FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1755, 1465 aa
1>>>pF1KB1755 1465 - 1465 aa - 1465 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4452+/-0.00132; mu= 12.3543+/- 0.078
mean_var=140.5315+/-28.262, 0's: 0 Z-trim(103.6): 141 B-trim: 4 in 2/51
Lambda= 0.108190
statistics sampled from 7336 (7490) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5957.1 MYOM2 gene_id:9172|Hs108|chr8 (1465) 9812 1545.1 0
CCDS45823.1 MYOM1 gene_id:8736|Hs108|chr18 (1589) 4109 655.0 5.2e-187
CCDS41281.1 MYOM3 gene_id:127294|Hs108|chr1 (1437) 3541 566.3 2.3e-160
CCDS45824.1 MYOM1 gene_id:8736|Hs108|chr18 (1685) 2668 430.1 2.8e-119
CCDS54421.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (26926) 531 97.3 6.7e-18
CCDS54423.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27051) 531 97.3 6.7e-18
CCDS54422.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27118) 531 97.3 6.7e-18
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 531 97.3 7.9e-18
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 531 97.4 8.1e-18
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 531 97.4 8.4e-18
CCDS53621.1 MYBPC3 gene_id:4607|Hs108|chr11 (1274) 412 77.9 2.2e-13
CCDS53455.1 IGFN1 gene_id:91156|Hs108|chr1 (3708) 382 73.5 1.4e-11
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 366 70.7 3.5e-11
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 366 70.7 3.6e-11
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 366 70.7 3.6e-11
>>CCDS5957.1 MYOM2 gene_id:9172|Hs108|chr8 (1465 aa)
initn: 9812 init1: 9812 opt: 9812 Z-score: 8282.2 bits: 1545.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9812; 99.8% identity (99.9% similar) in 1465 aa overlap (1-1465:1-1465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MSLVTVPFYQKRHRHFDQSYRNIQTRYLLDEYASKKRASTQASSQKSLSQRSSSQRASSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSLVTVPFYQKRHRHFDQSYRNIQTRYLLDEYASKKRASTQASSQKSLSQRSSSQRASSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 TSLGGTICRVCAKRVSTQEDEEQENRSRYQSLVAAYGEAKRQRFLSELAHLEEDVHLARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TSLGGTICRVCAKRVSTQEDEEQENRSRYQSLVAAYGEAKRQRFLSELAHLEEDVHLARS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 QARDKLDKYAIQQMMEDKLAWERHTFEERISRAPEILVRLRSHTVWERMSVKLCFTVQGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QARDKLDKYAIQQMMEDKLAWERHTFEERISRAPEILVRLRSHTVWERMSVKLCFTVQGF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 PMPVVQWYKDGSLICQAAEPGKYRIESNYGVHTLEINRADFDDTATYSAVATNAHGQVST
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PTPVVQWYKDGSLICQAAEPGKYRIESNYGVHTLEINRADFDDTATYSAVATNAHGQVST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 NAAVVVRRFRGDEEPFRSVGLPIGLPLSSMIPYTHFDVQFLEKFGVTFRREGETVTLKCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NAAVVVRRFRGDEEPFRSVGLPIGLPLSSMIPYTHFDVQFLEKFGVTFRREGETVTLKCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 MLVTPDLKRVQPRAEWYRDDVLLKESKWTKMFFGEGQASLSFSHLHKDDEGLYTLRIVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MLVTPDLKRVQPRAEWYRDDVLLKESKWTKMFFGEGQASLSFSHLHKDDEGLYTLRIVSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 GGVSDHSAFLFVRDADPLVTGAPGAPMDLQCHDANRDYVIVTWKPPNTTTESPVMGYFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGVSDHSAFLFVRDADPLVTGAPGAPMDLQCHDANRDYVIVTWKPPNTTTESPVMGYFVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 RCEVGTNNWVQCNDAPVKICKYPVTGLFEGRSYIFRVRAVNSAGISRPSRVSDAVAALDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RCEVGTNNWVQCNDAPVKICKYPVTGLFEGRSYIFRVRAVNSAGISRPSRVSDAVAALDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 LDLRRLQAVHLEGEKEIAIYQDDLEGDAQVPGPPTGVHASEISRNYVVLSWEPPTPRGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LDLRRLQAVHLEGEKEIAIYQDDLEGDAQVPGPPTGVHASEISRNYVVLSWEPPTPRGKD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 PLMYFIEKSVVGSGSWQRVNAQTAVRSPRYAVFDLMEGKSYVFRVLSANRHGLSEPSEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PLMYFIEKSVVGSGSWQRVNAQTAVRSPRYAVFDLMEGKSYVFRVLSANRHGLSEPSEIT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 SPIQAQDVTVVPSAPGRVLASRNTKTSVVVQWDRPKHEEDLLGYYVDCCVAGTNLWEPCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPIQAQDVTVVPSAPGRVLASRNTKTSVVVQWDRPKHEEDLLGYYVDCCVAGTNLWEPCN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 HKPIGYNRFVVHGLTTGEQYIFRVKAVNAVGMSENSQESDVIKVQAALTVPSHPYGITLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HKPIGYNRFVVHGLTTGEQYIFRVKAVNAVGMSENSQESDVIKVQAALTVPSHPYGITLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 NCDGHSMTLGWKVPKFSGGSPILGYYLDKREVHHKNWHEVNSSPSKPTILTVDGLMEGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS59 NCDGHSMTLGWKVPKFSGGSPILGYYLDKREVHHKNWHEVNSSPSKPTILTVDGLTEGSL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB1 YEFKIAAVNLAGIGEPSDPSEHFKCEAWTMPEPGPAYDLTFCEVRDTSLVMLWKAPVYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YEFKIAAVNLAGIGEPSDPSEHFKCEAWTMPEPGPAYDLTFCEVRDTSLVMLWKAPVYSG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 SSPVSGYFVDFREEDAGEWITVNQTTTASRYLKVSDLQQGKTYVFRVRAVNANGVGKPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSPVSGYFVDFREEDAGEWITVNQTTTASRYLKVSDLQQGKTYVFRVRAVNANGVGKPSD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 TSEPVLVEARPGTKEISAGVDEQGNIYLGFDCQEMTDASQFTWCKSYEEISDDERFKIET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TSEPVLVEARPGTKEISAGVDEQGNIYLGFDCQEMTDASQFTWCKSYEEISDDERFKIET
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB1 VGDHSKLYLKNPDKEDLGTYSVSVSDTDGVSSSFVLDPEELERLMALSNEIKNPTIPLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VGDHSKLYLKNPDKEDLGTYSVSVSDTDGVSSSFVLDPEELERLMALSNEIKNPTIPLKS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB1 ELAYEIFDKGRVRFWLQAEHLSPDASYRFIINDREVSDSEIHRIKCDKATGIIEMVMDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELAYEIFDKGRVRFWLQAEHLSPDASYRFIINDREVSDSEIHRIKCDKATGIIEMVMDRF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB1 SIENEGTYTVQIHDGKAKSQSSLVLIGDAFKTVLEEAEFQRKEFLRKQGPHFAEYLHWDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SIENEGTYTVQIHDGKAKSQSSLVLIGDAFKTVLEEAEFQRKEFLRKQGPHFAEYLHWDV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB1 TEECEVRLVCKVANTKKETVFKWLKDDALYETETLPNLERGICELLIPKLSKKDHGEYKA
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TEECEVRLVCKVANTKKETVFKWLKDDVLYETETLPNLERGICELLIPKLSKKDHGEYKA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB1 TLKDDRGQDVSILEIAGKVYDDMILAMSRVCGKSASPLKVLCTPEGIRLQCFMKYFTDEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TLKDDRGQDVSILEIAGKVYDDMILAMSRVCGKSASPLKVLCTPEGIRLQCFMKYFTDEM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 KVNWCHKDAKISSSEHMRIGGSEEMAWLQICEPTEKDKGKYTFEIFDGKDNHQRSLDLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KVNWCHKDAKISSSEHMRIGGSEEMAWLQICEPTEKDKGKYTFEIFDGKDNHQRSLDLSG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB1 QAFDEAFAEFQQFKAAAFAEKNRGRLIGGLPDVVTIMEGKTLNLTCTVFGNPDPEVIWFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QAFDEAFAEFQQFKAAAFAEKNRGRLIGGLPDVVTIMEGKTLNLTCTVFGNPDPEVIWFK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB1 NDQDIQLSEHFSVKVEQAKYVSMTIKGVTSEDSGKYSINIKNKYGGEKIDVTVSVYKHGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NDQDIQLSEHFSVKVEQAKYVSMTIKGVTSEDSGKYSINIKNKYGGEKIDVTVSVYKHGE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460
pF1KB1 KIPDMAPPQQAKPKLIPASASAAGQ
:::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KIPDMAPPQQAKPKLIPASASAAGQ
1450 1460
>>CCDS45823.1 MYOM1 gene_id:8736|Hs108|chr18 (1589 aa)
initn: 4442 init1: 2027 opt: 4109 Z-score: 3470.9 bits: 655.0 E(32554): 5.2e-187
Smith-Waterman score: 4526; 46.6% identity (74.8% similar) in 1446 aa overlap (6-1436:138-1568)
10 20 30
pF1KB1 MSLVTVPFYQKRHRHFDQSYRNIQTRYLLDEYASK
::... :..: . . . . . . . :
CCDS45 YSSKLSPKPKRAKHSLLSGEEKENLPSDYMVPIFSGRQKHVS-GITDTEEERIKEAAAYI
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KB1 KRASTQASSQKSLSQRSSSQRASSQTSLGGTICRVCAKRVSTQEDEEQENRSRYQSLVAA
. . :: . ....:. ::.::. .: : ... . :: ..
CCDS45 AQRNLLASEEGITTSKQST--ASKQTT------------ASKQSTASKQSTASKQSTASR
170 180 190 200 210
100 110 120 130 140
pF1KB1 YGEAKRQRFLSELAH---LEEDVHLARSQA---RDKLDKYAIQQMMEDKLAWERHTFEER
. :.:: .:. : .:.. .:. :.: .. .... .:. ... . :..
CCDS45 QSTASRQSVVSKQATSALQQEETSEKKSRKVVIREKAERLSLRKTLEETETYHAKLNEDH
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KB1 ISRAPEILVRLRSHTVWERMSVKLCFTVQGFPMPVVQWYKDGSLICQAAEPGKYRIESNY
. .:::.... :::::::. .::: .. :.: : : :::. : :.:::: ::: :
CCDS45 LLHAPEFIIKPRSHTVWEKENVKLHCSIAGWPEPRVTWYKNQVPINVHANPGKYIIESRY
280 290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KB1 GVHTLEINRADFDDTATYSAVATNAHGQVSTNAAVVVRRFRGDEEPFRSVGLPIGLPLS-
:.:::::: ::.::: : : : :..:..:. :.:::.:..:. . : . .:::
CCDS45 GMHTLEINGCDFEDTAQYRASAMNVKGELSAYASVVVKRYKGEFDETRFHAGASTMPLSF
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KB1 SMIPY---THFDVQFLEKFGVTFRREGETVTLKCTMLVTPDLKRVQPRAEWYRDDVLLKE
.. :: ..:...: .:: :.: :::::..: : ...::..:. ::. .:::. : :.
CCDS45 GVTPYGYASRFEIHFDDKFDVSFGREGETMSLGCRVVITPEIKHFQPEIQWYRNGVPLSP
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB1 SKWTKMFFGEGQASLSFSHLHKDDEGLYTLRIVSRGGVSDHSAFLFVRDADPLVTGAPGA
:::.. ... .:.:.::::.:.::::::.:. ..::..:::::: . :::.:
CCDS45 SKWVQTLWSGERATLTFSHLNKEDEGLYTIRVRMGEYYEQYSAYVFVRDADAEIEGAPAA
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430 440
pF1KB1 PMDLQCHDANRDYVIVTWKPPNTTTESPVMGYFVDRCEVGTNNWVQCNDAPVKICKYPVT
:.:..: .::.::.:..:: : . ::..:::.:.:::::..: ::::.:::. ..:::
CCDS45 PLDVKCLEANKDYIIISWKQPAVDGGSPILGYFIDKCEVGTDSWSQCNDTPVKFARFPVT
520 530 540 550 560 570
450 460 470 480 490 500
pF1KB1 GLFEGRSYIFRVRAVNSAGISRPSRVSDAVAALDPLDLRRLQAVHLEGEKEIAIYQDDLE
::.:::::::::::::. ::. :::::. :::::: . ::.. : ..
CCDS45 GLIEGRSYIFRVRAVNKMGIGFPSRVSEPVAALDPAEKARLKSRPSAPWTGQIIVTEEEP
580 590 600 610 620 630
510 520 530 540 550 560
pF1KB1 GDAQVPGPPTGVHASEISRNYVVLSWEPPTPRGKDPLMYFIEKSVVGSGSWQRVNAQTAV
... :::::: . ..: .:.::::::.:: ::.. .:::.:: .:. .:::::.. :
CCDS45 SEGIVPGPPTDLSVTEATRSYVVLSWKPPGQRGHEGIMYFVEKCEAGTENWQRVNTELPV
640 650 660 670 680 690
570 580 590 600 610 620
pF1KB1 RSPRYAVFDLMEGKSYVFRVLSANRHGLSEPSEITSPIQAQDVTVVPSAPGRVLASRNTK
.:::.:.::: ::::: ::: .: :..:::: : . : .:.:::... ::::
CCDS45 KSPRFALFDLAEGKSYCFRVRCSNSAGVGEPSEATEVTVVGDKLDIPKAPGKIIPSRNTD
700 710 720 730 740 750
630 640 650 660 670 680
pF1KB1 TSVVVQWDRPKHEEDLLGYYVDCCVAGTNLWEPCNHKPIGYNRFVVHGLTTGEQYIFRVK
:::::.:.. : ..:.:::.. :::.. :::::..:. .::. :::.::..:::::.
CCDS45 TSVVVSWEESKDAKELVGYYIEASVAGSGKWEPCNNNPVKGSRFTCHGLVTGQSYIFRVR
760 770 780 790 800 810
690 700 710 720 730 740
pF1KB1 AVNAVGMSENSQESDVIKVQAALTVPSHPYGITLLNCDGHSMTLGWKVPKFSGGSPILGY
::::.:.:: ::.:..:.:.::.. :: : :: :. ::.:::: : ::. : ::
CCDS45 AVNAAGLSEYSQDSEAIEVKAAIAPPSPPCDITCLESFRDSMVLGWKQPDKIGGAEITGY
820 830 840 850 860 870
750 760 770 780 790 800
pF1KB1 YLDKREVHHK---NWHEVNSSPSKPTILTVDGLMEGSLYEFKIAAVNLAGIGEPSDPSEH
:.. ::: .:.:.: . . ...: :. .:.:..::.:.::.: :: ::
CCDS45 YVNYREVIDGVPGKWREANVKAVSEEAYKISNLKENMVYQFQVAAMNMAGLGAPSAVSEC
880 890 900 910 920 930
810 820 830 840 850 860
pF1KB1 FKCEAWTMPEPGPAYDLTFCEVRDTSLVMLWKAPVYSGSSPVSGYFVDFREEDAGE--WI
:::: ::. ::: ..: ::: :::. :: ::.:: .::.:::::..: : : :
CCDS45 FKCEEWTIAVPGPPHSLKCSEVRKDSLVLQWKPPVHSGRTPVTGYFVDLKEAKAKEDQWR
940 950 960 970 980 990
870 880 890 900 910 920
pF1KB1 TVNQTTTASRYLKVSDLQQGKTYVFRVRAVNANGVGKPSDTSEPVLVEARPGTKEISAGV
.:... . :::: :..: .:::::::.: ::::::: . ::..:.::::::. ..:
CCDS45 GLNEAAIKNVYLKVRGLKEGVSYVFRVRAINQAGVGKPSDLAGPVVAETRPGTKEVVVNV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
930 940 950 960 970 980
pF1KB1 DEQGNIYLGFDCQEMTDASQFTWCKSYEEISDDERFKIETVGDHSKLYLKNPDKEDLGTY
:..: : :.:.:..:: :.:.: :.: :. :...:. :...:. .:. .::: :
CCDS45 DDDGVISLNFECDKMTPKSEFSWSKDYVSTEDSPRLEVESKGNKTKMTFKDLGMDDLGIY
1060 1070 1080 1090 1100 1110
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB1 SVSVSDTDGVSSSFVLDPEELERLMALSNEIKNPTIPLKSELAYEIFDKGRVRFWLQAEH
: .:.::::..::...: :::.::.:::.: : ::.:.::::: ::..::.::::.:::.
CCDS45 SCDVTDTDGIASSYLIDEEELKRLLALSHEHKFPTVPVKSELAVEILEKGQVRFWMQAEK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB1 LSPDASYRFIINDREVSDSEIHRIKCDKATGIIEMVMDRFSIENEGTYTVQIHDGKAKSQ
:: .:. .:.:..:. .. .... :. :::::: :.... :.::::: :..:::: ..
CCDS45 LSGNAKVNYIFNEKEIFEGPKYKMHIDRNTGIIEMFMEKLQDEDEGTYTFQLQDGKATNH
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB1 SSLVLIGDAFKTVLEEAEFQRKEFLRKQGPHFAEYLHWDVTEECEVRLVCKVANTKKETV
:..::.::.:: . .::::::.:..:::::::.::: :.:: ::.: : ::::: ::::
CCDS45 STVVLVGDVFKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFVEYLSWEVTGECNVLLKCKVANIKKETH
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB1 FKWLKDDALYETETLPNLERGICELLIPKLSKKDHGEYKATLKDDRGQDVSILEIAGKVY
. : ::. .. ... ::: ::: ..:::: : :.. ::::::.: : :... ...
CCDS45 IVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAF
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB1 DDMILAMSRVCGKSASPLKVLCTPEGIRLQCFMKYFTDEMKVNWCHKDAKISSSEHMRIG
.... . . . ::. ::. : :::.: :. :.....:::: :. . : :.... :
CCDS45 KELMMEVCKKIALSATDLKIQSTAEGIQLYSFVTYYVEDLKVNWSHNGSAIRYSDRVKTG
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:.:..:::.. :.. ::.: ::. :. : ::: . : : .. :.:. :.: : ..:
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.: :.. . . . . .. :..: . .: . .: :
CCDS54 LDIDANFKQTHVVRAGASIRLFIAYQGRPTPTAVWSKPDSNLSLRADIHTTDSFSTLTVE
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::.. : ..:.. . ... : ::. : .:. : :
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:. . : :: : .: ..::. : : ..:::. ...:. .. . .. :. :. : :
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: : :...::: :.::: . : . . .:.: : .. .: :. : :
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..:.: ..::....:.. . :. ...: . . : : . : :::.: : : ..
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.... .: .: :. :.. : .:. . : : : ... .: ::..
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CCDS54 I---------------------------APPGPPFP-KVTDWTKSSADLEWSPPLKDGGS
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CCDS54 KVTGYIVEYKEEGKEEWEK-GKDKEVRGTKLVVTGLKEGAFYKFRVRAVNIAGIGEPGEV
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CCDS54 NTVTLTWNPPKYDGGSEIINYVLESRLIGTEKFHKVTNDNLLSRKYTVKGLKEGDTYEYR
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CCDS54 SPFYKACDTVFKPGPPGNPRVLDT--SRSSISIAWNKPIYDGGSEITGYMVEIALPEEDE
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CCDS54 ELDADLRKVVTIRAC----CTLRLFVPIKGRPAPEVKWARDHGESLDKASIE---STSSY
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CCDS54 TLLIV-----GNVNRFDSGKYILTV--ENSSGSKSAFVNVRVLDTPGPPQDLKVKEVTKT
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CCDS54 ILGKPLPKSSWSKAGKDI-RPSDITQITSTPTSSMLTIKYATRKDAGEYTITATNPFGT-
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CCDS54 RLLW-TVVSEDIQSCRHVATKLIQGNEYIFRVSAVNHYGKGEPVQ-SEPVKMVDRFGP-P
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CCDS54 VTGLQEGSTYEFRVSAENRAGIGPPSEASDSVLMKDAAYPPGPPSNPHVTDTTKKSASLA
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CCDS54 WGKPHYDGGLEITGYVVEHQKVGDEAWIK-DTTGTALRITQFVVPDLQTKEKYNFRISAI
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CCDS54 ---------YP---------PGPPAFPKVYDTTRSSVSLSWGKPAYDGGSPIIGYLVEVK
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: ..:. . . : . :. : ..:::::..: ..::....:.: :.. :: : . :
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CCDS54 KPKEILEPPEIDLDASMRKLVIVRAGCPIRLFAIVR-GRPAPKVTWRKVGIDNVVRKGQV
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CCDS54 VSDLKVSDVTKTSCHVSWAPPENDGGSQVTHYIVEKREADRKTWSTV-TPEVKKTSFHVT
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CCDS54 IDNVTRFDSGRYNLTLENNSGSKTAFVNVRVLDSPSAPVNLTIR-EVKKDSVTLSWE--P
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CCDS54 PLIDGGAKITNYIVEKRETTRKAYATITNNCTKTTFRIENLQEGCSYYFRVLASNEYGIG
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CCDS54 GDWHKVNAEACVKT-RYTVTDLQAGEEYKFRVSAINGAGKGDSCEVTGTIKAVDRLTAPE
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CCDS54 LDIDANFKQTHVVRAGASIRLFIAYQGRPTPTAVWSKPDSNLSLRADIHTTDSFSTLTVE
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CCDS54 NCNRNDAGKYTLTVENNSGSKSITFTVKV---------------------LDTPGPPGPI
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CCDS54 TFKDVTRGSATLMWDAPLLDGGARIHHYVVEKREASRRSWQVISEKCTRQ-IFKVNDLAE
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CCDS54 GVPYYFRVSAVNEYGVGEPYEMPEPIV----ATEQPAPPRRLDVVDTSKSSAVLAWLKPD
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CCDS54 HDGGSRITGYLLEMRQKGSDFWVEAGHTKQLT--FTVERLVEKTEYEFRVKAKNDAGYSE
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CCDS54 QPIVTEVT-KDSALVTWNKPH-------DGGKP-----ITNYILEKRETMSKRWARVTKD
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