Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1440
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1440, 1898 aa
1>>>pF1KB1440 1898 - 1898 aa - 1898 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8740+/-0.00149; mu= 11.9519+/- 0.089
mean_var=205.1459+/-42.840, 0's: 0 Z-trim(105.7): 280 B-trim: 64 in 2/49
Lambda= 0.089545
statistics sampled from 8253 (8562) to 8253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 5.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 12718 1658.3 0
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 7564 992.5 0
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 5573 735.3 5.4e-211
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 4890 646.9 1.7e-184
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 4875 645.0 6.3e-184
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 4875 645.0 6.4e-184
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 4873 644.7 7.6e-184
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 4761 630.3 1.7e-179
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 4761 630.3 1.7e-179
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 4592 608.5 7.6e-173
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 3651 486.9 2.5e-136
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 3602 480.7 2.4e-134
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 2054 280.3 2.1e-74
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 2053 280.2 2.2e-74
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 1952 267.1 1.7e-70
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 1897 259.9 2.3e-68
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 1717 237.0 4e-61
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 1706 235.6 1.1e-60
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 1658 229.4 7.9e-59
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 1658 229.4 7.9e-59
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 1641 227.2 3.6e-58
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 1641 227.2 3.6e-58
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 1638 226.8 4.8e-58
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 1636 226.6 5.7e-58
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 1557 216.3 6.6e-55
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 1557 216.3 6.7e-55
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1440) 1546 214.9 1.8e-54
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1433) 1522 211.8 1.5e-53
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 1318 185.5 1.3e-45
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 1318 185.7 1.8e-45
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 997 144.0 4e-33
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 943 136.9 4.3e-31
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 943 137.0 4.7e-31
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 894 130.8 4.9e-29
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 894 130.8 4.9e-29
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 894 130.8 5.1e-29
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 894 130.9 5.3e-29
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 894 130.9 5.5e-29
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 889 130.2 8.8e-29
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 860 126.2 7.1e-28
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 856 125.6 9e-28
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 786 116.2 2.5e-25
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 789 117.0 4.3e-25
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 770 114.1 1.1e-24
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 770 114.6 2.4e-24
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 774 115.4 2.5e-24
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 712 107.1 4.6e-22
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 651 99.2 1e-19
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 651 99.2 1e-19
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 651 99.2 1e-19
>>CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898 aa)
initn: 12718 init1: 12718 opt: 12718 Z-score: 8890.0 bits: 1658.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12718; 100.0% identity (100.0% similar) in 1898 aa overlap (1-1898:1-1898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MAPEPAPGRTMVPLVPALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MAPEPAPGRTMVPLVPALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 KPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINTSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 KLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPATS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 NGRIKQLRSGALQIESSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRVRRVAPRFSIPPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NGRIKQLRSGALQIESSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRVRRVAPRFSIPPSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 QEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLELSNVVRSANYTCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLELSNVVRSANYTCVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 ISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPVTYYGIQYRAAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPVTYYGIQYRAAGTE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 GPFQEVDGVATTRYSIGGLSPFSEYAFRVLAVNSIGRGPPSEAVRARTGEQAPSSPPRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GPFQEVDGVATTRYSIGGLSPFSEYAFRVLAVNSIGRGPPSEAVRARTGEQAPSSPPRRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 QARMLSASTMLVQWEPPEEPNGLVRGYRVYYTPDSRRPPNAWHKHNTDAGLLTTVGSLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QARMLSASTMLVQWEPPEEPNGLVRGYRVYYTPDSRRPPNAWHKHNTDAGLLTTVGSLLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 GITYSLRVLAFTAVGDGPPSPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQLSWLLPPQERI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GITYSLRVLAFTAVGDGPPSPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQLSWLLPPQERI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 IMYELVYWAAEDEDQQHKVTFDPTSSYTLEDLKPDTLYRFQLAARSDMGVGVFTPTIEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 IMYELVYWAAEDEDQQHKVTFDPTSSYTLEDLKPDTLYRFQLAARSDMGVGVFTPTIEAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 TAQSTPSAPPQKVMCVSMGSTTVRVSWVPPPADSRNGVITQYSVAYEAVDGEDRGRHVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TAQSTPSAPPQKVMCVSMGSTTVRVSWVPPPADSRNGVITQYSVAYEAVDGEDRGRHVVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 GISREHSSWDLVGLEKWTEYRVWVRAHTDVGPGPESSPVLVRTDEDVPSGPPRKVEVEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GISREHSSWDLVGLEKWTEYRVWVRAHTDVGPGPESSPVLVRTDEDVPSGPPRKVEVEPL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 NSTAVHVYWKLPVPSKQHGQIRGYQVTYVRLENGEPRGLPIIQDVMLAEAQETTISGLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NSTAVHVYWKLPVPSKQHGQIRGYQVTYVRLENGEPRGLPIIQDVMLAEAQETTISGLTP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB1 ETTYSVTVAAYTTKGDGARSKPKIVTTTGAVPGRPTMMISTTAMNTALLQWHPPKELPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ETTYSVTVAAYTTKGDGARSKPKIVTTTGAVPGRPTMMISTTAMNTALLQWHPPKELPGE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 LLGYRLQYCRADEARPNTIDFGKDDQHFTVTGLHKGTTYIFRLAAKNRAGLGEEFEKEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LLGYRLQYCRADEARPNTIDFGKDDQHFTVTGLHKGTTYIFRLAAKNRAGLGEEFEKEIR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 TPEDLPSGFPQNLHVTGLTTSTTELAWDPPVLAERNGRIISYTVVFRDINSQQELQNITT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TPEDLPSGFPQNLHVTGLTTSTTELAWDPPVLAERNGRIISYTVVFRDINSQQELQNITT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB1 DTRFTLTGLKPDTTYDIKVRAWTSKGSGPLSPSIQSRTMPVEQVFAKNFRVAAAMKTSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DTRFTLTGLKPDTTYDIKVRAWTSKGSGPLSPSIQSRTMPVEQVFAKNFRVAAAMKTSVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB1 LSWEVPDSYKSAVPFKILYNGQSVEVDGHSMRKLIADLQPNTEYSFVLMNRGSSAGGLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LSWEVPDSYKSAVPFKILYNGQSVEVDGHSMRKLIADLQPNTEYSFVLMNRGSSAGGLQH
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB1 LVSIRTAPDLLPHKPLPASAYIEDGRFDLSMPHVQDPSLVRWFYIVVVPIDRVGGSMLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LVSIRTAPDLLPHKPLPASAYIEDGRFDLSMPHVQDPSLVRWFYIVVVPIDRVGGSMLTP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB1 RWSTPEELELDELLEAIEQGGEEQRRRRRQAERLKPYVAAQLDVLPETFTLGDKKNYRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RWSTPEELELDELLEAIEQGGEEQRRRRRQAERLKPYVAAQLDVLPETFTLGDKKNYRGF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB1 YNRPLSPDLSYQCFVLASLKEPMDQKRYASSPYSDEIVVQVTPAQQQEEPEMLWVTGPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 YNRPLSPDLSYQCFVLASLKEPMDQKRYASSPYSDEIVVQVTPAQQQEEPEMLWVTGPVL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 AVILIILIVIAILLFKRKRTHSPSSKDEQSIGLKDSLLAHSSDPVEMRRLNYQTPGMRDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AVILIILIVIAILLFKRKRTHSPSSKDEQSIGLKDSLLAHSSDPVEMRRLNYQTPGMRDH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB1 PPIPITDLADNIERLKANDGLKFSQEYESIDPGQQFTWENSNLEVNKPKNRYANVIAYDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PPIPITDLADNIERLKANDGLKFSQEYESIDPGQQFTWENSNLEVNKPKNRYANVIAYDH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KB1 SRVILTSIDGVPGSDYINANYIDGYRKQNAYIATQGPLPETMGDFWRMVWEQRTATVVMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SRVILTSIDGVPGSDYINANYIDGYRKQNAYIATQGPLPETMGDFWRMVWEQRTATVVMM
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pF1KB1 TRLEEKSRVKCDQYWPARGTETCGLIQVTLLDTVELATYTVRTFALHKSGSSEKRELRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TRLEEKSRVKCDQYWPARGTETCGLIQVTLLDTVELATYTVRTFALHKSGSSEKRELRQF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB1 QFMAWPDHGVPEYPTPILAFLRRVKACNPLDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QFMAWPDHGVPEYPTPILAFLRRVKACNPLDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERMK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB1 HEKTVDIYGHVTCMRSQRNYMVQTEDQYVFIHEALLEAATCGHTEVPARNLYAHIQKLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HEKTVDIYGHVTCMRSQRNYMVQTEDQYVFIHEALLEAATCGHTEVPARNLYAHIQKLGQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB1 VPPGESVTAMELEFKLLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYELTRVCLQPIRGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VPPGESVTAMELEFKLLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYELTRVCLQPIRGV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB1 EGSDYINASFLDGYRQQKAYIATQGPLAESTEDFWRMLWEHNSTIIVMLTKLREMGREKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EGSDYINASFLDGYRQQKAYIATQGPLAESTEDFWRMLWEHNSTIIVMLTKLREMGREKC
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB1 HQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTIRQFQFTDWPEQGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTIRQFQFTDWPEQGVP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB1 KTGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDMFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KTGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDMFQ
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890
pF1KB1 TVKTLRTQRPAMVQTEDQYQLCYRAALEYLGSFDHYAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TVKTLRTQRPAMVQTEDQYQLCYRAALEYLGSFDHYAT
1870 1880 1890
>>CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907 aa)
initn: 7561 init1: 7561 opt: 7564 Z-score: 5291.6 bits: 992.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12690; 99.5% identity (99.5% similar) in 1907 aa overlap (1-1898:1-1907)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MAPEPAPGRTMVPLVPALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAPEPAPGRTMVPLVPALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 KPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINTSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 KLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPATS
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CCDS48 KLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPATS
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CCDS43 DAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQTEDQYIF
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::.:::::.:::.::::::::::.:::: :. ::.::.:::::: ::::::::::::::
CCDS43 IHDALLEAVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHTSRFISA
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CCDS43 NLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAET
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CCDS43 REFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHC
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CCDS43 GSFDHYAT
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.:.::.:.:.: :::.:::::::::::..:::::::::.:::::::.::::::::: ...
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CCDS75 RMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAALEYLGSFDHYAT
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CCDS55 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
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pF1KB1 VRSANYTCVAISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPVTYY
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CCDS55 RQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPVSYY
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CCDS55 IIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQTSE
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CCDS55 QAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNVADS
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pF1KB1 LLTTVGSLLPGITYSLRVLAFTAVGDGPPSPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQL
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CCDS55 QITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETSILL
480 490 500 510 520 530
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CCDS55 SWTPPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQ-RITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGL
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pF1KB1 GVFTPTIEARTAQSTPSAPPQKVMCVSMGSTTVRVSWVPPPADSRNGVITQYSVAYEAVD
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CCDS55 GASTAEISARTMQS----------------------------------------------
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CCDS55 ------------------------------------------------------------
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pF1KB1 QETTISGLTPETTYSVTVAAYTTKGDGARSKPKIVTTTGAVPGRPTMMISTTAMNTALLQ
CCDS55 ------------------------------------------------------------
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pF1KB1 WHPPKELPGELLGYRLQYCRADEARPNTIDFGKDDQHFTVTGLHKGTTYIFRLAAKNRAG
CCDS55 ------------------------------------------------------------
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pF1KB1 LGEEFEKEIRTPEDLPSGFPQNLHVTGLTTSTTELAWDPPVLAERNGRIISYTVVFRDIN
CCDS55 ------------------------------------------------------------
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pF1KB1 SQQELQNITTDTRFTLTGLKPDTTYDIKVRAWTSKGSGPLSPSIQSRTMPVEQVFAKNFR
.:::::.
CCDS55 -----------------------------------------------------MFAKNFH
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pF1KB1 VAAAMKTSVLLSWEVPDSYKSAVPFKILYN-GQSVE-VDGHSMRKLIADLQPNTEYSFVL
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CCDS55 VKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRATQKLIVNLKPEKSYSFVL
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pF1KB1 MNRGSSAGGLQHLVSIRTAPDLLPHKPLPASAYIEDGRFDLSMPHVQDPSLVRWFYIVVV
:::.::::::: :. .::::.: :: . :: . ...:.: .. .::..:
CCDS55 TNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQLPEVPANENIKGYYIIIV
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pF1KB1 PIDRVGGSMLTPRWSTPEELELDELLEAIEQGGEEQRRRRRQAERLKPYVAAQLDVLPET
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CCDS55 PLKKSRGKFIKP-WESPDEMELDELLKEISRK-RRSIRYGREVE-LKPYIAAHFDVLPTE
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CCDS55 TLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAALEYLGSFDHYAT
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CCDS64 VFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAALEYLGSFDHYAT
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CCDS55 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
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CCDS55 NGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREV
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pF1KB1 RRVAPRFSIPPSSQEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLEL
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CCDS55 RRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLEL
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pF1KB1 SNVVRSANYTCVAISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPV
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CCDS55 NDVRQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPV
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CCDS55 QGLGASTAEISARTMQS-------------------------------------------
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::: :::.::::::: :. .::::.: :: . :: . ...:.: .. .::
CCDS55 FVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQLPEVPANENIKGYYI
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..::. . :... : : .:.:.::::::. : . ... : :..: ::::.::..:::
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: ::::: :.: :: :. :. : :::: . : ..: ::.::::: .: ... :
CCDS55 PTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVM-EHAESKMYATSPYSDPVVSMDLDPQ
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.: : ..::.::::::..:: :::::::.: :::..: : :. :: . :.
CCDS55 PITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSSKPDRKRAESDSRKS--SIPNNKEIP
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:: ::::::.:.:::::::.::::: :::::::::.:::.::::::::.::: :::::::
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:::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::::::::::::.:::.::::
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CCDS55 AVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHTSRFISANLPCNKF
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::::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::
CCDS55 KNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRM
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CCDS55 LWEHNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTD
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CCDS55 ARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRT
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CCDS55 T
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::::::..:: :::::::.: : .. .:. . . :... :: : .:::::::.:.
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CCDS12 RSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSS
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CCDS12 EKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVI
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CCDS12 AYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRV
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CCDS12 CLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKL
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CCDS12 REMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFT
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pF1KB1 DWPEQGVPKTGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRY
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CCDS12 DWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRY
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pF1KB1 EGVVDMFQTVKTLRTQRPAMVQTEDQYQLCYRAALEYLGSFDHYAT
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CCDS12 EGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
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pF1KB1 MAPEPAPGRTMVPLV-P-ALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATG
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CCDS74 MAPTWGPG--MVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATG
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pF1KB1 EPKPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINT
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CCDS74 DPKPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB1 SAKLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPA
:::.::.:.::: :::.:::::::::::..:::::::::.:::::::.::::::::::.
CCDS74 HAKLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPS
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pF1KB1 TSNGRIKQLRSGALQIESSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVR----VRRVAPRF
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CCDS74 ASNGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRF
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pF1KB1 SIPPSSQEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLELSNVVRSA
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CCDS74 SILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSA
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