Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3061
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3061, 555 aa
1>>>pF1KB3061 555 - 555 aa - 555 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3744+/-0.00184; mu= 15.5279+/- 0.110
mean_var=278.0450+/-53.549, 0's: 0 Z-trim(106.1): 967 B-trim: 40 in 1/51
Lambda= 0.076916
statistics sampled from 7745 (8819) to 7745 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 3.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 3943 452.3 7e-127
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 3923 450.1 3.3e-126
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1806 215.2 1.8e-55
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1806 215.3 1.9e-55
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1806 215.3 1.9e-55
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1806 215.3 1.9e-55
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1794 214.0 4.7e-55
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1781 212.6 1.4e-54
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1776 211.8 1.7e-54
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1768 211.0 3.4e-54
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1767 210.9 3.5e-54
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1767 210.9 3.7e-54
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1755 209.7 9.6e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1755 209.7 9.9e-54
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1751 209.0 1.1e-53
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1751 209.2 1.3e-53
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1748 209.2 2e-53
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1748 209.2 2.1e-53
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1737 207.5 3.5e-53
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1737 207.6 3.7e-53
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1736 207.4 3.8e-53
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 1734 207.3 4.7e-53
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1725 206.1 8.3e-53
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1718 205.6 1.7e-52
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1717 205.5 1.9e-52
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1709 204.3 2.8e-52
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1708 204.4 3.4e-52
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1708 204.4 3.4e-52
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1707 204.3 3.8e-52
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1706 204.5 5.1e-52
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1691 202.6 1.4e-51
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1686 201.9 1.8e-51
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1686 202.1 2.1e-51
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1686 202.2 2.1e-51
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1682 201.3 2.2e-51
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1679 201.2 3.1e-51
CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 ( 644) 1679 201.2 3.2e-51
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 1678 201.0 3.3e-51
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1677 201.0 3.9e-51
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1677 201.1 4.2e-51
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1677 201.1 4.2e-51
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1677 201.1 4.2e-51
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1677 201.1 4.2e-51
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1675 200.9 4.7e-51
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1673 200.5 5e-51
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1673 200.5 5.1e-51
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1673 200.7 5.6e-51
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1673 200.7 5.7e-51
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 1670 200.1 6.1e-51
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 1670 200.2 6.6e-51
>>CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 (555 aa)
initn: 3943 init1: 3943 opt: 3943 Z-score: 2391.4 bits: 452.3 E(32554): 7e-127
Smith-Waterman score: 3943; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAARLLPVPAGPQAKLTFEDVAVLLSQDEWDRLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVSLGLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAAARLLPVPAGPQAKLTFEDVAVLLSQDEWDRLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVSLGLPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCPWECETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCPWECETK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCLSPNSVDHREVQVLSQSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCLSPNSVDHREVQVLSQSMP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSSVLSKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSSVLSKH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHTGEKPHECLECRKAFTQLSHLIQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHTGEKPHECLECRKAFTQLSHLIQHQRIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQHQRIHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERIHTEEKPYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERIHTEEKPYAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 YECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGEKPFQCTECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGEKPFQCTECG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYECGECGRAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYECGECGRAFN
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB3 QHGHLIQHQKVHRKL
:::::::::::::::
CCDS55 QHGHLIQHQKVHRKL
550
>>CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 (560 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3923 Z-score: 2379.3 bits: 450.1 E(32554): 3.3e-126
Smith-Waterman score: 3923; 99.1% identity (99.1% similar) in 560 aa overlap (1-555:1-560)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAAARLLPVPAGPQ-----AKLTFEDVAVLLSQDEWDRLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVS
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAAARLLPVPAGPQPLSFQAKLTFEDVAVLLSQDEWDRLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LGLPGSKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGLPGSKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCPW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ECETKGESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCLSPNSVDHREVQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ECETKGESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCLSPNSVDHREVQVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VLSKHRRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHTGEKPHECLECRKAFTQLSHLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLSKHRRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHTGEKPHECLECRKAFTQLSHLIQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 HQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQHQRI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 HTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERIHTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERIHTEE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KPYACYECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGEKPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPYACYECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGEKPFQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 CTECGKAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYECGEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CTECGKAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYECGEC
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KB3 GRAFNQHGHLIQHQKVHRKL
::::::::::::::::::::
CCDS34 GRAFNQHGHLIQHQKVHRKL
550 560
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 7012 init1: 1800 opt: 1806 Z-score: 1109.4 bits: 215.2 E(32554): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 1856; 53.6% identity (73.2% similar) in 481 aa overlap (88-552:78-558)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LPGSKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCP---
::: ... . .: . .::. :
CCDS74 RPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB3 ----------WECETKGE--SQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCL
:. . :: : : :: .:. :. :. .. . .. :. :.
CCDS74 TPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCV
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SPNSVDHREV-QVLSQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKP
. . .: ...:.: : :. . .::::: : :: : : :: : .::::::::::
CCDS74 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 YVCSVCGKAFSQSSVLSKHRRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHTGEKPHECL
: :. ::..:.: . : .:.: :::::::::.::::.: :...::.. ::::::.::
CCDS74 YKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECS
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 ECRKAFTQLSHLIQHQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGK
:: ::: : :: :: ::::::.:: : :::::.::. : .:::.::::::..:.::::
CCDS74 ECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 TFSVKRTLLQHQRIHTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSH
.:. :.:::: ::::::: :.:::::::. ..: .:. .::::::: :.::::::::
CCDS74 AFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSH
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 RSTLMNHERIHTEEKPYACYECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSL
:.: .::: :: :::: : .::::: : .:: ::::.::::::: :..::.::: ::
CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 IQHERIHTGEKPFQCTECGKAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQ
.:.::::::::..:..::.::: : :: : : ::::::::::.::.:::: :.::.::
CCDS74 TKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQ
470 480 490 500 510 520
530 540 550
pF1KB3 RIHTGEKPYECGECGRAFNQHGHLIQHQKVHRKL
:::: :::: :.:::..:.. . : ::...:
CCDS74 RIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHT
530 540 550 560 570 580
CCDS74 GEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
590 600 610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 7012 init1: 1800 opt: 1806 Z-score: 1109.1 bits: 215.3 E(32554): 1.9e-55
Smith-Waterman score: 1856; 53.6% identity (73.2% similar) in 481 aa overlap (88-552:120-600)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LPGSKPDIISQLERGEDPWVLDRKGAKKSQGLWSDYSDNLKYDHTTACTQQDSLSCP---
::: ... . .: . .::. :
CCDS74 RPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAF
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160
pF1KB3 ----------WECETKGE--SQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQSFCL
:. . :: : : :: .:. :. :. .. . .. :. :.
CCDS74 TPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCV
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SPNSVDHREV-QVLSQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQRIHTGEKP
. . .: ...:.: : :. . .::::: : :: : : :: : .::::::::::
CCDS74 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKP
210 220 230 240 250 260
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CCDS12 GEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS54 GEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB3 VHRKL
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CCDS64 IHTRE
680
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CCDS27 YECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCN
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CCDS27 NSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHL
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CCDS27 IIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQ
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CCDS27 RVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
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pF1KB3 GESQNTDLSPKPLISEQTVILGKTPLGRIDQENNETKQS----FCLSPNSVDHREV-QVL
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CCDS27 EKSLLLTSSLVTRLRVSTEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTF
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CCDS27 TQSSSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRS
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CCDS27 RPYKCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYK
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CCDS27 CKECGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIEC
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