FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB1434, 2102 aa 1>>>pF1KB1434 2102 - 2102 aa - 2102 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9680+/-0.00113; mu= 17.7477+/- 0.068 mean_var=127.3128+/-25.721, 0's: 0 Z-trim(106.0): 33 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.113668 statistics sampled from 8696 (8715) to 8696 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16 Scan time: 6.150 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33603.2 PI4KA gene_id:5297|Hs108|chr22 (2102) 14027 2313.4 0 CCDS55637.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 484) 661 121.1 1.2e-26 CCDS55638.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 801) 661 121.3 1.7e-26 CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 816) 661 121.3 1.7e-26 CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 828) 661 121.3 1.8e-26 CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686) 435 84.4 4.4e-15 CCDS77180.1 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CCDS55 NLGFETSAFKLTTEFVDVMGG-LDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGS 690 700 710 720 730 740 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KB1 GLPCFRGQ-TIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKVIQSCFLSNRSRTYDMIQYYQNDIPY ::::.:. ::. ::.:: .:::.. .. ..... . : .. :: .:: : : CCDS55 QLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQLLVEQMVDGSMRSITTKLYDGFQYLTNGIM 750 760 770 780 790 800 >>CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 (816 aa) initn: 651 init1: 461 opt: 661 Z-score: 589.0 bits: 121.3 E(32554): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 661; 39.3% identity (73.4% similar) in 267 aa overlap (1839-2100:551-815) 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KB1 VKRCGVSELEKEGLRCRSDSEDECSTQEADGQKISWQ--AAIFKVGDDCRQDMLALQIID :. .:. ..: : ::: ::..::.:.. CCDS81 FKRDPEDPSAVALKEPWQEKVRRIREGSPYGHLPNWRLLSVIVKCGDDLRQELLAFQVLK 530 540 550 560 570 580 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB1 LFKNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGVIECIPDCTSRDQLGRQTDFGMYDYFTRQYGD ...:.. . :.. ::.... . :.:: . . .: :. .:..... ::: ...:. 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CCDS81 NLGFETSAFKLTTEFVDVMGG-LDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGS 700 710 720 730 740 750 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KB1 GLPCFRGQ-TIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKVIQSCFLSNRSRTYDMIQYYQNDIPY ::::.:. ::. ::.:: .:::.. .. ..... . : .. :: .:: : : CCDS81 QLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQLLVEQMVDGSMRSITTKLYDGFQYLTNGIM 760 770 780 790 800 810 >>CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 (828 aa) initn: 651 init1: 461 opt: 661 Z-score: 588.9 bits: 121.3 E(32554): 1.8e-26 Smith-Waterman score: 661; 39.3% identity (73.4% similar) in 267 aa overlap (1839-2100:563-827) 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KB1 VKRCGVSELEKEGLRCRSDSEDECSTQEADGQKISWQ--AAIFKVGDDCRQDMLALQIID :. .:. ..: : ::: ::..::.:.. CCDS99 FKRDPEDPSAVALKEPWQEKVRRIREGSPYGHLPNWRLLSVIVKCGDDLRQELLAFQVLK 540 550 560 570 580 590 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB1 LFKNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGVIECIPDCTSRDQLGRQTDFGMYDYFTRQYGD ...:.. . :.. ::.... . :.:: . . .: :. .:..... ::: ...:. CCDS99 QLQSIWEQERVPLWIKPYKILVISADSGMIEPVVNAVSIHQVKKQSQLSLLDYFLQEHGS 600 610 620 630 640 650 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KB1 ESTLAFQQARYNFIRSMAAYSLLLFLLQIKDRHNGNIMLDKKGHIIHIDFGFMFESSPGG .: :: .:. ::..: :.: :. .:::.::::::::.:: .::::::::::.. ::: CCDS99 YTTEAFLSAQRNFVQSCAGYCLVCYLLQVKDRHNGNILLDAEGHIIHIDFGFILSSSPR- 660 670 680 690 700 710 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KB1 NLGWEPD-IKLTDEMVMIMGGKMEATPFKWFMEMCVRGYLAVRPYMDAVVSLVTLMLD-T :::.: . .::: :.: .::: ... :... . ..: .:.: .:: ::..: .: . . CCDS99 NLGFETSAFKLTTEFVDVMGG-LDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGS 720 730 740 750 760 770 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KB1 GLPCFRGQ-TIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKVIQSCFLSNRSRTYDMIQYYQNDIPY ::::.:. ::. ::.:: .:::.. .. ..... . : .. :: .:: : : CCDS99 QLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQLLVEQMVDGSMRSITTKLYDGFQYLTNGIM 780 790 800 810 820 >>CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686 aa) initn: 408 init1: 152 opt: 435 Z-score: 384.2 bits: 84.4 E(32554): 4.4e-15 Smith-Waterman score: 486; 24.5% identity (55.2% similar) in 518 aa overlap (1586-2084:909-1381) 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB1 VQLPARFKNTEAIGNEVTRLVRLDPGAVSDVPEAIKFLVTWHTIDADAPELSHVLCWAPT .:. . .:. .. : : . : CCDS78 LHKDSSLGLSKEDKAFLWEKRYYCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNL-AKTYSLLHQWPAL 880 890 900 910 920 930 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB1 DPPTGLSYFSSMYPPHPLTAQYGVKVLRSFPPDAILFYIPQIVQALRYDKM--GYVREYI : .: ..: . . . . .: .... : . .::.::::.:. . . . ... 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CCDS78 KQTKLVQLLGGVAEKVRQ-ASGSARQVVLQRSMERVQSFFQKNKCRLPLKPSLVAKELNI 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KB1 KSGTPMQSAAKAPYLAKFKVKRCGVSELEKEGLRCRSDSEDECSTQEADGQKISWQAAIF :: . ..: : .: .:: ... . :..:. ..: CCDS78 KSCSFFSSNA-VP----LKVTMVNADPM---------------------GEEIN---VMF 1110 1120 1130 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KB1 KVGDDCRQDMLALQIIDLFKNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGVIECIPDCTSRDQLG :::.: ::::::::.: .. .:. :::: . .. ..:. :..: .: . : : CCDS78 KVGEDLRQDMLALQMIKIMDKIWLKEGLDLRMVIFKCLSTGRDRGMVELVP---ASDTLR 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KB1 R-QTDFGMYDYFT--------RQYGDESTLAFQQARYNFIRSMAAYSLLLFLLQIKDRHN . :...:. : :.: . : ...: ::: : :. . ..: : :::: CCDS78 KIQVEYGVTGSFKDKPLAEWLRKY-NPSEEEYEKASENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHN 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KB1 GNIMLDKKGHIIHIDFG-FMFESSPGGNLGWE--PDIKLTDEMVMIMGGKMEATPFKWFM :::: . ::..::::: :. ... :.. . : . .: .: ::. . :. :. 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CCDS77 VKIRGIIP-ETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKY---PVIFKHGDDLRQDQLILQIISLM 540 550 560 570 580 590 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB1 KNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGV---IECIPDCTSRDQLGRQTDFGMYDYFTRQYG .... .::: . ::.:.::. : :. .: : : .: . : . : CCDS77 DKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNF-FRKYAPSENG 600 610 620 630 640 650 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KB1 DESTLAFQQARYNFIRSMAAYSLLLFLLQIKDRHNGNIMLDKKGHIIHIDFGFMFESSPG .. : .. ....: :.: .. ..: . ::: :..: : :...:::::... .: CCDS77 PNGISA--EVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPK 660 670 680 690 700 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KB1 GNLGWEPDIKLTDEMVMIMGGKMEATPFKWFMEMCVRGYLAVRPYMDAVVSLVTLMLDTG : .::. ::: ::: .. .. : ..: ..: .: : . ...: .::.:.. CCDS77 P---LPPPMKLNKEMVEGMGGT-QSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDAN 710 720 730 740 750 760 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KB1 LPCFR---GQTIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKVIQSCFLSNRSRTYDMIQYYQNDIPY .: . .:.: .. .: .....::.......: CCDS77 IPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK 770 780 790 800 810 820 >>CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 (887 aa) initn: 291 init1: 249 opt: 410 Z-score: 366.0 bits: 80.1 E(32554): 4.6e-14 Smith-Waterman score: 430; 25.1% identity (52.0% similar) in 546 aa overlap (1591-2078:332-863) 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB1 RFKNTEAIGNEVTRLVRLDPGAVSDVPEAIKFL--VTWHTIDADAPELSHVLCWAPTDPP ::: :.: . : . : : : CCDS11 YPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDVE 310 320 330 340 350 360 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB1 TGLSYFSSMYPPHPLTAQYGVKVLRSFPPDAILFYIPQIVQALRYDKMGYVREYILWAAS .: .:: : .: . .:.: ::. . .:.:. :.::::.:... ... . . . 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CCDS11 VKIRGIIP-ETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKY---PVIFKHGDDLRQDQLILQIISLM 600 610 620 630 640 650 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB1 KNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGV---IECIPDCTSRDQLGRQTDFGMYDYFTRQYG .... .::: . ::.:.::. : :. .: : : .: . : . : CCDS11 DKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNF-FRKYAPSENG 660 670 680 690 700 710 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KB1 DESTLAFQQARYNFIRSMAAYSLLLFLLQIKDRHNGNIMLDKKGHIIHIDFGFMFESSPG .. : .. ....: :.: .. ..: . ::: :..: : :...:::::... .: CCDS11 PNGISA--EVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPK 720 730 740 750 760 770 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KB1 GNLGWEPDIKLTDEMVMIMGGKMEATPFKWFMEMCVRGYLAVRPYMDAVVSLVTLMLDTG : .::. ::: ::: .. .. : ..: ..: .: : . ...: .::.:.. CCDS11 P---LPPPMKLNKEMVEGMGGT-QSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDAN 780 790 800 810 820 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KB1 LPCFR---GQTIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKVIQSCFLSNRSRTYDMIQYYQNDIPY .: . .:.: .. .: .....::.......: CCDS11 IPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK 830 840 850 860 870 880 >>CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1445 aa) initn: 404 init1: 177 opt: 412 Z-score: 364.8 bits: 80.6 E(32554): 5.4e-14 Smith-Waterman score: 517; 26.5% identity (58.8% similar) in 490 aa overlap (1612-2082:716-1165) 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KB1 AVSDVPEAIKFLVTWHTIDADAPELSHVLCWAPTDPPTGLSYFSSMYPPHPLTAQYGVKV :. ..: .:. ..: .: . . . .:. CCDS44 NENCSLPLVLGSAPGWDERTVSEMHTILRRWTFSQPLEALGLLTSSFPDQEIR-KVAVQQ 690 700 710 720 730 740 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KB1 LRSFPPDAILFYIPQIVQALRYDKM--GYVREYILWAASKSQLLAHQFIWNMKTNIYLDE : .. : .: :.::.:::.... . . . .: . .: .::.. : .:. .. 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