FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3109, 1786 aa 1>>>pF1KB3109 1786 - 1786 aa - 1786 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0953+/-0.00172; mu= 8.7080+/- 0.102 mean_var=384.7412+/-76.487, 0's: 0 Z-trim(107.8): 161 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.065387 statistics sampled from 9659 (9798) to 9659 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16 Scan time: 4.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 12583 1203.9 0 CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 6774 655.9 3.6e-187 CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 4457 437.4 2.2e-121 CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 ( 772) 2428 245.5 5.7e-64 CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12 ( 628) 1284 137.4 1.5e-31 CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 1210 131.0 3.4e-29 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CCDS27 SGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGH 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 TIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYT----LI .: :: .:.: .::...: :::.: : .: ..:.: . :..... :.::. :: CCDS27 LVPKDDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVR-TGGSAQPETPYSGPGLLI 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KB3 DSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFS :::::.: :..:. .::... . ::.::.: :.. :: ...: ...: CCDS27 DSLVLLPRVLVLEMFS---GGDAAALERQ-ATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLIS 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KB3 ISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPC .:.:... .: :.:.::::::: :.:.:::: :.:.:::: :. :::: .::::.::. : CCDS27 LSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQAC 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KB3 ECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTG .: .:.....:. ..::: : :... .:::: :.::::::.:: ::::::.:. :: CCDS27 QCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTG 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KB3 ECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQ ::.:.:.: :..::::.::..::: . : .:::::::.:: : :.:: ::.:: . : CCDS27 ACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQ 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KB3 LACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCL ..: : :: : ::. :: :.::.::. :: :: :.: .::: ::.::: .::.::.:: CCDS27 IVCHCRAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCL 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB3 YHTEGEHCQFCRFGYYGDALRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSD-CQCDKATGQCLCLPNV .:::: :: :. :..:.: ::.:..:.:: ::: ..: . : :.:: ..::: ::::: CCDS27 HHTEGPHCAHCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB3 IGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQEL : .::::::: :.:.:: ::.:: :. ... ::.::::::::.: ::::::::::::: CCDS27 QGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQEL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB3 FWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCH :::: ..:.::::: :::.:::: . ::.: : :: : :::.:.::.::.:: : ::: CCDS27 HWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCH 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB3 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDIL-AQSPA ::. :: .. .:. ::.:. ..:. :. .::.: .. . ...:.. .. :. :.. . 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CCDS34 LCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVF 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KB3 PAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQV-EVK-LSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESL :... :: . . . ... : ...:.. : : . :.:: .. ..::. : CCDS34 PSGKFLK-VKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDT----------IERAKNEADLL 1240 1250 1260 1270 1280 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB3 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR . ..: . . :..: . ..: ::...: ::...: : .::.. :: :. CCDS34 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KB3 VEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPN . .. . .. : : ... :.. : .:: : .. : ::: CCDS34 LLTIL--------DTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGAL 1350 1360 1370 1380 1390 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB3 CRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEA : .:.::: :::: : .:.. :: :::.. . . . .:. :.... . .:. . CCDS34 CTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVS 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KB3 KQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS :..: .. : . ... :. .:.. .::...::: .... ..:: ::: :: ...: CCDS34 KNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPI 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KB3 TPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMV :.: . :..... . .. .. . :. :: .:: : :.: .. .. : . CCDS34 PSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLDKT 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KB3 KEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNV . :..:. .: :...: : .: .. . . :..: . : :.:: : :: .. CCDS34 LNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLEDGL 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KB3 EELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADA :. : ... .: .. : . .::. .:. :. : :: .. .:: .. . CCDS34 SLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTGLT 1640 1650 1660 1670 1680 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KB3 RR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLL .. :...:.. :. : .....:.. . ::::: .: . . ::..: :: .: .. CCDS34 KETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNLSRQAKADQLRILEDQVVAIK 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1780 pF1KB3 KDISQKVAVYSTCL ..: .. :. : CCDS34 NEIVEQEKKYARCYS 1750 1760 >>CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (772 aa) initn: 2562 init1: 1012 opt: 2428 Z-score: 1261.9 bits: 245.5 E(32554): 5.7e-64 Smith-Waterman score: 2651; 49.8% identity (73.6% similar) in 723 aa overlap (30-723:23-739) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK : .:.:.:.:::::.:: .: ..::::: . CCDS83 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN . :::.:.:. ..:::::.:. :: .:.:: ::::...: :.: : :::::::... CCDS83 AQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..: CCDS83 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL . : ::.:::.:::::::: :::....:::.:.::.:::: ::.:. .:::::.:.:: CCDS83 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG ::::: :: :. . .:::::.:.:.:::.::: :::::: :.. . .: ::::: CCDS83 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN .:.:.::: : ::: : ::..: ::::: ..:::..:.:: :: :::::..:::.:. CCDS83 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD .:::::.:::::: :..:..:.:..:. : . : :: : : ::: :. . ::: :..: CCDS83 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..: . :: .: CCDS83 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI :.: : ::: ::..: .:::.: : :: :::::.::: .: : ..::: ::::. CCDS83 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS ::.:.: :::.:: :. ::::::::. :: :.: .: . . . CCDS83 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR ::: ::.:: :: :.: ..:::. ... : :.:: : : .. :. :: : . CCDS83 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID : .. : .: ..: ..:: :.:.: ..:.. . . : ...: ..: ..:.: CCDS83 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 SLVLM-----------PYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPM : ... : ::... :. .: : CCDS83 SAAVQWHNLGSLQPPPPECKQFSCFSFPSSWDYRHPPPHLANFCIFSRDGVSPHWPGWSQ 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 TDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTF CCDS83 TPDLR 770 >>CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12 (628 aa) initn: 1315 init1: 346 opt: 1284 Z-score: 679.7 bits: 137.4 E(32554): 1.5e-31 Smith-Waterman score: 1313; 40.5% identity (63.4% similar) in 519 aa overlap (30-537:30-514) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK : : .: : :.: .:: :: . .::: . CCDS90 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRC-EKACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB3 PEPYCIVSHLQE----DKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSEN : ::. :. . . :: ::. :. : : : . . ..: : :::: . CCDS90 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-P-SAMAD---SSFRFPRT--WWQSAE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 GVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPG :. :::::::::.:::::. ::. :::::...::.:::::: :.::: .: :.: : CCDS90 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATF-G 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 ISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIK . .:: :: :.::. : : :::::.::.: . :.::: ..:. :::::::.. CCDS90 LEDDVVKK--GAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 FVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNE-EVEG--- ..: .. . : : .. .::.::..:.:.::: :::..: :: :: .. : CCDS90 LLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFH 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 MVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNS--NACKKCNCNEHSISCHFDMAV ::::.:::.::: : .:. : .:.: ::. :.:... : :. :.:: :. .::::. : CCDS90 MVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 YLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGI . :.:: :::::::::::: :. :..::: .:. .: . :. :. :.: :.:: CCDS90 WEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB3 CD-SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGG . .. : :.: .: :: .: :..:: : :.. ... .::. : : :. CCDS90 NSVTFCDPSNG----DCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGD---YGCRPCDCA--GS---- 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 NPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQC :: :: : .. . . .:. . : . : . : . : . .::.: CCDS90 --CDPITGDCISSHTDIDWYHE--VPDFRPVHNKSE---PAW-EWEDAQGFSALLHSGKC 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 SCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFV :. . .: CCDS90 ECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTL 510 520 530 540 550 560 >>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609 aa) initn: 1222 init1: 363 opt: 1210 Z-score: 637.6 bits: 131.0 E(32554): 3.4e-29 Smith-Waterman score: 2102; 27.3% identity (54.1% similar) in 1818 aa overlap (3-1761:20-1596) 10 20 30 40 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLL .: .:: . : : :.. :.. . : :.: . CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGC-AQA-AMDECTDEGGRPQRCMPE----F 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 IGRAQKLSV--TSTCGLHKPEPYCIVSHLQE-DKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVV .. : ...: :.::: :: ::. . . :.: .:.. .:. :. . .. CCDS13 VNAAFNVTVVATNTCGT-PPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPH---LQHGAAFL---- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 TTFAPNRLKIWWQSEN---GVE---NVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSS : . . ::::.. ::. .... : : : .:.. . :.: :: .. : . . CCDS13 TDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRT 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 DFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDD---IICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALD : :.:.. .:: .. . : .. : .: ...::: : : :.: : .:. CCDS13 REDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLE 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KB3 --P-AFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVR : :..... :: .:. . :..:. . .:.:.::..... .. ..::::. :..: CCDS13 GRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDP-KVLKSYYYAISDFAVG 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 GNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRN : : : :::::: ...: . .: : :.::: :..:: :. :..: ::: : ... CCDS13 GRCKCNGHASEC-----MKNEFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAES 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 SNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERD .. : :.:: .: :.:: .: .::. :: : .:: :: : .::.:. ... CCDS13 ASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR----- 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 IRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLS . . . : : :.:.:: . :::: :.: :: .: :..:: :. ::..:. CCDS13 LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLT 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 SEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGL-SNDLDGC ::. :.:.: :.: . :. :::.: :: : : .:..: : ..: :.. :: CCDS13 EA---GCRPCSCDPSGSI---DECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGC 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 RPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPG :: ::..:. :. . .: . . . .:. ..::. . : CCDS13 TPC----------FCFGHSSVCT---NAVGYSVYSISSTFQ---IDEDGWRAEQRD-GSE 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 pF1KB3 VSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKA .:. . :: .. . .. . ..:: : .. .. : .: . CCDS13 ASLEWSSERQD---------IAVISDSYFPRYFI--APAKFLGKQVLSYGQNLSFSF--- 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KB3 VITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQY :. .: . . .: .: . : : : :. . .:..: : CCDS13 --------RV---DRRDTRLSAED--LVLEGAGLRVSV---PL-IAQGNSY------P-- 590 600 610 690 700 710 720 730 740 pF1KB3 TSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVV :.. :. . : .. . .:. .: : ::. : :. . . CCDS13 --SETTVKYVFRLHEA-TDYPWRPALTPFE----------------FQK---LLNNLTSI 620 630 640 650 750 760 770 780 790 800 pF1KB3 KTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCA : : : :: : :..: : CCDS13 KIRGTYSER------SA--------------GYLDDV-----------------TLASAR 660 670 810 820 830 840 850 860 pF1KB3 PGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPC :: : . . : : . : . ::. :..: : :. : . : : CCDS13 PGP-GVPATWVESCTCPV-GYGGQFCE------MCLSG-YRRETPNLGP----YSPCVLC 680 690 700 710 720 870 880 890 900 910 920 pF1KB3 QCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGR ::::.. ::: :: : ::.: : : .::.: ::::: :... :.::::: : CCDS13 ACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGS---- 730 740 750 760 770 930 940 950 960 970 980 pF1KB3 QFARSCYQDPVTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGS---CQPCQCHNNID :: : : ...:. : : :.::. : .::::.: .: :. ::: .::: CCDS13 ----SCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNID 780 790 800 810 820 830 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB3 TTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALRQD----CRKCVCNYLGTVQEH . :.. ::.::::.:.: : .:. :. :..:. : . :. : :: ::.... CCDS13 PNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQ 840 850 860 870 880 890 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB3 CNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEF . :. .:::: :::.: ::.: : :. ..: :: ::. :.:.: : . .:. CCDS13 SS-----CNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIR 900 910 920 930 940 950 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB3 TGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEG ::::.:.::. :. : .:. .: :. ::: :.: . :: .. :.: : :: : CCDS13 TGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQC-KDDGRCECREGFVG 960 970 980 990 1000 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB3 PRCDKCTRGY--SGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF-LEKAKALKISGVIGPY :::.: ..: . .: : : :. : .:. :: :.. ..: . : CCDS13 NRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVAD-----HRVKLQELESLIANLGTGDE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB3 RETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTS : .. : ...: :: ... .:..::. .::: . .: : . CCDS13 MVTDQAFEDRLKE----------AE--REVMDLLREAQD-VKDVDQ-------NLMDRLQ 1070 1080 1090 1100 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB3 QSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKE---LAEQLE-FIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAE . :.: :.: .. ... ::..: :::: . ..:.. : .. .. .. . : CCDS13 RVNNT---LSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE-R-LIEIASRELEKAKVAA 1110 1120 1130 1140 1150 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KB3 ERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSA .:.:.:.:.:: . . . .. :. .. :.....: . ..: : . . CCDS13 --ANVSVTQPESTGDPNNMT------LLAEEARKLAERHKQEADDIVRVA-KTANDTSTE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KB3 AAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVL : .. : : . . : : . ... : . .. .:. ..: : .. CCDS13 AYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQA--KNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIY 1220 1230 1240 1250 1260 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KB3 SALAEV-----EQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQI ...:.. : : . ... :..:.. .: .. : . .: : .. :..::... CCDS13 ASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKG 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB3 RNFLTQDSADL-----DSIEAVANEVLKMEMPSTPQ--QLQNLTEDIRERV-ESLSQVEV .. :..:: :. .:.:.:. : . . .. : .:. .:: .. . .: CCDS13 KT--EQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEE 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB3 ILQHSAA---DIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQA :.. : :..:. .::..: ::. . : .:. .:::. :..: .. CCDS13 ALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAA---ADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATST 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB3 DEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVV . . : .:....:. . : .: ..... . .... :.. : :. : . CCDS13 KAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINA 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KB3 YTVKQSAEDVKKTLD------GELD----EKYKKVENLIAKKTEES--ADARRKAEMLQN .:.:. .. . .. :.:: .: ...:. . : .: .: ::. :.: CCDS13 RKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLEN 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KB3 EAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYST ::: : . .. .:.:. ..: : ::: . : CCDS13 EAKK---QEAAIMDYNRDIEEIMKDI-RNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP 1570 1580 1590 1600 pF1KB3 CL >>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575 aa) initn: 998 init1: 361 opt: 1143 Z-score: 603.5 bits: 124.7 E(32554): 2.7e-27 Smith-Waterman score: 1919; 27.2% identity (51.7% similar) in 1778 aa overlap (30-1724:25-1566) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGS-----CYPATGDLLIGRAQKLSVTST : .:. : :. . .:: . : : CCDS69 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQAS--HT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 CGLHKPEPYCI-VSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQS :: :: .: :. .: :.. :: . : . .: : . . :::: CCDS69 CG-SPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQR-------HHNASYLTDFHSQDESTWWQS 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB3 EN---GVE---NVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAY . ::. .:.: : : ...:.. . :.: :: .. : . : : :.... CCDS69 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 DCEASF--P-GISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALD--P-AFKIEDPYSP .:. .. : : : . .: :..::: : . :.: : .:. : :...:. :: CCDS69 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEE--SP 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP .:. . :.: :.. .:.:.::... . .. ..::::: :. : : : : ::::::.: CCDS69 GLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDP-KVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGP 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI .: :.. : :.::: : .:: :. :..: :: . .. .. : :::. .: CCDS69 ------DVAGQLA--CRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSE 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 SCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKP-FYYQHPERDIRDPNFCERCTCD : :: .. .::. :: : :. .: : .::.:. ::. : : : :. : :. CCDS69 ECTFDRELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDP----RMP--CQPCDCQ 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 PAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACN ::: . ::. .: : :: .: : .:: : ::..:: ::. :.:: CCDS69 SAGSLHLQ-CDD---------TGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEG---GCRPCTCN 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 PLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNS : :.. . :: ..:.: ::. : :. ::.: : : : :. : : .: CCDS69 PAGSL---DTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRP---GTFN-LQPHNPAGC-------SS 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 CFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIP :: : : .. : . :. . ... :. . .:. :. : CCDS69 CF-------CYGH--SKVCASTAQFQVHHILSDF-HQGAEGWWARSVGGSEHP------P 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 SWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSS .:. : . :: :. . : .. : . : : ..: :.: CCDS69 QWSPNGVLLSPEDEE-EL---TAPEKFLGDQRFSYGQPL-------ILTF----RVP--- 530 540 550 560 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 RCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLI : : :: :: . .: ::. .. :. . :. .:. : CCDS69 ------PGD-------SP------LPVQLRLE-GTGLALSLRHSSL-SGPQDAGHPR--- 570 580 590 600 710 720 730 740 750 760 pF1KB3 DSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFS :. :.. :.:..:. :. : CCDS69 ------------------------------EVELRFHLQETSEDVAP-PLPP------FH 610 620 770 780 790 800 810 pF1KB3 ISALL-HQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGP--SGC .. :: . :.: . .: : : : : : : : . . :..: : CCDS69 FQRLLANLTSLRLRVSPGPS------PAG------P--VFLTEVRLTSARPGLSPPASWV 630 640 650 660 670 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 KPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDP . : : : .. ::. : : : :. .: . :: :: :: :. ::: CCDS69 EICSCPT-GYTGQFCES------CAPG-YKRE----MPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CDP 680 690 700 710 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 VTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPV :: :. :. .: : .::::: :.::.:. :..: :.::::: :.. .: : CCDS69 NTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCP-----GQS---ACTTIPE 720 730 740 750 760 940 950 960 970 980 990 pF1KB3 TLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPC---QCHNNIDTTDPEACDKET . ...:. : :: : ::. : .:.::.: . : ::: :: .:.: . :: . CCDS69 SREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLS 770 780 790 800 810 820 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB3 GRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALR----QDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKA :.::.::..: :.::. :. :.::.:: . : : :. :.:.:. :: . CCDS69 GHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQM-----PCDPV 830 840 850 860 870 880 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB3 TGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFG :::: :::.: ...:.:: :. ..: : :: :.:. : .:. :::: : :: CCDS69 TGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVT 890 900 910 920 930 940 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 GRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGY- :..:..:: :.: :::: :.: : . :: .. : ::: : :: .::.: .. CCDS69 GQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN-GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFF 950 960 970 980 990 1000 1170 1180 1190 pF1KB3 -SGVFPDCTPCHQCFAL-----------------W-------------DVIIAELTN--- .. : : .:.:: : :....: CCDS69 LTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB3 -RTHRFLEKAKA------LKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGN . :..: :. ... :.. :: .. .. : .. . .:. .. : .. CCDS69 YQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLN-KGARCAQAGSQKTCTQ-LADLEA 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB3 LFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEF ..: .:. : .. ..:..:. ... : . . : :::..: . .. : . CCDS69 VLESSEEEILHAAAILASLEIP-----QEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATK--- 1130 1140 1150 1160 1170 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB3 IKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFK : . :. : : :.: . : :: : .:: .:: ..: .. : CCDS69 IAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVALET------------QRD-LEDRYQEVQAAQK 1180 1190 1200 1210 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB3 EKQEEQARLLDELAGKL---QSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKC . :..: : . : :.. ..: .. . ::: .... . .. :. CCDS69 ALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKT- 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB3 GGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLK ... : : . : :. . ..: ..: :.:. .::. .:..:.. . CCDS69 -------VASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQASSSVQAATVT 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KB3 TNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLD-SIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNL- . ... . .:... :. .:.: :. . ..:....: .: : . : CCDS69 VMGARTLL----ADLEGMKLQFPR--PKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLG 1340 1350 1360 1370 1380 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB3 -TEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA . . ... .. .: ...: .:.: ::.: :.: . :. ..:.. .. .:..: CCDS69 NAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKA--LLRERKQAHRRAS--RLTSQ-TQATLQQA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KB3 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEEL--KR . :: : .: .: :. . . :. .:.. :. .: . . .::: . : .. CCDS69 SQ-QVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQ 1450 1460 1470 1480 1490 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KB3 KAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKT--LDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARR :: .:... .:.. . . . .: :. : ... ..... . .: :: . CCDS69 APAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQN 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KB3 KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQ .:.. CCDS69 LEAILHSLPENCASWQ 1560 1570 >>CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1 (1172 aa) initn: 1726 init1: 470 opt: 1119 Z-score: 592.6 bits: 122.2 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 1532; 41.6% identity (66.6% similar) in 539 aa overlap (11-541:4-512) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRAR---VRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCG :. :: : ..::. .:..:.::: .::::.::.. : ..:::: CCDS14 MRPFFLLCFALPGLLHAQQ-----ACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENG : ::: :: ... . . :: :.:..:. : :: .:::... .: : ::::.: CCDS14 LTKPETYC-TQYGEWQMKCCKCDSRQPH----NYYSHRVENVASSSGPMR---WWQSQND 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 VENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGI :. :..::::. .:.. ...: :. ::.::::::::::::: ::.:.: :: ..:: . CCDS14 VNPVSLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTFPRV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 STGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTE---GEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLR : .. .:. :.: . .:... :.: . .: . : : .::.. .::::: CCDS14 RQGRPQSWQDVRCQSLPQ--RPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLR 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 IKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNE--EVEG ..:..: . .: . :::: .. ..:.:::.:::..::: : . . CCDS14 VNFTRLAPV-----PQRGYHPPSAYYAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPGASAGPSTAV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 MVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYL .:: :.:.::: : ::: : ::.. :::::::.... :..:.:: :: .:::: ::. CCDS14 QVHDVCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFA 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 ATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICD :. .. :::::.:. .: :.:::.:. :... . . : : ::: :. . :: CCDS14 ASQGAYGGVCDNCRDHTEGKNCERCQLHYFRNRRPGASIQETCISCECDPDGAVPGAPCD 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPC : ::: :: .:.::.::.:: :: :. .: ::. : :: ::. :: CCDS14 PVT--------GQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGS-RRDMPC 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 DSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCR : :.:.: : :.: .:::: : :: :.. .::.:: :: ..:. .: .::: :: CCDS14 DEESGRCLCLPNVVGPKCDQCAPYHWKLASG-QGCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCR 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 PHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVP . : .:. CCDS14 EGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPR 510 520 530 540 550 560 >-- initn: 369 init1: 325 opt: 813 Z-score: 436.6 bits: 93.4 E(32554): 5.3e-18 Smith-Waterman score: 813; 25.2% identity (62.2% similar) in 678 aa overlap (1116-1785:518-1171) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB3 CNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCD .: . .:: . ::::::: :: : : :: CCDS14 SLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCD 490 500 510 520 530 540 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB3 QSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF--LEK ...:.:.: :. :::::.: ::: . .: :. :: :: .: :.: ... :: :.. CCDS14 KASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYD---ADLREQALRFGRLRN 550 560 570 580 590 600 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB3 AKALKISGVIGPYRETVDSV---ERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV : : :: : .. . . :. .:. .:. :::. ...... .: . . CCDS14 ATASLWSGPGLEDRGLASRILDAKSKIEQIRAVLS-SPAVTE-QEVAQVASAILSLRRTL 610 620 630 640 650 660 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB3 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS . :... : . : : ..:.::. ..: . .. ::.: :...: ::. CCDS14 QGL--QLDLPLEEETL---SLPRDLESLDRSFNGLLTMYQRKREQFEKISSADPSGAFRM 670 680 690 700 710 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB3 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRD-RVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLD .. ...: .: ..:. :. ..: .:: : : . :.. . .:. CCDS14 LSTAYEQSAQAAQQVSDSSR----LLDQ---LRDSRREAERLVRQAG-GGGGTGSPKLV- 720 730 740 750 760 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB3 ELAGKLQSL-DLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAH : ...:: ::. . . ::. .:. : : : :.: ::. : :.. : CCDS14 ALRLEMSSLPDLTPTFNKLCGNSRQMACTPISCPGELCPQDNGT-ACGSR-CRGVLPRAG 770 780 790 800 810 820 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB3 NAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNE .:. : .. ... . :.... .:. :. :.. ..::. . ...:.. .:... . CCDS14 GAFLMAGQVAEQLRGFNAQLQRTRQMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVR 830 840 850 860 870 880 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB3 ELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS-TPQQLQNLTEDIRERVESLSQV . : ::.:.:.:::. ..: .:. :.. :: . .:. . ::...: :. . : .: CCDS14 RTRLLIQQVRDFLTDPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNE-IQAIAARLPNV 890 900 910 920 930 940 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KB3 EVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQAD ...:... :::::. : ::..: . : :. .. : :... : :. ... .. CCDS14 DLVLSQTKQDIARARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDTMQGTS 950 960 970 980 990 1000 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KB3 EDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVY .... :. .. ... .:. . . ....... .:::...: :...:: .... CCDS14 RSLRLIQDRVAEVQQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQARQQGAEAVQAQQLAE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KB3 TVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKL ....: .... .. .. .:: .... ..... . .. : . ...::. :.... . CCDS14 GASEQALSAQEGFE-RIKQKYAELKDRLGQSSMLGEQGAR-IQSVKTEAEELFGETMEMM 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KB3 QLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL . .::.: . ... . .. .:. :: .:... :. .: :.:: CCDS14 DRMKDMELELLRGSQAIMLRSADLTGLEKRVEQIRDHINGRVLYYATCK 1130 1140 1150 1160 1170 >>CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122 aa) initn: 1236 init1: 342 opt: 1054 Z-score: 555.0 bits: 116.7 E(32554): 1.4e-24 Smith-Waterman score: 1861; 30.2% identity (54.1% similar) in 1222 aa overlap (2-1182:6-1062) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGLLQLLAFSF-LALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTST :.: :: .: :. .:. : :. . : . . . .::. : .. .....: CCDS51 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQ-RPQQQRQSQAHQQRGLFPAV--LNLASNALITTNAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 CGLHKPEPYC-IVSHLQ----EDKKCFICNSQDPYHETLNPDS-HLIENVVTTFAPNRLK :: . :: :: .: :. .. .: ::: ... ::.. : : :.. . . CCDS51 CGEKGPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICN-----QNSSNPNQRHPITNAI-----DGKN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 IWWQS---ENGVEN--VTIQLDLEAEFHFTHLIM-TFKTFRPAAMLIERSSD--FGKTWG :::: .::.: ::: :::. :.....:. . .. ::. ..::: : : : CCDS51 TWWQSPSIKNGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 VYRYFAYDCEASFPGIS-TGP--MKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIED . .: . . ::: . : :..:: : :: :.: .::. . .. . .: CCDS51 YHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADD 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 PYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLL-----DSRME---IREKYYYAVYDMVVRGN : ::.. .. . .:..: ...::. .:. : : . ..:::.: :. : : CCDS51 P-SPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGM 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 CFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSN :.::::: : :.: ... ..: :.::: : .:. : .:. ::: . ... CCDS51 CICYGHARAC-PLDPATNK------SRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKT 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 ACKKCNCNEHSISCHFD-------MAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQ :. :::. .. :..: ... . ..:::: .: .:: : ::: : ... CCDS51 ECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFR 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 HPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFST-GLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKE . : :. : ::: :: :: .: . . :: :.:.:: . : :: : . CCDS51 PKGVSPNYPRPCQPCHCDPIGSLNE-VCVKDEKHARRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCAR 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 GFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSN :. : ::.: :. ::. . .:: : : ::. : : :..: ..:.. CCDS51 GYTGY----P-DCKACNCSGLGS-KNEDPC---FGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQE 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 D-LDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEE : :: : : .:. :..:. :. . :.:.. : CCDS51 DNWKGCDECFC--SGV--------SNRCQSSYWTYGKIQDM--SGWYLTDL--------- 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KB3 ANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEP-QL :: : : :: . : . . .. . .:.:. .. : .: CCDS51 ----PGRIRVAPQ--QDDLDS---PQQISISNAEARQ----ALPHSYYWSAPAPYLGNKL 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 pF1KB3 PDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTV : . ..:. : . .: ..:..: ...: .:.. .. CCDS51 PAVGGQLTFTI---------SYDLEEEEEDTERVLQL-----MIIL-------EGNDLSI 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KB3 RLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCL :..: : ...:. . ::. :. : . . . : CCDS51 S------TAQDEVYLHPSEEHTNVLLLKE----ESFTIHGTHFPVRRK------EFMTVL 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KB3 ENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVG : . :. . . :: .:.. ..... : ::.... . ::: :. .: CCDS51 ANLKRVLLQITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTD--GSIAAAVEV----CQCPPGYTG 680 690 700 710 720 730 810 820 830 840 850 860 pF1KB3 RTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWG .:. : : . ...:.. : :. CCDS51 SSCESCWPR------------HRRVNGTI-------------FGGI-------------- 740 750 870 880 890 900 910 920 pF1KB3 FPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCP :.:::: :::..:: ::::::::.:.: : :..:: :.::.: :... :.:: :: CCDS51 ---CEPCQCFGHAESCDDVTGECLNCKDHTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACP 760 770 780 790 800 810 930 940 950 960 970 pF1KB3 DGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCH . :. .:. .:. : .: : : : :: : ::. :: ::::.:: :::::::::. CCDS51 LNIPSN-NFSPTCHLDR-SLGLICDGCPVGYTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCN 820 830 840 850 860 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB3 NNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALR-QDCRKCVCNYLGTVQE .:.: . : .::. .: :: : : :..:..: ::.:::. ..:. : :: :. .: CCDS51 DNLDFSIPGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYCELCADGYFGDAVDAKNCQPCRCNAGGSFSE 870 880 890 900 910 920 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB3 HCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNE :... :::: : :: :: ::.: .:. : :. :: :::::. : . .:.: CCDS51 VCHSQ-------TGQCECRANVQGQRCDKCKAGTFGLQSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEE 930 940 950 960 970 980 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB3 FTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVE .::: :.:: :. :..: . ... . : ::.:. : .:: .::.:.: .. CCDS51 -SGQCWCQPGVTGKKCDRCAHGYFNFQEGGCTACECSHLG---NNCDPKTGRCICPPNTI 990 1000 1010 1020 1030 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB3 GPRCDKC---TRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGP : .:.:: : :.: . : :. : CCDS51 GEKCSKCAPNTWGHS-ITTGCKACN-CSTVGSLDFQCNVNTGQCNCHPKFSGAKCTECSR 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075 aa) initn: 1152 init1: 338 opt: 1004 Z-score: 529.5 bits: 112.0 E(32554): 3.6e-23 Smith-Waterman score: 1916; 28.3% identity (52.5% similar) in 1525 aa overlap (30-1431:17-1423) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK : . . .:: : .. ..:...::: . CCDS32 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAI--LNLASNAHISTNATCGEKG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB3 PEPYC-IVSHLQ----EDKKCFIC--NSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQ :: .: .: :. .. .: :: :: .: .. .: :: :... . ::: CCDS32 PEMFCKLVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRER--HPISHAIDGTNN---------WWQ 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KB3 S---ENGVEN--VTIQLDLEAEFHFTHLIM-TFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFA : .:: : ::: :::. :. ...:. . .. ::. ..::: : : :.. ..:.: CCDS32 SPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD-GTTFSPWQYYA 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 Y---DCEASFPGIST--GP--MKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPY .: . . .:. :: .. :..:: : :: . : .:: : .: . : CCDS32 VSDSECLSRY-NITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGE-IHTSLINGRPSADDL 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KB3 SPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLD-SRMEIRE-------KYYYAVYDMVVRGNCF ::.. .. . .:... ...::. .:. :. : .: .:::.. :. : : :. CCDS32 SPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCI 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 CYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNAC :::::: : : : ..... :.:.::: : .:. : ::. ::::. ..:.: CCDS32 CYGHASSC-PWDETTKKLQ------CQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTC 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 pF1KB3 KKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVS-------GGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHP . :::.... .:..: .: ... :::: .: .:::: ::: : ::. CCDS32 EACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPH 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 ERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGIC---DSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKE . . . . :. :.:::.:: . ..: : ..:. .: ::: :: . ::.:: :. CCDS32 KVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLS-SVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQL 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 GFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSN :. : . : ::.:::.:. . .:: :: : ::. : :. ::.: : ..:.. CCDS32 GYKDYPT-----CVSCGCNPVGSA-SDEPC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKE 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 -DLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEE . :: : ::. : :: .: : : . .. ... CCDS32 KNPRGCSEC----------FCFGVSDVCSSLSWPVG-QVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQ 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 pF1KB3 ANLGP--GVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPE---GAYLEFFIDNIPYSMEYDILIR- :: ::: . .: :.. :. :: : : : . :.. ::: .. CCDS32 DALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAA----PEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVET 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 pF1KB3 YEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPR--PVCFE . .: .: : . .. : ... : .::.: .:. . : : :. CCDS32 VDSNLMSH---ADVIIKGNGLTLSTQAEG----------LSLQPYEEYLNVVRLVPENFQ 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 pF1KB3 --KGTNYTVRLELPQYTSSDSD--VESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNS .. : .: .. . ... :. . :::: . ... : ::. . 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CCDS32 SVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGF 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1400 1410 1420 1430 pF1KB3 SAA--------AEMTCGTPPG-----ASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVA : ... :. : : : :.. . : . :: .:: CCDS32 SCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCL--NCGDNTAGD 1380 1390 1400 1410 1420 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB3 HNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSN CCDS32 HCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCE 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1786 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:28:12 2016 done: Thu Nov 3 12:28:13 2016 Total Scan time: 4.710 Total Display time: 1.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]