Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3028, 1184 aa
1>>>pF1KB3028 1184 - 1184 aa - 1184 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1037+/-0.00108; mu= 15.1915+/- 0.065
mean_var=142.6567+/-29.066, 0's: 0 Z-trim(108.4): 194 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.107381
statistics sampled from 9986 (10185) to 9986 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 5.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4269.1 PCDH12 gene_id:51294|Hs108|chr5 (1184) 7769 1216.3 0
CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134) 1521 248.4 7.3e-65
CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135) 1521 248.4 7.3e-65
CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100) 1483 242.5 4.2e-63
CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101) 1483 242.5 4.2e-63
CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148) 1483 242.5 4.4e-63
CCDS4242.1 PCDHAC2 gene_id:56134|Hs108|chr5 (1007) 1381 226.7 2.3e-58
CCDS75349.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 871) 1316 216.6 2.2e-55
CCDS4262.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 938) 1316 216.6 2.3e-55
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 1313 216.1 2.8e-55
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 1313 216.1 3.1e-55
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 1310 215.6 4.4e-55
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 1308 215.3 4.9e-55
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 1308 215.3 5.4e-55
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 1306 215.0 6.1e-55
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 1306 215.0 6.7e-55
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 1298 213.8 1.6e-54
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 863) 1297 213.6 1.7e-54
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 934) 1297 213.6 1.8e-54
CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5 ( 950) 1295 213.3 2.2e-54
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 1290 212.5 3.3e-54
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 1290 212.5 3.3e-54
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 1290 212.5 3.7e-54
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 1286 211.9 5.2e-54
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 1286 211.9 5.7e-54
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 1280 210.9 9.7e-54
CCDS54917.1 PCDHA5 gene_id:56143|Hs108|chr5 ( 936) 1278 210.7 1.4e-53
CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5 ( 950) 1277 210.5 1.5e-53
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 1275 210.2 1.7e-53
CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5 ( 947) 1276 210.4 1.7e-53
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 1274 210.0 1.8e-53
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 1275 210.2 1.9e-53
CCDS54913.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5 ( 950) 1275 210.2 1.9e-53
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 1271 209.6 2.6e-53
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 1271 209.6 2.9e-53
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 1267 208.9 4e-53
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 1267 209.0 4.4e-53
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 1261 208.0 7.6e-53
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 1261 208.1 8.4e-53
CCDS64269.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 808) 1260 207.9 8.4e-53
CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5 ( 950) 1261 208.1 8.5e-53
CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 948) 1260 207.9 9.5e-53
CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5 ( 950) 1260 207.9 9.5e-53
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 1259 207.7 9.7e-53
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 1259 207.8 1.1e-52
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 1257 207.4 1.1e-52
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 1255 207.1 1.5e-52
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 1255 207.1 1.6e-52
CCDS75325.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 ( 844) 1253 206.8 1.8e-52
CCDS54921.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 ( 948) 1253 206.8 2e-52
>>CCDS4269.1 PCDH12 gene_id:51294|Hs108|chr5 (1184 aa)
initn: 7769 init1: 7769 opt: 7769 Z-score: 6508.8 bits: 1216.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7769; 99.9% identity (100.0% similar) in 1184 aa overlap (1-1184:1-1184)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMQLLQLLLGLLGPGGYLFLLGDCQEVTTLTVKYQVSEEVPSGTVIGKLSQELGREERRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MMQLLQLLLGLLGPGGYLFLLGDCQEVTTLTVKYQVSEEVPSGTVIGKLSQELGREERRR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 QAGAAFQVLQLPQALPIQVDSEEGLLSTGRRLDREQLCRQWDPCLVSFDVLATGDLALIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QAGAAFQVLQLPQALPIQVDSEEGLLSTGRRLDREQLCRQWDPCLVSFDVLATGDLALIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VEIQVLDINDHQPRFPKGEQELEISESASLRTRIPLDRALDPDTGPNTLHTYTLSPSEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VEIQVLDINDHQPRFPKGEQELEISESASLRTRIPLDRALDPDTGPNTLHTYTLSPSEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ALDVIVGPDETKHAELIVVKELDREIHSFFDLVLTAYDNGNPPKSGTSLVKVNVLDSNDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALDVIVGPDETKHAELIVVKELDREIHSFFDLVLTAYDNGNPPKSGTSLVKVNVLDSNDN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SPAFAESSLALEIQEDAAPGTLLIKLTATDPDQGPNGEVEFFLSKHMPPEVLDTFSIDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPAFAESSLALEIQEDAAPGTLLIKLTATDPDQGPNGEVEFFLSKHMPPEVLDTFSIDAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TGQVILRRPLDYEKNPAYEVDVQARDLGPNPIPAHCKVLIKVLDVNDNIPSIHVTWASQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TGQVILRRPLDYEKNPAYEVDVQARDLGPNPIPAHCKVLIKVLDVNDNIPSIHVTWASQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SLVSEALPKDSFIALVMADDLDSGHNGLVHCWLSQELGHFRLKRTNGNTYMLLTNATLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLVSEALPKDSFIALVMADDLDSGHNGLVHCWLSQELGHFRLKRTNGNTYMLLTNATLDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EQWPKYTLTLLAQDQGLQPLSAKKQLSIQISDINDNAPVFEKSRYEVSTRENNLPSLHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EQWPKYTLTLLAQDQGLQPLSAKKQLSIQISDINDNAPVFEKSRYEVSTRENNLPSLHLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TIKAHDADLGINGKVSYRIQDSPVAHLVAIDSNTGEVTAQRSLNYEEMAGFEFQVIAEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TIKAHDADLGINGKVSYRIQDSPVAHLVAIDSNTGEVTAQRSLNYEEMAGFEFQVIAEDS
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 GQPMLASSVSVWVSLLDANDNAPEVVQPVLSDGKASLSVLVNASTGHLLVPIETPNGLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GQPMLASSVSVWVSLLDANDNAPEVVQPVLSDGKASLSVLVNASTGHLLVPIETPNGLGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 AGTDTPPLATHSSRPFLLTTIVARDADSGANGEPLYSIRNGNEAHLFILNPHTGQLFVNV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS42 AGTDTPPLATHSSRPFLLTTIVARDADSGANGEPLYSIRSGNEAHLFILNPHTGQLFVNV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TNASSLIGSEWELEIVVEDQGSPPLQTRALLRVMFVTSVDHLRDSARKPGALSMSMLTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TNASSLIGSEWELEIVVEDQGSPPLQTRALLRVMFVTSVDHLRDSARKPGALSMSMLTVI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 CLAVLLGIFGLILALFMSICRTEKKDNRAYNCREAESTYRQQPKRPQKHIQKADIHLVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CLAVLLGIFGLILALFMSICRTEKKDNRAYNCREAESTYRQQPKRPQKHIQKADIHLVPV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LRGQAGEPCEVGQSHKDVDKEAMMEAGWDPCLQAPFHLTPTLYRTLRNQGNQGAPAESRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRGQAGEPCEVGQSHKDVDKEAMMEAGWDPCLQAPFHLTPTLYRTLRNQGNQGAPAESRE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 VLQDTVNLLFNHPRQRNASRENLNLPEPQPATGQPRSRPLKVAGSPTGRLAGDQGSEEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLQDTVNLLFNHPRQRNASRENLNLPEPQPATGQPRSRPLKVAGSPTGRLAGDQGSEEAP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 QRPPASSATLRRQRHLNGKVSPEKESGPRQILRSLVRLSVAAFAERNPVEELTVDSPPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QRPPASSATLRRQRHLNGKVSPEKESGPRQILRSLVRLSVAAFAERNPVEELTVDSPPVQ
910 920 930 940 950 960
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pF1KB3 QISQLLSLLHQGQFQPKPNHRGNKYLAKPGGSRSAIPDTDGPSARAGGQTDPEQEEGPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QISQLLSLLHQGQFQPKPNHRGNKYLAKPGGSRSAIPDTDGPSARAGGQTDPEQEEGPLD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 PEEDLSVKQLLEEELSSLLDPSTGLALDRLSAPDPAWMARLSLPLTTNYRDNVISPDAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEEDLSVKQLLEEELSSLLDPSTGLALDRLSAPDPAWMARLSLPLTTNYRDNVISPDAAA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB3 TEEPRTFQTFGKAEAPELSPTGTRLASTFVSEMSSLLEMLLEQRSSMPVEAASEALRRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TEEPRTFQTFGKAEAPELSPTGTRLASTFVSEMSSLLEMLLEQRSSMPVEAASEALRRLS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KB3 VCGRTLSLDLATSAASGMKVQGDPGGKTGTEGKSRGSSSSSRCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VCGRTLSLDLATSAASGMKVQGDPGGKTGTEGKSRGSSSSSRCL
1150 1160 1170 1180
>>CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134 aa)
initn: 1681 init1: 894 opt: 1521 Z-score: 1278.0 bits: 248.4 E(32554): 7.3e-65
Smith-Waterman score: 2083; 35.9% identity (61.2% similar) in 1152 aa overlap (18-1121:16-1015)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MMQLLQLLLGLLGPGGYLFLLGDCQEVTTLTVKYQVSEEVPSGTVIGKLSQELGREERR-
:.... ..: ..::.. :: :.::..::.... .
CCDS75 MHQMNAKMHFRFVFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 -RQAGAAFQVLQLPQALPIQVDSEEGLLSTGRRLDREQLCRQWDPCLVSFDV--LATGDL
. . :...: .. . :. ..: .: : .::::::.. : . ::: : : :
CCDS75 PNPSTVRFRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ALIHVEIQVLDINDHQPRFPKGEQELEISESASLRTRIPLDRALDPDTGPNTLHTYTLSP
:.:.:..::::::..:.: .. .::::::.. :::::: :.:::.: :.::::.::
CCDS75 QLFHIEVEVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SEHFALDVIVGPDETKHAELIVVKELDREIHSFFDLVLTAYDNGNPPKSGTSLVKVNVLD
.. : ..: . : .:.::::::.:::::..: ..: ::: : : : .::.:..:... :
CCDS75 NDFFNIEVRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASDMGVPQRSGSSILKISISD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 SNDNSPAFAESSLALEIQEDAAPGTLLIKLTATDPDQGPNGEVEFFLSKHMPPEVLDTFS
:::::::: ..: ... :.. ::::. :.:::::.: ::.. . .:.:. :....::.
CCDS75 SNDNSPAFEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKIVYSFSSHVSPKIMETFK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 IDAKTGQVILRRPLDYEKNPAYEVDVQARDLGPNPIPAHCKVLIKVLDVNDNIPSIHVTW
::.. :.. : . .::: . .::.::::.::::: ::::::..:::.::::: : :...
CCDS75 IDSERGHLTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKPEININL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 AS----QPSLVSEALPKDSFIALVMADDLDSGHNGLVHCWLSQELGHFRLKRTNGNTYML
: . : . :. : :.:.::: ..: ::: :: . : : . :::.:..: :.:..
CCDS75 MSPGKEEISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHGH-GHFKLQKTYENNYLI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LTNATLDREQWPKYTLTLLAQDQGLQPLSAKKQLSIQISDINDNAPVFEKSRYEVSTREN
:::::::::. .:.::..:.:.: ::. :....::.::::: : :..:::: ::
CCDS75 LTNATLDREKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDNPPHFQRSRYEFVISEN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB3 NLPSLHLITIKAHDADLGINGKVSYRIQDS-----PVAHLVAIDSNTGEVTAQRSLNYEE
: :. .. :. : : ::: ::.:.: : .: .. :.:: ..: . : : ...::
CCDS75 NSPGAYITTVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTIDPSNGAIYALRIFDHEE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 MAGFEFQVIAEDSGQP-MLASSVSVWVSLLDANDNAPEVVQPVLSDGKASLSVLVNASTG
.. . : : :.:.:.: .:.:...: ....: :::.: :. :.: .. : ...
CCDS75 VSQITFVVEARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPALRNNTAEITI-------
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 HLLVPIETPNGLGPAGTDTPPLATHSSRPFLLTTIVARDADSGANGEPLYSIRNGNEAHL
: :... : .: : : : :::.:.: .: ::: ..
CCDS75 -------------PKGAESG---------FHVTRIRAIDRDSGVNAELSCAIVAGNEENI
600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 FILNPHTGQLFVNVTNASSLIGSEWELEIVVEDQGSPPLQTRALLRVM---FVTSVDHLR
::..:.. .. .::. .:. .:::: ....:.:.: :.:..::. : .. ::
CCDS75 FIIDPRSCDIHTNVS-MDSVPYTEWELSVIIQDKGNPQLHTKVLLKCMIFEYAESVTSTA
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 DSARKPGALSMSMLTVICLAVLLGIFGLILALFMSICRTEKKDNRAYNCREAESTYRQQP
.. . ..:..::. .: :... ... .:..:: . : ::::.:.:::: :::::...:
CCDS75 MTSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLFATRCNREKKDTRSYNCRVAESTYQHHP
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 KRPQKHIQKADIHLVPVLRGQAGEPCEVGQSHKDVDKEAMMEAGWDPCLQAPFHLTPTLY
:::...:.:.:: :::.. : ::
CCDS75 KRPSRQIHKGDITLVPTING-------------------------------------TL-
750 760
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CCDS43 KKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVEN
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180 190 200 210 220 230
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10 20 30
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CCDS42 MEQAGTRPAATEHPRLRRPMPWLLLLPLLLLLL-----LLLPGP----AASQLRYSVPEE
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
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CCDS42 QAPGALVGNVARALGLELRRLGPGCLRINHLGAPSPRYLELDLTSGALFVNERIDREALC
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CCDS42 EQRPRCLLSLEVLAHNPVAVSAVEVEILDINDNSPRFPRPNYQLQVSESVAPGARFHIES
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160 170 180 190 200 210
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CCDS42 AQDPDVGANSVQTYELSPSEHFELDLKPLQENSKVLELVLRKGLDREQAALHHLVLTAVD
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280 290 300 310 320 330
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CCDS42 LFYHLAQTSDLDLFKVELHTGEIRTT-RKMGDESGSTFNLTVVVRDNGEPSLSASVAITV
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: :.. : :. :. : . : ... .: :... :: :. ...:: . .
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. : . :. . : . ..:. .. . . .: .: . ... .. : ..:
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:: : .. . : . : :. .. .. :. :: . .. . . :
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CCDS42 --AGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQI
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>>CCDS75349.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 (871 aa)
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CCDS75 LAASDPDSGLNALISYSLLEPRNRDVSASSFISLNPQTGAVHATRSFDYEQTQTLQFEVQ
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CCDS75 ARDRGNPPLSSTVTVRLFVLDLNDNAPAVLRPRARPGS--------------LCPQALPP
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pF1KB3 GLGPAGTDTPPLATHSSRPFLLTTIVARDADSGANGEPLYSIRNGNEAHLFILNPHTGQL
..: :: : :.: ..: : ::: :. :.. .. . :: .. ..:..
CCDS75 SVG-AG--------H-----LITKVTAVDLDSGYNAWVSYQLLEAPDPSLFAVSRYAGEV
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. : ..: .: :::.:.:::::.: . : : . . : ::.: : . :
CCDS75 RTAVPIPADL--PPQKLVIVVKDSGSPPLSTSVTLLVSLEEDTHPVVPDLRESSAPREGE
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CCDS75 SRLTLYLAVSLVAICFVSFGSFVAL-LSKCLRGAACGVTCFPAGTCACLTRSRRREGLPP
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>>CCDS4262.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 (938 aa)
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pF1KB3 MQLLQLLLGLLGPGGYLFLLGDCQEVTTLTVKYQVSEEVPSGTVIGKLSQELGREERRRQ
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CCDS42 MLRKVRSWTEIWRWATLLFLFYHLGYVCGQIRYPVPEESQEGTFVGNVAQDFLLDTDSLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 AGAAFQVLQLPQALPIQVDSEEGLLSTGRRLDREQLCRQWDPCLVSFDVLATGDLALIHV
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CCDS42 A-RRLQVAGEVNQRHFRVDLDSGALLIKNPIDREALCGLSASCIVPLEFVTEGPLEMYRA
70 80 90 100 110
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pF1KB3 EIQVLDINDHQPRFPKGEQELEISESASLRTRIPLDRALDPDTGPNTLHTYTLSPSEHFA
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CCDS42 EVEIVDVNDHAPRFPRQQLDLEIGEAAPPGQRFPLEKAQDADVGSNSISSYRLSSNEHFA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LDVIVGPDETKHAELIVVKELDREIHSFFDLVLTAYDNGNPPKSGTSLVKVNVLDSNDNS
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CCDS42 LDVKKRSDGSLVPELLLEKPLDREKQSDYRLVLTAVDGGNPPRSGTAELRVSVLDVNDNA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PAFAESSLALEIQEDAAPGTLLIKLTATDPDQGPNGEVEFFLSKHMPPEVLDTFSIDAKT
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CCDS42 PAFQQSSYRISVLESAPAGMVLIQLNASDPDLGPSGNVTFYFSGHTPDRVRNLFSLHPTT
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 GQVILRRPLDYEKNPAYEVDVQARDLGPNPIPAHCKVLIKVLDVNDNIPSIHVTWASQPS
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CCDS42 GKLTLLGPLDFESENYYEFDVRARDGGSPAMEQHCSLRVDLLDVNDNAPYITVT--SELG
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pF1KB3 LVSEALPKDSFIALVMADDLDSGHNGLVHCWLSQELGHFRLKRTNGNTYMLLTNATLDRE
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CCDS42 TLPESAEPGTVVALISVQDPDSGSNGDVSLRIPDHLP-FALKSAFRNQFSLVTAGPLDRE
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CCDS42 AKSSYDIMVTASDAGNPPLSTHRTIFLNISDVNDNPPSFFQRSHEVFVPENNRPGDLLCS
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