FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3114, 545 aa 1>>>pF1KB3114 545 - 545 aa - 545 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6776+/-0.00132; mu= 16.2981+/- 0.079 mean_var=67.8165+/-13.558, 0's: 0 Z-trim(99.8): 76 B-trim: 180 in 1/49 Lambda= 0.155742 statistics sampled from 5809 (5885) to 5809 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16 Scan time: 3.010 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 3525 801.8 0 CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 3367 766.3 0 CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 3154 718.4 4.9e-207 CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 2917 665.2 5.1e-191 CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 2364 541.0 1.6e-153 CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 2364 541.0 1.8e-153 CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 2360 540.1 3.5e-153 CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 1980 454.7 1.3e-127 CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 1934 444.3 1.6e-124 CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 1925 442.3 6.3e-124 CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 591 142.6 1.4e-33 CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 591 142.6 1.4e-33 CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 591 142.6 1.4e-33 CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 591 142.6 1.5e-33 CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 591 142.6 1.5e-33 CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 591 142.6 1.7e-33 CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 587 141.6 1.8e-33 CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 586 141.4 2.4e-33 CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 585 141.2 2.8e-33 CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 575 138.9 1.2e-32 CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 575 139.0 1.3e-32 CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 554 134.3 4.1e-31 CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 554 134.3 4.5e-31 CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 554 134.3 4.7e-31 CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 548 132.9 1.1e-30 CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 548 133.0 1.4e-30 CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 548 133.0 1.4e-30 CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 548 133.0 1.4e-30 CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 548 133.0 1.5e-30 CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 528 128.4 2e-29 CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 528 128.4 2.2e-29 CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 528 128.5 2.7e-29 CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 528 128.5 2.8e-29 CCDS31754.1 PDE3A gene_id:5139|Hs108|chr12 (1141) 513 125.2 4.2e-28 CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 504 123.0 7.3e-28 CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 504 123.0 7.7e-28 CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 504 123.0 7.8e-28 CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 504 123.0 7.8e-28 CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 504 123.0 8.2e-28 CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 504 123.0 8.2e-28 CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 504 123.0 8.4e-28 CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 504 123.0 8.7e-28 CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 504 123.0 8.8e-28 CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 504 123.0 8.9e-28 CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 504 123.0 9e-28 CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 504 123.0 9.3e-28 CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 504 123.0 9.6e-28 CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 920) 457 112.6 2.1e-24 CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 932) 457 112.6 2.2e-24 CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 934) 457 112.6 2.2e-24 >>CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (545 aa) initn: 3525 init1: 3525 opt: 3525 Z-score: 4280.6 bits: 801.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3525; 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67.7% identity (87.5% similar) in 554 aa overlap (1-542:1-549) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGI---------LRCLVKQLERGDVNVVD : : . ::::.:....::: :: ::.: ::.:. :: ::::::::...::: CCDS54 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKK ::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: .. CCDS54 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS .:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.::::: CCDS54 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV :.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.::::::::: CCDS54 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH ::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::: CCDS54 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE :.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....::::: CCDS54 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS .:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::::::::::::::: CCDS54 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 TMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIAD :::::::.:::::::::::..::: ::::: :::.:.:.. .. :: ..: . .: CCDS54 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNS : .::..: : :.:: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . . : .:.. CCDS54 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEA 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 EDL--VNAEEKHDETHS :. . :::.. : CCDS54 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE 540 550 560 570 580 590 >>CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 (709 aa) initn: 2455 init1: 1467 opt: 2364 Z-score: 2868.9 bits: 541.0 E(32554): 1.8e-153 Smith-Waterman score: 2453; 67.7% identity (87.5% similar) in 554 aa overlap (1-542:1-549) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGI---------LRCLVKQLERGDVNVVD : : . ::::.:....::: :: ::.: ::.:. :: ::::::::...::: CCDS55 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKK ::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: .. CCDS55 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS .:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.::::: CCDS55 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV :.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.::::::::: CCDS55 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH ::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::: CCDS55 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE :.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....::::: CCDS55 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS .:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::::::::::::::: CCDS55 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 TMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIAD :::::::.:::::::::::..::: ::::: :::.:.:.. .. :: ..: . .: CCDS55 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNS : .::..: : :.:: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . . : .:.. CCDS55 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEA 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 EDL--VNAEEKHDETHS :. . :::.. : CCDS55 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE 540 550 560 570 580 590 >>CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 (769 aa) initn: 2355 init1: 1467 opt: 2360 Z-score: 2863.5 bits: 540.1 E(32554): 3.5e-153 Smith-Waterman score: 2360; 69.9% identity (89.6% similar) in 511 aa overlap (35-542:104-609) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 ATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE :: ::::::::...:::::::.::::.::: CCDS55 VHDPRPPEEILADELPQLDSPEVLVKTSFRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVLE 80 90 100 110 120 130 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA .::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: .. .:::.:.::::: CCDS55 SVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFKSIVHA 140 150 160 170 180 190 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF ::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.::::::.:.:::..:::. CCDS55 VQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYELL 200 210 220 230 240 250 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL ::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::::.. .::. .:: CCDS55 TRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANWL 260 270 280 290 300 310 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQE-E :::::.:..:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::.:. : CCDS55 TELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRLLQDDE 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 EMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILH ::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::.:.. :..::.:: CCDS55 EMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLMLH 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 AADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDF .::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::::::::::::::::::::::.::::: CCDS55 TADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDF 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 IVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSD ::::::..::: ::::: :::.:.:.. .. :: ..: . .:: .::..: : :. CCDS55 IVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SDA-KRSGVKTSGSE 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 GSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDL--VNAEEKHD :: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . . : .:..:. . :::.. CCDS55 GSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEAEEKARLAAEEQQK 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 ETHS : CCDS55 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK 610 620 630 640 650 660 >>CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 (536 aa) initn: 2086 init1: 1978 opt: 1980 Z-score: 2404.6 bits: 454.7 E(32554): 1.3e-127 Smith-Waterman score: 2016; 58.3% identity (82.1% similar) in 532 aa overlap (8-539:12-519) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNI .:: . . : . ..::: .:...:: .::::: :..:. .::::. CCDS88 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 EYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKP ::.::.::::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. :::: CCDS88 EYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 KFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSL ::::::::::::::::::.:.:: :: .: .::. ::..: : ::::.::.:. .:.: CCDS88 KFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHAL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 KFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIML . ...::.::..::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..: CCDS88 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 HTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAA .::..: :.:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:.. CCDS88 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 YRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAK .::::..::::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. : CCDS88 FRLMQDDEMNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 TMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQS ..::.:::::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.:::: CCDS88 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 QIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSN ::::::::::::::.::: .:: : :: .: ::.... ... . CCDS88 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQ 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 TKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNA . .. :. .:: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..: CCDS88 PSLDVEVGDPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPC 470 480 490 500 510 540 pF1KB3 EEKHDETHS ::. CCDS88 EEEAPPSPAEDEHNQNGNLD 520 530 >>CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 (516 aa) initn: 2015 init1: 1934 opt: 1934 Z-score: 2349.0 bits: 444.3 E(32554): 1.6e-124 Smith-Waterman score: 1970; 60.0% identity (83.2% similar) in 505 aa overlap (35-539:19-499) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 ATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE :: .::::: :..:. .::::.::.::.:: CCDS53 MANPVPVQRSHLQGPILRLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA ::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. :::::::::::: CCDS53 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF ::::::::::.:.:: :: .: .::. ::..: : ::::.::.:. .:.:. ...::. CCDS53 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL ::..::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:.::..: : CCDS53 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEE .:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:...::::..: CCDS53 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 MNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHA :::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :..::.::: CCDS53 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 ADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFI ::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.:::::::::::: CCDS53 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 VEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDG ::::::.::: .:: : :: .: ::.... ... . . .. : CCDS53 VEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQPSLDVEVG 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 SYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKHDETH . .:: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..: ::. CCDS53 DPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPCEEEAPPSP 460 470 480 490 500 pF1KB3 S CCDS53 AEDEHNQNGNLD 510 >>CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 2003 init1: 1922 opt: 1925 Z-score: 2338.3 bits: 442.3 E(32554): 6.3e-124 Smith-Waterman score: 1961; 60.0% identity (83.3% similar) in 502 aa overlap (38-539:1-478) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 IEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLEAVY .::::: :..:. .::::.::.::.::::: CCDS73 MVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVY 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 IDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQA :::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. ::::::::::::::: CCDS73 IDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHAVQA 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 GIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRY :::::::.:.:: :: .: .::. ::..: : ::::.::.:. .:.:. ...::.::. CCDS73 GIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELLTRH 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 DLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTEL .::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:.::..: :.:. 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CCDS73 TFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQPSLDVEVGDPN 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 PDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKHDETHS :: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..: ::. CCDS73 PD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPCEEEAPPSPAED 440 450 460 470 480 CCDS73 EHNQNGNLD 490 545 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 20:37:28 2016 done: Thu Nov 3 20:37:29 2016 Total Scan time: 3.010 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]