FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3091, 934 aa 1>>>pF1KB3091 934 - 934 aa - 934 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3434+/-0.000613; mu= 16.4629+/- 0.038 mean_var=91.1918+/-18.937, 0's: 0 Z-trim(106.4): 78 B-trim: 858 in 1/52 Lambda= 0.134306 statistics sampled from 14462 (14520) to 14462 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16 Scan time: 12.440 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000242 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA ( 934) 6015 1177.0 0 XP_011531169 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 924) 5681 1112.3 0 XP_005264389 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 974) 5681 1112.3 0 NP_001245210 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) D ( 868) 5587 1094.1 0 NP_002430 (OMIM: 600887,608089,617100) DNA mismatc (1137) 778 162.3 1.2e-38 NP_002431 (OMIM: 602105) mutS protein homolog 4 [H ( 936) 752 157.2 3.5e-37 NP_001268423 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058) 590 125.9 1.1e-27 NP_001268422 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058) 590 125.9 1.1e-27 NP_001268421 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1230) 590 125.9 1.2e-27 XP_011531101 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1261) 590 125.9 1.3e-27 XP_011531100 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1299) 590 125.9 1.3e-27 NP_000170 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA (1360) 590 125.9 1.3e-27 NP_751898 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834) 554 118.8 1.1e-25 NP_002432 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834) 554 118.8 1.1e-25 NP_751897 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 835) 544 116.9 4.3e-25 NP_079535 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 822) 500 108.4 1.6e-22 >>NP_000242 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA mism (934 aa) initn: 6015 init1: 6015 opt: 6015 Z-score: 6299.9 bits: 1177.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6015; 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