Result of FASTA (omim) for
pF1KB3125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3125, 594 aa
1>>>pF1KB3125 594 - 594 aa - 594 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1905+/-0.000423; mu= 19.5498+/- 0.026
mean_var=66.4141+/-13.304, 0's: 0 Z-trim(111.1): 66 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.157378
statistics sampled from 19490 (19556) to 19490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 6.960
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 3997 916.9 0
XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 3997 916.9 0
NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 594) 3997 916.9 0
XP_016859246 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 395) 2618 603.7 3.6e-172
NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylas ( 585) 2618 603.8 5e-172
NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 ( 585) 2618 603.8 5e-172
NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 493) 1781 413.7 7e-115
XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 520) 1781 413.8 7.4e-115
NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid de ( 520) 1781 413.8 7.4e-115
XP_016861786 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 502) 1732 402.6 1.6e-111
NP_997242 (OMIM: 615601) acidic amino acid decarbo ( 521) 1732 402.6 1.6e-111
NP_038473 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_005246501 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_016859247 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224) 1409 329.1 9.9e-90
XP_016874907 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1116 262.6 1.2e-69
XP_011536753 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1116 262.6 1.2e-69
XP_016861787 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 275) 1100 259.0 1.5e-68
XP_016874906 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1088 256.3 1.1e-67
XP_011536751 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1088 256.3 1.1e-67
XP_016874908 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 368) 1088 256.3 1.3e-67
XP_016874905 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 422) 1088 256.4 1.4e-67
XP_011536744 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 551) 1088 256.4 1.8e-67
NP_001231635 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 260) 1081 254.6 2.9e-67
NP_001076440 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 480) 453 112.2 4e-24
NP_000781 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amino-a ( 480) 453 112.2 4e-24
NP_001229817 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 402) 443 109.9 1.7e-23
NP_001229815 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 442) 439 109.0 3.4e-23
XP_005271802 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 442) 439 109.0 3.4e-23
XP_011513463 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 461) 438 108.8 4.1e-23
NP_002103 (OMIM: 137580,142704) histidine decarbox ( 662) 416 103.9 1.8e-21
NP_001229819 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 338) 362 91.5 5e-18
NP_001293075 (OMIM: 137580,142704) histidine decar ( 629) 354 89.8 2.9e-17
NP_001229816 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 432) 350 88.8 4.1e-17
NP_001229818 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 387) 336 85.6 3.4e-16
XP_016877587 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 553) 233 62.3 4.9e-09
XP_016877586 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 618) 233 62.3 5.4e-09
XP_016877585 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 621) 233 62.3 5.4e-09
XP_016877583 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 697) 233 62.4 5.9e-09
XP_016877588 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 437) 171 48.2 7e-05
XP_016877584 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 664) 171 48.3 9.9e-05
NP_001272379 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 429) 154 44.3 0.001
NP_001310950 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 471) 144 42.1 0.0052
XP_016878554 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 483) 144 42.1 0.0053
NP_001310949 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 497) 144 42.1 0.0055
NP_001272378 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 498) 144 42.1 0.0055
NP_001272377 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 697) 144 42.2 0.0072
XP_016878552 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 708) 144 42.2 0.0073
XP_006720928 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746) 144 42.2 0.0076
XP_016878553 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746) 144 42.2 0.0076
NP_001272374 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 760) 144 42.2 0.0077
>>XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat (594 aa)
initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997 Z-score: 4901.4 bits: 916.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580 590
>>XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat (594 aa)
initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997 Z-score: 4901.4 bits: 916.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
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pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
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310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
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pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580 590
>>NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarboxylas (594 aa)
initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997 Z-score: 4901.4 bits: 916.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
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70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
550 560 570 580 590
>>XP_016859246 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat (395 aa)
initn: 2618 init1: 2618 opt: 2618 Z-score: 3211.9 bits: 603.7 E(85289): 3.6e-172
Smith-Waterman score: 2618; 100.0% identity (100.0% similar) in 395 aa overlap (1-395:1-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
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XP_016 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
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XP_016 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIER
370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
>>NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 (585 aa)
initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618 Z-score: 3209.4 bits: 603.8 E(85289): 5e-172
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (4-594:2-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
..:.:. : .. : . . : : .:: ::. : .: :.:..: .. :.
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10 20 30 40 50
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.. .. : .... .: ... ....... : : ::::: .::. :. :: .:
NP_001 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
..:::.:: :.:::::::.:::.:..::. .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
NP_001 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
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190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
.:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.::
NP_001 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
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pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
. .:::::::::::::::..: ::.:.::::: :::::.:.:. ::::.::.:.::..::
NP_001 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::. .:
NP_001 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
:::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
NP_001 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
.:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
NP_001 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
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pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
.:::::::::: ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .: .: ::::
NP_001 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
NP_001 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
540 550 560 570 580
>>NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 [Ho (585 aa)
initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618 Z-score: 3209.4 bits: 603.8 E(85289): 5e-172
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (4-594:2-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
..:.:. : .. : . . : : .:: ::. : .: :.:..: .. :.
NP_000 MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
.. .. : .... .: ... ....... : : ::::: .::. :. :: .:
NP_000 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
..:::.:: :.:::::::.:::.:..::. .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
NP_000 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
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NP_000 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
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NP_000 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::. .:
NP_000 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
:::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
NP_000 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
.:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
NP_000 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
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NP_000 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
480 490 500 510 520 530
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pF1KB3 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
NP_000 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
540 550 560 570 580
>>NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid dec (493 aa)
initn: 1461 init1: 760 opt: 1781 Z-score: 2183.4 bits: 413.7 E(85289): 7e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:7-493)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
::. :. .:. ::..: .... ..:
NP_001 MADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
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140 150 160 170 180 190
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
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NP_001 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
40 50 60 70 80 90
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pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
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NP_001 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
:.:::::.. :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
NP_001 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
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NP_001 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
:::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.
NP_001 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
:.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.: :.: .:.. . ::.::
NP_001 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
..:.:: ::.:. ::: .:::::..: :::: .::. .:.: :::: .: :.. :
NP_001 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
400 410 420 430 440
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pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
. :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
NP_001 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
450 460 470 480 490
>>XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine sulfin (520 aa)
initn: 1461 init1: 760 opt: 1781 Z-score: 2183.1 bits: 413.8 E(85289): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:34-520)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
::. :. .:. ::..: .... ..:
XP_011 PLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
. : :: ....:..: . .. ::: .. :: .::: :: ...:.:.::::::::::
XP_011 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
.::: .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .::::: ::::: ::
XP_011 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
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XP_011 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
: .::::..: :.: .: :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
XP_011 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
:::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.
XP_011 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
:.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.: :.: .:.. . ::.::
XP_011 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
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XP_011 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590
pF1KB3 TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
. :.::::.: ..::::.:..: : : .:.:::..:.:::::::
XP_011 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
480 490 500 510 520
>>NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid decarb (520 aa)
initn: 1461 init1: 760 opt: 1781 Z-score: 2183.1 bits: 413.8 E(85289): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 1781; 52.4% identity (81.2% similar) in 494 aa overlap (104-594:34-520)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEVV-DILLNY-VRKT
::. :. .:. ::..: .... ..:
NP_057 PLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAIQKG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 FDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQL
. : :: ....:..: . .. ::: .. :: .::: :: ...:.:.::::::::::
NP_057 TSVSQKVCEWKEPEELKQLLD---LELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 STGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSPG
.::: .:::. .: . ::...::::::::::::. .:.:.: .::::: ::::: ::
NP_057 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSS--GDGIFCPG
130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAALGFGTDNVILI
:.:::::.. :::. .:. : .:. ..: :.::::.. ::::.:..: ::.:::.: ..
NP_057 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIADICEKYNLWLH
: .::::..: :.: .: :. .: ::: :.::.:::: :::::.. :::.:....::::
NP_057 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE-KGILQGCNQM
:::::::..:.:. ::: :.::.::.::.:::::.... :::::.:... ...:. :.
NP_057 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 CAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYL
:.:::: :: :::. :::::..::::.:: .:.::::::.: :.: .:.. . ::.::
NP_057 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 YAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG
..:.:: ::.:. ::: .:::::..: :::: .::. .:.: :::: .: :.. :
NP_057 VEEMKKREGFELVM--EPEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
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