Result of FASTA (ccds) for pF1KB0946
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0946, 399 aa
  1>>>pF1KB0946 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0781+/-0.00155; mu= 16.1185+/- 0.093
 mean_var=267.0137+/-51.592, 0's: 0 Z-trim(106.2): 969  B-trim: 36 in 1/51
 Lambda= 0.078489
 statistics sampled from 7766 (8835) to 7766 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.271), width:  16
 Scan time:  2.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46042.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19       ( 399) 2738 324.1 1.4e-88
CCDS74332.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19       ( 400) 2726 322.7 3.7e-88
CCDS74330.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19       ( 443) 2719 322.0 6.7e-88
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19      ( 570) 1812 219.5 6.2e-57
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19      ( 571) 1812 219.5 6.2e-57
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 418) 1275 158.5 1.1e-38
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 419) 1263 157.1 2.8e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475) 1237 154.3 2.3e-37
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19        ( 533) 1163 146.0   8e-35
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10       ( 441) 1152 144.6 1.7e-34
CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs108|chr2         ( 400) 1136 142.7 5.8e-34
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19      ( 679) 1134 142.9 8.7e-34
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7       ( 411) 1119 140.8 2.2e-33
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19   ( 536) 1117 140.8   3e-33
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7        ( 586) 1116 140.7 3.3e-33
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19      ( 444) 1108 139.6 5.5e-33
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19       ( 628) 1107 139.7   7e-33
CCDS78236.1 ZNF735 gene_id:730291|Hs108|chr7       ( 412) 1104 139.1 7.2e-33
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX         ( 506) 1099 138.7 1.2e-32
CCDS42533.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19       ( 498) 1092 137.9   2e-32
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620) 1085 137.2 3.9e-32
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19      ( 674) 1084 137.2 4.4e-32
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7        ( 524) 1082 136.8 4.6e-32
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19       ( 499) 1080 136.5 5.2e-32
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19       ( 572) 1063 134.7 2.1e-31
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19      ( 528) 1062 134.5 2.2e-31
CCDS55114.1 ZNF736 gene_id:728927|Hs108|chr7       ( 427) 1059 134.0 2.5e-31
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19      ( 492) 1054 133.6   4e-31
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19      ( 616) 1044 132.6 9.7e-31
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19        (1280) 1048 133.6   1e-30
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19      ( 576) 1036 131.6 1.8e-30
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19       ( 463) 1033 131.1   2e-30
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7       ( 530) 1033 131.2 2.2e-30
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7        ( 852) 1033 131.6 2.7e-30
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19      ( 569) 1028 130.7 3.3e-30
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9          ( 626) 1025 130.5 4.4e-30
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19         ( 601) 1021 130.0 5.9e-30
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19      ( 422) 1002 127.6 2.2e-29
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1004 128.1 2.3e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1004 128.1 2.3e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1004 128.1 2.3e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1004 128.1 2.4e-29
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7         ( 569)  993 126.8 5.1e-29
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  992 126.6 5.4e-29
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  992 126.7 5.7e-29
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688)  990 126.6 7.1e-29
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9         ( 612)  989 126.4 7.3e-29
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19        ( 659)  987 126.2 8.8e-29
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19       ( 665)  985 126.0   1e-28
CCDS10914.2 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16        ( 407)  982 125.3   1e-28


>>CCDS46042.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19            (399 aa)
 initn: 2738 init1: 2738 opt: 2738  Z-score: 1703.6  bits: 324.1 E(32554): 1.4e-88
Smith-Waterman score: 2738; 99.7% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 EPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 CDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 AAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILSRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 GSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 IQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390         
pF1KB0 RIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
              370       380       390         

>>CCDS74332.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19            (400 aa)
 initn: 2453 init1: 2453 opt: 2726  Z-score: 1696.3  bits: 322.7 E(32554): 3.7e-88
Smith-Waterman score: 2726; 99.5% identity (99.8% similar) in 400 aa overlap (1-399:1-400)

               10        20        30        40         50         
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS74 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVIMLLEDG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 KEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYT
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB0 ECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKS
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 GAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS74 GAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILSRHWRIHTGEKPYECRECGKTFS
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 HGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSL
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 LIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQH
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390         
pF1KB0 QRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
              370       380       390       400

>>CCDS74330.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19            (443 aa)
 initn: 2719 init1: 2719 opt: 2719  Z-score: 1691.6  bits: 322.0 E(32554): 6.7e-88
Smith-Waterman score: 2719; 99.7% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (4-399:48-443)

                                          10        20        30   
pF1KB0                            MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSNCGVNKMSNEELVGQNHGMEGEACTGGDVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVM
        20        30        40        50        60        70       

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB0 VQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGKEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGKEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDS
        80        90       100       110       120       130       

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB0 PQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILK
       140       150       160       170       180       190       

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB0 KNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQ
       200       210       220       230       240       250       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB0 SILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLT
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SILSRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLT
       260       270       280       290       300       310       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB0 NHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQK
       320       330       340       350       360       370       

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB0 SHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTE
       380       390       400       410       420       430       

             
pF1KB0 EKPFEV
       ::::::
CCDS74 EKPFEV
       440   

>>CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19           (570 aa)
 initn: 3942 init1: 1788 opt: 1812  Z-score: 1135.6  bits: 219.5 E(32554): 6.2e-57
Smith-Waterman score: 2388; 84.0% identity (88.4% similar) in 430 aa overlap (4-398:4-433)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
          :::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS46 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLEDGK
               10        20        30        40        50        60

               70            80        90       100       110      
pF1KB0 EPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNL
       :::::::::::    :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.:::
CCDS46 EPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNL
               70        80        90       100       110       120

        120                                      130       140     
pF1KB0 EYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGN
       :: :                          :.      :::::::::::::::. :::::
CCDS46 EYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGN
              130       140       150       160       170       180

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB0 SHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSE
       ::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::
CCDS46 SHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSE
              190       200       210       220       230       240

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB0 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS46 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKA
              250       260       270       280       290       300

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB0 FSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHS
       ::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: :::::::::::: 
CCDS46 FSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHR
              310       320       330       340       350       360

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB0 SSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLV
       :::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.::::
CCDS46 SSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLV
              370       380       390       400       410       420

         390                                                       
pF1KB0 QHQSIHTEEKPFEV                                              
       :::::::::::::                                               
CCDS46 QHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHR
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19           (571 aa)
 initn: 1788 init1: 1788 opt: 1812  Z-score: 1135.6  bits: 219.5 E(32554): 6.2e-57
Smith-Waterman score: 2371; 83.7% identity (88.1% similar) in 430 aa overlap (5-398:5-434)

               10        20        30        40         50         
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
           ::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::
CCDS32 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVITLLEDG
               10        20        30        40        50        60

      60        70            80        90       100       110     
pF1KB0 KEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKN
       ::::::::::::    :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.::
CCDS32 KEPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKN
               70        80        90       100       110       120

         120                                      130       140    
pF1KB0 LEYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEG
       ::: :                          :.      :::::::::::::::. ::::
CCDS32 LEYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEG
              130       140       150       160       170       180

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB0 NSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCS
       :::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::
CCDS32 NSHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCS
              190       200       210       220       230       240

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB0 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS32 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGK
              250       260       270       280       290       300

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB0 AFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIH
       :::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
CCDS32 AFSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIH
              310       320       330       340       350       360

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB0 SSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFL
        :::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.:::
CCDS32 RSSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFL
              370       380       390       400       410       420

          390                                                      
pF1KB0 VQHQSIHTEEKPFEV                                             
       ::::::::::::::                                              
CCDS32 VQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHH
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19            (418 aa)
 initn: 3664 init1: 906 opt: 1275  Z-score: 808.1  bits: 158.5 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1275; 48.4% identity (73.6% similar) in 409 aa overlap (1-398:1-396)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB0 MSQ--VTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLED
       :.:  : ::::..:::.::: ::.. :::::.:::..:: ::::.: :..:: ::  ::.
CCDS12 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKPNVISYLEQ
               10        20        30        40        50        60

       60        70            80        90       100       110    
pF1KB0 GKEPWMMEKKLSK-DW---ESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNK
       :::::. ...:.. .:   ::: :.:.:  ::.::. .: :   :::.......      
CCDS12 GKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQ------
               70        80        90       100       110          

          120       130       140       150           160       170
pF1KB0 NLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLS----KKSVIKSERINGG
             :..::. .. .  ... . .:  :. ..  . ...:     . :   .. ::. 
CCDS12 ------CSSFRDDWECNRQFKK-ELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSK
                120       130        140       150       160       

              180       190        200       210       220         
pF1KB0 KKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNR-EKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPY
       ::.  :..   .: ......  .  .  :: : :.::::.: . : :..: .::::.::.
CCDS12 KKFCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPF
       170       180       190       200       210       220       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB0 ECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMN
       ::.::::::  ::.::::.  :.:::::.: ::::::: ::..: ::  ::::::::: .
CCDS12 ECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKE
       230       240       250       260       270       280       

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB0 CGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKA
       :::.::  : . :: :::: :: :::. ::.:: .::.::.::. :::::::::.:: ::
CCDS12 CGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKA
       290       300       310       320       330       340       

     350       360       370       380       390                   
pF1KB0 FCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV          
       :  .: ::.:::::. .: :::. : :..:. : :..:. ::: :::.:           
CCDS12 FRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYD
       350       360       370       380       390       400       

CCDS12 PQLIQHQNLYW
       410        

>>CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19            (419 aa)
 initn: 2379 init1: 906 opt: 1263  Z-score: 800.8  bits: 157.1 E(32554): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1263; 48.3% identity (73.4% similar) in 410 aa overlap (1-398:1-397)

                 10        20        30        40         50       
pF1KB0 MSQ--VTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLE
       :.:  : ::::..:::.::: ::.. :::::.:::..:: ::::. : :..:: ::  ::
CCDS46 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMAGHSISKPNVISYLE
               10        20        30        40        50        60

        60        70            80        90       100       110   
pF1KB0 DGKEPWMMEKKLSK-DW---ESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSN
       .:::::. ...:.. .:   ::: :.:.:  ::.::. .: :   :::.......     
CCDS46 QGKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQ-----
               70        80        90       100       110          

           120       130       140       150           160         
pF1KB0 KNLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLS----KKSVIKSERING
              :..::. .. .  ... . .:  :. ..  . ...:     . :   .. ::.
CCDS46 -------CSSFRDDWECNRQFKK-ELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINS
                120       130        140       150       160       

     170       180       190        200       210       220        
pF1KB0 GKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNR-EKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKP
        ::.  :..   .: ......  .  .  :: : :.::::.: . : :..: .::::.::
CCDS46 KKKFCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKP
       170       180       190       200       210       220       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB0 YECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECM
       .::.::::::  ::.::::.  :.:::::.: ::::::: ::..: ::  ::::::::: 
CCDS46 FECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECK
       230       240       250       260       270       280       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB0 NCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGK
       .:::.::  : . :: :::: :: :::. ::.:: .::.::.::. :::::::::.:: :
CCDS46 ECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEK
       290       300       310       320       330       340       

      350       360       370       380       390                  
pF1KB0 AFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV         
       ::  .: ::.:::::. .: :::. : :..:. : :..:. ::: :::.:          
CCDS46 AFRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNY
       350       360       370       380       390       400       

CCDS46 DPQLIQHQNLYW
       410         

>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19           (475 aa)
 initn: 917 init1: 917 opt: 1237  Z-score: 784.4  bits: 154.3 E(32554): 2.3e-37
Smith-Waterman score: 1287; 50.9% identity (72.8% similar) in 401 aa overlap (4-398:6-395)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB0   MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLED
            : ::::.::::.::: ::: .:::::.:::..:: ::::.:: . :: :: :::.
CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQ
               10        20        30        40        50        60

       60        70            80        90       100       110    
pF1KB0 GKEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNK
       ::::::. ..:..    : ::  :.: :: ::..:. .  :   :  ..:.. :.:. . 
CCDS12 GKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIELCQREIM-GLTKHGLEYSSFGD
               70        80        90       100        110         

          120       130       140        150       160       170   
pF1KB0 NLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNN-SAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKL
        :::      ::  :  . :. :... : :  . .:  .   ...  .   . ::.  . 
CCDS12 VLEY------RS--HLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEY--MPTFIQQTFLTLHQIINNEDRP
     120               130       140         150       160         

           180       190        200       210       220       230  
pF1KB0 LNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCN-REKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECR
        . .: : ::.:....   :  .  :: : :.:::: :.  : ..:: .:::::::.::.
CCDS12 YECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECK
     170       180       190       200       210       220         

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB0 ECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGK
       ::::.:: .: :..::  :.:.:::.: :::::::. :.: .::  :::::::::  :::
CCDS12 ECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGK
     230       240       250       260       270       280         

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB0 SFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCC
       .:.. : :.:: :::: :: :::. ::::: .::.:..::. :::::::::.::::::  
CCDS12 AFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSS
     290       300       310       320       330       340         

            360       370       380       390                      
pF1KB0 SSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV             
       .: ::.:::::. .: :.:..: :.:.. : : ::: ::. :::::              
CCDS12 GSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQL
     350       360       370       380       390       400         

CCDS12 FQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQ
     410       420       430       440       450       460         

>>CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19             (533 aa)
 initn: 6157 init1: 843 opt: 1163  Z-score: 738.7  bits: 146.0 E(32554): 8e-35
Smith-Waterman score: 1163; 46.4% identity (70.1% similar) in 405 aa overlap (4-398:6-397)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB0   MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLL-E
            ::: :::::::.:::  :: ::::::.::: .:: :..:.: :..:: :: :: :
CCDS33 MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
               10        20        30        40        50        60

        60        70            80        90       100       110   
pF1KB0 DGKEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSN
       . ::: :. .. ..    : :::.... :: .::::.  : :   ::..  .:: ...: 
CCDS33 ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERI--KSYSLQGS-
               70        80        90       100         110        

           120       130       140       150         160           
pF1KB0 KNLEYTECDTFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLS--KKSVIKSER--ING
                 ::. .. :: . : .... ::   .  : .....  :.  . .:   ...
CCDS33 ---------IFRNDWECKSKI-EGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHN
                120        130       140       150       160       

     170       180       190        200       210       220        
pF1KB0 GKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNR-EKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKP
       :.:. . ..   .: . ..:.     .  :: : :.:::.:: ... : :: ..::::::
CCDS33 GEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKP
       170       180       190       200       210       220       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB0 YECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECM
       :::.::::.:.  . ::.::  :.:::::.: ::::::   ..:. ::  ::::::::: 
CCDS33 YECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECK
       230       240       250       260       270       280       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB0 NCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGK
       .:::.: . . : .: :.:: :: :::. :::::. . .:  ::: : :::::::.::::
CCDS33 DCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYECKECGK
       290       300       310       320       330       340       

      350       360       370       380       390                  
pF1KB0 AFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV         
       ::   ..:: :: ::. .: :::..: :.:   . ::.:: :::.:::.:          
CCDS33 AFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSS
       350       360       370       380       390       400       

CCDS33 YSQLISHQSIHIGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQL
       410       420       430       440       450       460       

>--
 initn: 566 init1: 566 opt: 577  Z-score: 380.1  bits: 79.6 E(32554): 7.5e-15
Smith-Waterman score: 577; 62.7% identity (73.1% similar) in 134 aa overlap (231-364:398-531)

              210       220       230       240       250       260
pF1KB0 YTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCI
                                     : :: ::::  :.:  ::  : ::.::.: 
CCDS33 YECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPYECE
       370       380       390       400       410       420       

              270       280       290       300       310       320
pF1KB0 ECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGK
       ::::::   :.::.::: ::::::::: .: : :  .: : ::  ::: :: :::. :::
CCDS33 ECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECGK
       430       440       450       460       470       480       

              330       340       350       360       370       380
pF1KB0 AFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSS
       ::   : : .::. :::::::.:.:: :::   :::::::.::.                
CCDS33 AFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI              
       490       500       510       520       530                 

              390         
pF1KB0 FSFLVQHQSIHTEEKPFEV

>>CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10            (441 aa)
 initn: 4282 init1: 874 opt: 1152  Z-score: 732.6  bits: 144.6 E(32554): 1.7e-34
Smith-Waterman score: 1152; 44.0% identity (70.9% similar) in 405 aa overlap (4-398:11-411)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB0        MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVI
                 .::.:::. :.. ::  ::.::: ::.:::..:: :::::::  .:: .:
CCDS72 MAPRAQIQGPLTFGDVAVAFTRIEWRHLDAAQRALYRDVMLENYGNLVSVGLLSSKPKLI
               10        20        30        40        50        60

            60           70        80        90            100     
pF1KB0 MLLEDGKEPWMMEKKL---SKDWESRWENKELSTKKDIYDEDS-----PQPVTMEKVVKQ
         ::.: :::   ..    ..  :. : . ..:. :.  .: :      . : ::: .  
CCDS72 TQLEQGAEPWTEVREAPSGTHAVEDYWFETKMSALKQSTSEASVLGERTKSVMMEKGLDW
               70        80        90       100       110       120

         110       120        130       140       150       160    
pF1KB0 SYEFSNSNKNLEYTECD-TFRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKS
         . :...:: .  ::  .:.   ...: .:. .:...:   .  .     ....:... 
CCDS72 EGR-SSTEKNYKCKECGKVFK---YNSSFISHQRNHTSEKPHKCKECGIAFMNSSSLLNH
               130       140          150       160       170      

          170       180       190        200       210       220   
pF1KB0 ERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCN-REKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIH
       .....::.     . :  ... ...   :  . ::: . : ::::.: :.:::  : :::
CCDS72 HKVHAGKQPYRCIECGKFLKKHSTFINHQRIHSREKPHKCIECGKTFRKNSILLSHQRIH
        180       190       200       210       220       230      

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB0 TGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEK
       ::.:::.: .:::.:.....::::.  ::::::.:: .::.::  .:.. .::. :::::
CCDS72 TGQKPYKCNDCGKAFAQNAALTRHERIHSGEKPFKCNKCGRAFRDNSTVLEHQKIHTGEK
        240       250       260       270       280       290      

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB0 PYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYEC
       ::.: .:::.: . : ::.: :.:: :: :.:  :::.: .:::.  :::.:.:.:::.:
CCDS72 PYQCNECGKAFRKSSTLISHQRMHTGEKPYHCSKCGKSFRYSSSFAGHQKTHSGNKPYQC
        300       310       320       330       340       350      

           350       360       370       380       390             
pF1KB0 RECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV    
       :.:::::  :: :: :::::. .: :.:.:: :.:   : ::.:: .:: :::..     
CCDS72 RDCGKAFTKSSTLTGHQRIHTGEKPYHCKKCGKAFRHSSGLVEHQRLHTGEKPYKCNECG
        360       370       380       390       400       410      

CCDS72 KAFPRSSALKQHKKIHNKERAMKCS
        420       430       440 




399 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 20:17:05 2016 done: Sat Nov  5 20:17:05 2016
 Total Scan time:  2.880 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com