Result of FASTA (omim) for
pF1KB3089
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3089, 475 aa
1>>>pF1KB3089 475 - 475 aa - 475 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1704+/-0.000404; mu= 18.4324+/- 0.025
mean_var=65.8424+/-13.456, 0's: 0 Z-trim(110.4): 36 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.158060
statistics sampled from 18719 (18754) to 18719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 9.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein ( 475) 3191 737.0 2.7e-212
NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isofor ( 500) 1504 352.3 1.8e-96
XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 536) 1504 352.3 1.9e-96
XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 420) 1426 334.5 3.5e-91
NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepa ( 499) 1249 294.2 5.7e-79
XP_005254429 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 499) 1249 294.2 5.7e-79
XP_005254431 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 511) 1249 294.2 5.8e-79
XP_006720565 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 452) 1246 293.4 8.4e-79
XP_016877665 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 398) 1015 240.7 5.5e-63
XP_016881584 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 303) 886 211.2 3.1e-54
NP_000927 (OMIM: 246600,614338) pancreatic triacyl ( 465) 706 170.3 1e-41
NP_006220 (OMIM: 604422) inactive pancreatic lipas ( 467) 697 168.3 4.2e-41
NP_001290064 (OMIM: 604422) inactive pancreatic li ( 467) 697 168.3 4.2e-41
XP_011538170 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 467) 697 168.3 4.2e-41
NP_005387 (OMIM: 604423) pancreatic lipase-related ( 470) 679 164.2 7.3e-40
XP_011538171 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 318) 555 135.8 1.7e-31
XP_016871828 (OMIM: 604423) PREDICTED: pancreatic ( 249) 497 122.5 1.3e-27
NP_001294935 (OMIM: 603684) endothelial lipase iso ( 426) 491 121.3 5.4e-27
XP_011524567 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 462) 491 121.3 5.8e-27
NP_001289930 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 375) 457 113.5 1e-24
NP_001289927 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 460) 453 112.6 2.3e-24
NP_945347 (OMIM: 145750,609252) lipase member I is ( 481) 453 112.6 2.4e-24
XP_006724028 (OMIM: 145750,609252) PREDICTED: lipa ( 404) 452 112.4 2.5e-24
NP_001289929 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 454) 441 109.9 1.5e-23
XP_011510833 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408) 435 108.5 3.6e-23
XP_011510832 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408) 435 108.5 3.6e-23
NP_640341 (OMIM: 604379,607365) lipase member H pr ( 451) 435 108.5 3.9e-23
NP_056984 (OMIM: 607460) phospholipase A1 member A ( 456) 414 103.7 1.1e-21
NP_001280154 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440) 413 103.5 1.3e-21
XP_006713592 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 421) 345 88.0 5.6e-17
NP_001289928 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 430) 322 82.7 2.2e-15
NP_001193889 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440) 294 76.4 1.8e-13
XP_016862061 (OMIM: 607460) PREDICTED: phospholipa ( 283) 227 61.0 5.1e-09
NP_001193890 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 283) 227 61.0 5.1e-09
>>NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein lip (475 aa)
initn: 3191 init1: 3191 opt: 3191 Z-score: 3932.4 bits: 737.0 E(85289): 2.7e-212
Smith-Waterman score: 3191; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AFEISLYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB3 WSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
430 440 450 460 470
>>NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isoform 1 (500 aa)
initn: 1481 init1: 674 opt: 1504 Z-score: 1853.0 bits: 352.3 E(85289): 1.8e-96
Smith-Waterman score: 1508; 49.1% identity (77.8% similar) in 442 aa overlap (40-467:50-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 TLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHF
.: ::: .: .. :.: : .. . : :
NP_006 GSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTK
: ..:::..:::::..:..:.:. :::.::. :: :.::.::::: :.. : ... :.
NP_006 NMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNF
.::...::...:..:. .. : ::::.:::::::.:: ::.... :.:::::::::: :
NP_006 VVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMF
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAI
: :. .:::::::::::::::.:: : : ::::: ::::.::::::: :::::......
NP_006 EGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTR-SFGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVL
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNR
:: : . ..::: :::..:::.:::.:...:: :..:.... :.::.::::::::
NP_006 GSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNR
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGT
::..::. .:.: ::.::::::::. ::..:.:::.::: . .. . . .: ..::::
NP_006 CNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGT
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS------
:.:...:. . : . : : .::.::: :.:.:: ..: :.. : :: . :.
NP_006 NADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYL
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470
pF1KB3 ----SPG--FAIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE-KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
.:: . :..::::.::::.:. ::... . . .. :. : ::.:
NP_006 SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRE-LWFRKCRDGWRMKNET
440 450 460 470 480 490
NP_006 SPTVELP
500
>>XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip (536 aa)
initn: 1481 init1: 674 opt: 1504 Z-score: 1852.6 bits: 352.3 E(85289): 1.9e-96
Smith-Waterman score: 1508; 49.1% identity (77.8% similar) in 442 aa overlap (40-467:86-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 TLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHF
.: ::: .: .. :.: : .. . : :
XP_005 AREEAGPSVRRPRDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSF
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTK
: ..:::..:::::..:..:.:. :::.::. :: :.::.::::: :.. : ... :.
XP_005 NMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTR
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNF
.::...::...:..:. .. : ::::.:::::::.:: ::.... :.:::::::::: :
XP_005 VVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMF
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAI
: :. .:::::::::::::::.:: : : ::::: ::::.::::::: :::::......
XP_005 EGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTR-SFGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVL
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNR
:: : . ..::: :::..:::.:::.:...:: :..:.... :.::.::::::::
XP_005 GSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNR
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGT
::..::. .:.: ::.::::::::. ::..:.:::.::: . .. . . .: ..::::
XP_005 CNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGT
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS------
:.:...:. . : . : : .::.::: :.:.:: ..: :.. : :: . :.
XP_005 NADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYL
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KB3 ----SPG--FAIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE-KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
.:: . :..::::.::::.:. ::... . . .. :. : ::.:
XP_005 SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRE-LWFRKCRDGWRMKNET
480 490 500 510 520
XP_005 SPTVELP
530
>>XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip (420 aa)
initn: 1403 init1: 596 opt: 1426 Z-score: 1758.0 bits: 334.5 E(85289): 3.5e-91
Smith-Waterman score: 1430; 50.2% identity (79.3% similar) in 410 aa overlap (72-467:2-405)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 ALRTPEDTAEDTCHLIPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYK
..:::..:::::..:..:.:. :::.::.
XP_011 MTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHT
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 REPDSNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLG
:: :.::.::::: :.. : ... :..::...::...:..:. .. : ::::.:::::
XP_011 REKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLG
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 AHAAGIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSI
::.:: ::.... :.:::::::::: :: :. .:::::::::::::::.:: : : ::
XP_011 AHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTR-SFGLSI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GIQKPVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLN
::: ::::.::::::: :::::...... :: : . ..::: :::..:::.:::.:
XP_011 GIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVN
160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 EENPSKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVF
...:: :..:.... :.::.::::::::::..::. .:.: ::.::::::::. ::..:.
XP_011 QDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVY
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 HYQVKIHFSGTESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIG
:::.::: . .. . . .: ..:::: :.:...:. . : . : : .::.::: :.:
XP_011 HYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLG
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440
pF1KB3 ELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWS----------SPG--FAIQKIRVKAGETQKKVIFCSRE
.:: ..: :.. : :: . :. .:: . :..::::.::::.:. ::...
XP_011 DLLKIQLTWEGASQ-SWYNLWKEFRSYLSQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTED
330 340 350 360 370 380
450 460 470
pF1KB3 -KVSHLQKGKAPAVFVKCHDKSLNKKSG
. . .. :. : ::.:
XP_011 PENTSISPGRE-LWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
390 400 410 420
>>NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepatic (499 aa)
initn: 1308 init1: 794 opt: 1249 Z-score: 1538.8 bits: 294.2 E(85289): 5.7e-79
Smith-Waterman score: 1353; 44.3% identity (73.7% similar) in 463 aa overlap (27-473:38-495)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHL
:.. . . .....: : . . :..
NP_000 FSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQG---CQI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 IPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDS--NVIVVDWL
. ... : :: : :.::::.: :. :.:. ..:::: : .: . :: .:::.
NP_000 RINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAAL-KSQPAQPVNVGLVDWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTN-
. :..:: ... :.:::..:: .. :.:: . ..:::.:::::::..:.::: .
NP_000 TLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]