FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1380, 707 aa
1>>>pF1KB1380 707 - 707 aa - 707 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5127+/-0.00264; mu= 11.5803+/- 0.158
mean_var=377.1019+/-68.424, 0's: 0 Z-trim(103.5): 960 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.066046
statistics sampled from 6424 (7459) to 6424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.524), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 5123 504.2 2.7e-142
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 3513 350.8 4e-96
CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 ( 617) 3408 340.7 3.9e-93
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 3016 303.5 7.2e-82
CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 538) 2920 294.1 3.6e-79
CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 549) 2890 291.3 2.6e-78
CCDS46099.1 ZNF284 gene_id:342909|Hs108|chr19 ( 593) 2876 290.0 6.9e-78
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2281 233.4 8.6e-61
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2278 233.2 1.1e-60
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2278 233.3 1.1e-60
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CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2266 232.3 2.9e-60
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2242 230.1 1.5e-59
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2242 230.1 1.5e-59
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2223 228.3 5.4e-59
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2211 226.9 9.8e-59
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2213 227.4 1e-58
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2187 224.6 4.8e-58
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2184 224.3 5.7e-58
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2184 224.3 5.8e-58
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2171 223.0 1.3e-57
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2171 223.0 1.3e-57
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2171 223.1 1.3e-57
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2165 222.6 2.2e-57
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2161 222.0 2.4e-57
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 2157 221.6 3e-57
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CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2149 220.9 5.4e-57
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CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2149 220.9 5.6e-57
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2151 221.3 5.7e-57
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2146 220.6 6.7e-57
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CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2146 220.7 7.1e-57
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2146 220.7 7.1e-57
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2144 220.6 8.5e-57
CCDS46098.1 ZNF222 gene_id:7673|Hs108|chr19 ( 491) 2138 219.5 9.2e-57
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2135 219.6 1.4e-56
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 2129 219.0 2.1e-56
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 2129 219.0 2.1e-56
CCDS12635.1 ZNF223 gene_id:7766|Hs108|chr19 ( 482) 2122 218.0 2.6e-56
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2121 218.3 3.6e-56
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2121 218.4 3.9e-56
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2109 217.0 7.4e-56
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2111 217.4 7.6e-56
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2105 216.8 1.1e-55
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2097 215.9 1.6e-55
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2097 216.0 1.8e-55
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 2094 215.6 2.1e-55
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 2094 215.6 2.1e-55
>>CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 (707 aa)
initn: 5123 init1: 5123 opt: 5123 Z-score: 2668.3 bits: 504.2 E(32554): 2.7e-142
Smith-Waterman score: 5123; 100.0% identity (100.0% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB1 REEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHTCDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 FSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 SRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 THHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 THHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 SHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 EKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPY
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550 560 570 580 590 600
pF1KB1 NCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDE
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLKCEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB1 YNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCRECDMCFSQASSLRLHQNVHVGEKP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCRECDMCFSQASSLRLHQNVHVGEKP
670 680 690 700
>>CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 (706 aa)
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Smith-Waterman score: 3698; 75.3% identity (86.2% similar) in 696 aa overlap (1-668:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFL
:::.:::.:::::::::::::: :::::::::::.:::::::::::::::..::::::::
CCDS46 MTTLKEAVTFKDVAVVFTEEELRLLDLAQRKLYREVMLENFRNLLSVGHQSLHRDTFHFL
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pF1KB1 REEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMIN
.:::.:::.:: ::::: : ::: :::::::.:::. .: ::.:.::::: :: :.:
CCDS46 KEEKFWMMETATQREGNLGGKIQMEMETVSESGTHEGLFSHQTWEQISSDLTRFQDSMVN
70 80 90 100 110 120
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pF1KB1 SSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHTCDE
: ::::. :.:::..::::.::.::: :.: : :::::: .:.::::.: ::::::::
CCDS46 SFQFSKQDDMPCQVDAGLSIIHVRQKPSEGRTCKKSFSDVSVLDLHQQLQSREKSHTCDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 CGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKG
:::.::: :::::::::::::: :.::::::::.:::::: :::.::::::::: .::::
CCDS46 CGKSFCYSSALRIHQRVHMGEKLYNCDVCGKEFNQSSHLQIHQRIHTGEKPFKCEQCGKG
190 200 210 220 230 240
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pF1KB1 FSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGR
:::::.: ::.::::: ::. ::.::::::::::::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS46 FSRRSGLYVHRKLHTGVKPHICEKCGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICCKSFRSR
250 260 270 280 290 300
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pF1KB1 SRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLY
. :::::::: ::::::::: ::: .::::::::.::::: :::::::: :: :.:::
CCDS46 ANLNRHSMVHMREKPFRCDTCGKSFGLKSALNSHRMVHTGEKRYKCEECGKRFIYRQDLY
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370 380 390 400 410 420
pF1KB1 THHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQR
:.. :::::::::::::::::::: : .: :::::: ::::::::::::::: :::::
CCDS46 KHQIDHTGEKPYNCKECGKSFRWASGLSRHVRVHSGETTFKCEECGKGFYTNSQRYSHQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 SHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSG
.:::::::.: ::::::::::::::::::: ::: ::::::::::. : :::.:.:.:::
CCDS46 AHSGEKPYRCEECGKGYKRRLDLDFHQRVHRGEKPYNCKECGKSFGWASCLLNHQRIHSG
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490 500 510
pF1KB1 EKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKP----------------------------Y
::::.::::::::::::.:..:.:::.:::: :
CCDS46 EKPFKCEECGKRFTQNSQLYTHRRVHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLYSHRRVHTGVKPY
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB1 KCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEE
:::.::::.::::::::::.:::::::::::::::::. :: .:.:.:::. ::::::::
CCDS46 KCEECGKGFNSKFNLDMHQRVHTGERPYNCKECGKSFSRASSILNHKRLHGDEKPFKCEE
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB1 CGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLKCEQHGKN
::::::.:::::::::::::::::::..:::.: :.::.::::: :::: :.::. ::.
CCDS46 CGKRFTENSQLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKSFRWASTHLTHQRLHSREKLLQCEDCGKS
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB1 IVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCRECDMCFSQA
::..: : :.. .: :: ::::::: :.::::::
CCDS46 IVHSSCLKDQQRDQSGEKTSKCEDCGKRYKRRLNLDTLLSLFLNDT
670 680 690 700
700
pF1KB1 SSLRLHQNVHVGEKP
>>CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 (617 aa)
initn: 4960 init1: 3405 opt: 3408 Z-score: 1785.6 bits: 340.7 E(32554): 3.9e-93
Smith-Waterman score: 3408; 82.1% identity (89.8% similar) in 581 aa overlap (1-578:23-603)
10 20 30
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVML
:::::::.:::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS12 MISPSLELLHSGLCKFPEVEGKMTTFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB1 ENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFLREEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEW
::::::::::.: ::.:::::: .::.: :::. ::::::: ::: ::::: ::: :.::
CCDS12 ENFRNLLSVGNQPFHQDTFHFLGKEKFWKMKTTSQREGNSGGKIQIEMETVPEAGPHEEW
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB1 SFQQIWEKIASDLTRSQDLMINSSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFS
: :::::.:::::::::. . ::::: :::: ::: :: ::. :..:: . : : :::
CCDS12 SCQQIWEQIASDLTRSQNSIRNSSQFFKEGDVPCQIEARLSISHVQQKPYRCNECKQSFS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB1 DVSHFDFHQQLHSGEKSHTCDECGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSH
::: ::.::: ::::::::: ::::.::: ::.:::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 DVSVFDLHQQSHSGEKSHTCGECGKSFCYSPALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFNQSSH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB1 LQTHQRVHTGEKPFKCVECGKGFSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH
:::::::::::::::: .::::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQTHQRVHTGEKPFKCGQCGKGFHSRSALNVHCKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB1 QRIHTGEKPFKCDICGKSFCGRSRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIH
::::::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::: :.:::::::::: :.:
CCDS12 QRIHTGEKPFKCDICGKSFRVRSRLNRHSMVHTGEKPFRCDTCGKNFRQRSALNSHSMVH
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB1 TGEKPYKCEECGKGFICRRDLYTHHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEK
:::::::.::::::::::. :.::::::::::::::::.:::.::::.::.::::.:
CCDS12 IEEKPYKCEQCGKGFICRRDFCKHQMVHTGEKPYNCKECGKTFRWSSCLLNHQQVHSGQK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB1 PFKCEECGKGFYTNSQCYSHQRSHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNC
::::::::::::::. ::::::.:::::.: :::: :::::::.:::::::::. :::
CCDS12 SFKCEECGKGFYTNSRRSSHQRSHNGEKPYNCEECGKDYKRRLDLEFHQRVHTGERPYNC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB1 KECGKSFSRAPCLLKHERLHSGEKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCG
:::::::. : :::::.:::::::::.::::::::::.:.::::: ::::: ::::.:
CCDS12 KECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQSSQLHSHQTCHTGEKLYKCEQCE
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB1 KGYNSKFNLDMHQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKC---EECGK
:::::::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::.: :: .
CCDS12 KGYNSKFNLDMHQRVHGGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPLKSGVWEEIYS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB1 RFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLKCEQHGKNIVQ
.::
CCDS12 EFTASFTSVSLCGRKAI
610
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10 20 30 40 50 60
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::::::..:::::::::::::::::: .::.::.:::::::::::::::. :..:.: .
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10 20 30 40 50 60
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.:.:. .:::: ::.:.:.::::.:.::: ::: :.: . :::..::::: . .: ::.
CCDS46 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
70 80 90 100 110 120
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:.: ..::. ::..::: . :: :: : . :: ::.:: .::.:::::::::::::::
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:::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS46 CGKSFCYISALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKG
190 200 210 220 230 240
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:::::.:.:: :::.:::::::::::.:::: :.::::::::::::::::: :::.:
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:.:::::.: :.::::::::::.::: : : .:
CCDS46 -------------------------RRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLR
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:. ::::::::.:.:::: : : . :.:.:.::::. :. ::::: .:. .::
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.:::.:::::. :.:.:.:. :: .::::::::::.::::.. . .: .: ..::::.::
CCDS46 QKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPY
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::.:::: :. :: :: :::.:::::::::::::: :.....:..::.:::::::::: :
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:::::.:: . ::: :. : : : . ::.. : : .....::. ::::::. :::
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..: .:..:.::: ::: .::. : :: :.: :...:
CCDS46 FSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIREL
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CCDS46 SEGGSSTR
700
>>CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 (538 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::.::: :: ::::::: :::::.:.: :::.:.::: :::::.::.::::::: .::
CCDS12 REEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELESVPEAGAHEEWSCQQIWEQIAKDLTRSQDSIIN
70 80 90 100 110 120
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CCDS12 NSQFFENGDVPSQVEAGLPTIHTGQKPSQGGKCKQSISDVPIFDLPQQLYSEEKSYTCDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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:::..::::::..:::::.::: . ::::::::::::::::::::::::::::: .::::
CCDS12 CGKSICYISALHVHQRVHVGEKLFMCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCEQCGKG
190 200 210 220 230 240
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::::::::::.::::::::: :: :::::::::::.::.::::::::::::::::.: :
CCDS12 FSRRSALNVHRKLHTGEKPYICEACGKAFIHDSQLKEHKRIHTGEKPFKCDICGKTFYFR
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CCDS12 SRLKSHSMVHTGEKPFRCDTCDKSFHQRSALNRHCMVHTGEKPYRCEQCGKGFIGRLDFY
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pF1KB1 THHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQR
:..:::::::::::::::::::.::::.::::::::: ::::::::::::::: ::::
CCDS12 KHQVVHTGEKPYNCKECGKSFRWSSCLLNHQRVHSGEKSFKCEECGKGFYTNSQLSSHQR
370 380 390 400 410 420
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pF1KB1 SHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSG
:::::::::: :::::: ...::.::::::::. ::::::::.:::: .:.:.:::
CCDS12 SHSGEKPYKCEECGKGYVTKFNLDLHQRVHTGERPYNCKECGKNFSRASSILNHKRLHCQ
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pF1KB1 EKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPY
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CCDS12 KKPFKCEDCGKRLVHRTYRKDQPRDYSGENPSKCEDCGRRYKRRLNLDILLSLFLNDT
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pF1KB1 NCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDE
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10 20 30 40
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGH
.::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS58 MIKRSKVLVFCSKIMEEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGH
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50 60 70 80 90 100
pF1KB1 QAFHRDTFHFLREEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIAS
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CCDS58 QPFHQDTCHFLREEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELESVPEAGAHEEWSCQQIWEQIAK
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pF1KB1 DLTRSQDLMINSSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQL
::::::: .::.::: ..:: : :.:::: .::: :: :::. : :.::: ::. :::
CCDS58 DLTRSQDSIINNSQFFENGDVPSQVEAGLPTIHTGQKPSQGGKCKQSISDVPIFDLPQQL
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170 180 190 200 210 220
pF1KB1 HSGEKSHTCDECGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGE
.: :::.:::::::..::::::..:::::.::: . ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YSEEKSYTCDECGKSICYISALHVHQRVHVGEKLFMCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGE
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pF1KB1 KPFKCVECGKGFSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFK
::::: .::::::::::::::.::::::::: :: :::::::::::.::.::::::::::
CCDS58 KPFKCEQCGKGFSRRSALNVHRKLHTGEKPYICEACGKAFIHDSQLKEHKRIHTGEKPFK
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pF1KB1 CDICGKSFCGRSRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEEC
::::::.: ::::. ::::::.:::::::::::::.:::::: : :.:::::::.::.:
CCDS58 CDICGKTFYFRSRLKSHSMVHTGEKPFRCDTCDKSFHQRSALNRHCMVHTGEKPYRCEQC
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pF1KB1 GKGFICRRDLYTHHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGF
::::: : :.: :..:::::::::::::::::::.::::.::::::::: ::::::::::
CCDS58 GKGFIGRLDFYKHQVVHTGEKPYNCKECGKSFRWSSCLLNHQRVHSGEKSFKCEECGKGF
370 380 390 400 410 420
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pF1KB1 YTNSQCYSHQRSHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAP
::::: :::::::::::::: :::::: ...::.::::::::. ::::::::.::::
CCDS58 YTNSQLSSHQRSHSGEKPYKCEECGKGYVTKFNLDLHQRVHTGERPYNCKECGKNFSRAS
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pF1KB1 CLLKHERLHSGEKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDM
.:.:.::: .:::.::.::::... .. ... : ..::.: ::: ::. :. ..:::.
CCDS58 SILNHKRLHCQKKPFKCEDCGKRLVHRTYRKDQPRDYSGENPSKCEDCGRRYKRRLNLDI
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB1 HQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRV
CCDS58 LLSLFLNDT
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10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFL
:: ::::.::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS46 MTMFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDVSQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQLSHRDTFHFQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KB1 REEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMIN
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CCDS46 REEKFWIMETATQREGNSGGKIQTELESVPETGPHEEWSCQQIWEQTASELTRPQD-SIS
70 80 90 100 110
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pF1KB1 SSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHTCDE
::::: .:: : :..::::.:: . :. . : ::::: .:.:::::::. ::::.:
CCDS46 SSQFSTQGDVPSQVDAGLSIIHIGETPSEHGKCKKFFSDVSILDLHQQLHSGKISHTCNE
120 130 140 150 160 170
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pF1KB1 CGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKG
: ::: ::: .::.:::::: ::::::.: :::.:.::::::.::::::::: .:::.
CCDS46 YRKRFCYSSALCLHQKVHMGEKRYKCDVCSKAFSQNSQLQTHQRIHTGEKPFKCEQCGKS
180 190 200 210 220 230
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pF1KB1 FSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGR
:::::.. :: ::::::::. ::::::::::.:::.:::::::::::::: :::::: .:
CCDS46 FSRRSGMYVHCKLHTGEKPHICEECGKAFIHNSQLREHQRIHTGEKPFKCYICGKSFHSR
240 250 260 270 280 290
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pF1KB1 SRLNRHSMVHTAEKPFRCDTCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLY
: :::::::: :: ::::::..:: :::::::: : :: :: :::::::..: ::.::
CCDS46 SNLNRHSMVHMQEKSFRCDTCSNSFGQRSALNSHCMDHTKEKLYKCEECGRSFTCRQDLC
300 310 320 330 340 350
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pF1KB1 THHMVHTGEKPYNCKECGKSFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQR
:.: :::.:::::. :::.:::.::: .:::::.:: :::. ::: :: ::: .::::
CCDS46 KHQMDHTGDKPYNCNVCGKGFRWSSCLSRHQRVHNGETTFKCDGCGKRFYMNSQGHSHQR
360 370 380 390 400 410
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pF1KB1 SHSGEKPYKCVECGKGYKRRLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSG
.. :. ::: .::::: ...::.::::::::. :::::::::: : .:.:.:::.:
CCDS46 AYREEELYKCQKCGKGYISKFNLDLHQRVHTGERPYNCKECGKSFRWASGILRHKRLHTG
420 430 440 450 460 470
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pF1KB1 EKPFQCEECGKRFTQNSHLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPY
::::.:::::::::.::.:. :::.::::::::::.::::. . ::..:. :. .
CCDS46 EKPFKCEECGKRFTENSKLRFHQRIHTGEKPYKCEECGKGFRWASTHLTHQRLHSREKLF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 NCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDE
.:..:::: .::: .: ::::: :::.::::. . .:
CCDS46 QCEDCGKSSEHSSCLQDQQSDHSGEKTSKCEDCGKRYERRLNLDMILSLFLNDI
540 550 560 570 580 590
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pF1KB1 CGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLKCEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKG
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initn: 4327 init1: 2281 opt: 2281 Z-score: 1204.9 bits: 233.4 E(32554): 8.6e-61
Smith-Waterman score: 2367; 47.0% identity (72.4% similar) in 702 aa overlap (5-706:3-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MTTFKEAMTFKDVAVVFTEEELGLLDLAQRKLYRDVMLENFRNLLSVGHQAFHRDTFHFL
.. . :.:::. :..:: :: ::: :::::::::. ::.:. . : . . :
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSLDLPS--RCASKDL
10 20 30 40 50
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pF1KB1 REEKIWMMKTAIQREGNSGDKIQTEMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMIN
:: . .::. ..: ... :. . . :.: .
CCDS12 SPEK---------------NTYETEL---------SQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEA
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 SSQFSKEGDFPCQTEAGLSVIHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHTCDE
.... :. . : : . . .: : :.. .... :.. :: :: . : :
CCDS12 KGKMEKQQE--NQKEYFRQGMIIYDKMSI-------FNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKE
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 CGKNFCYISALRIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKG
::: : : : :: .: ::: :.: ::: ::..:.:. :::.::::::. : ::::.
CCDS12 CGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKA
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 FSRRSALNVHHKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGR
:.. : : .::..:::::::.:::::::::..::: .::..::::::..: :::.:
CCDS12 FTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQN
210 220 230 240 250 260
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CCDS12 SQVYM
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CCDS82 K
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]