Result of FASTA (omim) for
pF1KB3043
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3043, 1152 aa
1>>>pF1KB3043 1152 - 1152 aa - 1152 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4600+/-0.000446; mu= 21.4756+/- 0.028
mean_var=78.0621+/-16.319, 0's: 0 Z-trim(109.0): 189 B-trim: 103 in 1/52
Lambda= 0.145162
statistics sampled from 16969 (17175) to 16969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 14.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 7598 1602.1 0
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 7586 1599.6 0
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 7073 1492.2 0
XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917) 5946 1256.1 0
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 4569 967.8 0
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 4569 967.8 0
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 4479 948.9 0
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 4467 946.4 0
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 4467 946.4 0
XP_006721108 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 613) 4057 860.4 0
XP_011544153 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 622) 4057 860.4 0
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 3770 800.5 0
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 3319 705.9 2.5e-202
XP_011544156 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 614) 2688 573.7 1.2e-162
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 2407 515.0 1.1e-144
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 2086 447.8 1.8e-124
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 1941 417.4 2.5e-115
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 1682 363.2 5.4e-99
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 1624 351.0 2.4e-95
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 1570 339.7 5.8e-92
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 1569 339.5 6.8e-92
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 1535 332.4 1e-89
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 1533 331.9 1.2e-89
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 1533 332.0 1.4e-89
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 1525 330.3 4e-89
XP_011544150 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 690) 1431 310.5 2.4e-83
XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790) 1431 310.5 2.6e-83
XP_011544147 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 813) 1431 310.5 2.7e-83
XP_011544146 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 998) 1431 310.6 3.2e-83
XP_011544149 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 778) 1415 307.1 2.7e-82
XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103) 1415 307.3 3.5e-82
XP_011522130 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1137) 1345 292.6 9.3e-78
XP_011522129 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1163) 1345 292.6 9.4e-78
NP_002199 (OMIM: 604682) integrin alpha-E precurso (1179) 1339 291.4 2.3e-77
XP_011522127 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1185) 1339 291.4 2.3e-77
XP_016880075 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1191) 1339 291.4 2.3e-77
XP_011522125 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1217) 1339 291.4 2.3e-77
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180) 1282 279.4 8.9e-74
XP_016880076 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al ( 848) 1208 263.8 3.2e-69
NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188) 1045 229.8 7.9e-59
XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086) 1038 228.3 2e-58
XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119) 933 206.3 8.6e-52
NP_002194 (OMIM: 192974,614200) integrin alpha-2 p (1181) 907 200.9 3.9e-50
XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002) 860 191.0 3.2e-47
NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024) 860 191.0 3.2e-47
NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036) 860 191.0 3.2e-47
XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100) 860 191.0 3.4e-47
XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105) 860 191.0 3.4e-47
XP_016858113 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 860 191.0 3.5e-47
XP_016858114 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 860 191.0 3.5e-47
>>NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M isofo (1152 aa)
initn: 7598 init1: 7598 opt: 7598 Z-score: 8594.2 bits: 1602.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7598; 100.0% identity (100.0% similar) in 1152 aa overlap (1-1152:1-1152)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLPN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 CIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 RSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKAN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 VTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENTSRVMQHQYQVSNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 GQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPVV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 NCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 LLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKDM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KB3 MSEGGPPGAEPQ
::::::::::::
NP_000 MSEGGPPGAEPQ
1150
>>NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M is (1153 aa)
initn: 4314 init1: 4314 opt: 7586 Z-score: 8580.7 bits: 1599.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7586; 99.9% identity (99.9% similar) in 1153 aa overlap (1-1152:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYKD
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NP_001 MMSEGGPPGAEPQ
1150
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: :: . ::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 LLALITAALYKLGFFKRQYKDMMSEGGPPGAEPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
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:: :.:::: ::::.:::: :::: ::::::::::::.:::: ::::::::::. :..:
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:. :::::.: . : :..: . . ::....::.::::::::: ..: : .:: .:.
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:... .: :::::.:..:. ::::.::. . :: ::. . :: : :.:::.:..::..
NP_000 SQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHR
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::. . :::..: :::.:::::.: :: : :.:::: :: :.:::.:::: ::....:
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.::: ::::: ..:.:.:..:.::: :::::.:::::::::.: :::::: ::.::::::
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..: .::.:..:::. :.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . ::
NP_000 VFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQ
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pF1KB3 SLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLI
::::::::::: : ...: : . .:. .:.: :::::.:::::::::::::.::::::::
NP_000 SLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLI
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:::::::::::::::::::::: :: ::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_000 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTD
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pF1KB3 VAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDG
:.:::::::.::::::::::. : .::::::::::::.:: :::::::.::::::::.::
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pF1KB3 LVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHV
::::.:::.:.:::::..::: : . :.: : :. :..::: .:::. . . .::..
NP_000 LVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYI
600 610 620 630 640 650
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pF1KB3 QKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQ
.: ... : ..:: :: ::::: :: ::.:.:::: . ...:::: ::...:
NP_000 DKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLL
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 LPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQ
::.:.:: :.::.:::::.::: :: :: ::::.:: :::: ::: .::::::: :.:::
NP_000 LPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQ
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pF1KB3 DDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQ
:.:.:.::: .: :.::. :.:. : : ::::::: : .:: : :::: :. :.:
NP_000 DNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQ
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pF1KB3 RSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLL
. :: .:.:.:: : . :::: ::: :: ....:: ::::. :: ::..:::
NP_000 GQLRSLHLTCDSAPVG--SQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLL
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pF1KB3 KANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENT-SRVMQHQYQ
:::.:::: :::.:: :::::::::::: ::.:: ::::::. ::. :.: .:.::
NP_000 TANVSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQ
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XP_006 LTVGAQGHVLLLR
610
1152 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:13:18 2016 done: Thu Nov 3 12:13:20 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]