Result of FASTA (ccds) for pF1KB0994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0994, 461 aa
  1>>>pF1KB0994 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5056+/-0.000843; mu= 12.2879+/- 0.050
 mean_var=110.1701+/-22.979, 0's: 0 Z-trim(109.8): 99  B-trim: 219 in 1/50
 Lambda= 0.122192
 statistics sampled from 11027 (11137) to 11027 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.342), width:  16
 Scan time:  2.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10673.1 CORO1A gene_id:11151|Hs108|chr16       ( 461) 3136 563.7 1.4e-160
CCDS8164.1 CORO1B gene_id:57175|Hs108|chr11        ( 489) 2190 397.0 2.3e-110
CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12        ( 474) 2155 390.8 1.6e-108
CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12       ( 527) 2155 390.8 1.8e-108
CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17        ( 472) 2143 388.7 7.1e-108
CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15       ( 475) 1381 254.3   2e-67
CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15       ( 480) 1381 254.3   2e-67
CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9          ( 525) 1349 248.7 1.1e-65
CCDS10513.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16        ( 925)  740 141.5 3.4e-33
CCDS58418.1 PAM16 gene_id:100529144|Hs108|chr16    (1048)  740 141.6 3.8e-33
CCDS58417.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16        ( 907)  648 125.3 2.6e-28
CCDS55982.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16        ( 840)  538 105.9 1.7e-22


>>CCDS10673.1 CORO1A gene_id:11151|Hs108|chr16            (461 aa)
 initn: 3136 init1: 3136 opt: 3136  Z-score: 2996.4  bits: 563.7 E(32554): 1.4e-160
Smith-Waterman score: 3136; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 RMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 APFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 APFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 EDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRAAPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRAAPE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460 
pF1KB0 ASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK
              430       440       450       460 

>>CCDS8164.1 CORO1B gene_id:57175|Hs108|chr11             (489 aa)
 initn: 2244 init1: 1235 opt: 2190  Z-score: 2094.7  bits: 397.0 E(32554): 2.3e-110
Smith-Waterman score: 2217; 66.5% identity (86.2% similar) in 477 aa overlap (3-456:4-479)

                10        20        30        40        50         
pF1KB0  MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAF
          :.:::.::::::::::.: ::::::.:::..:::: ::::::::.:.: ::::::::
CCDS81 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
       :::::.::::.::  :::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.::..::  :
CCDS81 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB0 LREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTI
       : ::::.::::::::::.::: ::.:::::::::::...:.:::.  .  :   .::: :
CCDS81 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDS-LHPDLI
              130       140       150       160       170          

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 YSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGF
       :.:.:...:.:.:..:.:: ::::.::.::.:::... :::.::.::.:...::..::::
CCDS81 YNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGF
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 SRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITS
       :::::::.:::: ..::::..:::::.:.:.::::.::::..::.:::::::::::::: 
CCDS81 SRMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITE
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 EAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLF
       : :..:.:. :.::: ::::: ::::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::
CCDS81 EPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLF
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400         410       
pF1KB0 QEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LDTGRRRA
       :.:::: ::::. :: ::::..:::: :.::::...::: :.:.:...:   :. .:   
CCDS81 QDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAM
     360       370       380       390       400       410         

       420              430                     440       450      
pF1KB0 APEAS--GTPSS-----DAV-----------SRLEE---EMRKLQATVQELQKRLDRLEE
       :: .:  :.:.:     ::.           ..:::   :.: :.: :.:   :. ::::
CCDS81 APGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEE
     420       430       440       450       460       470         

        460      
pF1KB0 TVQAK     
                 
CCDS81 QLGRMENGDA
     480         

>>CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12             (474 aa)
 initn: 2181 init1: 1198 opt: 2155  Z-score: 2061.6  bits: 390.8 E(32554): 1.6e-108
Smith-Waterman score: 2170; 65.3% identity (88.0% similar) in 467 aa overlap (3-456:2-467)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
         :.:::.::::::::: .: ::::.:.:::..::::.::::::.:::.: :::::::::
CCDS91  MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
       :::: ::::.::. :::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.::..:: : :
CCDS91 VLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
        :::: ::::.::::::::: ::.::::::::::.:..:.:::: :...:  ..: : ::
CCDS91 TEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLD-DMHSDMIY
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFS
       .:.:.:.:.::::. .::.::.:.:::  .::::.. :::.::.::.:...:...:::::
CCDS91 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 RMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSE
       ::::::.:::. :...::..:.:.:::.::::::.::::.:.::::::::::::::::.:
CCDS91 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 APFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQ
       .:..:::. ::::: ::::::::::::.:::::::::.:::::.:::: :::::::::::
CCDS91 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400         410        
pF1KB0 EDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LD---TGRR
       .:::: ::::. :: ::::. :..: :.::::: ::.: :.:.:.: .   ::   :. .
CCDS91 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANK
      360       370       380       390       400       410        

             420        430          440       450       460   
pF1KB0 R----AAPE-ASGTPSSDAVSRLEE---EMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK  
       .    . :. .. : : .  ..:.:   :..... :. . ..:...::.       
CCDS91 KCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
      420       430       440       450       460       470    

>>CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12            (527 aa)
 initn: 2181 init1: 1198 opt: 2155  Z-score: 2060.9  bits: 390.8 E(32554): 1.8e-108
Smith-Waterman score: 2170; 65.3% identity (88.0% similar) in 467 aa overlap (3-456:55-520)

                                           10        20        30  
pF1KB0                             MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQ
                                     :.:::.::::::::: .: ::::.:.:::.
CCDS61 ACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSR
           30        40        50        60        70        80    

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB0 TTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPH
       .::::.::::::.:::.: ::::::::::::: ::::.::. :::::::.::::: ::::
CCDS61 VTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPH
           90       100       110       120       130       140    

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB0 NDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPLREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGC
       ::.::::::::::::::.::..:: : : :::: ::::.::::::::: ::.::::::::
CCDS61 NDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGC
          150       160       170       180       190       200    

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB0 DNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVA
       ::.:..:.:::: :...:  ..: : ::.:.:.:.:.::::. .::.::.:.:::  .::
CCDS61 DNAIIIWNVGTGEALINLD-DMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVA
          210       220        230       240       250       260   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB0 EKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLL
       ::.. :::.::.::.:...:...:::::::::::.:::. :...::..:.:.:::.::::
CCDS61 EKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLL
           270       280       290       300       310       320   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB0 PFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKC
       ::.::::.:.::::::::::::::::.:.:..:::. ::::: ::::::::::::.::::
CCDS61 PFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKC
           330       340       350       360       370       380   

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB0 EIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISL
       :::::.:::::.:::: :::::::::::.:::: ::::. :: ::::. :..: :.::::
CCDS61 EIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISL
           390       400       410       420       430       440   

            400         410              420        430            
pF1KB0 KDGYVPPKSRELRVNRG--LD---TGRRR----AAPE-ASGTPSSDAVSRLEE---EMRK
       : ::.: :.:.:.: .   ::   :. ..    . :. .. : : .  ..:.:   :...
CCDS61 KHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKS
           450       460       470       480       490       500   

     440       450       460   
pF1KB0 LQATVQELQKRLDRLEETVQAK  
       .. :. . ..:...::.       
CCDS61 IKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
           510       520       

>>CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17             (472 aa)
 initn: 2214 init1: 1221 opt: 2143  Z-score: 2050.2  bits: 388.7 E(32554): 7.1e-108
Smith-Waterman score: 2143; 67.0% identity (86.2% similar) in 463 aa overlap (1-455:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
       :::.:::.::::::::: ::::: :::.:::..::::.::::::::.:.: ::.:::::.
CCDS11 MSRRVVRQSKFRHVFGQAAKADQAYEDIRVSKVTWDSSFCAVNPKFLAIIVEAGGGGAFI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
       ::::.:::::::: : : ::::::::: :::::::::::.:.: :.:::.:::   :  .
CCDS11 VLPLAKTGRVDKNYPLVTGHTAPVLDIDWCPHNDNVIASASDDTTIMVWQIPDYTPMRNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
        ::..:::::.:::::..:: ::.::::::: ::::..:.:::: ..:.:  ..:::.:.
CCDS11 TEPIITLEGHSKRVGILSWHPTARNVLLSAGGDNVIIIWNVGTGEVLLSLD-DMHPDVIH
              130       140       150       160       170          

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFS
       :: :. .:.:. :.:.:: .:::.:::: ::::.   ::: ::.::::. .:.:.::::.
CCDS11 SVCWNSNGSLLATTCKDKTLRIIDPRKGQVVAERFAAHEGMRPMRAVFTRQGHIFTTGFT
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 RMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSE
       :::.:...::: ...:::..:::.:::.::::::.:::..::::::::::::::::::.:
CCDS11 RMSQRELGLWDPNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVYLCGKGDSSIRYFEITDE
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 APFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQ
        ::.:::. ::::: :::::.::::::.:.:::::::::::::.:::: :::::::::::
CCDS11 PPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400         410        
pF1KB0 EDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LD----TGR
       .:::: : ::.::: :.:::.:.:: :.::::.::::::: :::::..   ::    .: 
CCDS11 DDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRELRVTKRNILDVRPPSGP
     360       370       380       390       400       410         

          420         430       440       450       460      
pF1KB0 RRAAPEASGTPSSD--AVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK     
       ::.   :: .: :.  ..  : ::.. :.  ::  ..:.  ::           
CCDS11 RRSQS-ASDAPLSQQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQRITALENMLCELVDGTD
     420        430       440       450       460       470  

>>CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15            (475 aa)
 initn: 1376 init1: 603 opt: 1381  Z-score: 1324.2  bits: 254.3 E(32554): 2e-67
Smith-Waterman score: 1389; 44.3% identity (70.8% similar) in 476 aa overlap (3-457:4-471)

                10        20        30        40        50         
pF1KB0  MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAF
          :   ::::::.:.:. :. ..:.. . ..... :. ::::: .:.:.. :..:::.:
CCDS53 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
       ::.:: .:::.. : : :::: . :::: : :  ::.::: ::: .: .::::.:::   
CCDS53 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150         160       170       
pF1KB0 LREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVW--DVGTGAAMLTLGPEVHPD
       . : .. :.::..:::.: :: :..:.:.::: :  ...:  :::  . :.    . : :
CCDS53 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMI----DCHTD
              130       140       150       160       170          

       180       190       200       210        220       230      
pF1KB0 TIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKD-RPHEGTRPVRAVFVSEGK-IL
       .:  .... ::.:. :.:.::..:.::::.: :. : . . :   :  :.::... : .:
CCDS53 VILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLL
        180       190       200       210          220       230   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB0 TTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYF
       ::: :: . ::.:::: . :  ::  .:.:  ::.:.::.: ::...:: ::::..:::.
CCDS53 TTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYY
           240       250       260       270       280       290   

         300       310       320       330       340         350   
pF1KB0 EITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERR--CEPIAMTVP
       ::..: :.: ::  : :   :.:.: :::.::.:. ::. :::::   .   :::.: ::
CCDS53 EISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVP
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390                400    
pF1KB0 RKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGY---------VPPKSREL
       :.:: .:::.:: : : .:::: .::::: .  :.:.:::.::         .: : .. 
CCDS53 RRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKS
           360       370       380       390       400       410   

          410       420             430       440       450        
pF1KB0 RVNRGLDTGRRRAAPEASGT------PSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETV
        :  :.:   . . :.. .        ..: . ::.::. . .  ...:: .:  :... 
CCDS53 VVVNGIDL-LENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSP
           420        430       440       450       460       470  

      460 
pF1KB0 QAK
          
CCDS53 KNC
          

>>CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15            (480 aa)
 initn: 1376 init1: 603 opt: 1381  Z-score: 1324.1  bits: 254.3 E(32554): 2e-67
Smith-Waterman score: 1389; 44.3% identity (70.8% similar) in 476 aa overlap (3-457:9-476)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB0       MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEAS
               :   ::::::.:.:. :. ..:.. . ..... :. ::::: .:.:.. :..
CCDS10 MTVTKMSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESA
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB0 GGGAFLVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDG
       :::.:::.:: .:::.. : : :::: . :::: : :  ::.::: ::: .: .::::.:
CCDS10 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150         160       170  
pF1KB0 GLMLPLREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVW--DVGTGAAMLTLGP
       ::   . : .. :.::..:::.: :: :..:.:.::: :  ...:  :::  . :.    
CCDS10 GLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMI----
              130       140       150       160       170          

            180       190       200       210        220       230 
pF1KB0 EVHPDTIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKD-RPHEGTRPVRAVFVSE
       . : :.:  .... ::.:. :.:.::..:.::::.: :. : . . :   :  :.::...
CCDS10 DCHTDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGN
        180       190       200       210       220          230   

              240       250       260       270       280       290
pF1KB0 GK-ILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDS
        : .:::: :: . ::.:::: . :  ::  .:.:  ::.:.::.: ::...:: ::::.
CCDS10 MKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDG
           240       250       260       270       280       290   

              300       310       320       330       340          
pF1KB0 SIRYFEITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERR--CEPI
       .:::.::..: :.: ::  : :   :.:.: :::.::.:. ::. :::::   .   :::
CCDS10 NIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPI
           300       310       320       330       340       350   

      350       360       370       380       390                  
pF1KB0 AMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGY---------VPP
       .: :::.:: .:::.:: : : .:::: .::::: .  :.:.:::.::         .: 
CCDS10 SMIVPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPI
           360       370       380       390       400       410   

     400       410       420             430       440       450   
pF1KB0 KSRELRVNRGLDTGRRRAAPEASGT------PSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDR
       : ..  :  :.:   . . :.. .        ..: . ::.::. . .  ...:: .:  
CCDS10 KEKKSVVVNGIDL-LENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKN
           420        430       440       450       460       470  

           460 
pF1KB0 LEETVQAK
       :...    
CCDS10 LRNSPKNC
            480

>>CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9               (525 aa)
 initn: 1246 init1: 590 opt: 1349  Z-score: 1293.1  bits: 248.7 E(32554): 1.1e-65
Smith-Waterman score: 1349; 46.4% identity (74.0% similar) in 420 aa overlap (7-419:8-424)

                10        20        30        40        50         
pF1KB0  MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAF
              ::::::::::.::. ..::..: ..... :. ::::::.:.:.. : .:::::
CCDS67 MSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAF
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB0 LVLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLP
       ::.:: .::..: . : :::: . :::. : : .:  ::: ::: :. .: ::   :   
CCDS67 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB0 LREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGP----EVH
       :      : ::..:::.: :: :: :.:.::: :  .:.:.. :  ...: .:      :
CCDS67 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVIT-SPMSTISCH
              130       140       150       160       170          

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB0 PDTIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSE-GKI
        :.: :.... .:.:. :.:.:...:.:.:: :::. : .  ..: :  ...:...  :.
CCDS67 QDVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVLQEAS--YKGHRASKVLFLGNLKKL
     180       190       200       210         220       230       

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB0 LTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRY
       ..:: :: ..:::::::  .:  ::  ..:: :::::.::.: ::...:. ::::..:::
CCDS67 MSTGTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRY
       240       250       260       270       280       290       

          300       310       320       330       340         350  
pF1KB0 FEITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRC--EPIAMTV
       .:.... : : ::. . : . :.:.: ::::::.:..::: :::::   .   :::.: :
CCDS67 YEVSADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIV
       300       310       320       330       340       350       

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB0 PRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDT
       ::.:. .:::.:::::: .:.:::.:::.: .  :.:.::. :    . . : ..: . .
CCDS67 PRRSESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFN
       360       370       380       390       400       410       

            420       430       440       450       460            
pF1KB0 GRRRAAPEASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK           
       .   :.:                                                     
CCDS67 SMAPASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPP
       420       430       440       450       460       470       

>>CCDS10513.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16             (925 aa)
 initn: 633 init1: 392 opt: 740  Z-score: 709.3  bits: 141.5 E(32554): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 845; 35.2% identity (62.4% similar) in 457 aa overlap (8-456:470-913)

                                      10        20         30      
pF1KB0                        MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVR-VSQTT--
                                     ::::::. :   . :.   ... .. ::  
CCDS10 TPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPG
     440       450       460       470       480       490         

           40        50        60        70         80        90   
pF1KB0 WDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRV-DKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHN
        ..:::: :   :: .   :.::   :: : : ::. :   ::.  . : : :.:: : .
CCDS10 ESDGFCA-NKLRVA-VPLLSSGGQVAVLELRKPGRLPDTALPTL-QNGAAVTDLAWDPFD
     500        510        520       530       540        550      

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB0 DNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPLREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCD
        . .: ..::  . .:..:  ::   :  : ..: :::...  . .:  : ::: :.. :
CCDS10 PHRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYD
        560       570       580       590       600       610      

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB0 NVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAE
        .. .::. .::  : :  . : : :.:. :: ::  . : :.: :::. .::.:    .
CCDS10 LTVRIWDLQAGADRLKL--QGHQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQ
        620       630         640       650       660       670    

           220       230        240       250        260       270 
pF1KB0 KDRPHEGTRPVRAVFVSEGK-ILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEE-PLSLQELDTSSGVL
       .    .: : .: :.: .:. .:..::. .::::. :.... :   ::..  ::.. ..:
CCDS10 EGPGPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTL
          680       690       700       710       720       730    

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB0 LPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNK
       :: .::::..: : ::::. .  .:.  :.::.   . :.: . ..:.  .::   .: .
CCDS10 LPSYDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHKGLVLLPKTECDVRE
          740       750       760       770       780       790    

             340       350        360       370        380         
pF1KB0 CEIARFYKLHERRCEPIAMTVPR-KSDLFQEDLYPPTAGP-DPALTAEEWLGGRDAGPLL
        :. :  .:..   ::.:. .:: ....::.:..: ::   .:.:.:: :: : .. : :
CCDS10 VELMRCLRLRQSSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVIWEPVLSAEAWLQGANGQPWL
          800       810       820       830       840       850    

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB0 ISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRAAPEASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQK
       .::.   . : :.  :     ..  ::: : ..      . .. .::.  :.: : .: .
CCDS10 LSLQPPDMSPVSQAPR-----EAPARRA-PSSAQYLEEKSDQQKKEEL--LNAMVAKLGN
          860       870             880       890         900      

     450       460        
pF1KB0 RLDRLEETVQAK       
       : : : .            
CCDS10 REDPLPQDSFEGVDEDEWD
        910       920     

>--
 initn: 633 init1: 392 opt: 740  Z-score: 709.3  bits: 141.5 E(32554): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 740; 30.9% identity (60.6% similar) in 424 aa overlap (7-429:5-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
             : :::::. ..: . ..   :.:..  :  :    .. .   .  ...  :.. 
CCDS10   MNRFRVSKFRHTEARPPRRESWISDIRAG--TAPSCRNHIKSSCSLIAFNSDRPGVLG
                 10        20          30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
       ..::   :.  . .  .  :.  : :. . : .: ..:.:: : :: .:..:  :  :: 
CCDS10 IVPLQGQGEDKRRVAHLGCHSDLVTDLDFSPFDDFLLATGSADRTVKLWRLPGPGQALP-
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
         : :.:  .   : .. .: :....:.::.  ... :::..    .  :.  .: : . 
CCDS10 SAPGVVLGPEDLPVEVLQFHPTSDGILVSAA-GTTVKVWDAAKQQPLTELA--AHGDLVQ
         120       130       140        150       160         170  

              190       200       210       220       230          
pF1KB0 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGK-ILTTGF
       :. :::::.:. :.:.::..::..::    .... . ::..:  : ....  . ...:::
CCDS10 SAVWSRDGALVGTACKDKQLRIFDPRTKPRASQSTQAHENSRDSRLAWMGTWEHLVSTGF
            180       190       200       210       220       230  

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 SRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITS
       ..: ::.: ::::. .   :.   :::: : :.:..:::.... : :::. ..  .:.. 
CCDS10 NQMREREVKLWDTRFFSSALASLTLDTSLGCLVPLLDPDSGLLVLAGKGERQLYCYEVVP
            240       250       260       270       280       290  

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 EAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLF
       . : :  ...   .   :: . .:...: : .::. :  .: .    ::.. ::::.  :
CCDS10 QQPALSPVTQCVLESVLRGAALVPRQALAVMSCEVLRVLQLSDTAIVPIGYHVPRKAVEF
            300       310       320       330       340       350  

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB0 QEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRAAP
       .:::.: :::  ::   . : .: .     .::. .  :  :    .    .     : :
CCDS10 HEDLFPDTAGCVPATDPHSWWAGDNQQVQKVSLNPACRPHPSFTSCLVPPAEPLPDTAQP
            360       370       380       390       400       410  

     420       430       440       450       460                   
pF1KB0 EASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK                  
        .  :: .::                                                  
CCDS10 AVMETPVGDADASEGFSSPPSSLTSPSTPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSK
            420       430       440       450       460       470  

>>CCDS58418.1 PAM16 gene_id:100529144|Hs108|chr16         (1048 aa)
 initn: 633 init1: 392 opt: 740  Z-score: 708.6  bits: 141.6 E(32554): 3.8e-33
Smith-Waterman score: 845; 35.2% identity (62.4% similar) in 457 aa overlap (8-456:470-913)

                                      10        20         30      
pF1KB0                        MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVR-VSQTT--
                                     ::::::. :   . :.   ... .. ::  
CCDS58 TPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPG
     440       450       460       470       480       490         

           40        50        60        70         80        90   
pF1KB0 WDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRV-DKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHN
        ..:::: :   :: .   :.::   :: : : ::. :   ::.  . : : :.:: : .
CCDS58 ESDGFCA-NKLRVA-VPLLSSGGQVAVLELRKPGRLPDTALPTL-QNGAAVTDLAWDPFD
     500        510        520       530       540        550      

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB0 DNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPLREPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCD
        . .: ..::  . .:..:  ::   :  : ..: :::...  . .:  : ::: :.. :
CCDS58 PHRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYD
        560       570       580       590       600       610      

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB0 NVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIYSVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAE
        .. .::. .::  : :  . : : :.:. :: ::  . : :.: :::. .::.:    .
CCDS58 LTVRIWDLQAGADRLKL--QGHQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQ
        620       630         640       650       660       670    

           220       230        240       250        260       270 
pF1KB0 KDRPHEGTRPVRAVFVSEGK-ILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEE-PLSLQELDTSSGVL
       .    .: : .: :.: .:. .:..::. .::::. :.... :   ::..  ::.. ..:
CCDS58 EGPGPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTL
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       :: .::::..: : ::::. .  .:.  :.::.   . :.: . ..:.  .::   .: .
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       .::.   . : :.  :     ..  ::: : ..      . .. .::.  :.: : .: .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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