FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0946, 399 aa 1>>>pF1KB0946 399 - 399 aa - 399 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0402+/-0.000714; mu= 16.7714+/- 0.044 mean_var=306.1171+/-62.628, 0's: 0 Z-trim(113.1): 2067 B-trim: 79 in 1/53 Lambda= 0.073304 statistics sampled from 19925 (22295) to 19925 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16 Scan time: 7.920 The best scores are: opt bits E(85289) XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 566) 1812 206.4 1.5e-52 XP_005258908 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 567) 1812 206.4 1.5e-52 XP_016882228 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1812 206.4 1.5e-52 XP_005258907 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1812 206.4 1.5e-52 NP_001139137 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 570) 1812 206.4 1.5e-52 NP_001025168 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 571) 1812 206.4 1.5e-52 XP_005258906 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1812 206.4 1.5e-52 XP_006723246 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1812 206.4 1.5e-52 XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 585) 1812 206.4 1.5e-52 NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1117 132.8 1.9e-30 XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1117 132.8 1.9e-30 XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1117 132.8 1.9e-30 XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1117 132.8 1.9e-30 XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1117 132.8 1.9e-30 NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1116 132.8 2.1e-30 NP_115799 (OMIM: 615580) zinc finger protein 528 [ ( 628) 1107 131.9 4.2e-30 XP_016882852 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30 XP_016882851 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30 XP_016882853 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30 NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1099 130.9 6.9e-30 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1085 129.5 2.1e-29 NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 1080 128.8 2.8e-29 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1063 127.2 1e-28 NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1054 126.1 1.9e-28 XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1048 126.1 4.2e-28 NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1048 126.2 4.4e-28 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1033 124.3 1.1e-27 NP_003443 (OMIM: 603132) zinc finger protein 189 i ( 626) 1025 123.2 1.7e-27 NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 1021 122.8 2.3e-27 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1004 121.0 8e-27 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1004 121.0 8e-27 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1004 121.0 8.1e-27 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1004 121.0 8.2e-27 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1004 121.0 8.2e-27 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1004 121.0 8.3e-27 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1004 121.1 8.4e-27 XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 993 119.8 1.7e-26 NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 993 119.8 1.7e-26 NP_001265160 (OMIM: 603132) zinc finger protein 18 ( 612) 989 119.4 2.4e-26 NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 987 119.2 2.9e-26 XP_011526673 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 476) 985 118.8 2.9e-26 XP_016882860 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 519) 985 118.8 3e-26 XP_011526670 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26 XP_016882859 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26 XP_016882858 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26 XP_011526668 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26 XP_005260155 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26 >>XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (566 aa) initn: 4212 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52 Smith-Waterman score: 2419; 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NP_001 KPLTMKK---HEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD-SFQKVTLRRYE-NYGHDNLQFKK 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB0 -CDTF-RSTFHSKSTLSEPQN-NSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERI-NGGKKLLNS :.. . :... . : ...... . : : . : : . ..: . ::: .. NP_001 GCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 NKSGAAFNQSKSLTLPQTCNR-EKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECG . : :::::..:: . . :: . : ::::::. .: :. : ::::::: :.:..:: NP_001 IECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 KTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFS :.::. : :: :.: ::::::::: ::::::...:.::.:. :::::::.: .:::.:. 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