Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0481
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0481, 521 aa
1>>>pF1KB0481 521 - 521 aa - 521 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4838+/-0.00101; mu= 17.2533+/- 0.061
mean_var=69.1734+/-13.673, 0's: 0 Z-trim(104.2): 76 B-trim: 58 in 1/50
Lambda= 0.154207
statistics sampled from 7694 (7770) to 7694 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32291.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 521) 3524 793.5 0
CCDS45303.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 363) 2418 547.3 1.1e-155
CCDS6393.1 CYP11B2 gene_id:1585|Hs108|chr8 ( 503) 1198 276.0 7e-74
CCDS6392.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 ( 503) 1154 266.2 6.2e-71
CCDS34953.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 ( 437) 901 209.9 4.9e-54
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 869 202.8 7.7e-52
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 774 181.7 1.8e-45
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 741 174.3 3e-43
CCDS46616.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 448) 622 147.8 2.4e-35
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 596 142.0 1.1e-33
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 363 90.2 5.9e-18
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 358 89.1 1.3e-17
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 355 88.4 2e-17
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 346 86.4 8.1e-17
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 338 84.7 2.8e-16
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 331 83.1 8.5e-16
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 330 82.9 9.8e-16
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 327 82.2 1.6e-15
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 320 80.6 3.6e-15
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 312 78.9 1.6e-14
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 312 78.9 1.6e-14
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 311 78.7 1.8e-14
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 311 78.7 1.8e-14
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 311 78.7 1.9e-14
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 305 77.3 4.7e-14
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 304 77.1 5.4e-14
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 302 76.7 7.1e-14
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 299 76.0 1.1e-13
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 295 75.1 2.1e-13
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 287 73.3 7.1e-13
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 287 73.3 7.5e-13
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 281 72.0 1.8e-12
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 280 71.8 2.3e-12
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 278 71.3 2.9e-12
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 276 70.9 4e-12
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 271 69.7 8e-12
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 271 69.8 9e-12
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 271 69.8 9.6e-12
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 269 69.3 1.1e-11
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 267 68.9 1.7e-11
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 257 66.6 6.5e-11
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 257 66.6 7.2e-11
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 255 66.2 9.4e-11
>>CCDS32291.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 (521 aa)
initn: 3524 init1: 3524 opt: 3524 Z-score: 4236.3 bits: 793.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3524; 100.0% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MLAKGLPPRSVLVKGCQTFLSAPREGLGRLRVPTGEGAGISTRSPRPFNEIPSPGDNGWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLAKGLPPRSVLVKGCQTFLSAPREGLGRLRVPTGEGAGISTRSPRPFNEIPSPGDNGWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLYHFWRETGTHKVHLHHVQNFQKYGPIYREKLGNVESVYVIDPEDVALLFKSEGPNPER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLYHFWRETGTHKVHLHHVQNFQKYGPIYREKLGNVESVYVIDPEDVALLFKSEGPNPER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 FLIPPWVAYHQYYQRPIGVLLKKSAAWKKDRVALNQEVMAPEATKNFLPLLDAVSRDFVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLIPPWVAYHQYYQRPIGVLLKKSAAWKKDRVALNQEVMAPEATKNFLPLLDAVSRDFVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VLHRRIKKAGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLHRRIKKAGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 FHTSVPMLNLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FHTSVPMLNLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ILYRLLGDSKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILYRLLGDSKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 HQAQGDMATMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HQAQGDMATMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 ALGREPTFFFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALGREPTFFFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINML
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB0 ENFRVEIQHLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENFRVEIQHLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
490 500 510 520
>>CCDS45303.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 (363 aa)
initn: 2418 init1: 2418 opt: 2418 Z-score: 2908.8 bits: 547.3 E(32554): 1.1e-155
Smith-Waterman score: 2418; 100.0% identity (100.0% similar) in 363 aa overlap (159-521:1-363)
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 YHQYYQRPIGVLLKKSAAWKKDRVALNQEVMAPEATKNFLPLLDAVSRDFVSVLHRRIKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAPEATKNFLPLLDAVSRDFVSVLHRRIKK
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 AGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQMFHTSVPML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQMFHTSVPML
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 NLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYRGILYRLLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYRGILYRLLGD
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 SKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAARHQAQGDMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAARHQAQGDMA
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 TMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAIYALGREPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAIYALGREPTF
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 FFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINMLENFRVEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINMLENFRVEIQ
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520
pF1KB0 HLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
340 350 360
>>CCDS6393.1 CYP11B2 gene_id:1585|Hs108|chr8 (503 aa)
initn: 1173 init1: 618 opt: 1198 Z-score: 1439.8 bits: 276.0 E(32554): 7e-74
Smith-Waterman score: 1198; 38.9% identity (69.0% similar) in 496 aa overlap (20-515:11-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MLAKGLPPRSVLVKGCQTFLSAPREGLGRLRVPTGEGAGISTRSPRPFNEIPSPGDNGWL
..:: .: : :. : :. . :. ::. .:. : ::
CCDS63 MALRAKAEVCVAAPWLSLQRARA-LGTRAARAPRTVLPFEAMPQHPGNRWL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLYHFWRETGTHKVHLHHVQNFQKYGPIYREKLGNVESVYVIDPEDVALLFKSEGPNPER
: ..::: : ...::. :.::. :::.: .::. . : :. :::: : . .. .: :
CCDS63 RLLQIWREQGYEHLHLEMHQTFQELGPIFRYNLGGPRMVCVMLPEDVEKLQQVDSLHPCR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 FLIPPWVAYHQYYQRPIGVLLKKSAAWKKDRVALNQEVMAPEATKNFLPLLDAVSRDFVS
... :::::.:. . ::.: .. :. .:. :: .:..:.:.. :::..:::.::: .
CCDS63 MILEPWVAYRQHRGHKCGVFLLNGPEWRFNRLRLNPDVLSPKAVQRFLPMVDAVARDFSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VLHRRIKKAGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQM
.:.... . . :. . :.. ..:....:. . ..:::: :.. . . . :. :. :
CCDS63 ALKKKVLQNARGSLTLDVQPSIFHYTIEASNLALFGERLGLVGHSPSSASLNFLHALEVM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 FHTSVPMLNLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYRG
:...: .. .: .: : . :.::.: ::: ::. .: :..: :: . : : :
CCDS63 FKSTVQLMFMPRSLSRWISPKVWKEHFEAWDCIFQYGDNCIQKIYQELAFNRPQH--YTG
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ILYRLLGDSKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAAR
:. .:: ...:.: :::: :. ::.::::.. : :.:.::: ::..:: : :::
CCDS63 IVAELLLKAELSLEAIKANSMELTAGSVDTTAFPLLMTLFELARNPDVQQILRQESLAAA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 HQAQGDMATMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAIY
. . .:::.:..::::::.:... :.: . .::::..: ::: ::::: .:
CCDS63 ASISEHPQKATTELPLLRAALKETLRLYPVGLFLERVVSSDLVLQNYHIPAGTLVQVFLY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 ALGREPTFFFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINML
.:::. ..: :: ..: :::. . :... ::.:.:::::::.:: :: ..: ..:
CCDS63 SLGRNAALFPRPERYNPQRWLDIRGSGRNFHHVPFGFGMRQCLGRRLAEAEMLLLLHHVL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520
pF1KB0 ENFRVEIQHLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
..: :: :. ....:: : .:: .:
CCDS63 KHFLVETLTQEDIKMVYSFILRPGTSPLLTFRAIN
470 480 490 500
>>CCDS6392.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 (503 aa)
initn: 1138 init1: 610 opt: 1154 Z-score: 1386.9 bits: 266.2 E(32554): 6.2e-71
Smith-Waterman score: 1154; 38.4% identity (68.2% similar) in 497 aa overlap (20-515:11-503)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MLAKGLPPRSVLVKGCQTFLSAPREGLGRLRVPTGEGAGISTRSPRPFNEIPS-PGDNGW
...: .: : .. : :. :. ::. .: :: : :
CCDS63 MALRAKAEVCMAVPWLSLQRAQA-LGTRAARVPRTVLPFEAMPRRPG-NRW
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 LNLYHFWRETGTHKVHLHHVQNFQKYGPIYREKLGNVESVYVIDPEDVALLFKSEGPNPE
: : ..::: : . .::. :.::. :::.: ::.. : :. :::: : . .. .:.
CCDS63 LRLLQIWREQGYEDLHLEVHQTFQELGPIFRYDLGGAGMVCVMLPEDVEKLQQVDSLHPH
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 RFLIPPWVAYHQYYQRPIGVLLKKSAAWKKDRVALNQEVMAPEATKNFLPLLDAVSRDFV
:. . :::::.:. . ::.: .. :. .:. :: ::..:.:.. :::..:::.:::
CCDS63 RMSLEPWVAYRQHRGHKCGVFLLNGPEWRFNRLRLNPEVLSPNAVQRFLPMVDAVARDFS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 SVLHRRIKKAGSGNYSGDISDDLFRFAFESITNVIFGERQGMLEEVVNPEAQRFIDAIYQ
..:.... . . :. . :.. ..:....:. . ..:::: :.. . . . :. :.
CCDS63 QALKKKVLQNARGSLTLDVQPSIFHYTIEASNLALFGERLGLVGHSPSSASLNFLHALEV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 MFHTSVPMLNLPPDLFRLFRTKTWKDHVAAWDVIFSKADIYTQNFYWELRQKGSVHHDYR
::...: .. .: .: : :.::.: ::: ::. .: :..: :: : ..:
CCDS63 MFKSTVQLMFMPRSLSRWTSPKVWKEHFEAWDCIFQYGDNCIQKIYQEL--AFSRPQQYT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 GILYRLLGDSKMSFEDIKANVTEMLAGGVDTTSMTLQWHLYEMARNLKVQDMLRAEVLAA
.:. .:: ....: . :::: :. ::.:::: . : :.:.::: .::. :: : :::
CCDS63 SIVAELLLNAELSPDAIKANSMELTAGSVDTTVFPLLMTLFELARNPNVQQALRQESLAA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 RHQAQGDMATMLQLVPLLKASIKETLRLHPISVTLQRYLVNDLVLRDYMIPAKTLVQVAI
. . .:::.:..::::::.:... :.: .::::..: ::: :::.: .
CCDS63 AASISEHPQKATTELPLLRAALKETLRLYPVGLFLERVASSDLVLQNYHIPAGTLVRVFL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 YALGREPTFFFDPENFDPTRWLSKDKNITYFRNLGFGWGVRQCLGRRIAELEMTIFLINM
:.:::.:..: :: ..: :::. . : .. ::.:.:::::::.:: :: ..: ..
CCDS63 YSLGRNPALFPRPERYNPQRWLDIRGSGRNFYHVPFGFGMRQCLGRRLAEAEMLLLLHHV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB0 LENFRVEIQHLSDVGTTFNLILMPEKPISFTFWPFNQEATQQ
:....:: :. ....:: : .:: .:
CCDS63 LKHLQVETLTQEDIKMVYSFILRPSMFPLLTFRAIN
470 480 490 500
>>CCDS34953.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 882 init1: 610 opt: 901 Z-score: 1083.7 bits: 209.9 E(32554): 4.9e-54
Smith-Waterman score: 901; 36.3% identity (66.5% similar) in 421 aa overlap (20-435:11-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MLAKGLPPRSVLVKGCQTFLSAPREGLGRLRVPTGEGAGISTRSPRPFNEIPSPGDNGWL
...: .: : .. : :. :. ::. .: : ::
CCDS34 MALRAKAEVCMAVPWLSLQRAQA-LGTRAARVPRTVLPFEAMPRRPGNRWL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLYHFWRETGTHKVHLHHVQNFQKYGPIYREKLGNVESVYVIDPEDVALLFKSEGPNPER
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CCDS34 TLTQEDIKMVYSFILRPSMFPLLTFRAIN
410 420 430
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10 20 30 40 50
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..: ... . : ..: .::. ..::.. ..:.:..::: : : :...:::
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..: . : : ..: .. ..: .::::.: .::::.: ::.: :::..:. .::
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10 20 30 40
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520
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..: ......: . . ... .. ..:.:.: ... :
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10 20 30 40
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CCDS33 VSGGLLTYLFLSQALTLQEIYANVTEMLLAGVDTTSFTLSWTVYLLARHPEVQQTVYREI
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CCDS33 LCHYATSYQDENFPRAKEFRPERWLRKGDLDRVDNFGSIPFGHGVRSCIGRRIAELEIHL
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CCDS33 VVIQLLQHFEIKTSSQTNAVHAKTHGLLTPGGPIHVRFVNRK
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521 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]