Result of FASTA (omim) for
pF1KB1338
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1338, 605 aa
1>>>pF1KB1338 605 - 605 aa - 605 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4463+/-0.00038; mu= -8.9390+/- 0.024
mean_var=354.3922+/-73.585, 0's: 0 Z-trim(123.4): 39 B-trim: 544 in 1/59
Lambda= 0.068129
statistics sampled from 43223 (43272) to 43223 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16
Scan time: 14.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens] ( 632) 2700 279.4 2.6e-74
XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 576) 1324 144.1 1.3e-33
NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Hom ( 576) 1324 144.1 1.3e-33
XP_016882212 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 1324 144.1 1.4e-33
XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 1324 144.1 1.4e-33
XP_011525182 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 575) 1322 143.9 1.4e-33
NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Hom ( 575) 1322 143.9 1.4e-33
NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo s ( 584) 1116 123.6 1.8e-27
NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo s ( 641) 1006 112.9 3.5e-24
NP_037465 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform c [Homo s ( 550) 1001 112.3 4.4e-24
XP_016882211 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 550) 1001 112.3 4.4e-24
XP_011525183 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 551) 998 112.0 5.4e-24
XP_016882214 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 611) 998 112.1 5.8e-24
NP_001123543 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform a [Hom ( 662) 998 112.1 6.2e-24
NP_055481 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 iso ( 625) 598 72.8 4.1e-12
NP_001182484 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 ( 643) 576 70.6 1.9e-11
XP_016865576 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 518) 564 69.4 3.5e-11
NP_001182485 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 ( 625) 560 69.0 5.4e-11
XP_011533003 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 536) 558 68.8 5.5e-11
XP_016865577 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 468) 553 68.2 6.9e-11
NP_001096134 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform c [Hom ( 356) 345 47.7 8e-05
>>NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens] (632 aa)
initn: 2695 init1: 2695 opt: 2700 Z-score: 1455.1 bits: 279.4 E(85289): 2.6e-74
Smith-Waterman score: 4013; 95.6% identity (95.6% similar) in 632 aa overlap (1-605:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEK-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKPVPPASHRDEDLQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB1 --------------EVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LQLALRLSRQEHEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSI
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB1 LDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQP
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB1 WDLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGPPTTDPWALNSPHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 WDLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGPPTTDPWALNSPHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGAS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB1 TFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILG
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB1 EALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQVAKTRNPFLTGLSAPSPTNPFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQVAKTRNPFLTGLSAPSPTNPFG
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB1 AGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFP
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AGEPGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFP
550 560 570 580 590 600
580 590 600
pF1KB1 QAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
610 620 630
>>XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (576 aa)
initn: 1236 init1: 876 opt: 1324 Z-score: 724.7 bits: 144.1 E(85289): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.6% identity (65.2% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
:.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
XP_005 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
XP_005 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..: .
XP_005 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLA-----------------------QT
130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
.. :: .:. : . ::: ::.:::::::::::::::.:::.. : . .
XP_005 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280
pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS------------QSSILDLADIFV-PALAPP
. : .. ....:.: :: .: .. .:. . .::..::::.:. :: ::
XP_005 QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB1 STHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG-----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DL
..::: :. :.. ... :: :.::::. : :. . ..::
XP_005 ----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPA
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380
pF1KB1 TPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLE
.: : .::: ::. :: :: :::. ...: . : : : ::::.:
XP_005 APAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-P
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB1 TSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEP
.. . .:... : :. . :. :::.. :: ::.:.. :. . :
XP_005 AKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KB1 DALDL----GILGEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----AP
:.:. : :.::. .: : .::::::::.:. ::.:::::. .:
XP_005 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
::. :::: : ..:: :::: . . ::::.: ::. . :.: .:::.
XP_005 PGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 MTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
. .:: :. .: : : .
XP_005 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL
560 570
>>NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Homo sa (576 aa)
initn: 1236 init1: 876 opt: 1324 Z-score: 724.7 bits: 144.1 E(85289): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.6% identity (65.2% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
:.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
NP_001 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..: .
NP_001 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLA-----------------------QT
130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
.. :: .:. : . ::: ::.:::::::::::::::.:::.. : . .
NP_001 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280
pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS------------QSSILDLADIFV-PALAPP
. : .. ....:.: :: .: .. .:. . .::..::::.:. :: ::
NP_001 QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB1 STHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG-----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DL
..::: :. :.. ... :: :.::::. : :. . ..::
NP_001 ----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPA
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380
pF1KB1 TPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLE
.: : .::: ::. :: :: :::. ...: . : : : ::::.:
NP_001 APAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-P
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB1 TSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEP
.. . .:... : :. . :. :::.. :: ::.:.. :. . :
NP_001 AKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KB1 DALDL----GILGEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----AP
:.:. : :.::. .: : .::::::::.:. ::.:::::. .:
NP_001 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
::. :::: : ..:: :::: . . ::::.: ::. . :.: .:::.
NP_001 PGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 MTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
. .:: :. .: : : .
NP_001 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL
560 570
>>XP_016882212 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (636 aa)
initn: 1236 init1: 876 opt: 1324 Z-score: 724.1 bits: 144.1 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.6% identity (65.2% similar) in 623 aa overlap (1-568:61-631)
10 20 30
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSN
:.::.::::.::::::::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB1 DPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGMLWRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSE
::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.:.:::: ::::::::::.::..::.:::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB1 RVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKT
::..::.::.:..::::::::.::::::::::::::.::..:::.::.:::.::.:::::
XP_016 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB1 KERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSRGSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEE
::..: . .. :: .:. : . ::: ::.::::
XP_016 KEKLA-----------------------QTATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEE
220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB1 ELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS-
:::::::::::.:::.. : . . . : .. ....:.: :: .: .. .:. .
XP_016 ELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAI
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310
pF1KB1 -----------QSSILDLADIFV-PALAPPSTHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG
.::..::::.:. :: :: ..::: :. :.. ... ::
XP_016 EESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWG
310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KB1 -----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA--
:.::::. : :. . ..:: .: : .::: ::. :: :: :::.
XP_016 GPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPAAPAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSS
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410
pF1KB1 -----LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQA
...: . : : : ::::.: .. . .:... : :. . :. :
XP_016 DGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-PAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTA
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460
pF1KB1 LPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDL----GILGEALTQPSKEARAC----
::.. :: ::.:.. :. . : :.:. : :.::. .: :
XP_016 LPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPP
480 490 500 510 520
470 480 490 500 510
pF1KB1 --RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----APQVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGET
.::::::::.:. ::.:::::. .: ::. :::: : ..:: :::: .
XP_016 TRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB1 GRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQA
. ::::.: ::. . :.: .:::. . .:: :. .: : : .
XP_016 ATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL
590 600 610 620 630
580 590 600
pF1KB1 GAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
>>XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (636 aa)
initn: 1236 init1: 876 opt: 1324 Z-score: 724.1 bits: 144.1 E(85289): 1.4e-33
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10 20 30
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSN
:.::.::::.::::::::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
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40 50 60 70 80 90
pF1KB1 DPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGMLWRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSE
::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.:.:::: ::::::::::.::..::.:::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB1 RVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKT
::..::.::.:..::::::::.::::::::::::::.::..:::.::.:::.::.:::::
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160 170 180 190 200 210
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::..: . .. :: .:. : . ::: ::.::::
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220 230 240 250 260
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:::::::::::.:::.. : . . . : .. ....:.: :: .: .. .:. .
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270 280 290 300 310
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.::..::::.:. :: :: ..::: :. :.. ... ::
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320 330 340 350 360
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:.::::. : :. . ..:: .: : .::: ::. :: :: :::.
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370 380 390 400 410
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...: . : : : ::::.: .. . .:... : :. . :. :
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420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460
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::.. :: ::.:.. :. . : :.:. : :.::. .: :
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470 480 490 500 510
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.::::::::.:. ::.:::::. .: ::. :::: : ..:: :::: .
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pF1KB1 GRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQA
. ::::.: ::. . :.: .:::. . .:: :. .: : : .
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10 20 30 40 50 60
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:.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
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:.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
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::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..: .
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.. :: .:. : . ::: ::.:::::::::::::::.:::.. : . .
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. : .. ....:.: :: .: .. .:. . .::..::::.:. :: ::
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220 230 240 250 260 270
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..::: :. :.. ... :: :.::::. : :. . ..::
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.: : .::: ::. :: :: :::. ...: . : : : ::::.:
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pF1KB1 TSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEP
.: : .: : :. . :. :::.. :: ::.:.. :. . :
XP_011 KPSTNG--TTAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
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:.:. : :.::. .: : .::::::::.:. ::.:::::. .:
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pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
::. :::: : ..:: :::: . . ::::.: ::. . :.: .:::.
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. .:: :. .: : : .
XP_011 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL
560 570
>>NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Homo sa (575 aa)
initn: 1236 init1: 876 opt: 1322 Z-score: 723.6 bits: 143.9 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.9% identity (64.7% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
:.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
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:.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
NP_001 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
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::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..: .
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pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
.. :: .:. : . ::: ::.:::::::::::::::.:::.. : . .
NP_001 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280
pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS------------QSSILDLADIFV-PALAPP
. : .. ....:.: :: .: .. .:. . .::..::::.:. :: ::
NP_001 QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-
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..::: :. :.. ... :: :.::::. : :. . ..::
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pF1KB1 TPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLE
.: : .::: ::. :: :: :::. ...: . : : : ::::.:
NP_001 APAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGSPA
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.: : .: : :. . :. :::.. :: ::.:.. :. . :
NP_001 KPSTNG--TTAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
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pF1KB1 DALDL----GILGEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----AP
:.:. : :.::. .: : .::::::::.:. ::.:::::. .:
NP_001 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
::. :::: : ..:: :::: . . ::::.: ::. . :.: .:::.
NP_001 PGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG
500 510 520 530 540 550
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pF1KB1 MTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
. .:: :. .: : : .
NP_001 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL
560 570
>>NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo sapie (584 aa)
initn: 1123 init1: 929 opt: 1116 Z-score: 614.1 bits: 123.6 E(85289): 1.8e-27
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10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
::::..:::.::::.:::::::::::::::::::: ::::.::::::.:.:::.:.:.:.
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NP_683 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
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pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGE------
.::::: ::..:::::::::. ::..::::::::: . :.::.:. :.: ..
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.:... :::.::..:.: :: .:.::::::::::::::::::::::::: ::.: :
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pF1KB1 SWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSILDLADIFVPALAPPSTH
.:: . .. .. :. . .:.:. .:...::: : . :. .: . .
NP_683 LRRGDDLRLQ-----MALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQK
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pF1KB1 CSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGR
:.:: : .:. . . :: : : : :.:: : .: .:::
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pF1KB1 TPV---LPAGPPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPES
.:. . . : ..:::: .. : . . ..: ::: . :. . ...:. :.. .
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pF1KB1 TETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEAR
. . . : ..: .. .: :: ..::: :: .. : : ..::. ::
NP_683 IKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSL-----PS-QNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR
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pF1KB1 ACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRNPFLT-GLSAPS-PTNPFGAGETGRPT
.::::::::.:. :::::::: : :.. ::::. : : : :.::: ... :
NP_683 --KTPESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLT
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pF1KB1 LNQMRTGSPALGLAG--GPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFA
:::.: :::.:: . :: : . ::. ::. :..: .. :. : . :
NP_683 LNQLR-GSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAV-ASMT---SAAPQPALGATGSSLTPLGPA--
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pF1KB1 PQPLLPTPSSAGPRPPPPQ-TGT-NPFL
.. .:.: : : ::: ::::
NP_683 ---MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
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>>NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo sapie (641 aa)
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Smith-Waterman score: 1400; 43.7% identity (63.9% similar) in 664 aa overlap (1-575:1-629)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
::::..:::.::::.:::::::::::::::::::: ::::.::::::.:.:::.:.:.:.
NP_055 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.:::: :::::::::::::::::.::::::::.:::::...::::::::::::::::::
NP_055 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
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pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGE------
.::::: ::..:::::::::. ::..::::::::: . :.::.:. :.: ..
NP_055 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
130 140 150 160 170 180
180
pF1KB1 ----DYSRSRGSPSSYNSS-----------------------------------------
.:... :::.::..:
NP_055 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KB1 ---------------SSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQG
..::: .:.::::::::::::::::::::::::: ::.: : .:
NP_055 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KB1 DGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSILDLADIFVPALAPPSTHCSAD
: . .....: :. . .:.:. .:...::: : . :. .: . .:.
NP_055 DDLRLQ----MALEESR-RDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQ--KAE
310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB1 PWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGRTPV-
:: :. : . . :: : : : :.:: : .: .::: .:.
NP_055 PWG-PSASTN---QTNPWGGPAAP---------ASTSDPWPSFGTKPAASIDPWG-VPTG
360 370 380 390
360 370 380 390 400
pF1KB1 --LPAGPPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETK
. . : ..:::: .. : . . ..: ::: . :. . ...:. :.. . .
NP_055 ATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGA-VSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDD
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB1 EGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEARACRT
. . : ..: .. .: : :..::: :: .. : : ..::. :: .:
NP_055 FSEFDNLRTSKKTAESVTSL---P---SQNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR--KT
460 470 480 490 500
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pF1KB1 PESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRNPFLT-GLSAPS-PTNPFGAGETGRPTLNQM
:::::::.:. :::::::: : :.. ::::. : : : :.::: ... ::::.
NP_055 PESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQL
510 520 530 540 550 560
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