FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3114, 545 aa
1>>>pF1KB3114 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6776+/-0.00132; mu= 16.2981+/- 0.079
mean_var=67.8165+/-13.558, 0's: 0 Z-trim(99.8): 76 B-trim: 180 in 1/49
Lambda= 0.155742
statistics sampled from 5809 (5885) to 5809 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 3525 801.8 0
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 3367 766.3 0
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 3154 718.4 4.9e-207
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 2917 665.2 5.1e-191
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 2364 541.0 1.6e-153
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 2364 541.0 1.8e-153
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 2360 540.1 3.5e-153
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 1980 454.7 1.3e-127
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 1934 444.3 1.6e-124
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 1925 442.3 6.3e-124
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 591 142.6 1.4e-33
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 591 142.6 1.4e-33
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 591 142.6 1.4e-33
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 591 142.6 1.5e-33
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 591 142.6 1.5e-33
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 591 142.6 1.7e-33
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 587 141.6 1.8e-33
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 586 141.4 2.4e-33
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 585 141.2 2.8e-33
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 575 138.9 1.2e-32
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 575 139.0 1.3e-32
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 554 134.3 4.1e-31
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 554 134.3 4.5e-31
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 554 134.3 4.7e-31
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 548 132.9 1.1e-30
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 548 133.0 1.4e-30
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 548 133.0 1.4e-30
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 548 133.0 1.4e-30
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 548 133.0 1.5e-30
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 528 128.4 2e-29
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 528 128.4 2.2e-29
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 528 128.5 2.7e-29
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 528 128.5 2.8e-29
CCDS31754.1 PDE3A gene_id:5139|Hs108|chr12 (1141) 513 125.2 4.2e-28
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 504 123.0 7.3e-28
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 504 123.0 7.7e-28
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 504 123.0 7.8e-28
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 504 123.0 7.8e-28
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 504 123.0 8.2e-28
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 504 123.0 8.2e-28
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 504 123.0 8.4e-28
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 504 123.0 8.7e-28
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 504 123.0 8.8e-28
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 504 123.0 8.9e-28
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 504 123.0 9e-28
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 504 123.0 9.3e-28
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 504 123.0 9.6e-28
CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 920) 457 112.6 2.1e-24
CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 932) 457 112.6 2.2e-24
CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 934) 457 112.6 2.2e-24
>>CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (545 aa)
initn: 3525 init1: 3525 opt: 3525 Z-score: 4280.6 bits: 801.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3525; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DETHS
:::::
CCDS22 DETHS
>>CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (535 aa)
initn: 3367 init1: 3367 opt: 3367 Z-score: 4088.8 bits: 766.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3367; 100.0% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ
490 500 510 520 530
pF1KB3 DETHS
>>CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (519 aa)
initn: 3151 init1: 3151 opt: 3154 Z-score: 3830.4 bits: 718.4 E(32554): 4.9e-207
Smith-Waterman score: 3154; 98.6% identity (98.8% similar) in 497 aa overlap (25-521:9-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
.: :: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDDHVTIRKKHLQRPIFRLRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ
470 480 490 500 510
pF1KB3 DETHS
>>CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 2917 init1: 2917 opt: 2917 Z-score: 3542.9 bits: 665.2 E(32554): 5.1e-191
Smith-Waterman score: 2917; 99.1% identity (99.8% similar) in 453 aa overlap (69-521:35-487)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 VKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLA
.. .::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 INKLFCFNFLVQCFRGKSKPSKCQIRKKVKNHIERLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLA
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 STFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVD
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 KWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPY
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 HNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDV
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 AILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQ
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 IKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAEL
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 GLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVAS
370 380 390 400 410 420
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CCDS54 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE
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: : . ::::.:....::: :: ::.: ::.:. :: ::::::::...:::
CCDS55 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
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CCDS55 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE
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pF1KB3 AADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDF
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CCDS55 TADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDF
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:: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . . : .:..:. . :::..
CCDS55 GSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEAEEKARLAAEEQQK
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pF1KB3 ETHS
:
CCDS55 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK
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pF1KB3 KFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIML
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240 250 260 270 280 290
pF1KB3 HTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAA
.::..: :.:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:..
CCDS88 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
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pF1KB3 YRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAK
.::::..::::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :
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CCDS88 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS
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pF1KB3 QIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSN
::::::::::::::.::: .:: : :: .: ::.... ... .
CCDS88 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQ
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. .. :. .:: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..:
CCDS88 PSLDVEVGDPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPC
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pF1KB3 EEKHDETHS
::.
CCDS88 EEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
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pF1KB3 ATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE
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CCDS53 MANPVPVQRSHLQGPILRLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
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pF1KB3 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA
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CCDS53 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
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pF1KB3 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF
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CCDS53 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL
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pF1KB3 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL
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CCDS53 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL
170 180 190 200 210 220
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pF1KB3 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEE
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CCDS53 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE
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CCDS53 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA
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pF1KB3 ADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFI
::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS53 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI
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pF1KB3 VEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDG
::::::.::: .:: : :: .: ::.... ... . . .. :
CCDS53 VEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQPSLDVEVG
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pF1KB3 SYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKHDETH
. .:: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..: ::.
CCDS53 DPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPCEEEAPPSP
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pF1KB3 S
CCDS53 AEDEHNQNGNLD
510
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pF1KB3 IEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLEAVY
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CCDS73 MVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVY
10 20 30
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