB0 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR
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CCDS32 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL
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       :: .:::. . ... :..::  :  :.  .. . :. :  :.   : :::::.: ::: :
CCDS32 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS
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CCDS32 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLL
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pF1KB0 ---------DGGGPGQVVDDGLEHR-ELGHGQPEA--------RGPAPLQQHPQVLLWEQ
                .:.  .. ... ::.. :   :. :         .: .  .. :..    .
CCDS32 GEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDL----E
         570       580       590       600       610       620     

            500               510       520       530       540    
pF1KB0 QRLAGRLPRGSTGDTVL--------LPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARV
       .  ::     : .. .         : ::   :. :.:.:::::::.....: :      
CCDS32 EPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQSSPAAPGGMKSP-P------
             630       640       650       660       670           

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB0 LSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCE
           . :.. : ::::..::. :::::: ::..  ::::::::::::::::: :: :.::
CCDS32 ----DQPVKHL-FTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCE
              680        690       700       710       720         

          610       620       630       640       650       660    
pF1KB0 CLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDT
        .:::::.:.:.:.:::: :.:::::.::.: :::. :: : ..:.:...:::::.:::.
CCDS32 RIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDS
     730       740       750       760       770       780         

          670       680       690       700       710       720    
pF1KB0 DTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSV
       ::.:::.:::.:.: :.: . .::::::. :::::::..:::::::..::::::::::::
CCDS32 DTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSV
     790       800       810       820       830       840         

          730       740       750       760       770       780    
pF1KB0 AIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVD
       ::. . :::. ...:.::::::.::::::::.::.:::::::::::.:.::::::::: .
CCDS32 AITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPE
     850       860       870       880       890       900         

          790       800       810       820       830       840    
pF1KB0 EVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEG
       :::.: : :.::::::.::.:::.:: :::.::: ::::::.:::::.:::::::::.::
CCDS32 EVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEG
     910       920       930       940       950       960         

          850       860       870       880       890       900    
pF1KB0 HPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVD
       : .::::: :.:.:::..:.:::.:::: ::::::::::::::::::::::.:::. ...
CCDS32 HLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQ
     970       980       990      1000      1010      1020         

          910       920       930       940       950       960    
pF1KB0 PLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTA
       ::.:   .::::.::. .:: ::...::.:.:.:..:.     . .. ... ::.:.:.:
CCDS32 PLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSA
    1030      1040      1050      1060      1070      1080         

          970                980       990 
pF1KB0 LASLSVGILAED---------RPSEQLVEEEEPMNL
       .: ::::    .         ::.:. .:.:  .  
CCDS32 MALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL  
    1090      1100      1110      1120     

>>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1025 aa)
 initn: 2220 init1: 1879 opt: 1937  Z-score: 1196.9  bits: 233.0 E(32554): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 2191; 43.8% identity (63.9% similar) in 998 aa overlap (61-988:83-1023)

               40        50        60        70        80          
pF1KB0 DTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEP-MRLSM
                                     ::.  .:...: ::  :::. .:  ..: .
CCDS83 IQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQEL-LAIKQQQELLEKEQKLEQ
             60        70        80        90        100       110 

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB0 DTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSP
       .    :..   .::.:  :  ::.... ::::. ::::: : .:.:  .: . :  :.. 
CCDS83 QRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSK--SATKDT--PTNG
             120       130       140       150         160         

     150        160       170       180       190       200        
pF1KB0 GIPYRTLEP-LETEGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSL
            . .: :   .: .. :..  ::. .  ..:  .. :              :  . 
CCDS83 KNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSG--TSPSYKYTL--------------PGAQD
       170       180       190         200                     210 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB0 ERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALL
        .   :: . ::.  :    :.     :.::: ..  .:  . :..   : :   .: ..
CCDS83 AKDDFPLRKTESSVSS--SSPG-----SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLP-PTPHAEQMV
             220         230            240       250        260   

      270        280       290        300       310       320      
pF1KB0 GQ-RLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-PARADSDRRTHPTLGPRGPIL--GSPH
       .: :. ..: :.  ..: :   :: ::::::: :.. ...   .     .   :  : : 
CCDS83 SQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVP-
           270       280       290       300       310       320   

          330       340        350          360                    
pF1KB0 TPLFLPHGLEPEAGGTLP-SRLQPILLLD---PSGSHAPLLTVPGL------------GP
           ::     . ::..: :  .: . :.   :..::  ::    :            : 
CCDS83 ----LPG----QYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGG
                    330       340       350       360       370    

      370       380               390       400        410         
pF1KB0 LPFHFAQSLMTTERLSGSGL--------HWPLSRTRSEPLPPSATAP-PPPGPMQPRLEQ
       .:.:  . : : ::.:  :.        : ::.::.: ::: :. :        :  ::.
CCDS83 VPLHPQSPLATKERIS-PGIRGTHKLPRHRPLNRTQSAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEK
          380       390        400       410       420       430   

     420             430       440       450                 460   
pF1KB0 LKTHVQ------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETD----------GGGPGQVVDDGL
        : . :      ....: .  ..:  .   . :.:. :          .:.  .  ... 
CCDS83 QKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSAC
           440       450       460       470       480       490   

           470         480       490             500        510    
pF1KB0 EHRELGH-GQPEARG-PAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRL------PRGSTGDTV-LLPLAQ
           ::. :  ...  :.  ..  :.   :. . :. .      :  . . .:   ::: 
CCDS83 VDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAA
           500       510       520       530       540       550   

                520       530       540       550       560        
pF1KB0 GG------HRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVML
        :      :: .::..::::: .    :.::     ..    :. .    ::. :: .::
CCDS83 VGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASV---LPHPA-----MDRPLQPGSA----TGIAYDPLML
           560       570          580            590           600 

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB0 KHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLY
       :::: ::... ::::::::::::::::: :: ..:: ..::::::::.: ::::.: :::
CCDS83 KHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLY
             610       620       630       640       650       660 

      630       640       650       660       670       680        
pF1KB0 GTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLA
       :::::.  :::   : :  .:..:  :::::.:::.::::::::::.::: :.: : .::
CCDS83 GTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELA
             670       680       690       700       710       720 

      690       700       710       720       730       740        
pF1KB0 FKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVH
        :::: ::::::::::::::::..::::::::::::::. . :..: . ::::::: :::
CCDS83 SKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVH
             730       740       750       760       770       780 

      750       760       770       780       790       800        
pF1KB0 HGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPM
       :::::::.:: :::.:::::::.:.::::::::: .:::.: :::.:.:.::.:::::::
CCDS83 HGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPM
             790       800       810       820       830       840 

      810       820       830       840       850       860        
pF1KB0 GDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMN
       :: ::: ::: .: :.:.::.::.::::::::: :::  :::::.:.:::::..:.:::.
CCDS83 GDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMT
             850       860       870       880       890       900 

      870       880       890       900       910       920        
pF1KB0 LAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIR
       :: : :::::::::::::::::::::: :::::...::.:.  .:.::.::. ::. .:.
CCDS83 LADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIE
             910       920       930       940       950       960 

      930       940       950           960       970           980
pF1KB0 VHSKYWGCMQRLASCPDSWVPR---VPGAD-KEEVEAVTALASLSVGI----LAEDRPSE
       ..::::  .. .:      :::   . ::. .::.:.:.:::::.: .      ::  . 
CCDS83 IQSKYWKSVRMVA------VPRGCALAGAQLQEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTA
             970             980       990      1000      1010     

              990 
pF1KB0 QLVEEEEPMNL
           ::::   
CCDS83 GEPMEEEPAL 
        1020      

>>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1066 aa)
 initn: 2265 init1: 1879 opt: 1936  Z-score: 1196.0  bits: 232.9 E(32554): 2.7e-60
Smith-Waterman score: 2350; 45.4% identity (65.5% similar) in 1027 aa overlap (59-988:75-1064)

       30        40        50        60        70          80      
pF1KB0 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL--FLAGLQQQRSVEP-M
                                     :. :.  .:..:.  .::  :::. .:  .
CCDS47 QLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKELLAIKQQQELLEKEQ
           50        60        70        80        90       100    

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB0 RLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVH
       .: ..    :..   .::.:  :  ::.... ::::. ::::: : .:.:  .: . :  
CCDS47 KLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSK--SATKDT--
          110       120       130       140       150         160  

         150        160       170               180         190    
pF1KB0 PNSPGIPYRTLEP-LETEGATRSMLSSFLPPV----PS----LPS--DPPEHFPLRKTVS
       :..      . .: :   .: .. :..  ::.    ::    ::.  :  . ::::::.:
CCDS47 PTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTAS
              170       180       190       200       210       220

          200        210       220         230       240       250 
pF1KB0 EPNLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSP
       :::::.: . :... :::..::::....    :...:  : . .:: :::: :.:: :::
CCDS47 EPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFE-VTESSVSSSS-PGSGPSSP
              230       240       250       260        270         

                      260       270        280       290        300
pF1KB0 NDSEHGP---------NPILGSEALLGQ-RLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-P
       :..  :           :   .: ...: :. ..: :.  ..: :   :: ::::::: :
CCDS47 NNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVP
      280       290       300       310       320       330        

              310       320         330       340        350       
pF1KB0 ARADSDRRTHPTLGPRGPIL--GSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLP-SRLQPILLLD---PS
       .. ...   .     .   :  : :     ::     . ::..: :  .: . :.   :.
CCDS47 SQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVP-----LPG----QYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
      340       350       360                370       380         

          360                   370       380               390    
pF1KB0 GSHAPLLTVPGL------------GPLPFHFAQSLMTTERLSGSGL--------HWPLSR
       .::  ::    :            : .:.:  . : : ::.:  :.        : ::.:
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERIS-PGIRGTHKLPRHRPLNR
     390       400       410       420       430        440        

          400        410       420             430       440       
pF1KB0 TRSEPLPPSATAP-PPPGPMQPRLEQLKTHVQ------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAED
       :.: ::: :. :        :  ::. : . :      ....: .  ..:  .   . :.
CCDS47 TQSAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEE
      450       460       470       480       490       500        

       450                      460       470       480       490  
pF1KB0 LETDGG-----GPGQ----------VVDDGLEHRELGHGQPEARGPAPLQQHPQVLLWEQ
       :. : .     .:..           ::: :   ..:  . . . :.  ..  :.   :.
CCDS47 LQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLG--QVGAVKVKEE-PVDSDEDAQIQEMES
      510       520       530       540         550        560     

                  500        510             520       530         
pF1KB0 QRLAGRL------PRGSTGDTV-LLPLAQGG------HRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPA
        . :. .      :  . . .:   :::  :      :: .::..::::: .    :.::
CCDS47 GEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASV---LPHPA
         570       580       590       600       610          620  

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB0 SQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGL
            ..    :. .    ::. :: .:::::: ::... ::::::::::::::::: ::
CCDS47 -----MDRPLQPGSA----TGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGL
                 630           640       650       660       670   

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB0 RSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGG
        ..:: ..::::::::.: ::::.: ::::::::.  :::   : :  .:..:  :::::
CCDS47 LNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGG
           680       690       700       710       720       730   

     660       670       680       690       700       710         
pF1KB0 VGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFC
       .:::.::::::::::.::: :.: : .:: :::: ::::::::::::::::..:::::::
CCDS47 LGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFC
           740       750       760       770       780       790   

     720       730       740       750       760       770         
pF1KB0 FFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPG
       :::::::. . :..: . ::::::: ::::::::::.:: :::.:::::::.:.::::::
CCDS47 FFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPG
           800       810       820       830       840       850   

     780       790       800       810       820       830         
pF1KB0 SGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGF
       ::: .:::.: :::.:.:.::.::::::::: ::: ::: .: :.:.::.::.:::::::
CCDS47 SGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGF
           860       870       880       890       900       910   

     840       850       860       870       880       890         
pF1KB0 DAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALL
       :: :::  :::::.:.:::::..:.:::.:: : :::::::::::::::::::::: :::
CCDS47 DALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALL
           920       930       940       950       960       970   

     900       910       920       930       940       950         
pF1KB0 GNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPR---VPGAD-
       ::...::.:.  .:.::.::. ::. .:...::::  .. .:      :::   . ::. 
CCDS47 GNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVA------VPRGCALAGAQL
           980       990      1000      1010            1020       

         960       970           980       990 
pF1KB0 KEEVEAVTALASLSVGI----LAEDRPSEQLVEEEEPMNL
       .::.:.:.:::::.: .      ::  .     ::::   
CCDS47 QEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL 
      1030      1040      1050      1060       

>>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1069 aa)
 initn: 2281 init1: 1879 opt: 1936  Z-score: 1196.0  bits: 232.9 E(32554): 2.7e-60
Smith-Waterman score: 2347; 45.5% identity (65.7% similar) in 1020 aa overlap (61-988:83-1067)

               40        50        60        70        80          
pF1KB0 DTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEP-MRLSM
                                     ::.  .:...: ::  :::. .:  ..: .
CCDS47 IQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQEL-LAIKQQQELLEKEQKLEQ
             60        70        80        90        100       110 

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB0 DTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSP
       .    :..   .::.:  :  ::.... ::::. ::::: : .:.:  .: . :  :.. 
CCDS47 QRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSK--SATKDT--PTNG
             120       130       140       150         160         

     150        160       170               180         190        
pF1KB0 GIPYRTLEP-LETEGATRSMLSSFLPPV----PS----LPS--DPPEHFPLRKTVSEPNL
            . .: :   .: .. :..  ::.    ::    ::.  :  . ::::::.:::::
CCDS47 KNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTASEPNL
       170       180       190       200       210       220       

      200        210       220         230       240       250     
pF1KB0 KLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPNDSE
       :.: . :... :::..::::....    :...:  : . .:: :::: :.:: ::::.. 
CCDS47 KVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFE-VTESSVSSSS-PGSGPSSPNNGP
       230       240       250       260        270        280     

                  260       270        280       290        300    
pF1KB0 HGP---------NPILGSEALLGQ-RLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-PARAD
        :           :   .: ...: :. ..: :.  ..: :   :: ::::::: :.. .
CCDS47 TGSVTENETSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLN
         290       300       310       320       330       340     

          310       320         330       340        350           
pF1KB0 SDRRTHPTLGPRGPIL--GSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLP-SRLQPILLLD---PSGSHA
       ..   .     .   :  : :     ::     . ::..: :  .: . :.   :..:: 
CCDS47 ASNSLKEKQKCETQTLRQGVP-----LPG----QYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQ
         350       360                370       380       390      

      360                   370       380               390        
pF1KB0 PLLTVPGL------------GPLPFHFAQSLMTTERLSGSGL--------HWPLSRTRSE
        ::    :            : .:.:  . : : ::.:  :.        : ::.::.: 
CCDS47 ALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERIS-PGIRGTHKLPRHRPLNRTQSA
        400       410       420       430        440       450     

      400        410       420             430       440       450 
pF1KB0 PLPPSATAP-PPPGPMQPRLEQLKTHVQ------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETD
       ::: :. :        :  ::. : . :      ....: .  ..:  .   . :.:. :
CCDS47 PLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEELQGD
         460       470       480       490       500       510     

                       460       470         480       490         
pF1KB0 ----------GGGPGQVVDDGLEHRELGH-GQPEARG-PAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRL
                 .:.  .  ...     ::. :  ...  :.  ..  :.   :. . :. .
CCDS47 QAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQIQEMESGEQAAFM
         520       530       540       550       560       570     

           500        510             520       530       540      
pF1KB0 ------PRGSTGDTV-LLPLAQGG------HRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLS
             :  . . .:   :::  :      :: .::..::::: .    :.::     ..
CCDS47 QQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASV---LPHPA-----MD
         580       590       600       610       620               

        550       560       570       580       590       600      
pF1KB0 SSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECL
           :. .    ::. :: .:::::: ::... ::::::::::::::::: :: ..:: .
CCDS47 RPLQPGSA----TGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERI
       630           640       650       660       670       680   

        610       620       630       640       650       660      
pF1KB0 RGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDT
       .::::::::.: ::::.: ::::::::.  :::   : :  .:..:  :::::.:::.::
CCDS47 QGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDT
           690       700       710       720       730       740   

        670       680       690       700       710       720      
pF1KB0 IWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAI
       ::::::::.::: :.: : .:: :::: ::::::::::::::::..::::::::::::::
CCDS47 IWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI
           750       760       770       780       790       800   

        730       740       750       760       770       780      
pF1KB0 ACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEV
       . . :..: . ::::::: ::::::::::.:: :::.:::::::.:.::::::::: .::
CCDS47 TAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEV
           810       820       830       840       850       860   

        790       800       810       820       830       840      
pF1KB0 GAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHP
       :.: :::.:.:.::.::::::::: ::: ::: .: :.:.::.::.::::::::: ::: 
CCDS47 GTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHT
           870       880       890       900       910       920   

        850       860       870       880       890       900      
pF1KB0 APLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPL
        :::::.:.:::::..:.:::.:: : :::::::::::::::::::::: :::::...::
CCDS47 PPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPL
           930       940       950       960       970       980   

        910       920       930       940       950           960  
pF1KB0 SEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPR---VPGAD-KEEVEAV
       .:.  .:.::.::. ::. .:...::::  .. .:      :::   . ::. .::.:.:
CCDS47 AEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVA------VPRGCALAGAQLQEETETV
           990      1000      1010            1020      1030       

            970           980       990 
pF1KB0 TALASLSVGI----LAEDRPSEQLVEEEEPMNL
       .:::::.: .      ::  .     ::::   
CCDS47 SALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL 
      1040      1050      1060          

>>CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1011 aa)
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