Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3017, 798 aa
1>>>pF1KB3017 798 - 798 aa - 798 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5143+/-0.00121; mu= 10.7805+/- 0.073
mean_var=200.4305+/-38.350, 0's: 0 Z-trim(109.7): 121 B-trim: 48 in 2/48
Lambda= 0.090593
statistics sampled from 10937 (11060) to 10937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 4.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 5618 748.0 1.4e-215
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 2524 343.6 7.5e-94
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2226 304.6 4.1e-82
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 2065 283.6 8.8e-76
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 2054 282.1 2.4e-75
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 2043 280.7 6.5e-75
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 1946 268.0 4.1e-71
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 1786 247.1 7.6e-65
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 1568 218.6 2.8e-56
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1376 193.9 1.9e-48
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1376 193.9 2e-48
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1376 193.9 2e-48
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1339 188.7 3.2e-47
>>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 (798 aa)
initn: 5618 init1: 5618 opt: 5618 Z-score: 3983.6 bits: 748.0 E(32554): 1.4e-215
Smith-Waterman score: 5618; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
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CCDS88 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
::::::::::::::::::
CCDS88 AITTTINPRFQEADSPTL
790
>>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 (769 aa)
initn: 1666 init1: 896 opt: 2524 Z-score: 1798.4 bits: 343.6 E(32554): 7.5e-94
Smith-Waterman score: 2524; 48.3% identity (73.9% similar) in 756 aa overlap (50-793:32-769)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
::..:: : :.:.::..::::. :. .. :
CCDS13 LGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSIR
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGATQLAPQRVRVTLRPGEPQQ
: : .:: ::: ... .: . :. .:. .: : ::.::.: . ::::.
CCDS13 CDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDH---NG----GQKQLSPQKVTLYLRPGQAAA
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 LQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDK
..: : ::.:::.:::::::::::: :::. :..:: :: :.:.:.: ::::::::::
CCDS13 FNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDK
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 TVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPE
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CCDS13 TVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPE
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLY
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CCDS13 GGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDN-LY
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 SRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVV
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CCDS13 KRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVV
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 QLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQC-EGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVT
.:: .:::.::: : :.:..:: ....:.: : .: .:. . ::.:. :.:: .:
CCDS13 HLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRN---QPRGDCDGVQINVPIT
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 FWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCG
: :.. ::.:. : .. .:::::.. . :.. :.: : : . . : :.: :.::
CCDS13 FQVKVTATECIQEQSFV-IRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCH-GKGFLECG
420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 VCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCSGQSS---
.: : : .:. :::.. :: .::..:: :.. .::: : : ::.: : ..
CCDS13 ICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNS-IICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGK
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 ---GHLCECDDASCERHEGILCGGFGR--CQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEG
:. :::: .:::..: .::: :: : :: :.:: . : ::.: ..:..:.
CCDS13 LIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRR
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 GLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTAC
:::.:::.:: :.: .:: ::..:::: .:: .. .:::: :. ::.. :::.::
CCDS13 VECSGRGRCRCNVCECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAAC
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720
pF1KB3 AHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDN-QLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEK--GADHTQAI
.. :. :. :::: .. . . : ..:. .. : ... .. . ::
CCDS13 P--GLQLSNNPV-KGRTCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAI
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTIN
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CCDS13 VGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMN
710 720 730 740 750 760
790
pF1KB3 PRFQEADSPTL
:.: :.
CCDS13 PKFAES
>>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa)
initn: 1601 init1: 506 opt: 2226 Z-score: 1587.7 bits: 304.6 E(32554): 4.1e-82
Smith-Waterman score: 2477; 45.1% identity (72.8% similar) in 771 aa overlap (48-791:32-796)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 ESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEA
: :: .:: . :.:.:: . .: : .
CCDS71 NLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTS
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 RRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARG-------EGATQLAPQRVRV
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CCDS71 ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 TLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVR
:: :::: . ..: ::: ::.::::::::::::::::: :..:: :. .....: . :
CCDS71 RLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFR
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQS
:::::::.:::.:..::.:.:::.:: : . : ::::...:::::. ...:.. ::.:
CCDS71 IGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPC-TSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQR
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 VSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGH
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CCDS71 ISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQ
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 CHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGE
:::..: .:. : .::::.....: :: ::: ::::: :::.::..::::::::
CCDS71 CHLENN-MYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGT
310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNH
:: .::::.:::.:::::::: : ::...: :: :::.: :.. . : .:. .:..
CCDS71 LSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVN--GTGENGRKCSN
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480
pF1KB3 VRINQTVTFWVSLQATHCLP--EPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPH
. :.. : : .:. ...: : . ...: :::.::. : :. .:.:.: :. :..:.
CCDS71 ISIGDEVQFEISITSNKC-PKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 CSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGR
: .:.: ..::.: : ::.:: ::::. :..: :... :: : .. .::..:.: ::.
CCDS71 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKEN-SSEICSNNGECVCGQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 CSCSGQS------SGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGD
: : .. ::..::::. .:.: .:..::: : :.: ::.:. : :: ::.:: :
CCDS71 CVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLD
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 MDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDG-YYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
..: . .: .:.:.: :.:. :.: : . : :..: : : .:..:..: :: :
CCDS71 TSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALA------PILDD--GWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVL
.:. :.. :.: . . :. : . :::. .:. :.: .. . :..
CCDS71 EKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 RV--RPQEKGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNW
.: :. . :: : :.::: .::.:.: ..: . :.::::...::::... .:
CCDS71 HVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKW
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KB3 KQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL
::.::::.::..::...
CCDS71 DTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
780 790
>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa)
initn: 1114 init1: 607 opt: 2065 Z-score: 1474.0 bits: 283.6 E(32554): 8.8e-76
Smith-Waterman score: 2065; 40.3% identity (68.1% similar) in 762 aa overlap (50-791:38-786)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
:::.:. : ::::.. . .. :
CCDS11 RPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLGSP----R
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA--TQLAPQRVRVTLRPGEP
: .:.:: .: : .: : .. .::.:.:::. . :... ::..:::. . ::: .
CCDS11 CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 QQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFV
...... ..: ::::.:::::::::::::: ...:: : ......: ..:::::.::
CCDS11 KNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFV
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 DKTVLPFVSTVPSK-LRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLD
:: : :.. : . :..:: : :...:::.:: .. :..:: .:::: : :
CCDS11 DKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 SPEGGFDAILQAALCQEQIGWRN-VSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDS
.::::::::.::..:.:.::::: .:.:::::.: : : ::.:.:: .:.::.::. :
CCDS11 APEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGS
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
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:::.:::.:::... : : :: .:: . .:... : . : : .: ..:..
CCDS11 SNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK----SCMGLKIGD
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::.: . .. : : . . .. .::.. :::.. ::: : ....:.. .:..:.:
CCDS11 TVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNG
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..:::: :.:: :: :::: : :. .. : .: :.:: .:.: ::.: :
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CCDS11 EATSTFTNITYRGT
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CCDS30 PSGKSNLTVLR-EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQ
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CCDS74 ELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQK----KCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSR
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CCDS74 RHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCT
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CCDS74 NPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKD
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CCDS74 GSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVV
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CCDS74 LLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLS
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CCDS74 TDC
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CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM
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CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL
60 70 80 90 100 110
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:.:.:.: ::.::. :.. : :..:.:.:.::::::::.:::.:.:.::::: : .:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]