FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB2497, 803 aa 1>>>pF1KB2497 803 - 803 aa - 803 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1052+/-0.00106; mu= 1.7397+/- 0.063 mean_var=395.9887+/-83.767, 0's: 0 Z-trim(115.2): 809 B-trim: 139 in 1/52 Lambda= 0.064451 statistics sampled from 14891 (15771) to 14891 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16 Scan time: 4.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS35313.1 ZXDB gene_id:158586|Hs108|chrX ( 803) 5555 531.3 2.5e-150 CCDS14376.1 ZXDA gene_id:7789|Hs108|chrX ( 799) 5297 507.3 4.2e-143 CCDS43146.1 ZXDC gene_id:79364|Hs108|chr3 ( 710) 2591 255.6 2.1e-67 CCDS43145.1 ZXDC gene_id:79364|Hs108|chr3 ( 858) 2586 255.2 3.3e-67 >>CCDS35313.1 ZXDB gene_id:158586|Hs108|chrX (803 aa) initn: 5555 init1: 5555 opt: 5555 Z-score: 2812.3 bits: 531.3 E(32554): 2.5e-150 Smith-Waterman score: 5555; 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CCDS43 VNLASRP-----EQG--PSGPAA---------P-------PGPGVAPAGAVTISSQDLLV 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KB2 RFENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAE :.. :::.:..:: : .::: . ::::. CCDS43 RLDRGVLALSAPPGPATAGAAAPRR------APQAS------------------------ 140 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KB2 PAPAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSS :: : :: : ::: ::. .::::::::::::::... CCDS43 ------------GP-----------STPG---YRCPEPQCALAFAKKHQLKVHLLTHGGG 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KB2 QGQRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGH ::.::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::. ::::.:::::::::::::: CCDS43 QGRRPFKCPLEGCGWAFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPVGGCGKKFTTVYNLKAHMKGH 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KB2 EQENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHF :::. :::::: : :::.::::.::::::::::::.: : ::.::::::::::::::::: CCDS43 EQESLFKCEVCAERFPTHAKLSSHQRSHFEPERPYKCDFPGCEKTFITVSALFSHNRAHF 270 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KB2 REQELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKH ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :.:::.::::::::::.::: CCDS43 REQELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFICDSDSCGWTFTSMSKLLRHRRKH 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KB2 DDDRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKH :::::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::: CCDS43 DDDRRFTCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFECPVEGCCARFSARSSLYIHSKKH 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KB2 LQDVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQR .::: . :::::.:.::.:::::::::.:::..:. :::: :::: .::::::::.: CCDS43 VQDVGAPKSRCPVSTCNRLFTSKHSMKAHMVRQHSRRQDLLPQLEAPSSLTPSSELSSPG 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 pF1KB2 QNDLSDAEIVSLFSDVPD--STSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSV :..:.. ....::::.: : ::. : :: :::::::::.::::.:.:.:::::. :. 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CCDS43 LSDDPLALTSNSNLAAHITTPTSSSTPRENASVPELLAPIKVEPDSPSRPGAVGQQEGSH 620 630 640 650 660 670 780 790 800 pF1KB2 GETQFGFPNAAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV : : .:. : .::.: .:.: . ::. .: CCDS43 GLPQSTLPSPAEQHGAQ-DTELSAGTGNFYLESGGSARTDYRAIQLAKEKKQRGAGSNAG 680 690 700 710 720 730 CCDS43 ASQSTQRKIKEGKMSPPHFHASQNSWLCGSLVVPSGGRPGPAPAAGVQCGAQGVQVQLVQ 740 750 760 770 780 790 803 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:01:43 2016 done: Thu Nov 3 12:01:43 2016 Total Scan time: 4.190 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]