Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3043
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3043, 1152 aa
1>>>pF1KB3043 1152 - 1152 aa - 1152 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2700+/-0.00112; mu= 16.5034+/- 0.067
mean_var=73.9876+/-14.958, 0's: 0 Z-trim(102.4): 70 B-trim: 38 in 1/49
Lambda= 0.149106
statistics sampled from 6851 (6921) to 6851 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 7598 1644.8 0
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 7586 1642.2 0
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 4569 993.2 0
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 4569 993.2 0
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 4479 973.8 0
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 1682 372.2 4e-102
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 1569 347.9 7.8e-95
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 1339 298.4 6.6e-80
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188) 1045 235.1 7.3e-61
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 907 205.5 6.3e-52
CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1024) 860 195.3 6.1e-49
CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167) 860 195.3 6.8e-49
CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs108|chr5 (1179) 716 164.4 1.5e-39
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 689 158.6 7.2e-38
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 684 157.5 1.5e-37
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 591 137.5 1.6e-31
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 591 137.5 1.6e-31
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 591 137.5 1.6e-31
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 551 128.9 6.4e-29
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 549 128.4 8.6e-29
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 526 123.5 2.6e-27
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 468 111.0 1.6e-23
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 453 107.8 1.4e-22
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 453 107.8 1.5e-22
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 451 107.4 1.9e-22
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 ( 954) 428 102.4 5.3e-21
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1073) 410 98.5 8.7e-20
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1091) 410 98.5 8.9e-20
CCDS336.1 MATN1 gene_id:4146|Hs108|chr1 ( 496) 319 78.9 3.3e-14
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 296 74.0 1.8e-12
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 296 74.0 1.9e-12
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 296 74.0 1.9e-12
CCDS13348.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 581) 291 72.9 2.5e-12
CCDS43481.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (1899) 296 74.1 3.6e-12
CCDS46607.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 540) 278 70.1 1.6e-11
CCDS43482.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (3063) 277 70.0 9.5e-11
>>CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152 aa)
initn: 7598 init1: 7598 opt: 7598 Z-score: 8824.7 bits: 1644.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7598; 100.0% identity (100.0% similar) in 1152 aa overlap (1-1152:1-1152)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLPN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 CIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 RSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKAN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 VTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 GQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPVV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 NCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 LLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKDM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KB3 MSEGGPPGAEPQ
::::::::::::
CCDS45 MSEGGPPGAEPQ
1150
>>CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153 aa)
initn: 4314 init1: 4314 opt: 7586 Z-score: 8810.8 bits: 1642.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7586; 99.9% identity (99.9% similar) in 1153 aa overlap (1-1152:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
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600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 NVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSN
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPV
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 VNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 TLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150
pF1KB3 MMSEGGPPGAEPQ
:::::::::::::
CCDS54 MMSEGGPPGAEPQ
1150
>>CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163 aa)
initn: 4537 init1: 2937 opt: 4569 Z-score: 5303.2 bits: 993.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4569; 61.5% identity (81.7% similar) in 1140 aa overlap (5-1143:8-1143)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAA
.::.:::. :::::::. .:. .. :::.:::: .: :::::::.:.::
CCDS10 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
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60 70 80 90 100 110
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CCDS45 IGTLELVGEIEAS-SMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQVVMKVDVVYEKQMLY
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CCDS45 LYVLSGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAGD
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CCDS45 PGCLKPLHEKDSESGGGKD
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CCDS32 VNTARQRRALEKEEEEDKEEEEDEEEEEAGTEIAIILDGSGSIDPPDFQRAKDFISNMMR
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pF1KB3 QL--KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVR
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CCDS32 NFYEKCFECNFALVQYGGVIQTEFDLRDSQDVMASLARVQNITQVGSVTKTASAMQHVLD
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240 250 260 270 280 290
pF1KB3 ELFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKS
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CCDS32 SIFTSSHGSRRKASKVMVVLTDGGIFEDPLNLTTVINSPKMQGVERFAIGVGEEFKSART
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CCDS32 ARELNLIASDPDETHAFKVTNYMALDGLLSKLRYNIISMEGT-VGDA--LHYQLAQIGFS
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CCDS32 AQILDERQVLLGAVGAFDWSGGALLYDTRSRRGRFLNQTAAAAADAEAAQYSYLGYAVAV
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CCDS32 LHKTCSLSYIAGAPRYKHHG--AVFELQKEGREASFLPVLEGEQMGSYFGSELCPVDIDM
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pF1KB3 NGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLG
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CCDS32 DGSTDFLLVAAPFYHVHGEEGRVYVYRLSEQDGSFSLARILSGHPGFTNARFGFAMAAMG
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:. ::.:..... : . : ...... : .: :. . : .....
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. . .: :: : : .:. : :: : ......: :: . . .:.: . ..
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. .:.:: : : .: .:... . .: . :::: .:....... :.::::: :..
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.. .: .:. ... :. : . :.. . :...: .: :.::.. ..: .
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....... .: . :. .:: :. : . .. : ... :... .. :
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CCDS32 LVLIVILVILFKCGFFKRKYQQLNLESIRKAQLKSENLLEEEN
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CCDS39 VATSQTSQYGGDLTNTFGAIQYARKYAYSAASGGRRSATKVMVVVTDGESH-DGSMLKAV
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CCDS39 IADVAIEASFTPEKIT--LVNKNAQII-------LKLCF----SAKFRPTKQNNQVAIVY
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pF1KB3 DLALD----SGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTC--ETLKLQLPNCIEDPVSPIV
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CCDS39 NITLDADGFSSRVTSRGLFKENNERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIYIQEPS---DVVNSLD
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CCDS39 LRVDISLENPGTS------PALEAYSETAKVFSIPFHKDCGEDGLCISDLVLDVRQIPAA
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CCDS39 QEQPFIVSNQNKRLTFSVTLKNKRESAYNTGIVVDFSENLFFASFS-LPVDGTE----VT
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CCDS39 EENKADNLVNLKIPLLYDAEIHLT-RSTNINFYEISSDGNVPSIV-HSFE--DVGPKFIF
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CCDS39 SSSVSFKSENFRHTKELNCRTASCSNVTCWLKDVHMKGEYFVNVTTRIWNGTFASSTFQT
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CCDS39 VQLTAAAEINTYNPEIY-VIEDNTVTIPLMIMKPDEKAEVPTGV--IIGSIIAGILLLLA
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CCDS39 LVAILWKLGFFKRKYEKMTKNPDEIDETTELSS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]