FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0946, 399 aa
1>>>pF1KB0946 399 - 399 aa - 399 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0402+/-0.000714; mu= 16.7714+/- 0.044
mean_var=306.1171+/-62.628, 0's: 0 Z-trim(113.1): 2067 B-trim: 79 in 1/53
Lambda= 0.073304
statistics sampled from 19925 (22295) to 19925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 7.920
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 566) 1812 206.4 1.5e-52
XP_005258908 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 567) 1812 206.4 1.5e-52
XP_016882228 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1812 206.4 1.5e-52
XP_005258907 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 570) 1812 206.4 1.5e-52
NP_001139137 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 570) 1812 206.4 1.5e-52
NP_001025168 (OMIM: 606741) zinc finger protein 18 ( 571) 1812 206.4 1.5e-52
XP_005258906 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1812 206.4 1.5e-52
XP_006723246 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1812 206.4 1.5e-52
XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 585) 1812 206.4 1.5e-52
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1117 132.8 1.9e-30
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1117 132.8 1.9e-30
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1117 132.8 1.9e-30
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1117 132.8 1.9e-30
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1117 132.8 1.9e-30
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1116 132.8 2.1e-30
NP_115799 (OMIM: 615580) zinc finger protein 528 [ ( 628) 1107 131.9 4.2e-30
XP_016882852 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30
XP_016882851 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30
XP_016882853 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1101 131.2 6.5e-30
NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1099 130.9 6.9e-30
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1085 129.5 2.1e-29
NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 1080 128.8 2.8e-29
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1063 127.2 1e-28
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1054 126.1 1.9e-28
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1048 126.1 4.2e-28
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1048 126.2 4.4e-28
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1033 124.3 1.1e-27
NP_003443 (OMIM: 603132) zinc finger protein 189 i ( 626) 1025 123.2 1.7e-27
NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 1021 122.8 2.3e-27
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1004 121.0 8e-27
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1004 121.0 8e-27
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1004 121.0 8.1e-27
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1004 121.0 8.2e-27
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1004 121.0 8.2e-27
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1004 121.0 8.3e-27
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1004 121.0 8.3e-27
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1004 121.1 8.4e-27
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 993 119.8 1.7e-26
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 993 119.8 1.7e-26
NP_001265160 (OMIM: 603132) zinc finger protein 18 ( 612) 989 119.4 2.4e-26
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 987 119.2 2.9e-26
XP_011526673 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 476) 985 118.8 2.9e-26
XP_016882860 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 519) 985 118.8 3e-26
XP_011526670 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26
XP_016882859 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26
XP_016882858 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26
XP_011526668 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26
XP_005260155 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 985 118.9 3.1e-26
>>XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (566 aa)
initn: 4212 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2419; 84.6% identity (89.0% similar) in 429 aa overlap (1-398:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
: ::::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_006 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLEDGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTE
::::::::::::::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.::::: :
XP_006 EPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNLEYIE
70 80 90 100 110 120
130 140
pF1KB0 -------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHKY
:. :::::::::::::::. :::::::::
XP_006 KLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGNSHKY
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 DILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKA
::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::
XP_006 DILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSECGKA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 FGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_006 FGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKAFSHV
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 SSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLI
::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: :::::::::::: ::::
XP_006 SSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHRSSLI
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 HHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQS
:::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.::::::::
XP_006 HHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLVQHQS
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 IHTEEKPFEV
:::::::::
XP_006 IHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHRIHTG
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:430-539)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_006 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
400 410 420 430 440 450
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_006 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
460 470 480 490 500 510
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_006 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
520 530 540 550 560
>>XP_005258908 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (567 aa)
initn: 3971 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2407; 84.4% identity (88.8% similar) in 430 aa overlap (1-398:1-430)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
: ::::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::
XP_005 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVITLLEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 KEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYT
:::::::::::::::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.:::::
XP_005 KEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNLEYI
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 E-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGNSHK
: :. :::::::::::::::. ::::::::
XP_005 EKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGNSHK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 YDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSECGK
:::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::
XP_005 YDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSECGK
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 AFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_005 AFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKAFSH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 GSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSL
::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: :::::::::::: :::
XP_005 VSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHRSSL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 IHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQ
::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.:::::::
XP_005 IHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLVQHQ
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 SIHTEEKPFEV
::::::::::
XP_005 SIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHRIHT
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:431-540)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_005 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_005 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_005 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560
>>XP_016882228 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (570 aa)
initn: 3942 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2388; 84.0% identity (88.4% similar) in 430 aa overlap (4-398:4-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
:::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_016 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLEDGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB0 EPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNL
::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.:::
XP_016 EPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNL
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 EYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGN
:: : :. :::::::::::::::. :::::
XP_016 EYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGN
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 SHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSE
::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::
XP_016 SHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_016 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 FSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHS
::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
XP_016 FSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLV
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.::::
XP_016 SSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLV
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 QHQSIHTEEKPFEV
:::::::::::::
XP_016 QHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHR
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:434-543)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_016 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_016 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_016 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>XP_005258907 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (570 aa)
initn: 3942 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2388; 84.0% identity (88.4% similar) in 430 aa overlap (4-398:4-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
:::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_005 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLEDGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB0 EPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNL
::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.:::
XP_005 EPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNL
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 EYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGN
:: : :. :::::::::::::::. :::::
XP_005 EYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGN
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 SHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSE
::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::
XP_005 SHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_005 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 FSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHS
::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
XP_005 FSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLV
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.::::
XP_005 SSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLV
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 QHQSIHTEEKPFEV
:::::::::::::
XP_005 QHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHR
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:434-543)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_005 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_005 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_005 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>NP_001139137 (OMIM: 606741) zinc finger protein 181 is (570 aa)
initn: 3942 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2388; 84.0% identity (88.4% similar) in 430 aa overlap (4-398:4-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
:::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVITLLEDGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB0 EPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNL
::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.:::
NP_001 EPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKNL
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 EYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEGN
:: : :. :::::::::::::::. :::::
NP_001 EYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEGN
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 SHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCSE
::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::
NP_001 SHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCSE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
NP_001 CGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGKA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 FSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHS
::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
NP_001 FSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIHR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLV
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.::::
NP_001 SSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFLV
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 QHQSIHTEEKPFEV
:::::::::::::
NP_001 QHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHHR
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:434-543)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
NP_001 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
NP_001 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
NP_001 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>NP_001025168 (OMIM: 606741) zinc finger protein 181 is (571 aa)
initn: 1788 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2371; 83.7% identity (88.1% similar) in 430 aa overlap (5-398:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::
NP_001 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVITLLEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 KEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKN
:::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.::
NP_001 KEPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKN
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 LEYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEG
::: : :. :::::::::::::::. ::::
NP_001 LEYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 NSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCS
:::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::
NP_001 NSHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
NP_001 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 AFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIH
:::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
NP_001 AFSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFL
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.:::
NP_001 RSSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFL
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 VQHQSIHTEEKPFEV
::::::::::::::
NP_001 VQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHH
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:435-544)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
NP_001 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
NP_001 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
NP_001 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>XP_005258906 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (571 aa)
initn: 1788 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2371; 83.7% identity (88.1% similar) in 430 aa overlap (5-398:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::
XP_005 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVITLLEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 KEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKN
:::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.::
XP_005 KEPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKN
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 LEYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEG
::: : :. :::::::::::::::. ::::
XP_005 LEYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 NSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCS
:::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::
XP_005 NSHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_005 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 AFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIH
:::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
XP_005 AFSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFL
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.:::
XP_005 RSSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFL
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 VQHQSIHTEEKPFEV
::::::::::::::
XP_005 VQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHH
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:435-544)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_005 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_005 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_005 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>XP_006723246 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (571 aa)
initn: 1788 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.6 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2371; 83.7% identity (88.1% similar) in 430 aa overlap (5-398:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSV-GLSVTKPYVIMLLEDG
::.::::::.::::. :.::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::
XP_006 MPQVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVAGLSVTKPYVITLLEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 KEPWMMEKKLSK----DWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKN
:::::::::::: :::::::::::::::: ::::::: : .:::::::::::::.::
XP_006 KEPWMMEKKLSKGMIPDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEKVVKQSYEFSNSKKN
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB0 LEYTE-------------------------CDT------FRSTFHSKSTLSEPQNNSAEG
::: : :. :::::::::::::::. ::::
XP_006 LEYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHSKSTLSEPQKISAEG
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 NSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLTLPQTCNREKIYTCS
:::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::
XP_006 NSHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLTLPQTCNREKIYTCS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_006 ECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLISHSGEKPYKCIECGK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 AFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIH
:::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::: ::::::::::::
XP_006 AFSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQEKLYECRICGKAFIH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFL
:::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::::::::::::.:::
XP_006 RSSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYECNKCLKVFSSLSFL
370 380 390 400 410 420
390
pF1KB0 VQHQSIHTEEKPFEV
::::::::::::::
XP_006 VQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSICGKAFSHRSSLLQHH
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.2 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:435-544)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_006 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_006 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
470 480 490 500 510 520
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_006 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
530 540 550 560 570
>>XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger pro (585 aa)
initn: 4199 init1: 1788 opt: 1812 Z-score: 1064.5 bits: 206.4 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 2406; 84.7% identity (89.2% similar) in 426 aa overlap (4-398:23-448)
10 20 30 40
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLV
:::.::::::.::::. :.:::::::::::::::::::
XP_016 MSNDELVGQNHGMEGEACIGGDVTFNDVAIDFTHEEWGWLSSAQRDLYKDVMVQNYENLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 SVGLSVTKPYVIMLLEDGKEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEK
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: : .::
XP_016 SVGLSVTKPYVITLLEDGKEPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDNYDEDSPQTVIIEK
70 80 90 100 110 120
110 120 130
pF1KB0 VVKQSYEFSNSNKNLEYTE-------------------------CDT------FRSTFHS
:::::::::::.::::: : :. :::::::
XP_016 VVKQSYEFSNSKKNLEYIEKLEGKHGSQVDHFRPAILTSRESPTADSVYKYNIFRSTFHS
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB0 KSTLSEPQNNSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERINGGKKLLNSNKSGAAFNQSKSLT
::::::::. :::::::::::::::: ::::::.:..::::::::::::::::.:.::::
XP_016 KSTLSEPQKISAEGNSHKYDILKKNLPKKSVIKNEKVNGGKKLLNSNKSGAAFSQGKSLT
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB0 LPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_016 LPQTCNREKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHLIS
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 HSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQE
:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::
XP_016 HSGEKPYKCIECGKAFSHVSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSHLIEHLRIHTQE
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 KRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYE
: :::::::::::: :::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::
XP_016 KLYECRICGKAFIHRSSLIHHQKIHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTRHQRIHTMEKQYE
370 380 390 400 410 420
380 390
pF1KB0 CNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 CNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECSIC
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 464 init1: 464 opt: 464 Z-score: 294.1 bits: 63.8 E(85289): 1.2e-09
Smith-Waterman score: 464; 58.2% identity (79.1% similar) in 110 aa overlap (287-396:449-558)
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 YKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECR
:..: :::... : .::: : . : :::
XP_016 YECNKCLKVFSSLSFLVQHQSIHTEEKPFECQKCRKSFNQLESLNMHLRNHIRLKPYECS
420 430 440 450 460 470
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 ICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLK
:::::: : :::..:.. ::::::::: .:::.: :::.:: :::::. .: :.::.: :
XP_016 ICGKAFSHRSSLLQHHRIHTGEKPYECIKCGKTFSCSSNLTVHQRIHTGEKPYKCNECGK
480 490 500 510 520 530
380 390
pF1KB0 VFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
.::. : :. :: .:. :::
XP_016 AFSKGSNLTAHQRVHNGEKPNSVVSVEKPLDYMNHYTCEKSYRRETV
540 550 560 570 580
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 6308 init1: 926 opt: 1117 Z-score: 667.6 bits: 132.8 E(85289): 1.9e-30
Smith-Waterman score: 1117; 45.2% identity (70.5% similar) in 403 aa overlap (1-398:1-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSQVTFSDVAIDFSHEEWACLDSAQRDLYKDVMVQNYENLVSVGLSVTKPYVIMLLEDGK
:. . : ::::.:: ::: :::.:::.::..::..::.::: .:. :.:: .: ::.::
NP_001 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EPWMMEKKLSKDWESRWENKELSTKKDIYDEDSPQPVTMEKVVKQSYEFSNSNKNLEYTE
.: :.: .. . .:.. :.: . ...::. . :: . .. ::.. .
NP_001 KPLTMKK---HEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD-SFQKVTLRRYE-NYGHDNLQFKK
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB0 -CDTF-RSTFHSKSTLSEPQN-NSAEGNSHKYDILKKNLSKKSVIKSERI-NGGKKLLNS
:.. . :... . : ...... . : : . : : . ..: . ::: ..
NP_001 GCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 NKSGAAFNQSKSLTLPQTCNR-EKIYTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECG
. : :::::..:: . . :: . : ::::::. .: :. : ::::::: :.:..::
NP_001 IECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 KTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCIECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFS
:.::. : :: :.: ::::::::: ::::::...:.::.:. :::::::.: .:::.:.
NP_001 KAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 RVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGKAFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSH
: :.: : ::. :: :.:. ::::: : : : :.. :::::::.:.:::.:: :
NP_001 RSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB0 LTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSSFSFLVQHQSIHTEEKPFEV
:: :. ::: .: :.:..: :.:. : :. :. ::: :::..
NP_001 LTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTH
360 370 380 390 400 410
NP_001 KIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIH
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 559 init1: 559 opt: 572 Z-score: 356.1 bits: 75.2 E(85289): 4.3e-13
Smith-Waterman score: 572; 56.9% identity (78.8% similar) in 137 aa overlap (231-367:399-535)
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 YTCSECGKAFGKQSILNRHWRIHTGEKPYECRECGKTFSHGSSLTRHQISHSGEKPYKCI
:.:::..:...:::: :.: :.:..:.::
NP_001 YKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCE
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 ECGKAFSHGSSLTNHQSTHTGEKPYECMNCGKSFSRVSLLIQHLRIHTQEKRYECRICGK
::::::. : ::.:. :::::::.: .:::.:. : : : :::: :: :.:. :::
NP_001 ECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGK
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 AFIHSSSLIHHQKSHTGEKPYECRECGKAFCCSSHLTQHQRIHSMKKKYECNKCLKVFSS
:: .: : .:.. :::::::.:.::::.: : : :: :. ::. .:
NP_001 AFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
490 500 510 520 530
390
pF1KB0 FSFLVQHQSIHTEEKPFEV
399 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:17:05 2016 done: Sat Nov 5 20:17:07 2016
Total Scan time: 7.920 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]