FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3218, 896 aa 1>>>pF1KB3218 896 - 896 aa - 896 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1305+/-0.000531; mu= -9.4053+/- 0.033 mean_var=548.4960+/-116.049, 0's: 0 Z-trim(120.7): 71 B-trim: 466 in 1/60 Lambda= 0.054763 statistics sampled from 36142 (36224) to 36142 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16 Scan time: 13.860 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001972 (OMIM: 600051) epidermal growth factor r ( 896) 5879 480.4 1.7e-134 XP_016856108 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 708) 4654 383.5 2e-105 XP_016856104 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 933) 4473 369.3 4.7e-101 XP_005270675 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 866) 4454 367.8 1.3e-100 XP_016856109 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 658) 4313 356.5 2.4e-97 NP_001153441 (OMIM: 600051) epidermal growth facto ( 582) 3602 300.3 1.8e-80 XP_016856106 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 828) 3215 269.9 3.6e-71 XP_016856107 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 798) 2503 213.6 3e-54 XP_016856105 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 865) 2377 203.7 3.2e-51 XP_016882575 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 926) 1268 116.1 7.9e-25 XP_016882576 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 915) 1262 115.6 1.1e-24 XP_016882580 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 796) 1223 112.5 8.4e-24 XP_016882578 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 845) 1223 112.5 8.7e-24 NP_067058 (OMIM: 616826) epidermal growth factor r ( 864) 1223 112.5 8.9e-24 XP_016882577 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 874) 1223 112.5 8.9e-24 NP_001245303 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 910) 1223 112.5 9.2e-24 XP_016882579 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 797) 1204 111.0 2.4e-23 XP_016882581 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 750) 1202 110.8 2.6e-23 NP_001245304 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 754) 1202 110.8 2.6e-23 NP_001245305 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 601) 1055 99.1 6.9e-20 NP_055416 (OMIM: 605890) EH domain-containing prot ( 543) 347 43.1 0.0045 XP_011543041 (OMIM: 605888) PREDICTED: EH domain-c ( 534) 344 42.8 0.0052 NP_001269373 (OMIM: 605888) EH domain-containing p ( 534) 344 42.8 0.0052 NP_006786 (OMIM: 605888) EH domain-containing prot ( 534) 344 42.8 0.0052 NP_001269374 (OMIM: 605888) EH domain-containing p ( 548) 344 42.9 0.0053 XP_011531108 (OMIM: 605891) PREDICTED: EH domain-c ( 322) 332 41.6 0.0072 XP_016877589 (OMIM: 605892) PREDICTED: EH domain-c ( 453) 332 41.8 0.009 >>NP_001972 (OMIM: 600051) epidermal growth factor recep (896 aa) initn: 5879 init1: 5879 opt: 5879 Z-score: 2535.7 bits: 480.4 E(85289): 1.7e-134 Smith-Waterman score: 5879; 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