Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0494
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0494, 1039 aa
1>>>pF1KB0494 1039 - 1039 aa - 1039 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7127+/-0.000924; mu= 14.8669+/- 0.055
mean_var=99.1995+/-20.085, 0's: 0 Z-trim(107.8): 35 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.128771
statistics sampled from 9776 (9806) to 9776 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 4.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 7083 1327.0 0
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 2227 424.9 4.4e-118
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 2058 393.5 1.2e-108
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 1947 372.9 2e-102
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 1858 356.3 1.8e-97
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 1584 305.4 3.8e-82
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 721 145.1 7.3e-34
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 655 132.9 3.5e-30
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 646 131.2 1.1e-29
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 528 109.3 4.9e-23
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 508 105.6 6.6e-22
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 490 102.2 6.5e-21
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 481 100.6 2.1e-20
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 462 97.0 2.4e-19
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 451 95.0 9.9e-19
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1073) 430 91.1 1.4e-17
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1091) 430 91.1 1.4e-17
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 425 90.1 2.6e-17
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 412 87.7 1.5e-16
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 ( 954) 336 73.6 2.3e-12
>>CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039 aa)
initn: 7083 init1: 7083 opt: 7083 Z-score: 7109.1 bits: 1327.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7083; 100.0% identity (100.0% similar) in 1039 aa overlap (1-1039:1-1039)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPPAWALNLDPVQLTFYAGPNGSQFGFSLDFHKDS
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CCDS32 MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPPAWALNLDPVQLTFYAGPNGSQFGFSLDFHKDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 HGRVAIVVGAPRTLGPSQEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRDETRNVGSQTLQTFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HGRVAIVVGAPRTLGPSQEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRDETRNVGSQTLQTFKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 RQGLGASVVSWSDVIVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPVGSCFLAQPESGRRAEYSPCRGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQGLGASVVSWSDVIVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPVGSCFLAQPESGRRAEYSPCRGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGGYYFLGLLAQAPVADIFSSYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGGYYFLGLLAQAPVADIFSSYRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 GILLWHVSSQSLSFDSSNPEYFDGYWGYSVAVGEFDGDLNTTEYVVGAPTWSWTLGAVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GILLWHVSSQSLSFDSSNPEYFDGYWGYSVAVGEFDGDLNTTEYVVGAPTWSWTLGAVEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LDSYYQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMESRADRKLAEVGRVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDSYYQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMESRADRKLAEVGRVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LFLQPRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDRDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLQPRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDRDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 LVFLGQSEGLRSRPSQVLDSPFPTGSAFGFSLRGAVDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LVFLGQSEGLRSRPSQVLDSPFPTGSAFGFSLRGAVDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 AQPVVKASVQLLVQDSLNPAVKSCVLPQTKTPVSCFNIQMCVGATGHNIPQKLSLNAELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQPVVKASVQLLVQDSLNPAVKSCVLPQTKTPVSCFNIQMCVGATGHNIPQKLSLNAELQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 LDRQKPRQGRRVLLLGSQQAGTTLNLDLGGKHSPICHTTMAFLRDEADFRDKLSPIVLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDRQKPRQGRRVLLLGSQQAGTTLNLDLGGKHSPICHTTMAFLRDEADFRDKLSPIVLSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 NVSLPPTEAGMAPAVVLHGDTHVQEQTRIVLDCGEDDVCVPQLQLTASVTGSPLLVGADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVSLPPTEAGMAPAVVLHGDTHVQEQTRIVLDCGEDDVCVPQLQLTASVTGSPLLVGADN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 VLELQMDAANEGEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLICNQKKENETRVVLCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLELQMDAANEGEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLICNQKKENETRVVLCEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 GNPMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVSFQLQIRSKNSQNPNSKIVLLDVPVRAEAQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GNPMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVSFQLQIRSKNSQNPNSKIVLLDVPVRAEAQVE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 LRGNSFPASLVVAAEEGEREQNSLDSWGPKVEHTYELHNNGPGTVNGLHLSIHLPGQSQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRGNSFPASLVVAAEEGEREQNSLDSWGPKVEHTYELHNNGPGTVNGLHLSIHLPGQSQP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 SDLLYILDIQPQGGLQCFPQPPVNPLKVDWGLPIPSPSPIHPAHHKRDRRQIFLPEPEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDLLYILDIQPQGGLQCFPQPPVNPLKVDWGLPIPSPSPIHPAHHKRDRRQIFLPEPEQP
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910 920 930 940 950 960
pF1KB0 SRLQDPVLVSCDSAPCTVVQCDLQEMARGQRAMVTVLAFLWLPSLYQRPLDQFVLQSHAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLQDPVLVSCDSAPCTVVQCDLQEMARGQRAMVTVLAFLWLPSLYQRPLDQFVLQSHAW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 FNVSSLPYAVPPLSLPRGEAQVWTQLLRALEERAIPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FNVSSLPYAVPPLSLPRGEAQVWTQLLRALEERAIPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWK
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB0 VGFFKRNRPPLEEDDEEGE
:::::::::::::::::::
CCDS32 VGFFKRNRPPLEEDDEEGE
1030
>>CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063 aa)
initn: 1979 init1: 509 opt: 2227 Z-score: 2233.4 bits: 424.9 E(32554): 4.4e-118
Smith-Waterman score: 2495; 40.1% identity (67.8% similar) in 1062 aa overlap (6-1037:22-1053)
10 20 30 40
pF1KB0 MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPPAWALNLDPVQLTFYAG
: :: .: : .: :.::: .:: :.:
CCDS31 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLW---------SPACQAFNLDVEKLTVYSG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 PNGSQFGFSLDFHKDSHGRVAIVVGAPR--TLGPSQEETGGVFLCPWRAEGG-QCPSLLF
:.:: ::...::: . ....::::. : :. : :.:. ::: :::. :: .. :
CCDS31 PKGSYFGYAVDFHIPDARTASVLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB0 DLRD--ETRNVGSQTLQTFKARQGLGASVVSWSDVIVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPVG
: . . : :.. ::. : .::.: . . .::::: :: .:. : : : :::
CCDS31 DTTNNRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPE--KDPVG
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 SCFLAQPESGRRAEYSPCRGNTLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGG
.:..: . . ::.::::.. : . ::.:::: . :.:..:.::.
CCDS31 TCYVAIQNFSAYAEFSPCRNS--------NADPEGQGYCQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGS
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 YYFLGLLAQAPVADIFSSYRPGILLWHVSSQSLSFDSSNPEYFDGYWGYSVAVGEFDGDL
.:. : . : ::::...: .: ...... . . . : :.: :::::.::: ::
CCDS31 FYWQGQVITASVADIIANYSFKDILRKLAGEKQT-EVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGD-
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 NTTEYVVGAPTWSWTLGAVEILDSYYQR-LHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLL
. : :.: : . ..: : :..: . .. . :::::::::..:.:.:::.:: :.:
CCDS31 SQQELVAGIPRGAQNFGYVSIINSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVL
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 VGAPLYMESRADRKLAEVGRVYLFLQPRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLD
:::::.:: . . . :::..::.:: . : .::::. .::::::.: ::::.
CCDS31 VGAPLFMEREFESNPREVGQIYLYLQVSS--LLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGDLN
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 RDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQVLVFLGQSEGLRSRPSQVLDSPFPTG---SAFGFSLRGA
.:::::::...:..: . ::.::.. :...:: ..:::::.. . . :.:::.:::
CCDS31 QDGYNDIAIGVPFAGKDQRGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGD
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB0 VDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYRAQPVVKASVQLLVQDSL-NPAVKSCVLPQTKTPVS
::: : ::::::::.:...::::::.::: ...:::.. . : :.: .:.. : ..
CCDS31 SDIDKNDYPDLIVGAFGTGKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAA
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB0 CFNIQMCVGATGHNIPQKLSLNAELQLDRQKPRQG-RRVLLLGSQQAGTTLNLDLGGKHS
::....:...::..: . . : ::.::: : . . .:.:.: ..:: .. : . ..:
CCDS31 CFSLRVCASVTGQSIANTIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKS
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KB0 PICHTTMAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLPPT--EAGMA--PAVVLHGDTHVQEQTRI
:. ...::::..:::::::: .::: :: . . :. : . . .. :.::..:
CCDS31 HQCQDFIVYLRDETEFRDKLSPINISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHI
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KB0 VLDCGEDDVCVPQLQLTASVTGSPLLVGADNVLELQMDAANEGEGAYEAELAVHLPQGAH
..:::::..:::.:.:.: ...: .: : : ..: ::::::::::: : .:. :
CCDS31 LVDCGEDNLCVPDLKLSARPDKHQVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEAD
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KB0 YMRALSNVEGFERLICNQKKENETRVVLCELGNPMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVS
:. : .::. : :. : :: ::.:.:.::::: .... .... .: ::... :..
CCDS31 YVGIERNNKGFRPLSCEYKMENVTRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSIN
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KB0 FQLQIRSKNSQNPNSKIVLLDVPVRAEAQVELRGNSFPASLVVAAE--EGEREQNSLDSW
:.:::::.:..::.:..: :.. . : ::::.:: : : ..:. . : :.: .. .
CCDS31 FDLQIRSSNKDNPDSNFVSLQINITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEV
760 770 780 790 800 810
810 820 830 840 850 860
pF1KB0 GPKVEHTYELHNNGPGTVNGLHLSIHLPGQSQPSDLLYILDIQPQGGLQCFPQPPVNPLK
:: ::: ::::: ::.:.. : . : ... ::::. :: : ::: :.: .::
CCDS31 GPLVEHIYELHNIGPSTISDTILEVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQD
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910
pF1KB0 VDWGLPIPSP--SPIHPAH-------HKRDRRQIFLPEPEQPSRLQDPV-LVSCDSAPCT
. : :: .: : : .:.. . : .. :.:. ...: . :
CCDS31 IK---PAASPEDTPELSAFLRNSTIPHLVRKRDVHVVEFHR----QSPAKILNCTNIECL
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960 970
pF1KB0 VVQCDLQEMARGQRAMVTVLAFLWLPSLYQRPLDQFVLQSHAWFNVSSLPYAVPPLSLPR
..: . .. :. :.. : . :: .. :: : ..: : . :.:...::. : .::.
CCDS31 QISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQRKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPE
940 950 960 970 980 990
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB0 GEAQVWTQLLRALEERA--IPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFFKRNRPPLEE-D
: . :... : . . ::.: .....: :::.:.::.::.:: ::: : ::: :.
CCDS31 GSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMT
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB0 DEEGE
:.:
CCDS31 DREQLTNDKTPEA
1060
>>CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049 aa)
initn: 1491 init1: 282 opt: 2058 Z-score: 2063.8 bits: 393.5 E(32554): 1.2e-108
Smith-Waterman score: 2299; 39.3% identity (66.5% similar) in 1047 aa overlap (13-1029:25-1031)
10 20 30 40
pF1KB0 MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPP-AWALNLDPVQLTFYAGPNG
:: .:::: : :: . ..::: . .:: :
CCDS88 MGSRTPESPLHAVQLRWGPRRRPPLLPLLLLLLPP---PPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 SQFGFSLDFHKDSHGRVAIVVGAPR--TLGPSQEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRD
: ::::..:.. . :...::::. : :. . :.:.:::: : :: . :: .
CCDS88 SFFGFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQCTPIEFDSKG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB0 E-------TRNVGSQTLQTFKARQGLGASVVSWSDVIVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPV
. . : . .. .:. : .::.: . .. :.:::: : . :: : . ::
CCDS88 SRLLESSLSSSEGEEPVE-YKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRT-EK--EPLSDPV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 GSCFLAQPESGRRAEYSPCRGNTLSRIYVENDFSW--DKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGA
:.:.:. . : ::.::: .:::: . ::..:::. :..:..:::.
CCDS88 GTCYLSTDNFTRILEYAPCR----------SDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGG
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 PGGYYFLGLLAQAPVADIFSSYRPGILLWHVSSQSLSFDSSNPEYFDGYWGYSVAVGEFD
::.:.. : . .: .: :: : :. :..: :. ... : :.: :::::::::.
CCDS88 PGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQ-LQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFS
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 GDLNTTEYVVGAPTWSWTLGAVEILD-SYYQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRH
:: .: ..:.:.: . : : : ::. : . :. . :::::::::..::.:::::::
CCDS88 GD-DTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLD
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 DLLVGAPLYMESRADRKLAEVGRVYLFLQ-PRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPL
:::::::: :. : . ::::::..:: : : . .:.: ::: . .:::::...::
CCDS88 DLLVGAPLLMDRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAGIEP--TPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPL
350 360 370 380 390
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pF1KB0 GDLDRDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQVLVFLGQSEGLRSRPSQVLDSPFPTGSA----FGF
::::.:::::.:..::.:: . .: :.:: : :: :.:::::. :. ..: ::
CCDS88 GDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQ-PLWAASHTPDFFGS
400 410 420 430 440 450
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pF1KB0 SLRGAVDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYRAQPVVKASVQLLVQDSL-NPAVKSCVLPQT
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: :.: . . .: : :. :..:...:.:::::: .:.. .. .: .:..
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CCDS46 VRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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. .: : .: :.: :: . :::.:.. . . : .::.:..::.::: ::::::::::.
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CCDS46 GVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVL
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:.::....:: ::. : . . ::.:.: :.. . . :. .. :. .:.::::..
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:::::.::.. .. : : :. : . .....:..:.::::::.:: :.:.
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.... . . .: :: : : . : :.::::::::: : .: : .. .. : :.. ::
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: : ::.:: :.:.:::::: ..:. .. :: . : ::.:.:::.:.: . :
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.. . : .. : . . . ::::: . .: ..: . .:::.. . : .
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..:: ..... .. . :.: : ::: .:: :. . . : :.. ...
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CCDS46 PVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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CCDS11 NSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLF-LRTSIPTINME--NKTTWFSVDIDSELVEELPAE-I
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CCDS11 ELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDD
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CCDS11 Y
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CCDS42 PMQSTIR------EEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDND
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CCDS42 DNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVNRTKFDCV--ENGWPSVCIDL
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CCDS42 TLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREAN-C
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CCDS42 INFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETT
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CCDS42 LHVKLPVGLYFIKIL---ELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLD
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CCDS42 VSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
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CCDS42 NDENEPETCMVE----KMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQT
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CCDS42 TTG-ECHFENYQRVCALE-QQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKA-------DP---
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CCDS42 -----HCLNFLCNFGKMESGKEASVHI-QLEGRPSILE--MDE---TSALKFEIRATGFP
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CCDS42 EPNPRVIELNKDE-NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAG
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pF1KB0 FFKRN-RPPLEEDDEEGE
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CCDS42 FFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD
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CCDS26 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGIPAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHFHD
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CCDS26 NTRW-VLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTEL--DMARGKNRGTSCGKT
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. . . .:.:.. . ..::: ..: :. .... : : :.. : :.
CCDS26 CREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACA--HRWKNIYYEADHI--LPHGFCYII-P-SNL
120 130 140 150 160
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CCDS26 QA-----KGRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTE--ELVVMGAPGSFYWAGTIK
170 180 190 200 210 220
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CCDS26 VLNLTD--NTY------LKLNDEVI----MNRRYT--YLGYAVTAGHFSHP-STIDVVGG
230 240 250 260
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