FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3191, 589 aa 1>>>pF1KB3191 589 - 589 aa - 589 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7605+/-0.00128; mu= 16.3133+/- 0.077 mean_var=72.3481+/-14.061, 0's: 0 Z-trim(100.7): 45 B-trim: 148 in 1/48 Lambda= 0.150786 statistics sampled from 6178 (6206) to 6178 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16 Scan time: 2.930 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12849.1 PPP2R1A gene_id:5518|Hs108|chr19 ( 589) 3789 834.3 0 CCDS8349.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 ( 601) 3315 731.2 8.7e-211 CCDS8348.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 ( 667) 3301 728.2 7.9e-210 CCDS53706.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 ( 603) 2783 615.5 6e-176 CCDS53707.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 ( 474) 2074 461.2 1.3e-129 CCDS53708.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 ( 556) 1951 434.5 1.7e-121 >>CCDS12849.1 PPP2R1A gene_id:5518|Hs108|chr19 (589 aa) initn: 3789 init1: 3789 opt: 3789 Z-score: 4455.2 bits: 834.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3789; 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CCDS53 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 A CCDS53 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKGPVYQLRGDTRDTLAQLGIAELV 540 550 560 570 580 590 >>CCDS53707.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 (474 aa) initn: 2074 init1: 2074 opt: 2074 Z-score: 2440.4 bits: 461.2 E(32554): 1.3e-129 Smith-Waterman score: 2328; 67.7% identity (75.9% similar) in 588 aa overlap (2-589:14-474) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...:::: CCDS53 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLL------------------ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ CCDS53 ------------------------------------------------------------ 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::::::::::: CCDS53 -------------------------------------------------DSVRLLAVEAC 110 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: CCDS53 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 120 130 140 150 160 170 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: CCDS53 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 180 190 200 210 220 230 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 240 250 260 270 280 290 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : CCDS53 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 300 310 320 330 340 350 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: CCDS53 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 360 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..::.: CCDS53 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVLAL 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 A : CCDS53 A >>CCDS53708.1 PPP2R1B gene_id:5519|Hs108|chr11 (556 aa) initn: 1885 init1: 1836 opt: 1951 Z-score: 2294.7 bits: 434.5 E(32554): 1.7e-121 Smith-Waterman score: 2958; 79.1% identity (89.3% similar) in 588 aa overlap (2-589:14-556) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: CCDS53 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: CCDS53 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: CCDS53 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: CCDS53 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :: CCDS53 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIK----------------- 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ----------------------------CPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : CCDS53 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: CCDS53 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..::.: CCDS53 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVLAL 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 A : CCDS53 A 589 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:30:17 2016 done: Thu Nov 3 12:30:17 2016 Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]