FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3060, 626 aa 1>>>pF1KB3060 626 - 626 aa - 626 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3322+/-0.000983; mu= 19.4372+/- 0.059 mean_var=70.7211+/-13.952, 0's: 0 Z-trim(105.3): 24 B-trim: 45 in 1/45 Lambda= 0.152511 statistics sampled from 8355 (8369) to 8355 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16 Scan time: 3.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7 ( 626) 4143 921.1 0 CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7 ( 595) 1405 318.7 1.4e-86 CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 ( 641) 1310 297.8 3e-80 CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 525) 1185 270.2 4.8e-72 CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 551) 1185 270.2 5e-72 CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 568) 1185 270.2 5.1e-72 CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 ( 592) 1126 257.3 4.3e-68 CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 555) 1055 241.6 2.1e-63 CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 602) 1055 241.7 2.2e-63 CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 552) 849 196.3 9e-50 CCDS54469.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 520) 654 153.4 7.1e-37 CCDS45593.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 522) 550 130.5 5.5e-30 >>CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7 (626 aa) initn: 4143 init1: 4143 opt: 4143 Z-score: 4923.2 bits: 921.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4143; 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CCDS57 AWLTLGFMSSTAFLSMWLSNTSTAAMVMPIAEAVVQQIINAEAE---------VEATQMT 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 LDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKP ... .::. .:: ......: :.:. :. :: . . . CCDS57 YFNGSTNHGLEI----DES-------VNGHEINERKEKTKPVPGYNNDTGKISSKVELE- 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 QVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQ ... . :::... .. : : :.::.:::::::: ::::.::: :.::.. CCDS57 -------KNSGMRTKYRTKKGHVTRKLTCLCIAYSSTIGGLTTITGTSTNLIFAEYFNTR 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 YPAAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEK :: . .:::.:: :::: .::.:..::.:..::::: :::: . .: : .... .: CCDS57 YPDCRCLNFGSWFTFSFPAALIILLLSWIWLQWLFLGFNFKEMFKCGKTKTVQQKACAEV 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KB3 RIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFF-EKKGYRTDATVSVF :..::.::: : : :.:: .::.:..:::.:.:::::::...: : :. ::.::... CCDS57 -IKQEYQKLGPIRYQEIVTLVLFIIMALLWFSRDPGFVPGWSALFSEYPGFATDSTVALL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 LGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASG .:.:.:::::: :. .. .. :.::::.::. :::.:.::::::.:::.: CCDS57 IGLLFFLIPAKTLT---KTTPTGEIVAFDYSPLITWKEFQSFMPWDIAILVGGGFALADG 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 SKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETL . :::: ::::.. :.::: : . :.. ..:. .:: .:::::::.::::: :.:.. CCDS57 CEESGLSKWIGNKLSPLGSLPAWLIILISSLMVTSLTEVASNPATITLFLPILSPLAEAI 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 HINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVA :.:::: ::: :.: ::: .:::.:::::::::::: .. ::::::::::..:...::.. CCDS57 HVNPLYILIPSTLCTSFAFLLPVANPPNAIVFSYGHLKVIDMVKAGLGVNIVGVAVVMLG 510 520 530 540 550 560 600 610 620 pF1KB3 INTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA : :: : .: : :::.:: CCDS57 ICTWIVPMFDLYTYPSWAPAMSNETMP 570 580 590 >>CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 (641 aa) initn: 1273 init1: 619 opt: 1310 Z-score: 1554.2 bits: 297.8 E(32554): 3e-80 Smith-Waterman score: 1507; 38.5% identity (68.0% similar) in 676 aa overlap (5-625:6-628) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA :.: :. :.: ::.::::::.: ::.:: :::..:. :..: .::.::...: CCDS54 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA 10 20 30 40 50 60 60 70 pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNE------------------------------------------- : : .:.:..:.. ..: CCDS54 LFPLILFPMMGIVDASEIIQRPFPSSFESPGECQSVGMSVTASHNLGGTVGDSRVFPPLS 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 ------VAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCC ::.::.:...::. : . :: :::.::::::::::..:..:..:. :.: :: CCDS54 HVSTCQVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGFMLV 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KB3 TTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSL :..::::.:::.:.::..::..:::..: :.. ..::.::. ...:.. CCDS54 TAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQ------ASSNVEEG--------SNNPTF 190 200 210 220 200 210 220 230 240 pF1KB3 ELIFVNEES-NADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKPQVLTRSPRK :: .: : . ..: : ... : :. .:.. .:. : ::. CCDS54 EL---QEPSPQKEVTKLDNGQAL--------PVTSASS-EGRA-HLSQK----------- 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 QKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYPA-AEVVN : .. .:.:: . :::.:::..:. ::. .:.. ..:. .: ..::: CCDS54 ----------HLHLT-QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVN 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 FGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYEK :..:: :.:: .:.:...:.:.. :::: ::... ....: . ...: . :: :.. CCDS54 FASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGIGEKMQ-EQQQAAYCVIQTEHRL 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 LGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDS--FFEKKGYR--TDATVSVFLGFLL :: ... : . ...:.....::::::::: :: . : . :: .:.::..:.:... CCDS54 LGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIM 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 FLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSSG :.::.: : : .: :: . . .. :: .. :::.::.:.:::::::.::. :: CCDS54 FIIPSKFP--GLTQDPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSG 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 LSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINPL :: :.::.. :.:.: :.... .::. :: .:: :: ::::::: :..... ..:: CCDS54 LSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 YTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTWG :...: :. :.: ::::..::::::::.: .. ::..::. .:.::..:. .:::.:: CCDS54 YVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWG 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB3 VSLFHLDTYPAWARVSNITDQA . :: : ..:.::. :: : : CCDS54 IPLFSLHSFPSWAQ-SNTTAQCLPSLANTTTPSP 610 620 630 640 >>CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (525 aa) initn: 1295 init1: 655 opt: 1185 Z-score: 1406.9 bits: 270.2 E(32554): 4.8e-72 Smith-Waterman score: 1435; 40.1% identity (69.6% similar) in 589 aa overlap (42-622:1-523) 20 30 40 50 60 70 pF1KB3 KLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAALVPAFLYPFFGV ...:. .::. . ..: .: :. . CCDS67 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLV-I 10 20 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 LRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCCT : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .::::. :.: :: : CCDS67 LMPAKVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAKPARLMLGFMGVT 30 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 190 pF1KB3 TLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSLE .:::::.:::.::::..:::::.:: :. : .. :: . :: CCDS67 ALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG-------------LE 90 100 110 120 200 210 220 230 240 250 pF1KB3 LIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQEKPQVLTRSPRKQ :. .:: :. :.. ::. ..: CCDS67 LV----------------------------------DKGKAKELPGS---QVIFEGPTLG 130 140 150 260 270 280 290 300 pF1KB3 KLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYP-AAEVVNF . . . :.. .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..:. .: . ..::: CCDS67 QQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNF 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 GTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYE ..:: :.:: :.::. .:.:...... :::.. :.: .::. :. . : .::::. CCDS67 ASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---EKAALKVLQEEYR 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 KLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRTDATVSVFLGFLL ::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: . .: : .::::..:.. :: CCDS67 KLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLL 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 FLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSS :..:..:: :. ... :..... . :.. :: :. .:: ::.:.:::.:::.::..: CCDS67 FIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEAS 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 GLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINP :::.:.:.:: : ..:: :.::. .::.. :: .:: :: :.::::. :.:... .:: CCDS67 GLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIGLNP 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 LYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTW :: ..: :. ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.::. :..:.::: CCDS67 LYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTW 450 460 470 480 490 500 610 620 pF1KB3 GVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA : ..: :: .: :: :..: CCDS67 GRAIFDLDHFPDWANVTHIET 510 520 >>CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (551 aa) initn: 1425 init1: 655 opt: 1185 Z-score: 1406.6 bits: 270.2 E(32554): 5e-72 Smith-Waterman score: 1517; 39.4% identity (69.5% similar) in 622 aa overlap (9-622:10-549) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA . ...... .::::::: .: :.. . ::::.:. :.:: .:..::.... CCDS67 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK :.:..:.:.: .: : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .::: CCDS67 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI :. ::.::::..:::::.:: :. : .. :: . CCDS67 PA-----------------RNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG--- 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQE :::. .:: :. :.. CCDS67 ----------LELV----------------------------------DKGKAKELPGS- 160 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN ::. ..: . . . :.. .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..: CCDS67 --QVIFEGPTLGQQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 NQYP-AAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKRE . .: . ..:::..:: :.:: :.::. .:.:...... :::.. :.: .::. : CCDS67 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---E 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRT . . : .::::.::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: . .: : . CCDS67 KAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVS 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 DATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVG ::::..:.. :::..:..:: :. ... :..... . :.. :: :. .:: ::.:.: CCDS67 DATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLG 340 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 GGYALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPI ::.:::.::..::::.:.:.:: : ..:: :.::. .::.. :: .:: :: :.:::: CCDS67 GGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPI 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 LCSLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVI . :.:... .:::: ..: :. ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.: CCDS67 FASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNII 460 470 480 490 500 510 600 610 620 pF1KB3 GLVIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA :. :..:.:::: ..: :: .: :: :..: CCDS67 GVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET 520 530 540 550 >>CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (568 aa) initn: 1524 init1: 655 opt: 1185 Z-score: 1406.4 bits: 270.2 E(32554): 5.1e-72 Smith-Waterman score: 1630; 41.2% identity (71.7% similar) in 622 aa overlap (9-622:10-566) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA . ...... .::::::: .: :.. . ::::.:. :.:: .:..::.... CCDS11 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK :.:..:.:.: .: : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .::: CCDS11 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI :. :.: :: :.:::::.:::.::::..:::::.:: :. : .. :: . CCDS11 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG--- 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQE :::. .:: :. :.. CCDS11 ----------LELV----------------------------------DKGKAKELPGS- 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN ::. ..: . . . :.. .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..: CCDS11 --QVIFEGPTLGQQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 NQYP-AAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKRE . .: . ..:::..:: :.:: :.::. .:.:...... :::.. :.: .::. : CCDS11 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---E 240 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRT . . : .::::.::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: . .: : . CCDS11 KAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVS 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 DATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVG ::::..:.. :::..:..:: :. ... :..... . :.. :: :. .:: ::.:.: CCDS11 DATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLG 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 GGYALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPI ::.:::.::..::::.:.:.:: : ..:: :.::. .::.. :: .:: :: :.:::: CCDS11 GGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPI 420 430 440 450 460 470 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 LCSLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVI . :.:... .:::: ..: :. ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.: CCDS11 FASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNII 480 490 500 510 520 530 600 610 620 pF1KB3 GLVIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA :. :..:.:::: ..: :: .: :: :..: CCDS11 GVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET 540 550 560 >>CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 (592 aa) initn: 1513 init1: 619 opt: 1126 Z-score: 1336.0 bits: 257.3 E(32554): 4.3e-68 Smith-Waterman score: 1615; 41.5% identity (73.4% similar) in 627 aa overlap (5-625:6-579) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA :.: :. :.: ::.::::::.: ::.:: :::..:. :..: .::.::...: CCDS11 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK : : .:.:..:.. ..:::.::.:...::. : . :: :::.::::::::::..:..:.. CCDS11 LFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI :. :.: :: :..::::.:::.:.::..::..:::..: :.. ..::.::. CCDS11 PAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQ------ASSNVEEG--- 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEES-NADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQE ...:..:: .: : . ..: : ... : :. .:.. .:. : ::. CCDS11 -----SNNPTFEL---QEPSPQKEVTKLDNGQAL--------PVTSASS-EGRA-HLSQK 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN : .. .:.:: . :::.:::..:. ::. .:.. ..: CCDS11 ---------------------HLHLT-QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQIN 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 NQYPA-AEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQL . .: ..::::..:: :.:: .:.:...:.:.. :::: ::... ....: . ...: CCDS11 SLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGIGEKMQ-EQQQA 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 SEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDS--FFEKKGYR--TD . :: :.. :: ... : . ...:.....::::::::: :: . : . :: .: CCDS11 AYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSD 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 ATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGG .::..:.:...:.::.: : : .: :: . . .. :: .. :::.::.:.::: CCDS11 GTVAIFIGIIMFIIPSKFP--GLTQDPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGG 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 YALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILC ::::.::. :::: :.::.. :.:.: :.... .::. :: .:: :: ::::::: CCDS11 YALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSNVATTTIFLPILA 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 SLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGL :..... ..:::...: :. :.: ::::..::::::::.: .. ::..::. .:.::. CCDS11 SMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGV 490 500 510 520 530 540 600 610 620 pF1KB3 VIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA .:. .:::.::. :: : ..:.::. :: : : CCDS11 LIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWAQ-SNTTAQCLPSLANTTTPSP 550 560 570 580 590 >>CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 (555 aa) initn: 1405 init1: 623 opt: 1055 Z-score: 1251.9 bits: 241.6 E(32554): 2.1e-63 Smith-Waterman score: 1427; 38.7% identity (72.6% similar) in 581 aa overlap (45-622:2-538) 20 30 40 50 60 70 pF1KB3 LVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAALVPAFLYPFFGVLRS :::: .::.::...::.: :.::.:.: : CCDS42 MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILPS 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 NEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCCTTLL :.: .:: .:..:... . .:.:.:.::::.::::......:..:. :.: .: :..: CCDS42 NKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSFL 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KB3 SMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSLELIF :::::::..:::..::..:.:. : . .. . ..:: : CCDS42 SMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVR--------------------KDPSQE--- 100 110 120 200 210 220 230 240 250 pF1KB3 VNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQ-EKPQVLTRSPRKQKLN .::..: . ::. .. . .. . ..: .::.. : : : . ::. CCDS42 -SEENTAAVRR-------NGLHTVPTEMQFLASTEAK-DHPGETEVPLDLPADSRKED-- 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KB3 RKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYPAAEVVNFGTWF .:: . : : . .:: :::.::: .:. ::. .::.: .... .: .:::::.:: CCDS42 -EYRRN----IWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWF 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KB3 LFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYEKLGDIS .:.::. :..:...:.:. .:. : .:. . ... .:. :. .. :.:::..:: :. CCDS42 IFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIK 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KB3 YPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKGYRTDATVSVFLGFLLFLIPAKKPC . :... ..: ....: :::.: :.::: :.:. :. .::...: . .::..:...: CCDS42 FAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNP-GFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPS 300 310 320 330 340 350 440 450 460 470 480 490 pF1KB3 FGKKND--GENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSSGLSTWIGN . : . : : :::..::: :.:.::.:..:.:::.:.:.: . ::::.:::. CCDS42 LKWWFDFKAPNTE----TEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGG 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 QMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINPLYTLIPVT :. : ..:: ..:: ..... :::.:: ::: ::::.: :. :...::: .:: : CCDS42 QLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGT 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 MCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTWGVSLFHLD . ::: ::::..:::.:.:. :: .::::..:: .:..:.... .:.:::. ..:.: CCDS42 VGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLG 470 480 490 500 510 520 620 pF1KB3 TYPAWARVSNITDQA :.: :: . .. CCDS42 TFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL 530 540 550 >>CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 (602 aa) initn: 1489 init1: 623 opt: 1055 Z-score: 1251.4 bits: 241.7 E(32554): 2.2e-63 Smith-Waterman score: 1511; 38.7% identity (72.4% similar) in 615 aa overlap (11-622:15-585) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLG :.::... .:: :::. : .:. : .:... :::: .::.::. CCDS13 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 AAALVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMA ..::.: :.::.:.: ::.: .:: .:..:... . .:.:.:.::::.::::...... CCDS13 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 GAKPGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEA :..:. :.: .: :..::::::::..:::..::..:.:. : . .. CCDS13 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKE------------- 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 EPISLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPS . : :: : .::..: . ::. .. . .. . ..: .::. CCDS13 --VRKD-----PSQE----SEENTAAVRR-------NGLHTVPTEMQFLASTEAK-DHPG 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 Q-EKPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLE . : : : . ::. .:: . : : . .:: :::.::: .:. ::. .::.: CCDS13 ETEVPLDLPADSRKED---EYRRN----IWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLG 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 HFNNQYPAAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKRE .... .: .:::::.::.:.::. :..:...:.:. .:. : .:. . ... .:. : CCDS13 QLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAE 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKGYRTDAT . .. :.:::..:: :.. :... ..: ....: :::.: :.::: :.:. :. .::. CCDS13 DRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNP-GFLSDAV 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 VSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKND--GENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGG ..: . .::..:...: . : . : : :::..::: :.:.::.:..:.::: CCDS13 TGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTE----TEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGG 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 YALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILC .:.:.: . ::::.:::.:. : ..:: ..:: ..... :::.:: ::: ::::.: CCDS13 FAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLA 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 SLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGL :. :...::: .:: :. ::: ::::..:::.:.:. :: .::::..:: .:..:. CCDS13 ELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGV 500 510 520 530 540 550 600 610 620 pF1KB3 VIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA ... .:.:::. ..:.: :.: :: . .. CCDS13 LLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL 560 570 580 590 600 >>CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 (552 aa) initn: 1241 init1: 623 opt: 849 Z-score: 1007.0 bits: 196.3 E(32554): 9e-50 Smith-Waterman score: 1199; 34.9% identity (64.3% similar) in 616 aa overlap (11-622:15-535) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLG :.::... .:: :::. : .:. : .:... :::: .::.::. CCDS54 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 AAALVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMA ..::.: :.::.:.: ::.: .:: .:..:... . .:.:.:.::::.::::...... 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