Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3038
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3038, 1401 aa
1>>>pF1KB3038 1401 - 1401 aa - 1401 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5278+/-0.00104; mu= 4.2083+/- 0.062
mean_var=208.5889+/-41.668, 0's: 0 Z-trim(110.7): 45 B-trim: 3 in 1/52
Lambda= 0.088803
statistics sampled from 11796 (11829) to 11796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 5.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14265.1 KDM6A gene_id:7403|Hs108|chrX (1401) 9483 1228.7 0
CCDS59184.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1392) 8136 1056.2 0
CCDS76076.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1399) 7836 1017.7 0
CCDS76078.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1335) 7789 1011.7 0
CCDS76074.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1389) 7061 918.4 0
CCDS76077.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1367) 5982 780.2 0
CCDS76073.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1264) 5392 704.6 4.5e-202
CCDS14783.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1347) 5392 704.6 4.8e-202
CCDS76079.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1444) 5388 704.1 7.2e-202
CCDS14784.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1240) 4786 627.0 1.1e-178
CCDS76075.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1363) 4667 611.7 4.4e-174
CCDS59185.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1211) 4125 542.3 3.2e-153
CCDS14785.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1079) 2504 334.6 9.5e-91
CCDS32552.1 KDM6B gene_id:23135|Hs108|chr17 (1682) 2367 317.1 2.7e-85
>>CCDS14265.1 KDM6A gene_id:7403|Hs108|chrX (1401 aa)
initn: 9483 init1: 9483 opt: 9483 Z-score: 6573.2 bits: 1228.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9483; 100.0% identity (100.0% similar) in 1401 aa overlap (1-1401:1-1401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RFHEDGARTKALLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYPKALSAYQRYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RFHEDGARTKALLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYPKALSAYQRYY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SLQSDYWKNAAFLYGLGLVYFHYNAFQWAIKAFQEVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLQSDYWKNAAFLYGLGLVYFHYNAFQWAIKAFQEVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TDYESSLKHFQLALVDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TDYESSLKHFQLALVDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLSAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VKATVLQQLGWMHHTVDLLGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKATVLQQLGWMHHTVDLLGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LYESCNQPQDAIKCYLNATRSKSCSNTSALAARIKYLQAQLCNLPQGSLQNKTKLLPSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LYESCNQPQDAIKCYLNATRSKSCSNTSALAARIKYLQAQLCNLPQGSLQNKTKLLPSIE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQNTSDNWSGGHAVSHPPVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQNTSDNWSGGHAVSHPPVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RANRNNLNPAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RANRNNLNPAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 QQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SGSNGNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGSNGNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSVTQGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSVTQGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SGNILTVPETSRHTGETPNSTASVEGLPNHVHQMTADAVCSPSHGDSKSPGLLSSDNPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGNILTVPETSRHTGETPNSTASVEGLPNHVHQMTADAVCSPSHGDSKSPGLLSSDNPQL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SALLMGKANNNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDNSVASSPSSAISTATPSPKSTEQTTTNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SALLMGKANNNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDNSVASSPSSAISTATPSPKSTEQTTTNS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 VTSLNSPHSGLHTINGEGMEESQSPMKTDLLLVNHKPSPQIIPSMSVSIYPSSAEVLKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTSLNSPHSGLHTINGEGMEESQSPMKTDLLLVNHKPSPQIIPSMSVSIYPSSAEVLKAC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 RNLGKNGLSNSSILLDKCPPPRPPSSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RNLGKNGLSNSSILLDKCPPPRPPSSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 TNPNNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNPNNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 WHCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WHCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TIKFGTNIDLSDDKKWKLQLHELTKLPAFVRVVSAGNLLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TIKFGTNIDLSDDKKWKLQLHELTKLPAFVRVVSAGNLLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEGYWGVLNDFCEKNNLNFLMGSWWPNLEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEGYWGVLNDFCEKNNLNFLMGSWWPNLEDL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400
pF1KB3 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
:::::::::::::::::::::
CCDS14 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
1390 1400
>>CCDS59184.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1392 aa)
initn: 6742 init1: 3937 opt: 8136 Z-score: 5640.6 bits: 1056.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8136; 86.4% identity (94.3% similar) in 1400 aa overlap (1-1400:1-1392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
::::.:::.::: .::::: :::: :::: :::: : :::.::::::::.::::::::
CCDS59 MKSCAVSLTTAA---VAFGDEAKKMAEGKASRESEEESVSLTVEEREALGGMDSRLFGFV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RFHEDGARTKALLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYPKALSAYQRYY
:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS59 RLHEDGARTKTLLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYSKALSAYQRYY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SLQSDYWKNAAFLYGLGLVYFHYNAFQWAIKAFQEVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
:::.:::::::::::::::::.::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SLQADYWKNAAFLYGLGLVYFYYNAFHWAIKAFQDVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TDYESSLKHFQLALVDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLSAQ
:::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS59 TDYKSSLKHFQLALIDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLPAQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VKATVLQQLGWMHHTVDLLGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
::::::::::::::..::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VKATVLQQLGWMHHNMDLVGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LYESCNQPQDAIKCYLNATRSKSCSNTSALAARIKYLQAQLCNLPQGSLQNKTKLLPSIE
::::::::::::::::::.::: :::::.::::::.::::::::::.:::::::::::::
CCDS59 LYESCNQPQDAIKCYLNAARSKRCSNTSTLAARIKFLQAQLCNLPQSSLQNKTKLLPSIE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQNTSDNWSGGHAVSHPPVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQL
:::::::::::::::::::::::: ::::.::...:: :::: ..: :::::::::::::
CCDS59 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQNGSDNWNGGQSLSHHPVQQ-VYSLCLTPQKLQHLEQL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 RANRNNLNPAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSG
::::.::::::: .:::::::::::: ::: :::::.::: :: .::::::::::.
CCDS59 RANRDNLNPAQKHQLEQLESQFVLMQ--QMRHKEVAQVRTTGIHNGAITDSSLPTNSVSN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 QQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITG
.::. ::::: ::::::::::: . :..: :::: .::.::. ::::::::.:.: :.:
CCDS59 RQPHGALTRVSSVSQPGVRPACVEKLLSSGAFSAGCIPCGTSKILGSTDTILLGSNCIAG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SGSNGNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPL
: :::::::::.:. :::::.:.:.::.::::..:::::.:::::.::: .::: :.::
CCDS59 SESNGNVPYLQQNTHTLPHNHTDLNSSTEEPWRKQLSNSAQGLHKSQSSCLSGPNEEQPL
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSVTQGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKP
::: .:. ::...::.. : : ::::::: :: : .::: ::::::::::: .::::::
CCDS59 FSTGSAQYHQATSTGIKKANEHLTLPSNSVPQGDADSHLSCHTATSGGQQGIMFTKESKP
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SGNILTVPETSRHTGETPNSTASVEGLPNHVHQMTADAVCSPSHGDSKSPGLLSSDNPQL
: : :::::::::.: :. :.:.:: :::::. :::: ::.:::: :.:: .:::::
CCDS59 SKNRSLVPETSRHTGDTSNGCADVKGLSNHVHQLIADAVSSPNHGDS--PNLLIADNPQL
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SALLMGKANNNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDNSVASSPSSAISTATPSPKSTEQTTTNS
::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: . ::
CCDS59 SALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINS
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 VTSLNSPHSGLHTINGEGMEESQSPMKTDLLLVNHKPSPQIIPSMSVSIYPSSAEVLKAC
:::::::::::::.::::. .::: :.:: :..:. . ::.::::::: :::.::::::
CCDS59 VTSLNSPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQILPSMSVSICPSSTEVLKAC
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 RNLGKNGLSNSSILLDKCPPPRPPSSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
:: :::::::: ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RNPGKNGLSNSCILLDKCPPPRPPTSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 TNPNNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TNPKNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 WHCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFK
:.::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.:::::.:::::::::::
CCDS59 WRCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRTQHKDHSDNESTSSENSGRRRKGPFK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TIKFGTNIDLSDDKKWKLQLHELTKLPAFVRVVSAGNLLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS59 TIKFGTNIDLSDNKKWKLQLHELTKLPAFARVVSAGNLLTHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEGYWGVLNDFCEKNNLNFLMGSWWPNLEDL
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS59 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEDYWGVLNDFCEKNNLNFLMSSWWPNLEDL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAVGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
:.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::. ::: :::::::.:::::.:::
CCDS59 LKSVKSPVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLKILKQYQTLREALVAAGKEVIWH
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
:::..::::::::::::::.:::::::::..:::::::.::::::: .::::::::::::
CCDS59 GRTNDEPAHYCSICEVEVFNLLFVTNESNTQKTYIVHCHDCARKTSKSLENFVVLEQYKM
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400
pF1KB3 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
:::.::::::::: : :.:
CCDS59 EDLIQVYDQFTLALSLSSSS
1380 1390
>>CCDS76076.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1399 aa)
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>>CCDS76078.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1335 aa)
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CCDS76 SALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINS
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CCDS76 VTSLNSPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQILPSMSVSICPSSTEVLKAC
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CCDS76 WRCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRTQHKDHSDNESTSSENSGRRRKGPFK
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CCDS76 TIKFGTNIDLSDNKKWKLQLHELTKLPAFARVVSAGNLLTHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
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CCDS76 SRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEDYWGVLNDFCEKNNLNFLMSSWWPNLEDL
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pF1KB3 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
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CCDS76 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAVGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
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pF1KB3 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
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CCDS76 LKSVKSPVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLKILKQYQTLREALVAAGKEVIWH
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pF1KB3 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
:::..::::::::::
CCDS76 GRTNDEPAHYCSICEALSLSSSS
1320 1330
>>CCDS76074.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1389 aa)
initn: 6647 init1: 3937 opt: 7061 Z-score: 4896.2 bits: 918.4 E(32554): 0
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pF1KB3 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
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CCDS76 MKSCAVSLTTAA---VAFGDEAKKMAEGKASRESEEESVSLTVEEREALGGMDSRLFGFV
10 20 30 40 50
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pF1KB3 RFHEDGARTKALLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYPKALSAYQRYY
:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS76 RLHEDGARTKTLLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYSKALSAYQRYY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SLQSDYWKNAAFLYGLGLVYFHYNAFQWAIKAFQEVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
:::.:::::::::::::::::.::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLQADYWKNAAFLYGLGLVYFYYNAFHWAIKAFQDVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 TDYESSLKHFQLALVDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLSAQ
:::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS76 TDYKSSLKHFQLALIDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLPAQ
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 VKATVLQQLGWMHHTVDLLGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
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CCDS76 VKATVLQQLGWMHHNMDLVGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLG---------
240 250 260 270 280
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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ------------------------SVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LYESCNQPQDAIKCYLNATRSKSCSNTSALAARIKYLQAQLCNLPQGSLQNKTKLLPSIE
::::::::::::::::::.::: :::::.::::::.::::::::::.:::::::::::::
CCDS76 LYESCNQPQDAIKCYLNAARSKRCSNTSTLAARIKFLQAQLCNLPQSSLQNKTKLLPSIE
330 340 350 360 370 380
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pF1KB3 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQ------------------------------NTSDNWS
::::::::::::::::::::::: : ::::.
CCDS76 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQQSLSLHMITSSQVEGLSSPAKKKRTSSPTKNGSDNWN
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::...:: :::: ..: :::::::::::::::::.::::::: .:::::::::::: ::
CCDS76 GGQSLSHHPVQQ-VYSLCLTPQKLQHLEQLRANRDNLNPAQKHQLEQLESQFVLMQ--QM
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pF1KB3 RPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSGQQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANG
: :::::.::: :: .::::::::::..::. ::::: ::::::::::: . :..:
CCDS76 RHKEVAQVRTTGIHNGAITDSSLPTNSVSNRQPHGALTRVSSVSQPGVRPACVEKLLSSG
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pF1KB3 PFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITGSGSNGNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEE
:::: .::.::. ::::::::.:.: :.:: :::::::::.:. :::::.:.:.::.::
CCDS76 AFSAGCIPCGTSKILGSTDTILLGSNCIAGSESNGNVPYLQQNTHTLPHNHTDLNSSTEE
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pF1KB3 PWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPLSSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSV
::..:::::.:::::.::: .::: :.:: ::: .:. ::...::.. : : :::::::
CCDS76 PWRKQLSNSAQGLHKSQSSCLSGPNEEQPLFSTGSAQYHQATSTGIKKANEHLTLPSNSV
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:: : .::: ::::::::::: .::::::: : :::::::::.: :. :.:.:: ::
CCDS76 PQGDADSHLSCHTATSGGQQGIMFTKESKPSKNRSLVPETSRHTGDTSNGCADVKGLSNH
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:::. :::: ::.:::: :.:: .:::::::::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS76 VHQLIADAVSSPNHGDS--PNLLIADNPQLSALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTK
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::.:::::::::::::::::::::: . :::::::::::::::.::::. .::: :.::
CCDS76 TDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINSVTSLNSPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDL
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:..:. . ::.::::::: :::.:::::::: :::::::: ::::::::::::.:::::
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CCDS76 LPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFCTNPKNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLV
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CCDS76 EANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKIWRCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREE
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pF1KB3 NEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFKTIKFGTNIDLSDDKKWKLQLHELTKLPAFV
::::..::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.
CCDS76 NEKRTQHKDHSDNESTSSENSGRRRKGPFKTIKFGTNIDLSDNKKWKLQLHELTKLPAFA
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CCDS76 RVVSAGNLLTHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFVVP
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CCDS76 EDYWGVLNDFCEKNNLNFLMSSWWPNLEDLYEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQA
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.::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS76 VGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNKLKSVKSPVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFE
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pF1KB3 MIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWHGRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNS
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CCDS76 MIKYCLLKILKQYQTLREALVAAGKEVIWHGRTNDEPAHYCSICEVEVFNLLFVTNESNT
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CCDS76 QKTYIVHCHDCARKTSKSLENFVVLEQYKMEDLIQVYDQFTLALSLSSSS
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::: .:. ::...::.. : : ::::::: :: : .::: ::::::::::: .::::::
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CCDS76 SKNRSLVPETSRHTGDTSNGCADVKGLSNHVHQLIADAVSSPNHGDS--PNLLIADNPQL
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CCDS76 SALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINS
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CCDS76 TNPKNPVTVIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKI
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CCDS76 WRCESNRSHTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRTQHKDHSDNESTSSE-----------
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CCDS76 YEANVPVYRFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAVGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNK
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pF1KB3 LQSVKSIVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLRTLKQCQTLREALIAAGKEIIWH
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CCDS76 LKSVKSPVPMVHLSWNMARNIKVSDPKLFEMIKYCLLKILKQYQTLREALVAAGKEVIWH
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:::..::::::::::::::.:::::::::..:::::::.::::::: .::::::::::::
CCDS76 GRTNDEPAHYCSICEVEVFNLLFVTNESNTQKTYIVHCHDCARKTSKSLENFVVLEQYKM
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pF1KB3 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
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CCDS76 EDLIQVYDQFTLALSLSSSS
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>>CCDS76073.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1264 aa)
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pF1KB3 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
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CCDS76 MKSCAVSLTTAA---VAFGDEAKKMAEGKASRESEEESVSLTVEEREALGGMDSRLFGFV
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pF1KB3 RFHEDGARTKALLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYPKALSAYQRYY
:.::::::::.::::
CCDS76 RLHEDGARTKTLLGK---------------------------------------------
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pF1KB3 SLQSDYWKNAAFLYGLGLVYFHYNAFQWAIKAFQEVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
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CCDS76 --------NAAFLYGLGLVYFYYNAFHWAIKAFQDVLYVDPSFCRAKEIHLRLGLMFKVN
80 90 100 110 120
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pF1KB3 TDYESSLKHFQLALVDCNPCTLSNAEIQFHIAHLYETQRKYHSAKEAYEQLLQTENLSAQ
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CCDS76 TDYKSSLK------------------------------RKYHSAKEAYEQLLQTENLPAQ
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pF1KB3 VKATVLQQLGWMHHTVDLLGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
::::::::::::::..::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VKATVLQQLGWMHHNMDLVGDKATKESYAIQYLQKSLEADPNSGQSWYFLGRCYSSIGKV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QDAFISYRQSIDKSEASADTWCSIGVLYQQQNQPMDALQAYICAVQLDHGHAAAWMDLGT
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 LYESCNQPQDAIKCYLNATRSKSCSNTSALAARIKYLQAQLCNLPQGSLQNKTKLLPSIE
::::::::::::::::::.::: :::::.::::::.::
CCDS76 LYESCNQPQDAIKCYLNAARSKRCSNTSTLAARIKFLQ----------------------
280 290 300 310
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pF1KB3 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQNTSDNWSGGHAVSHPPVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQL
: ::::.::...:: :::: ..: :::::::::::::
CCDS76 -----------------------NGSDNWNGGQSLSHHPVQQ-VYSLCLTPQKLQHLEQL
320 330 340
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pF1KB3 RANRNNLNPAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSG
::::.::::::: .:::::::::::: ::: :::::.::: :: .::::::::::.
CCDS76 RANRDNLNPAQKHQLEQLESQFVLMQ--QMRHKEVAQVRTTGIHNGAITDSSLPTNSVSN
350 360 370 380 390 400
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pF1KB3 QQPQLALTRVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITG
.::. ::::: ::::::::::: . :..: :::: .::.::. ::::::::.:.: :.:
CCDS76 RQPHGALTRVSSVSQPGVRPACVEKLLSSGAFSAGCIPCGTSKILGSTDTILLGSNCIAG
410 420 430 440 450 460
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pF1KB3 SGSNGNVPYLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPL
: :::::::::.:. :::::.:.:.::.::::..:::::.:::::.::: .::: :.::
CCDS76 SESNGNVPYLQQNTHTLPHNHTDLNSSTEEPWRKQLSNSAQGLHKSQSSCLSGPNEEQPL
470 480 490 500 510 520
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pF1KB3 SSTGPSQHLQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSVTQGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKP
::: .:. ::...::.. : : ::::::: :: : .::: ::::::::::: .::::::
CCDS76 FSTGSAQYHQATSTGIKKANEHLTLPSNSVPQGDADSHLSCHTATSGGQQGIMFTKESKP
530 540 550 560 570 580
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pF1KB3 SGNILTVPETSRHTGETPNSTASVEGLPNHVHQMTADAVCSPSHGDSKSPGLLSSDNPQL
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CCDS76 SKNRSLVPETSRHTGDTSNGCADVKGLSNHVHQLIADAVSSPNHGDS--PNLLIADNPQL
590 600 610 620 630 640
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CCDS76 SALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINS
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CCDS76 VTSLNSPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQILPSMSVSICPSSTEVLKAC
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CCDS76 TIKFGTNIDLSDNKKWKLQLHELTKLPAFARVVSAGNLLTHVGHTILGMNTVQLYMKVPG
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CCDS76 EDLIQVYDQFTLALSLSSSS
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::: .:. ::...::.. : : ::::::: :: : .::: ::::::::::: .::::::
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: : :::::::::.: :. :.:.:: :::::. :::: ::.:::: :.:: .:::::
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CCDS14 SALLIGKANGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINS
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:::::::::::::.::::. .::: :.:: :..:. . ::.::::::: :::.::::::
CCDS14 VTSLNSPHSGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQILPSMSVSICPSSTEVLKAC
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pF1KB3 RNLGKNGLSNSSILLDKCPPPRPPSSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
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CCDS14 RNPGKNGLSNSCILLDKCPPPRPPTSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFC
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pF1KB3 GRTKEEPAHYCSICEVEVFDLLFVTNESNSRKTYIVHCQDCARKTSGNLENFVVLEQYKM
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CCDS14 GRTNDEPAHYCSICEVEVFNLLFVTNESNTQKTYIVHCHDCARKTSKSLENFVVLEQYKM
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pF1KB3 EDLMQVYDQFTLAPPLPSASS
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CCDS14 EDLIQVYDQFTLALSLSSSS
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>>CCDS76079.1 UTY gene_id:7404|Hs108|chrY (1444 aa)
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pF1KB3 MKSCGVSLATAAAAAAAFGDEEKKMAAGKASGESEEASPSLTAEEREALGGLDSRLFGFV
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CCDS76 RLHEDGARTKTLLGKAVRCYESLILKAEGKVESDFFCQLGHFNLLLEDYSKALSAYQRYY
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CCDS76 LYESCNQPQDAIKCYLNAARSKRCSNTSTLAARIKFLQAQLCNLPQSSLQNKTKLLPSIE
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pF1KB3 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQ-------------------------------------
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CCDS76 EAWSLPIPAELTSRQGAMNTAQQAYRAHDPNTEHVLNHSQTPILQQSLSLHMITSSQVEG
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pF1KB3 ---------------NTSDNWSGGHAVSHPPVQQQAHSWCLTPQKLQHLEQLRANRNNLN
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CCDS76 LSSPAKKKRTSSPTKNGSDNWNGGQSLSHHPVQQ-VYSLCLTPQKLQHLEQLRANRDNLN
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pF1KB3 PAQKLMLEQLESQFVLMQQHQMRPTGVAQVRSTGIPNGPTADSSLPTNSVSGQQPQLALT
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CCDS76 PAQKHQLEQLESQFVLMQQ--MRHKEVAQVRTTGIHNGAITDSSLPTNSVSNRQPHGALT
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pF1KB3 RVPSVSQPGVRPACPGQPLANGPFSAGHVPCSTSRTLGSTDTILIGNNHITGSGSNGNVP
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CCDS76 RVSSVSQPGVRPACVEKLLSSGAFSAGCIPCGTSKILGSTDTILLGSNCIAGSESNGNVP
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pF1KB3 YLQRNALTLPHNRTNLTSSAEEPWKNQLSNSTQGLHKGQSSHSAGPNGERPLSSTGPSQH
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CCDS76 YLQQNTHTLPHNHTDLNSSTEEPWRKQLSNSAQGLHKSQSSCLSGPNEEQPLFSTGSAQY
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pF1KB3 LQAAGSGIQNQNGHPTLPSNSVTQGAALNHLSSHTATSGGQQGITLTKESKPSGNILTVP
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CCDS76 HQATSTGIKKANEHLTLPSNSVPQGDADSHLSCHTATSGGQQGIMFTKESKPSKNRSLVP
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pF1KB3 ETSRHTGETPNSTASVEGLPNHVHQMTADAVCSPSHGDSKSPGLLSSDNPQLSALLMGKA
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CCDS76 ETSRHTGDTSNGCADVKGLSNHVHQLIADAVSSPNHGDS--PNLLIADNPQLSALLIGKA
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pF1KB3 NNNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDNSVASSPSSAISTATPSPKSTEQTTTNSVTSLNSPH
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CCDS76 NGNVGTGTCDKVNNIHPAVHTKTDHSVASSPSSAISTATPSPKSTEQRSINSVTSLNSPH
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pF1KB3 SGLHTINGEGMEESQSPMKTDLLLVNHKPSPQIIPSMSVSIYPSSAEVLKACRNLGKNGL
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CCDS76 SGLHTVNGEGLGKSQSSTKVDLPLASHRSTSQILPSMSVSICPSSTEVLKACRNPGKNGL
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CCDS76 SNSCILLDKCPPPRPPTSPYPPLPKDKLNPPTPSIYLENKRDAFFPPLHQFCTNPKNPVT
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CCDS76 VIRGLAGALKLDLGLFSTKTLVEANNEHMVEVRTQLLQPADENWDPTGTKKIWRCESNRS
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pF1KB3 HTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRSHHKDHSDSESTSSDNSGRRRKGPFKTIKFGTNI
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CCDS76 HTTIAKYAQYQASSFQESLREENEKRTQHKDHSDNESTSSENSGRRRKGPFKTIKFGTNI
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KB3 DLSDDKKWKLQLHELTKLPAFVRVVSAGNLLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQE
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CCDS76 DLSDNKKWKLQLHELTKLPAFARVVSAGNLLTHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQE
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pF1KB3 NNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEGYWGVLNDFCEKNNLNFLMGSWWPNLEDLYEANVPVY
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS76 NNNFCSVNINIGPGDCEWFVVPEDYWGVLNDFCEKNNLNFLMSSWWPNLEDLYEANVPVY
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pF1KB3 RFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAIGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNKLQSVKSIV
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CCDS76 RFIQRPGDLVWINAGTVHWVQAVGWCNNIAWNVGPLTACQYKLAVERYEWNKLKSVKSPV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]