Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0968
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0968, 431 aa
1>>>pF1KB0968 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5342+/-0.000948; mu= -2.8555+/- 0.057
mean_var=453.6777+/-99.512, 0's: 0 Z-trim(118.0): 608 B-trim: 918 in 1/53
Lambda= 0.060214
statistics sampled from 18107 (18878) to 18107 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.84), E-opt: 0.2 (0.58), width: 16
Scan time: 3.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 431) 3097 282.9 4.3e-76
CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 413) 2986 273.2 3.3e-73
CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 ( 376) 813 84.4 2.1e-16
CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 490) 808 84.1 3.4e-16
CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 508) 808 84.1 3.4e-16
CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 ( 484) 793 82.8 8.2e-16
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7 ( 784) 618 67.8 4.2e-11
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2 ( 398) 605 66.3 6e-11
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 778) 606 66.8 8.6e-11
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 785) 606 66.8 8.7e-11
>>CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 (431 aa)
initn: 3097 init1: 3097 opt: 3097 Z-score: 1479.6 bits: 282.9 E(32554): 4.3e-76
Smith-Waterman score: 3097; 100.0% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 GDAYPAPFTSTNGLLSPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHSFPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDAYPAPFTSTNGLLSPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHSFPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 CLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TLPTGPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGNSGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TLPTGPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGNSGQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 CGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 KRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAPG
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB0 GSPEQSNLLEI
:::::::::::
CCDS44 GSPEQSNLLEI
430
>>CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 (413 aa)
initn: 2986 init1: 2986 opt: 2986 Z-score: 1427.7 bits: 273.2 E(32554): 3.3e-73
Smith-Waterman score: 2986; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (19-431:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 GDAYPAPFTSTNGLLSPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHSFPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GDAYPAPFTSTNGLLSPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHSFPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 CLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TLPTGPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGNSGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TLPTGPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGNSGQL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPG
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 CGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 KRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAPG
350 360 370 380 390 400
430
pF1KB0 GSPEQSNLLEI
:::::::::::
CCDS73 GSPEQSNLLEI
410
>>CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 (376 aa)
initn: 700 init1: 526 opt: 813 Z-score: 408.0 bits: 84.4 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 857; 40.7% identity (59.0% similar) in 398 aa overlap (59-427:8-376)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 GSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYP-APFTSTNGL-LSPAGSPPAPTS
..:. . :: .: : :.: . . ::
CCDS11 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTS
10 20 30
90 100 110 120
pF1KB0 GYANDYP-PFS----HSFP-GPTGTQDPGLLVPKGHSSSDC---------LPSVYTSL--
:.::: :.. .:.: :: . : .: . : : :. ...:
CCDS11 PEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPEVDFSQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 -DMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQGTLPTGPAQ
::.: : ::.. : :: :::.::: .:. . ::.: :.:..
CCDS11 PDMSHHYESWFRP-TH------PGAEDGSWWDLHPGTSWMDLPH-----TQGAL-TSPGH
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 P-PLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQP--GPQHVL-PQDVYKPKAVG--NSGQLEG
: :. : : .: : :.: : : : : ::.: : : : :. .: :..
CCDS11 PGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAKALEVAAPESQGLDS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB0 S-GGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAA--GLRKKPIHSCHIP
: :: :.:. . ..:.. : :::: : ::::: . : .:: .:.::::
CCDS11 SLDGAARPKGSRRSVP-----RSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIP
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 GCGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLC
::::.:.:.::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::..::: ::: : .:
CCDS11 GCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVC
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 SKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAP
:. : :::::.::..:: : :: . : ..:: .:. . .: .. . :
CCDS11 SRVFMRSDHLAKHMKTH---------EGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAE-
320 330 340 350 360
420 430
pF1KB0 GGSPEQSNLLEI
:: ::
CCDS11 -GSVAPSN
370
>>CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 (490 aa)
initn: 702 init1: 702 opt: 808 Z-score: 404.3 bits: 84.1 E(32554): 3.4e-16
Smith-Waterman score: 993; 40.2% identity (64.3% similar) in 440 aa overlap (13-430:63-490)
10 20 30 40
pF1KB0 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKA
:.: : .:: . .... . :: . : .
CCDS53 WKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGS
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90
pF1KB0 GTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYPA---PFTSTNGLL-SPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHS
.. .:. :. .:. . . : : ::.. ... .:. : . .: .. .::
CCDS53 PGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 FPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGP--GNT-P
:...: ... : :.: : : ..: . :.::: ::.: . : :.. . :..
CCDS53 ---QDGSHQP-VFISKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPS-HPGLGAAGEVGSAGA
160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 TPWWDMHPGGNWLG-GGQGQGDGLQGTL-PT-GPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPA
. :::. :..:. . ... .: :.: :. : : :. : : ::.. :. . . .
CCDS53 SSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB0 ---PHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGN-----SGQLEGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSG
:::.:. ::.. : .:: :. . : :.::. : :. .:. .:.
CCDS53 GASSHLLSPAGQHLM--DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSA
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 ---AGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGKVYGKASHLKAHLRWHTGE
.::..:::::::: :::: :.:.::.: .::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS53 RRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGE
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGP
::::::::::::::::::::.::.:::: ::.:.: .:.::: :::::::: .::. :
CCDS53 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGG
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KB0 GPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPA-TPEKAPGGSPEQSNLLEI
: .: : : . : . :. .. : .:: : . : ::
CCDS53 GGGSAGS---GSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
450 460 470 480 490
>>CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 850 init1: 702 opt: 808 Z-score: 404.1 bits: 84.1 E(32554): 3.4e-16
Smith-Waterman score: 993; 40.2% identity (64.3% similar) in 440 aa overlap (13-430:81-508)
10 20 30 40
pF1KB0 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKA
:.: : .:: . .... . :: . : .
CCDS43 WKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGS
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90
pF1KB0 GTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYPA---PFTSTNGLL-SPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHS
.. .:. :. .:. . . : : ::.. ... .:. : . .: .. .::
CCDS43 PGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHS
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 FPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGP--GNT-P
:...: ... : :.: : : ..: . :.::: ::.: . : :.. . :..
CCDS43 ---QDGSHQP-VFISKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPS-HPGLGAAGEVGSAGA
180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 TPWWDMHPGGNWLG-GGQGQGDGLQGTL-PT-GPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPA
. :::. :..:. . ... .: :.: :. : : :. : : ::.. :. . . .
CCDS43 SSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSS
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260
pF1KB0 ---PHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGN-----SGQLEGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSG
:::.:. ::.. : .:: :. . : :.::. : :. .:. .:.
CCDS43 GASSHLLSPAGQHLM--DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSA
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 ---AGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGKVYGKASHLKAHLRWHTGE
.::..:::::::: :::: :.:.::.: .::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 RRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGE
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGP
::::::::::::::::::::.::.:::: ::.:.: .:.::: :::::::: .::. :
CCDS43 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGG
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
pF1KB0 GPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPA-TPEKAPGGSPEQSNLLEI
: .: : : . : . :. .. : .:: : . : ::
CCDS43 GGGSAGS---GSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
470 480 490 500
>>CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 (484 aa)
initn: 1053 init1: 700 opt: 793 Z-score: 397.3 bits: 82.8 E(32554): 8.2e-16
Smith-Waterman score: 1069; 42.4% identity (66.7% similar) in 448 aa overlap (8-412:8-441)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLR---DSTTLGKAGTK--KPYSVGSDLS
:: ..:..:::::.:.:.:.:..::: .:....:.: . : : . .:.
CCDS46 MATSILGEEPRFGTTPLAMLAATCNKIGNTSPLTTLPESSAFAKGGFHPWKRSSSSCNLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB0 ASKTMGDAYPAPFTSTNGLLSPAGSP--------PAPTSG-YANDYPP-FSHSFPGPTGT
.: . : : . ...:: . .:. .:::. ...:: ::.: . ...
CCDS46 SSLS-GFAVATGGRGSGGLAGGSGAANSAFCLASTSPTSSAFSSDYGGLFSNSAAAAAAA
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB0 -----QDPG---LLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGISPGP--GNTP
:. : .. : :... ..: . :.::: ::::.:.:. .. : ...
CCDS46 AGVSPQEAGGQSAFISKVHTTAA--DGLYPRVGMAHPYESWYKSGFHSTLAAGEVTNGAA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 TPWWDMHPG-GNWLGGGQGQGDGLQGTLPTGPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYP---
. :::.: . :.:: :. . :::..: .: : :. :: :: ::. :. . .
CCDS46 SSWWDVHSSPGSWLEV-QNPAGGLQSSLHSGAPQASLHSQLGTYNPDFSSLTHSAFSSTG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB0 -------APHLLQPGPQHVLPQDVYKP---KAVGNSGQLEGSGGAKPPRGASTGGSGGYG
: :::. . ::.: :: .:: . .:. . ..... ::.....:: .
CCDS46 LGSSAAAASHLLSTS-QHLLAQDGFKPVLPSYSDSSAAVAAAAASAMISGAAAAAAGGSS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB0 GSGA----GRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGKVYGKASHLKAHLRW
. .: ::..:::::::: :::: :.:.::.: .::::::::::::::.:::::::::
CCDS46 ARSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRW
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 HTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHG
::::::::::::::::::::::::.::.:::: ::.:.: .:.::: :::::::: .::.
CCDS46 HTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHIKTHN
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 EPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAPGGSPEQSNLLEI
: : : : . .::: : ::
CCDS46 GGGGGKKGSD--------SDTDASNLETPR-SESPDLILHDSGVSAARAAAAAAAAAAAA
420 430 440 450 460
CCDS46 AAAASAGGKEAASGPNDS
470 480
>>CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7 (784 aa)
initn: 675 init1: 529 opt: 618 Z-score: 312.8 bits: 67.8 E(32554): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 618; 46.0% identity (62.9% similar) in 224 aa overlap (217-430:562-782)
190 200 210 220 230 240
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: : . : . : . : .:. .: ... :
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pF1KB0 AKPP---------RGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSC
: : .: .:. . :. : .:.::::.: : :. : :: : :
CCDS53 AVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRLRRVACSCPNCREGEGRGSNEPG--KKKQHIC
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:: ::::::::.:::.::::::::::::.:::.::::::::::::.:: :::: ::.: :
CCDS53 HIEGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFICNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKRFEC
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::::: :::::::: .:: . : . :: :. :. .:: . : .
CCDS53 PECSKRFMRSDHLSKHVKTHQNKKGGGTALAIVTSGELDSS-VTEVLGSPRIVTVAAISQ
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420 430
pF1KB0 KAPGGSPEQSNLLEI
. ..:. :. .:
CCDS53 DSNPATPNVSTNMEEF
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::::.:.:.::..: :.. : .
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40 50 60 70 80 90
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.::. . .:.. .:. : . : : : : . :.: . :. : :.. :
CCDS33 PALGSPSRLFHPWT--ADMPAHSP--GALPPPHPSLG--LTPQKTHLQPSFGAAHELPLT
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100 110 120 130 140
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: . :.: :.. :. .: .... :: :..: :
CCDS33 PPADPSYPYEFSPVKMLPSSMAALPASCAPAYVPYAAQAALPPGYSNLLPPPPPPP--PP
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.::.:. :::.. .: :.. :.::.:. .: :. : .:..
CCDS33 PTCRQLSPNPAPDDLPWWSIPQAGAGPGASGVPGSGLSGAC-AGA------PHAPRFPAS
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210 220 230 240 250 260
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: : : :: : :: :.: . .. :. . .: : .:.
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: : : ::::: :: : :: : ::.:::::::::.:::::::::::
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:::::::::::::: :::::::.::.:::: ::.:.: :.::: :::::.:: .::
CCDS33 GERPFVCNWLFCGKSFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPECGKRFMRSDHLAKHVKTHQNK
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CCDS33 KLKVAEAGVKREDARDL
390
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: .:. : ::: ::::::::.:::.::::::::::::.:.: .:::::::::::.::
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:::: ::::.: : ::: :::::::: .:: . ::: : : : : .. :
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.: : :::
CCDS44 GSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGF
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>>CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 (785 aa)
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Smith-Waterman score: 614; 47.5% identity (62.1% similar) in 219 aa overlap (195-410:542-742)
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. ..: . :: : :. : : : . .
CCDS88 PAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAG
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. .. : :. : :.: :.: : : : .: :: :.. : :..
CCDS88 GDGIHDDTAGGEEG--ENSPDAQPQAGRRTR-----------REACTCPYCKDSEGRGSG
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CCDS88 DPGKKKQ--HICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]