Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3016, 779 aa
1>>>pF1KB3016 779 - 779 aa - 779 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3599+/-0.000864; mu= 19.7777+/- 0.052
mean_var=65.0827+/-12.849, 0's: 0 Z-trim(106.1): 31 B-trim: 53 in 1/52
Lambda= 0.158980
statistics sampled from 8740 (8768) to 8740 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 3.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 5224 1207.4 0
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 4306 996.8 0
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 1303 308.0 3.3e-83
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 1220 289.0 1.7e-77
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 1078 256.5 1.3e-67
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 913 218.7 4.4e-56
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 913 218.7 4.5e-56
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 876 210.2 1.4e-53
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 847 203.6 1.6e-51
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 812 195.5 4.1e-49
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 660 160.6 8.3e-39
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 643 156.8 1.9e-37
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 575 141.2 9.3e-33
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 572 140.4 1e-32
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 548 135.0 6e-31
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2 ( 717) 519 128.2 4.5e-29
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 515 127.4 1.1e-28
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 499 123.8 2e-27
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 489 121.5 9.4e-27
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 428 107.5 1.4e-22
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 406 102.5 5e-21
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 391 99.0 5.5e-20
>>CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 (779 aa)
initn: 5224 init1: 5224 opt: 5224 Z-score: 6466.9 bits: 1207.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5224; 100.0% identity (100.0% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-779)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSRFPAVAGRAPRRQEEGERSRDLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSRFPAVAGRAPRRQEEGERSRDLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KIIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYEAGFSQHGMIGVTQPRKVAAISVAQRVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KIIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYEAGFSQHGMIGVTQPRKVAAISVAQRVAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EMKCTLGSKVGYQVRFDDCSSKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMKCTLGSKVGYQVRFDDCSSKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFDIPGRLYPVREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFDIPGRLYPVREK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 HVIPEIKRTSLTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HVIPEIKRTSLTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 RELAAKAGGFNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RELAAKAGGFNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KQQSDFPKETFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQQSDFPKETFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 QETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDAR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB3 RRWTNKENVKQLKDGISKDVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRWTNKENVKQLKDGISKDVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
730 740 750 760 770
>>CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 (702 aa)
initn: 4708 init1: 4290 opt: 4306 Z-score: 5329.7 bits: 996.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4558; 90.1% identity (90.1% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSRFPAVAGRAPRRQEEGERSRDLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSRFPAVAGRAPRRQEEGERSRDLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KIIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYEAGFSQHGMIGVTQPRKVAAISVAQRVAE
:::::
CCDS54 KIIQA-------------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EMKCTLGSKVGYQVRFDDCSSKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------------ETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTL
70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFDIPGRLYPVREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFDIPGRLYPVREK
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVD
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 YDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYV
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPD
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 HVIPEIKRTSLTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HVIPEIKRTSLTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVT
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRH
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 RELAAKAGGFNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RELAAKAGGFNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKL
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KQQSDFPKETFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQQSDFPKETFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHE
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 QETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDAR
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770
pF1KB3 RRWTNKENVKQLKDGISKDVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRWTNKENVKQLKDGISKDVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
650 660 670 680 690 700
>>CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 (703 aa)
initn: 890 init1: 380 opt: 1303 Z-score: 1607.3 bits: 308.0 E(32554): 3.3e-83
Smith-Waterman score: 1519; 37.6% identity (70.0% similar) in 680 aa overlap (53-718:54-702)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 DLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRKKIIQAVRDNSFLIVTGNTGSGK
.:. : :..:. ... . ....:.:: ::
CCDS13 EERQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVIVGETGCGK
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 TTQLPKYLYEAGFSQHG-MIGVTQPRKVAAISVAQRVAEEMKCTLGSKVGYQVRFDDCSS
.::.:.:: :::.. .: ..::::::.:::..:: ::::: .:: .::: .:::::..
CCDS13 STQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTD
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 K-ETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTLTTDILFGLLKKLFQEKSPNR
. : ::..::: :..... :: :::.:::.::::::::: ::: .:::::. :.: .
CCDS13 QLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKI-QKKRGD-
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250
pF1KB3 KEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGN----------CPIFDIPGRLYPVREKFCNLIGPRDR
:...: :::.. :. ::.. : :. . :: .:: . : : .:
CCDS13 ---LRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPV-DIF-YLQSPVP-
210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 ENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVDYDYDVQDTTL
::.. :.... :: .: ::.:.::::: :.: .:...:... ..
CCDS13 ---DYIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARAL-----ARTGMK
260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYVVDGGFVKQLN
: .:: :... . .: ..: ..:: ...::.. ::.::.:: ::.: ::::
CCDS13 RHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 HNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPDHVIPEIKRTS
.::: ... : :::.:.. : ::.::.::. ::::.:.:... ... .:. ..::..:..
CCDS13 YNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAFDK-LPQSTVPEMQRSN
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480
pF1KB3 LTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVTR-LGLSMVEF
:. :.: :: :.: .:.:: ...:: . ...::. :: ..:.. ..:. ::. ..::
CCDS13 LAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRHRELAAKAGG
:: : .. ....... : . .: ::::....:.:. : :. ...: . ::..:.. :
CCDS13 PLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVP--PNQKSHAIRVHRKFAVEEG-
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 FNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKLKQQSDFPKE
: :. :.: . . ..:::.:..... : : :. ::..:. :.. :..
CCDS13 --DHLTMLNIYEAFIKHNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQ----VPRK
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 TFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVAR-RSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHEQETKLEWI
. :: ::: :. .:.: :.:: .:.: : . .::::.:.:. .. .:.
CCDS13 SSEGDPDLVLR-CIVSGFFANAARFHSTGAYRTIRDDH--ELHIHPASVLYAEKPP-RWV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 IFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDARRRWTNKEN
:..::. :.: : : : :. :. .: :.... ..: :: :.: .:
CCDS13 IYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLLELAPHFYQQGTH-LSLKAKRAKVQDP
660 670 680 690 700
730 740 750 760 770
pF1KB3 VKQLKDGISKDVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 (672 aa)
initn: 808 init1: 380 opt: 1220 Z-score: 1504.7 bits: 289.0 E(32554): 1.7e-77
Smith-Waterman score: 1436; 36.8% identity (67.7% similar) in 693 aa overlap (47-718:14-671)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 EGERSRDLQEERLSAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRKKIIQAVRDNSFLIVTG
: : :...: :.. .:: :.
CCDS54 MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEER----QSLAENSGTTVVY
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KB3 NTGSG-----KTTQLP--KYLYEAGFSQHG-MIGVTQPRKVAAISVAQRVAEEMKCTLGS
: .. . .:: ::: :::.. .: ..::::::.:::..:: ::::: .::
CCDS54 NPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KVGYQVRFDDCSSK-ETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTLTTDILFG
.::: .:::::... : ::..::: :..... :: :::.:::.::::::::: ::: .:
CCDS54 EVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB3 LLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGN----------CPIFDIPGRLYPV
::::. :.: . :...: :::.. :. ::.. : :. . :: .::
CCDS54 LLKKI-QKKRGD----LRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 REKFCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAE
. : .: ::.. :.... :: .: ::.:.::::: :.: .:...:.
CCDS54 --DIFYLQSPVPD----YIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQAR
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SVDYDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGI
.. .. : .:: :... . .: ..: ..:: ...::.. ::.::.::
CCDS54 AL-----ARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGI
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CCDS54 VQDP
670
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790
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CCDS11 LPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLV
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pF1KB3 VVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPDHVIPEIKRTSLTSVVLTLKCL
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CCDS11 VTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAM
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CCDS11 GINDLLSFDFMDAPPMETLIT-AMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLI
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CCDS11 MSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDK--QALADQKKAKFHQTEG---DHLTLLAVY
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CCDS11 NSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDV-----VSCGKSTVRVQ
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CCDS11 KAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQ-QVVYIHPSSALFNRQP--EWVVYHELVLTTKEY
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CCDS11 MREVTTIDPRWLVEFAPAF--FKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRR
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CCDS11 R
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10 20
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CCDS46 EESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEE
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CCDS46 LVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPV-DIFYTKAPEAD-----YLEACVVSVLQI
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CCDS46 QARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]