FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0999, 2450 aa 1>>>pF1KB0999 2450 - 2450 aa - 2450 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.2978+/-0.000493; mu= -29.3153+/- 0.031 mean_var=745.8416+/-155.613, 0's: 0 Z-trim(124.7): 123 B-trim: 504 in 1/60 Lambda= 0.046962 statistics sampled from 46682 (46842) to 46682 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.549), width: 16 Scan time: 25.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006303 (OMIM: 600848) nuclear receptor corepres (2514) 12442 860.0 0 NP_001070729 (OMIM: 600848) nuclear receptor corep (2458) 10933 757.8 3.9e-217 NP_001193583 (OMIM: 600848) nuclear receptor corep (2504) 10933 757.8 4e-217 XP_016880892 (OMIM: 600849) PREDICTED: nuclear rec (2515) 3616 262.1 6.8e-68 XP_005256928 (OMIM: 600849) PREDICTED: nuclear rec (2515) 3616 262.1 6.8e-68 XP_016880897 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