Result of FASTA (ccds) for pF1KB3109
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3109, 1786 aa
  1>>>pF1KB3109 1786 - 1786 aa - 1786 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0953+/-0.00172; mu= 8.7080+/- 0.102
 mean_var=384.7412+/-76.487, 0's: 0 Z-trim(107.8): 161  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.065387
 statistics sampled from 9659 (9798) to 9659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  4.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7           (1786) 12583 1203.9       0
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3           (1798) 6774 655.9 3.6e-187
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7         (1761) 4457 437.4 2.2e-121
CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7         ( 772) 2428 245.5 5.7e-64
CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12          ( 628) 1284 137.4 1.5e-31
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1           (1609) 1210 131.0 3.4e-29
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9          (1575) 1143 124.7 2.7e-27
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1           (1172) 1119 122.2 1.1e-26
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6           (3122) 1054 116.7 1.4e-24
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18       (3075) 1004 112.0 3.6e-23
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1           (1546)  833 95.4 1.7e-18
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17          ( 604)  816 93.3 2.9e-18
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1          (5202)  833 96.1 3.5e-18
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15       (1044)  660 78.9 1.1e-13
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1          (1111)  638 76.8 4.8e-13
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1           (1193)  638 76.9   5e-13
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5         (1140)  627 75.8   1e-12
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1823)  609 74.4 4.3e-12
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs108|chr9          ( 602)  595 72.4 5.6e-12
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6          (1816)  597 73.3 9.4e-12
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391)  588 72.9 2.9e-11
CCDS78055.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5        ( 567)  566 69.6 3.6e-11


>>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7                (1786 aa)
 initn: 12583 init1: 12583 opt: 12583  Z-score: 6435.2  bits: 1203.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12583; 99.9% identity (100.0% similar) in 1786 aa overlap (1-1786:1-1786)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 LRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 LEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB3 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB3 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB3 LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB3 WQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 WQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEEL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB3 RNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVI
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB3 LQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDI
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CCDS27 DGQPRCGGLSCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRA
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CCDS27 QAALDKANASRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQ
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CCDS27 IQHLAGAIAERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAAL
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CCDS27 EEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALK
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CCDS27 LKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARA
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CCDS34 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD
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CCDS34 LCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVF
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CCDS34 PSGKFLK-VKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDT----------IERAKNEADLL
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CCDS34 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND
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CCDS34 LLTIL--------DTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGAL
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CCDS34 CTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVS
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pF1KB3 KQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS
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CCDS34 KNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPI
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pF1KB3 TPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMV
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CCDS34 PSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLDKT
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pF1KB3 KEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNV
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CCDS34 LNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLEDGL
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pF1KB3 EELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADA
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CCDS34 SLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTGLT
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pF1KB3 RR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLL
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CCDS34 KETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNLSRQAKADQLRILEDQVVAIK
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pF1KB3 KDISQKVAVYSTCL 
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CCDS34 NEIVEQEKKYARCYS
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pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
                                    : .:.:.:.:::::.::  .: ..::::: .
CCDS83        MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
        . :::.:.:. ..:::::.:. ::    .:.:: ::::...: :.: : :::::::...
CCDS83 AQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDH
            60        70        80        90       100       110   

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pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..:
CCDS83 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
         . : ::.:::.:::::::: :::....:::.:.::.:::: ::.:. .:::::.:.::
CCDS83 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG
       ::::: ::  :. .  .:::::.:.:.:::.::: :::::: :.. .  .:    :::::
CCDS83 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN
       .:.:.::: : ::: : ::..: :::::   ..:::..:.:: ::  :::::..:::.:.
CCDS83 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KB3 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD
       .:::::.:::::: :..:..:.:..:. : . : ::  :  : ::: :. . ::: :..:
CCDS83 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD
           360       370       380       390       400       410   

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET
        . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..:  . :: .:
CCDS83 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT
           420       430       440       450       460        470  

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI
       :.: :   ::: ::..:   .:::.: : :: :::::.::: .: :  ..::: ::::. 
CCDS83 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT
            480       490       500       510       520       530  

        540       550       560                     570       580  
pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS
       ::.:.:  :::.:: :. ::::::::.       ::       :.: .:  . .     .
CCDS83 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT
            540       550       560       570       580       590  

            590       600       610       620       630       640  
pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
       ::: ::.::  :: :.: ..:::. ... : :.:: :    :   .. :. ::    : .
CCDS83 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH
            600       610       620       630        640           

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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
       :     ..  :  .:  ..: ..:: :.:.:  ..:.. . . :  ...: ..: ..:.:
CCDS83 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD
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                       710       720       730       740       750 
pF1KB3 SLVLM-----------PYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPM
       : ...           : ::... :.  .: :                            
CCDS83 SAAVQWHNLGSLQPPPPECKQFSCFSFPSSWDYRHPPPHLANFCIFSRDGVSPHWPGWSQ
       710       720       730       740       750       760       

             760       770       780       790       800       810 
pF1KB3 TDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTF
                                                                   
CCDS83 TPDLR                                                       
       770                                                         

>>CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12               (628 aa)
 initn: 1315 init1: 346 opt: 1284  Z-score: 679.7  bits: 137.4 E(32554): 1.5e-31
Smith-Waterman score: 1313; 40.5% identity (63.4% similar) in 519 aa overlap (30-537:30-514)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
                                    : : .: :  :.: .::  :: . .::: . 
CCDS90 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRC-EKACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA
               10        20        30         40          50       

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pF1KB3 PEPYCIVSHLQE----DKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSEN
        : ::. :.  .    . ::  ::.  :.   : : : . .   ..:   :   :::: .
CCDS90 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-P-SAMAD---SSFRFPRT--WWQSAE
        60        70        80        90            100         110

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pF1KB3 GVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPG
        :.   :::::::::.:::::. ::. :::::...::.::::::  :.::: .: :.: :
CCDS90 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATF-G
              120       130       140       150       160          

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 ISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIK
       .    .::    :: :.::.  : : :::::.::.: .  :.::: ..:. :::::::..
CCDS90 LEDDVVKK--GAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
     170         180       190       200       210       220       

        240       250       260       270       280        290     
pF1KB3 FVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNE-EVEG---
       ..: ..   .  :   : ..  .::.::..:.:.::: :::..: :: ::   .. :   
CCDS90 LLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFH
       230       240       250       260       270       280       

            300       310       320         330       340       350
pF1KB3 MVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNS--NACKKCNCNEHSISCHFDMAV
       ::::.:::.::: : .:. :  .:.: ::. :.:...  : :. :.:: :. .::::. :
CCDS90 MVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV
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              360       370       380       390       400       410
pF1KB3 YLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGI
       . :.:: :::::::::::: :. :..::: .:.  .: .  :. :. :.: :.::     
CCDS90 WEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPA
       350       360       370       380       390       400       

               420       430       440       450       460         
pF1KB3 CD-SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGG
        . .. : :.:    .: :: .: :..:: :  :.. ...   .::. : :   :.    
CCDS90 NSVTFCDPSNG----DCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGD---YGCRPCDCA--GS----
       410           420       430       440          450          

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB3 NPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQC
         ::  :: :  ..     . .  .:.   . :  .   :   .   : . : . .::.:
CCDS90 --CDPITGDCISSHTDIDWYHE--VPDFRPVHNKSE---PAW-EWEDAQGFSALLHSGKC
            460       470         480           490       500      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KB3 SCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFV
        :. . .:                                                    
CCDS90 ECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTL
        510       520       530       540       550       560      

>>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1                (1609 aa)
 initn: 1222 init1: 363 opt: 1210  Z-score: 637.6  bits: 131.0 E(32554): 3.4e-29
Smith-Waterman score: 2102; 27.3% identity (54.1% similar) in 1818 aa overlap (3-1761:20-1596)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLL
                          .: .:: .  : : :.. :..   . :     :.:     .
CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGC-AQA-AMDECTDEGGRPQRCMPE----F
               10        20        30          40        50        

            50          60        70         80        90       100
pF1KB3 IGRAQKLSV--TSTCGLHKPEPYCIVSHLQE-DKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVV
       .. : ...:  :.:::   :: ::. . .    :.: .:.. .:.   :.  . ..    
CCDS13 VNAAFNVTVVATNTCGT-PPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPH---LQHGAAFL----
           60        70         80        90          100          

              110             120       130       140       150    
pF1KB3 TTFAPNRLKIWWQSEN---GVE---NVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSS
       : .  .    ::::..   ::.   .... : :   : .:.. . :.: :: .. : . .
CCDS13 TDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRT
        110       120       130       140       150       160      

          160       170       180          190       200       210 
pF1KB3 DFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDD---IICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALD
            :  :.:.. .:: ..   . : ..   :    .: ...::: : : :.: : .:.
CCDS13 REDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLE
        170       180       190       200       210       220      

                220       230       240       250       260        
pF1KB3 --P-AFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVR
         : :.....  :: .:. .  :..:. . .:.:.::.....  .. ..::::. :..: 
CCDS13 GRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDP-KVLKSYYYAISDFAVG
        230         240       250       260        270       280   

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 GNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRN
       : : : ::::::     ...: . .:   : :.::: :..:: :. :..: ::: : ...
CCDS13 GRCKCNGHASEC-----MKNEFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAES
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      330       340       350       360       370       380        
pF1KB3 SNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERD
       .. :  :.:: .:  :.::  .: .::.  :: : .:: :: : .::.:.  ...     
CCDS13 ASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-----
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pF1KB3 IRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLS
       . . . :  : :.:.:: .   ::::         :.: :: .: :..:: :. ::..:.
CCDS13 LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLT
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CCDS13 EA---GCRPCSCDPSGSI---DECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGC
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        ::           ::..:. :.   . .: .   .   .    .:.  ..::. . :  
CCDS13 TPC----------FCFGHSSVCT---NAVGYSVYSISSTFQ---IDEDGWRAEQRD-GSE
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       .:.   .  ::         .. . .. . ..::   : ..    .. :  .:   .   
CCDS13 ASLEWSSERQD---------IAVISDSYFPRYFI--APAKFLGKQVLSYGQNLSFSF---
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pF1KB3 VITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQY
               :.   .:  . .  .:  .:  . : :  :   :. . .:..:      :  
CCDS13 --------RV---DRRDTRLSAED--LVLEGAGLRVSV---PL-IAQGNSY------P--
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CCDS13 --SETTVKYVFRLHEA-TDYPWRPALTPFE----------------FQK---LLNNLTSI
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CCDS13 KIRGTYSER------SA--------------GYLDDV-----------------TLASAR
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CCDS13 PGP-GVPATWVESCTCPV-GYGGQFCE------MCLSG-YRRETPNLGP----YSPCVLC
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pF1KB3 QCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGR
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CCDS13 ACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGS----
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CCDS13 ----SCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNID
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pF1KB3 TTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALRQD----CRKCVCNYLGTVQEH
        .    :.. ::.::::.:.: : .:. :. :..:. :  .    :. : ::  ::....
CCDS13 PNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQ
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CCDS13 SS-----CNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIR
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       ::::.:.::. :. : .:.   .:     :. ::: :.:  . :: .. :.: : ::  :
CCDS13 TGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQC-KDDGRCECREGFVG
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pF1KB3 PRCDKCTRGY--SGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF-LEKAKALKISGVIGPY
        :::.: ..:  .  .: :  :  :. :    .:.     ::  :.. ..:  .   :  
CCDS13 NRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVAD-----HRVKLQELESLIANLGTGDE
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pF1KB3 RETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTS
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CCDS13 MVTDQAFEDRLKE----------AE--REVMDLLREAQD-VKDVDQ-------NLMDRLQ
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pF1KB3 QSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKE---LAEQLE-FIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAE
       . :.:   :.:  .. ... ::..:   :::: .  ..:.. :  ..  .. .. .  : 
CCDS13 RVNNT---LSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE-R-LIEIASRELEKAKVAA
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pF1KB3 ERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSA
         .:.:.:.:.:: . . .       .. :.  .. :.....:  . ..: :  .   . 
CCDS13 --ANVSVTQPESTGDPNNMT------LLAEEARKLAERHKQEADDIVRVA-KTANDTSTE
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CCDS13 AYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQA--KNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIY
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pF1KB3 SALAEV-----EQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQI
       ...:..     : : . ... :..:.. .:  .. :   .  .: :  .. :..::... 
CCDS13 ASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKG
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pF1KB3 RNFLTQDSADL-----DSIEAVANEVLKMEMPSTPQ--QLQNLTEDIRERV-ESLSQVEV
       ..   :..::      :. .:.:.:. :    .  .  .. :  .:. .:: .. . .: 
CCDS13 KT--EQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEE
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pF1KB3 ILQHSAA---DIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQA
        :..  :    :..:.   .::..:  ::.   . :  .:.  .:::.   :..:   ..
CCDS13 ALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAA---ADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATST
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pF1KB3 DEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVV
         . . :   .:....:.    . : .: ..... . ....    :.. :  :.  :  .
CCDS13 KAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINA
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pF1KB3 YTVKQSAEDVKKTLD------GELD----EKYKKVENLIAKKTEES--ADARRKAEMLQN
         .:.:. .. . ..      :.::    .: ...:. . :  .:   .:  ::.  :.:
CCDS13 RKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLEN
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pF1KB3 EAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYST
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CCDS13 EAKK---QEAAIMDYNRDIEEIMKDI-RNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP          
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pF1KB3 CL

>>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9               (1575 aa)
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CCDS69 CG-SPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQR-------HHNASYLTDFHSQDESTWWQS
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CCDS69 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
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CCDS69 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEE--SP
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pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
        .:. .  :.: :.. .:.:.::... .  .. ..::::: :. : : : : ::::::.:
CCDS69 GLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDP-KVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGP
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pF1KB3 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
             .: :..   : :.::: : .:: :. :..: ::  . .. .. :  :::. .: 
CCDS69 ------DVAGQLA--CRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSE
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        : ::  .. .::.  :: :  :. .: : .::.:.  ::.  :    : :  :. : :.
CCDS69 ECTFDRELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDP----RMP--CQPCDCQ
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pF1KB3 PAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACN
        ::: .   ::.         .: : :: .: : .:: :  ::..::     ::. :.::
CCDS69 SAGSLHLQ-CDD---------TGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEG---GCRPCTCN
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pF1KB3 PLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNS
       : :..   . :: ..:.: ::. : :. ::.: :   :  : :.   :  :       .:
CCDS69 PAGSL---DTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRP---GTFN-LQPHNPAGC-------SS
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pF1KB3 CFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIP
       ::       :  :  .. :  .        :. . ... :.  . .:.  :.       :
CCDS69 CF-------CYGH--SKVCASTAQFQVHHILSDF-HQGAEGWWARSVGGSEHP------P
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       .:.  : .  ::    :.   . : ..  :  . :   :       ..:     :.:   
CCDS69 QWSPNGVLLSPEDEE-EL---TAPEKFLGDQRFSYGQPL-------ILTF----RVP---
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             : :       ::      ::  . .: ::. .. :.  .  :. .:.  :    
CCDS69 ------PGD-------SP------LPVQLRLE-GTGLALSLRHSSL-SGPQDAGHPR---
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CCDS69 ------------------------------EVELRFHLQETSEDVAP-PLPP------FH
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       .. :: . :.:  . .:  :      : :      :  :  :  : . .  :..:  :  
CCDS69 FQRLLANLTSLRLRVSPGPS------PAG------P--VFLTEVRLTSARPGLSPPASWV
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pF1KB3 KPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDP
       . : :   : .. ::.       :  : : :.    .:    . :: :: :: :.  :::
CCDS69 EICSCPT-GYTGQFCES------CAPG-YKRE----MPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CDP
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        :: :. :. .: : .::::: :.::.:. :..: :.:::::     :..   .:   : 
CCDS69 NTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCP-----GQS---ACTTIPE
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pF1KB3 TLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPC---QCHNNIDTTDPEACDKET
       . ...:. : ::  : ::. : .:.::.:  . :  :::   :: .:.: .    ::  .
CCDS69 SREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLS
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       :.::.::..: :.::. :. :.::.::     . :  : :.  :.:.:.       :: .
CCDS69 GHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQM-----PCDPV
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       :::: :::.: ...:.:: :. ..:  : ::  :.:.   :   .:.  :::: : ::  
CCDS69 TGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVT
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pF1KB3 GRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGY-
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CCDS69 GQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN-GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFF
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        ..    :  : .:.::                 :             :....:      
CCDS69 LTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDV
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pF1KB3 -RTHRFLEKAKA------LKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGN
        . :..:  :.       ... :..   :: .. .. : ..  .  .:.  .. : ..  
CCDS69 YQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLN-KGARCAQAGSQKTCTQ-LADLEA
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pF1KB3 LFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEF
       ..: .:. :  .. ..:..:.      ... :   . . : :::..:  . .. : .   
CCDS69 VLESSEEEILHAAAILASLEIP-----QEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATK---
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pF1KB3 IKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFK
       :  .  :. : : :.:  .    : ::   :            .:: .:: ..: ..  :
CCDS69 IAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVALET------------QRD-LEDRYQEVQAAQK
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pF1KB3 EKQEEQARLLDELAGKL---QSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKC
         .   :..: :  . :   :..  ..:  ..  . :::  ....    . ..   :.  
CCDS69 ALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKT-
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pF1KB3 GGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLK
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CCDS69 -------VASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQASSSVQAATVT
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pF1KB3 TNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLD-SIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNL-
       . ...  .     .:...  :.     .:.: :. . ..:....:     .: :  . : 
CCDS69 VMGARTLL----ADLEGMKLQFPR--PKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLG
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pF1KB3 -TEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
        .  .   ... ..   .: ...: .:.:  ::.: :.: . :.  ..:.. .. .:..:
CCDS69 NAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKA--LLRERKQAHRRAS--RLTSQ-TQATLQQA
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pF1KB3 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEEL--KR
        . :: : .: .:  :. . .   :. .:..   :. .: .  . .:::   .  :  ..
CCDS69 SQ-QVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQ
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pF1KB3 KAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKT--LDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARR
         ::  .:... .:..   . . .   .:   :. : ...  ..... .  .:  :: . 
CCDS69 APAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQN
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          .:..                                                     
CCDS69 LEAILHSLPENCASWQ                                            
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>>CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1                (1172 aa)
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                 :. :: :    ..::.     .:..:.::: .::::.::.. : ..::::
CCDS14        MRPFFLLCFALPGLLHAQQ-----ACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCG
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pF1KB3 LHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENG
       : ::: :: ... . . ::  :.:..:.    :  :: .:::... .: :   ::::.: 
CCDS14 LTKPETYC-TQYGEWQMKCCKCDSRQPH----NYYSHRVENVASSSGPMR---WWQSQND
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pF1KB3 VENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGI
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CCDS14 VNPVSLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTFPRV
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         :  .. .:. :.:  .  .:...   :.: .  .: .  :    : .::.. .:::::
CCDS14 RQGRPQSWQDVRCQSLPQ--RPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLR
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       ..:..:  .      .:     . :::: .. ..:.:::.:::..:::  : .    .  
CCDS14 VNFTRLAPV-----PQRGYHPPSAYYAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPGASAGPSTAV
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pF1KB3 MVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYL
       .::  :.:.::: : ::: :  ::.. :::::::.... :..:.:: :: .:::: ::. 
CCDS14 QVHDVCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFA
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       :. .. :::::.:. .: :.:::.:.  :... .      . :  : ::: :.   . ::
CCDS14 ASQGAYGGVCDNCRDHTEGKNCERCQLHYFRNRRPGASIQETCISCECDPDGAVPGAPCD
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pF1KB3 SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPC
         :        ::: :: .:.::.::.:: ::  :.  .: ::. : :: ::.     ::
CCDS14 PVT--------GQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGS-RRDMPC
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       : :.:.: :   :.: .:::: : :: :..  .::.:: ::  ..:. .:   .::: ::
CCDS14 DEESGRCLCLPNVVGPKCDQCAPYHWKLASG-QGCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCR
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         . : .:.                                                   
CCDS14 EGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPR
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CCDS14 SLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCD
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CCDS14 KASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYD---ADLREQALRFGRLRN
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       : :   ::     :  .. .   . :. .:. .:. :::.   ......     .: . .
CCDS14 ATASLWSGPGLEDRGLASRILDAKSKIEQIRAVLS-SPAVTE-QEVAQVASAILSLRRTL
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CCDS14 QGL--QLDLPLEEETL---SLPRDLESLDRSFNGLLTMYQRKREQFEKISSADPSGAFRM
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       ..  ...: .: ..:. :.      ..:   .:: : :   . :..        . .:. 
CCDS14 LSTAYEQSAQAAQQVSDSSR----LLDQ---LRDSRREAERLVRQAG-GGGGTGSPKLV-
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CCDS14 ALRLEMSSLPDLTPTFNKLCGNSRQMACTPISCPGELCPQDNGT-ACGSR-CRGVLPRAG
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       .:.  : .. ... .  :....  .:.  :.  :.. ..::. .  ...:.. .:... .
CCDS14 GAFLMAGQVAEQLRGFNAQLQRTRQMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVR
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pF1KB3 ELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS-TPQQLQNLTEDIRERVESLSQV
       . : ::.:.:.:::. ..:  .:. :.. :: . .:. .   ::...: :.  .  : .:
CCDS14 RTRLLIQQVRDFLTDPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNE-IQAIAARLPNV
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pF1KB3 EVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQAD
       ...:...  :::::. :  ::..: . :  :.  .. :   :...  :   :. ... ..
CCDS14 DLVLSQTKQDIARARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDTMQGTS
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pF1KB3 EDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVY
       ....  :. .. ...    .:. . . .......   .:::...: :...::   .... 
CCDS14 RSLRLIQDRVAEVQQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQARQQGAEAVQAQQLAE
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pF1KB3 TVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKL
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CCDS14 GASEQALSAQEGFE-RIKQKYAELKDRLGQSSMLGEQGAR-IQSVKTEAEELFGETMEMM
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pF1KB3 QLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL
       . .::.: .   ... .  .. .:. :: .:...   :. .:  :.:: 
CCDS14 DRMKDMELELLRGSQAIMLRSADLTGLEKRVEQIRDHINGRVLYYATCK
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CCDS51 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQ-RPQQQRQSQAHQQRGLFPAV--LNLASNALITTNAT
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pF1KB3 CGLHKPEPYC-IVSHLQ----EDKKCFICNSQDPYHETLNPDS-HLIENVVTTFAPNRLK
       :: . :: :: .: :.     .. .: :::     ... ::.. : : :..     .  .
CCDS51 CGEKGPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICN-----QNSSNPNQRHPITNAI-----DGKN
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CCDS51 TWWQSPSIKNGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQ
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        .     .: . .     :::  . : :..:: : :: :.:  .::. .  ..   . .:
CCDS51 YHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADD
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pF1KB3 PYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLL-----DSRME---IREKYYYAVYDMVVRGN
       : ::.. .. .   .:..: ...::. .:.     : :     . ..:::.: :. : : 
CCDS51 P-SPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGM
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pF1KB3 CFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSN
       :.:::::  : :.:  ...      ..: :.::: : .:. :   .:. ::: .   ...
CCDS51 CICYGHARAC-PLDPATNK------SRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKT
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pF1KB3 ACKKCNCNEHSISCHFD-------MAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQ
        :. :::. ..  :..:       ... .    ..:::: .: .:: : ::: :   ...
CCDS51 ECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFR
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pF1KB3 HPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFST-GLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKE
           .   :  :. : ::: :: :: .: .    .  ::  :.:.:: .  :  :: : .
CCDS51 PKGVSPNYPRPCQPCHCDPIGSLNE-VCVKDEKHARRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCAR
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CCDS51 GYTGY----P-DCKACNCSGLGS-KNEDPC---FGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQE
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       :   ::  : :  .:.        :..:.      :.  .    :.:.. :         
CCDS51 DNWKGCDECFC--SGV--------SNRCQSSYWTYGKIQDM--SGWYLTDL---------
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pF1KB3 ANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEP-QL
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CCDS51 ----PGRIRVAPQ--QDDLDS---PQQISISNAEARQ----ALPHSYYWSAPAPYLGNKL
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CCDS51 PAVGGQLTFTI---------SYDLEEEEEDTERVLQL-----MIIL-------EGNDLSI
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              :..:     :     ...:.      . ::. :.   :  .      . .  :
CCDS51 S------TAQDEVYLHPSEEHTNVLLLKE----ESFTIHGTHFPVRRK------EFMTVL
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pF1KB3 ENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVG
        : . :.     .   . :: .:..  .....   :  ::.... .     ::: :. .:
CCDS51 ANLKRVLLQITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTD--GSIAAAVEV----CQCPPGYTG
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pF1KB3 RTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWG
        .:. : :             . ...:..             : :.              
CCDS51 SSCESCWPR------------HRRVNGTI-------------FGGI--------------
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CCDS32 DFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIAS-SNAIDLVVAAD
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CCDS32 VCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCL
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CCDS32 GNTDGAHCERCADGFYGDAV--TAKNCRACECHVKGSHSA-----VCHLETGL----CDC
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pF1KB3 DPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEG
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CCDS32 KPNVTGQQCDQCLHGYYGLDS--GHGCRPCNCSVAGSVSD--GCTDE-GQC-HCVPGVAG
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CCDS32 KRCDRCAHGFYA---YQDGSCTPCDC-------PHTQNT---CDPETGECVCPPHTQGVK
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CCDS32 PD--CVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRAD
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CCDS32 LDAAT-----VRQHIRAEPFYWRLPQQFQ-GDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEP
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pF1KB3 KEL---DSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEA----EERV
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CCDS32 QVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQE--QEVAMR---ENFWKYFNSVSEKPVTREDFM
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CCDS32 SVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGF
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