Result of FASTA (ccds) for pF1KB2497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB2497, 803 aa
  1>>>pF1KB2497 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1052+/-0.00106; mu= 1.7397+/- 0.063
 mean_var=395.9887+/-83.767, 0's: 0 Z-trim(115.2): 809  B-trim: 139 in 1/52
 Lambda= 0.064451
 statistics sampled from 14891 (15771) to 14891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.484), width:  16
 Scan time:  4.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35313.1 ZXDB gene_id:158586|Hs108|chrX         ( 803) 5555 531.3 2.5e-150
CCDS14376.1 ZXDA gene_id:7789|Hs108|chrX           ( 799) 5297 507.3 4.2e-143
CCDS43146.1 ZXDC gene_id:79364|Hs108|chr3          ( 710) 2591 255.6 2.1e-67
CCDS43145.1 ZXDC gene_id:79364|Hs108|chr3          ( 858) 2586 255.2 3.3e-67


>>CCDS35313.1 ZXDB gene_id:158586|Hs108|chrX              (803 aa)
 initn: 5555 init1: 5555 opt: 5555  Z-score: 2812.3  bits: 531.3 E(32554): 2.5e-150
Smith-Waterman score: 5555; 100.0% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB2 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB2 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB2 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB2 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB2 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB2 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB2 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB2 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB2 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB2 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB2 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB2 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
              730       740       750       760       770       780

              790       800   
pF1KB2 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
       :::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
              790       800   

>>CCDS14376.1 ZXDA gene_id:7789|Hs108|chrX                (799 aa)
 initn: 4769 init1: 4769 opt: 5297  Z-score: 2682.7  bits: 507.3 E(32554): 4.2e-143
Smith-Waterman score: 5297; 96.1% identity (97.8% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-799)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS14 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLPRGPQDGGPGRRRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB2 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
       :::::::::::::.:::  ::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EASTASRGPGPSLFAPRPHQPSG----GGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
               70        80            90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB2 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
       :. :::::: :::::::: .: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKAGPGLQGDESGANPAGCSAQGPHCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB2 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::  :::::::::::
CCDS14 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPRCLIAPQAGFPQAAHPGDCPELRSDLLLAEPAEPA
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB2 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
       :::::.::::: :::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS14 PAPAPQEEAEGLAAALGPRGLLGSGPGVVLYLCPEALCGQTFAKKHQLKMHLLTHSSSQG
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB2 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB2 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
       :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENSFKCEVCEESFPTQAKLGAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
        360       370       380       390       400       410      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB2 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
        420       430       440       450       460       470      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB2 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
        480       490       500       510       520       530      

              550       560       570       580       590       600
pF1KB2 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
        540       550       560       570       580       590      

              610       620       630       640       650       660
pF1KB2 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
        600       610       620       630       640       650      

              670       680       690       700       710       720
pF1KB2 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
        660       670       680       690       700       710      

              730       740       750       760       770       780
pF1KB2 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::.:::.::::::::::::::::
CCDS14 PQALTPSSKLTVDTDTLTPSSTLCENSVSELLTPAKAEWSVHPNSDFFGQEGETQFGFPN
        720       730       740       750       760       770      

              790       800   
pF1KB2 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
       :::::::::: .:::::::::::
CCDS14 AAGNHGSQKERNLITVTGSSFLV
        780       790         

>>CCDS43146.1 ZXDC gene_id:79364|Hs108|chr3               (710 aa)
 initn: 2485 init1: 2121 opt: 2591  Z-score: 1323.5  bits: 255.6 E(32554): 2.1e-67
Smith-Waterman score: 2785; 58.4% identity (72.4% similar) in 812 aa overlap (1-803:1-710)

               10        20        30        40         50         
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRR-LLLLRGPQDGGPGRRR
       :..: ::::  : .::  :: :   : ..:.: .: :  :.:: :::.:::.::::: : 
CCDS43 MDLPALLPA-PTARGGQHGGGP---GPLRRAP-APLGASPARRRLLLVRGPEDGGPGARP
                10        20            30        40        50     

      60        70        80        90        100       110        
pF1KB2 EEASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLD-PVGGDVETAGSGQAAGPVLR
        :::    ::.:    :  :. .:       : :::::. : :: .  :...: : :  :
CCDS43 GEAS----GPSPP---PAEDDSDG-------DSFLVLLEVPHGGAAAEAAGSQEAEPGSR
              60           70               80        90       100 

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB2 EEAEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLL
        .    :     :.:  :.::.:         :       :::..: ::.::: .::::.
CCDS43 VNLASRP-----EQG--PSGPAA---------P-------PGPGVAPAGAVTISSQDLLV
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      180       190       200       210       220       230        
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