Result of FASTA (ccds) for pF1KB3230
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3230, 629 aa
  1>>>pF1KB3230 629 - 629 aa - 629 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6807+/-0.00124; mu= 7.4508+/- 0.074
 mean_var=149.8931+/-31.958, 0's: 0 Z-trim(105.1): 136  B-trim: 161 in 2/51
 Lambda= 0.104757
 statistics sampled from 8090 (8238) to 8090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.253), width:  16
 Scan time:  3.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX           ( 667) 2978 462.9 6.2e-130
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX          ( 705) 2310 362.0 1.6e-99
CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX           ( 228) 1472 235.0 8.6e-62
CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX           ( 540) 1279 206.1   1e-52
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX          ( 735) 1223 197.7 4.7e-50
CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9          ( 497)  457 81.8 2.4e-15
CCDS75870.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9         ( 508)  457 81.8 2.5e-15
CCDS83391.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9         ( 509)  457 81.8 2.5e-15
CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9         ( 530)  452 81.1 4.3e-15
CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15        ( 749)  436 78.7   3e-14
CCDS61738.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15        ( 704)  433 78.3 3.9e-14


>>CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX                (667 aa)
 initn: 2977 init1: 2977 opt: 2978  Z-score: 2446.2  bits: 462.9 E(32554): 6.2e-130
Smith-Waterman score: 4123; 94.3% identity (94.3% similar) in 661 aa overlap (7-629:7-667)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
              130       140       150       160       170       180

                                                    190       200  
pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL
       ::                                      ::::::::::::::::::::
CCDS14 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL
              190       200       210       220       230       240

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB3 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA
              250       260       270       280       290       300

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB3 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD
              310       320       330       340       350       360

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB3 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI
              370       380       390       400       410       420

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB3 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK
              430       440       450       460       470       480

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB3 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR
              490       500       510       520       530       540

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB3 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH
              550       560       570       580       590       600

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB3 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL
              610       620       630       640       650       660

              
pF1KB3 DCTEQLP
       :::::::
CCDS14 DCTEQLP
              

>>CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX               (705 aa)
 initn: 3422 init1: 2308 opt: 2310  Z-score: 1900.3  bits: 362.0 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 3266; 71.2% identity (87.4% similar) in 659 aa overlap (7-627:27-685)

                                   10        20        30        40
pF1KB3                     METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS
                                 :::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS
               10        20        30        40        50        60

               50        60        70        80        90       100
pF1KB3 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
        :...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 SCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLNHRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSES
               70        80        90       100       110       120

              110       120       130       140       150       160
pF1KB3 RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHR
       ::::..  .:  :.:.. ::::.::: .::::::.::::::::.::.::::::::::.::
CCDS14 RRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDPPRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHR
              130       140       150       160       170       180

              170       180                                        
pF1KB3 LIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK--------------------------------------
       :.::.::.:.::. ::.::.::                                      
CCDS14 LVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMYCVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLK
              190       200       210       220       230       240

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB3 QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQII
       :.:: :::::.:::.:::. .::::: ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:
CCDS14 QTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMI
              250       260       270       280       290       300

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB3 GTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVS
       ..:::: :::.:::::::.:::.::.:::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.
CCDS14 AVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCLERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVA
              310       320       330       340       350       360

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB3 MATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
       :::::::::::.::.::.:..::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.::::
CCDS14 MATASSQVLIPDINFNDAFENFALDFSREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTIT
              370       380       390       400       410       420

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB3 VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI
       ::: ::::::. :::::::::::::: .:: ::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS14 VHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQANFISLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTRYI
              430       440       450       460       470       480

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB3 FMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPE
       :.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::::::
CCDS14 FIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKSHTPE
              490       500       510       520       530       540

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB3 RFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRC
       ::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.. ::
CCDS14 RFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWVFSRC
              550       560       570       580       590       600

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB3 NNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPT
       :.:.:::::.::. ..  :::.:.:.::::::. ..:::  ::.::.::::.:  :::::
CCDS14 NSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILPVCPT
              610       620       630       640       650       660

            610       620                           
pF1KB3 FTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP                  
       ::.::: : :..::: :: .:  :.                    
CCDS14 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
              670       680       690       700     

>>CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX                (228 aa)
 initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472  Z-score: 1222.9  bits: 235.0 E(32554): 8.6e-62
Smith-Waterman score: 1472; 98.6% identity (99.5% similar) in 218 aa overlap (1-218:1-218)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :                      
CCDS75 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVELECSVLFPRVAQWG            
              190       200       210       220                    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 IIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITER

>>CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX                (540 aa)
 initn: 2392 init1: 1279 opt: 1279  Z-score: 1059.8  bits: 206.1 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 2395; 81.5% identity (81.5% similar) in 480 aa overlap (1-391:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED
              130       140       150       160       170       180

                                                    190       200  
pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL
       ::                                      ::::::::::::::::::::
CCDS75 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL
              190       200       210       220       230       240

            210                                                    
pF1KB3 LAKLIQTCQHVE------------------------------------------------
       ::::::::::::                                                
CCDS75 LAKLIQTCQHVETVKDQKVIGREKQQYYPRNRRKWVSNSLQARLMGRRCISRRERKLTLD
              250       260       270       280       290       300

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB3 ---VNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEKVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS
              310       320       330       340       350       360

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB3 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE
              370       380       390       400       410       420

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB3 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS
              430       440       450       460       470       480

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB3 LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLD
                                                                   
CCDS75 EYLMAYLFLSLVAFFRLIAFLNLNFKGRQGRKEHTIFIDLSFLNKKVIALTCTTLVKTAG
              490       500       510       520       530       540

>>CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX               (735 aa)
 initn: 3406 init1: 1221 opt: 1223  Z-score: 1012.2  bits: 197.7 E(32554): 4.7e-50
Smith-Waterman score: 2971; 66.8% identity (82.9% similar) in 659 aa overlap (37-627:57-715)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB3 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCRHVITLS
                                     :::: :...::.: ::::::::::.::.:.
CCDS14 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVSSCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLN
         30        40        50        60        70        80      

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB3 QRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDP
       .::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..  .:  :.:.. ::::.:::
CCDS14 HRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDP
         90       100       110       120       130       140      

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB3 AQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK----
        .::::::.::::::::.::.::::::::::.:::.::.::.:.::. ::.::.::    
CCDS14 PRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMY
        150       160       170       180       190       200      

                                              190       200        
pF1KB3 ----------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
                                         :.:: :::::.:::.:::. .:::::
CCDS14 CVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQ
        210       220       230       240       250       260      

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
        ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:..:::: :::.:::::::.:::.::.
CCDS14 ICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCL
        270       280       290       300       310       320      

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
       :::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.:::::::::::.::.::.:..:::::
CCDS14 ERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFENFALDF
        330       340       350       360       370       380      

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQAN
       :::::::: ::::::::::.:::::::::.::::::: ::::::. ::::::::::::::
CCDS14 SREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQAN
        390       400       410       420       430       440      

      390                                     400       410        
pF1KB3 VVS------------------------------LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG
        .:                              : ::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 FISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG
        450       460       470       480       490       500      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB3 TKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKS
       :.:::.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: :::
CCDS14 TRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKS
        510       520       530       540       550       560      

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB3 HTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWA
       ::::::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::.
CCDS14 HTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWV
        570       580       590       600       610       620      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB3 LCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQP
       . :::.:.:::::.::. ..  :::.:.:.::::::. ..:::  ::.::.::::.:  :
CCDS14 FSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILP
        630       640       650       660       670       680      

      600       610       620                           
pF1KB3 VCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP                  
       ::::::.::: : :..::: :: .:  :.                    
CCDS14 VCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH
        690       700       710       720       730     

>>CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9               (497 aa)
 initn: 460 init1: 136 opt: 457  Z-score: 389.0  bits: 81.8 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 739; 31.1% identity (61.9% similar) in 483 aa overlap (179-619:2-471)

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
                                     ...:. :.  ...: ..: :.....  : .
CCDS67                              MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
                                            10        20        30 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
       : . :. :.:   ..: :: : :  :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS67 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
              40        50        60        70        80        90 

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
       : :  :.  : .::  ..  .: ..:..: .::.::.:    : :...  :..  . .::
CCDS67 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
             100       110       120       130         140         

      330       340       350       360       370          380     
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
       :.:...:. : .: .:. : :    : .. ...:: :   .: . ...   : . : : :
CCDS67 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
     150       160       170       180       190       200         

         390       400       410       420        430        440   
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
          :    ..   : :. ::: ..::. ::.  .::. : :.: :.: ... :.:  :.:
CCDS67 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
     210           220       230       240       250       260     

           450       460       470                   480           
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESS------------SKKSHTP----------
       ..  :.:: .:.: .:::  ..  :: : ..            .: : ::          
CCDS67 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSGTPSPKRTSVGSR
         270       280         290       300       310       320   

                     490       500       510        520       530  
pF1KB3 --------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAYKSAPKHEWIGK
               .:::.. :: : :.. :.::.:::::  . .   :..:.:::.  : . .::
CCDS67 PPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAYKTLGKFDQLGK
           330        340       350       360       370       380  

            540            550        560       570       580      
pF1KB3 NSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSI
       ...::  :   :::.     ..::.:   ..  .:  ...:.. :.:.:...:::: .. 
CCDS67 TNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDGGQLSFYDANSKQ
              390       400       410         420       430        

        590       600       610       620                         
pF1KB3 HLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP                
        ::.: . :.::: : : ::   :.. ::. .:                          
CCDS67 LLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGSASSLNNVVTQ
      440       450       460       470       480       490       

>>CCDS75870.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9              (508 aa)
 initn: 460 init1: 136 opt: 457  Z-score: 388.8  bits: 81.8 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 721; 30.6% identity (60.9% similar) in 494 aa overlap (179-619:2-482)

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
                                     ...:. :.  ...: ..: :.....  : .
CCDS75                              MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
                                            10        20        30 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
       : . :. :.:   ..: :: : :  :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS75 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
              40        50        60        70        80        90 

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
       : :  :.  : .::  ..  .: ..:..: .::.::.:    : :...  :..  . .::
CCDS75 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
             100       110       120       130         140         

      330       340       350       360       370          380     
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
       :.:...:. : .: .:. : :    : .. ...:: :   .: . ...   : . : : :
CCDS75 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
     150       160       170       180       190       200         

         390       400       410       420        430        440   
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
          :    ..   : :. ::: ..::. ::.  .::. : :.: :.: ... :.:  :.:
CCDS75 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
     210           220       230       240       250       260     

           450       460       470                           480   
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK--------------------KSHT---
       ..  :.:: .:.: .:::  ..  :: : ...:                    :.::   
CCDS75 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSVHVTSLKKHTSGT
         270       280         290       300       310       320   

                                490       500       510        520 
pF1KB3 P------------------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAY
       :                  .:::.. :: : :.. :.::.:::::  . .   :..:.::
CCDS75 PSPKRTSVGSRPPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAY
           330       340        350       360       370       380  

             530       540            550        560       570     
pF1KB3 KSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNG
       :.  : . .::...::  :   :::.     ..::.:   ..  .:  ...:.. :.:.:
CCDS75 KTLGKFDQLGKTNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDGG
            390         400       410       420         430        

         580       590       600       610       620               
pF1KB3 SIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP      
       ...:::: ..  ::.: . :.::: : : ::   :.. ::. .:                
CCDS75 QLSFYDANSKQLLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGS
      440       450       460       470       480       490        

CCDS75 ASSLNNVVTQ
      500        

>>CCDS83391.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9              (509 aa)
 initn: 460 init1: 136 opt: 457  Z-score: 388.8  bits: 81.8 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 719; 30.5% identity (60.8% similar) in 495 aa overlap (179-619:2-483)

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ
                                     ...:. :.  ...: ..: :.....  : .
CCDS83                              MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH
                                            10        20        30 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI
       : . :. :.:   ..: :: : :  :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .
CCDS83 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL
              40        50        60        70        80        90 

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF
       : :  :.  : .::  ..  .: ..:..: .::.::.:    : :...  :..  . .::
CCDS83 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF
             100       110       120       130         140         

      330       340       350       360       370          380     
pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG
       :.:...:. : .: .:. : :    : .. ...:: :   .: . ...   : . : : :
CCDS83 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG
     150       160       170       180       190       200         

         390       400       410       420        430        440   
pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT
          :    ..   : :. ::: ..::. ::.  .::. : :.: :.: ... :.:  :.:
CCDS83 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET
     210           220       230       240       250       260     

           450       460       470                           480   
pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK--------------------KSHT---
       ..  :.:: .:.: .:::  ..  :: : ...:                    :.::   
CCDS83 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSVHVTSLKKHTRSG
         270       280         290       300       310       320   

                                 490       500       510        520
pF1KB3 -P------------------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLA
        :                  .:::.. :: : :.. :.::.:::::  . .   :..:.:
CCDS83 TPSPKRTSVGSRPPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVA
           330       340        350       360       370       380  

              530       540            550        560       570    
pF1KB3 YKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDN
       ::.  : . .::...::  :   :::.     ..::.:   ..  .:  ...:.. :.:.
CCDS83 YKTLGKFDQLGKTNTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVP--EKIGVFCDFDG
            390         400       410       420         430        

          580       590       600       610       620              
pF1KB3 GSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP     
       :...:::: ..  ::.: . :.::: : : ::   :.. ::. .:               
CCDS83 GQLSFYDANSKQLLYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTG
      440       450       460       470       480       490        

CCDS83 SASSLNNVVTQ
      500         

>>CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9              (530 aa)
 initn: 460 init1: 136 opt: 452  Z-score: 384.5  bits: 81.1 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 735; 30.9% identity (61.8% similar) in 482 aa overlap (181-619:36-504)

              160       170       180       190       200       210
pF1KB3 PNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTC
                                     ... :.  ...: ..: :.....  : .: 
CCDS47 YCFKENENVTVDKACFLISNITIGPESINLQQEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHHTL
          10        20        30        40        50        60     

              220       230       240       250       260       270
pF1KB3 QHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIER
       . :. :.:   ..: :: : :  :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. .: 
CCDS47 KGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNALEN
          70        80        90       100       110       120     

              280       290       300       310       320       330
pF1KB3 SASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSR
       :  :.  : .::  ..  .: ..:..: .::.::.:    : :...  :..  . .:::.
CCDS47 SEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDFSQ
         130       140       150       160       170         180   

              340       350       360       370          380       
pF1KB3 EKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTGQA
       :...:. : .: .:. : :    : .. ...:: :   .: . ...   : . : : :  
CCDS47 ERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDGLP
           190       200       210       220       230       240   

       390       400       410       420        430        440     
pF1KB3 NVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKTNS
        :    ..   : :. ::: ..::. ::.  .::. : :.: :.: ... :.:  :.:..
CCDS47 RV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLETKA
               250       260       270       280       290         

         450       460       470                    480            
pF1KB3 QPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-------------KSHTP-----------
         :.:: .:.: .:::  ..  :: : ...:             .: ::           
CCDS47 LNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGRSGTPSPKRTSVGSRP
     300       310         320       330       340       350       

                    490       500       510        520       530   
pF1KB3 -------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAYKSAPKHEWIGKN
              .:::.. :: : :.. :.::.:::::  . .   :..:.:::.  : . .::.
CCDS47 PAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAYKTLGKFDQLGKT
       360       370        380       390       400       410      

           540            550        560       570       580       
pF1KB3 SASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIH
       ..::  :   :::.     ..::.:   ..  .:.  ..:.. :.:.:...:::: ..  
CCDS47 NTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVPE--KIGVFCDFDGGQLSFYDANSKQL
        420         430       440         450       460       470  

       590       600       610       620                         
pF1KB3 LYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP                
       ::.: . :.::: : : ::   :.. ::. .:                          
CCDS47 LYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGSASSLNNVVTQ
            480       490       500       510       520       530

>>CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15             (749 aa)
 initn: 331 init1: 118 opt: 436  Z-score: 369.2  bits: 78.7 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 440; 23.9% identity (50.7% similar) in 598 aa overlap (123-622:171-746)

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB3 GPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPN
                                     :.. : :.   ::::..      ..:    
CCDS45 GQCQDLREAYRYTHGRASEEYECYVIPEEEDEEEAADVF--CVTCKTP-----IRAF---
              150       160       170         180            190   

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB3 KKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQH
       .: :  :.  : ::       .    :. :.....:. .: :.  :.:..  .: ..   
CCDS45 QKVFDEHKEHEVIP-------LNEALESAKDEIHKNMYKLEKQIIEMENFANHLEEVFIT
              200              210       220       230       240   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB3 VEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSA
       :: : ..:: ..  . . ..: . :. .     . : :  .:. :  :...: . ..   
CCDS45 VEENFGKQEQNFESHYNEILETLAQKYEEKIQALGEKKKEKLEALYGQLVSCGENLDTCK
           250       260       270       280       290       300   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB3 SLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREK
        :.   :.  .: ... :.. :  ...:..    ..  .  ::. .  :.  .::::  .
CCDS45 ELMETIEEMCHE-EKVDFIKDAVAMADRLGKFLKTKTDV--EISAQPEFEDQTLDFSDVE
           310        320       330       340         350       360

            340       350        360                               
pF1KB3 KLLECLDYLTAPNPPTIREEL-CTASYDTITVHWT--SDD--------------------
       .:.  .. . ::. :.:  ..  .:. ... : :.  :::                    
CCDS45 QLMGSINTIPAPSAPVINPQVPNSATGSSVRVCWSLYSDDTVESYQLSYRPVQDSSPGTD
              370       380       390       400       410       420

       370                  380                                    
pF1KB3 --EFSVVSYEL-----------QYTIFTGQAN----------------------------
         ::.:.  :            :: ...   :                            
CCDS45 QAEFTVTVKETYCSVTNLVPNTQYEFWVTAHNRAGPSPSSERAVYMTAPSPPIIKTKEIR
              430       440       450       460       470       480

          390             400             410                420   
pF1KB3 ----VVSLC------NSADSWMI------VPNIKQNHYTVHG---------LQSGTKYIF
           .: .:      : .::. .       :. .    .: :         :: : .::.
CCDS45 SCEEAVLICWESGNLNPVDSYTVELTQAESPEASGVTESVVGIPTCESVVQLQPGRSYII
              490       500       510       520       530       540

           430        440       450       460       470        480 
pF1KB3 MVKAINQAG-SRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-KSHTP
       .:.:.:..: :  :::. ..: .. :.:.  . :  : .:.:.::. :.:  .  .  .:
CCDS45 YVRALNMGGPSVRSEPATVHTIGSYFRLNKDTCHPWLTISEDGLTAVRSERRTPARELSP
              550       560       570       580       590       600

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB3 ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCR
                .: ::..   :.::::: ..    : .:.:. .. :.: .: :  ::  : 
CCDS45 SDTHFTRCVAVMGNLIPVRGHHYWEVEVDEHLDYRVGVAFADVRKQEDLGANCLSW--CM
              610       620       630       640       650          

             550       560             570       580       590     
pF1KB3 CNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLR------RVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAF
        ..    ::. . .  . .: .:      ..::::::......:...  : :::::.  .
CCDS45 RHTFASSRHKYEFLHNRTTPDIRITVPPKKIGILLDYEHSKLSFFNVDLSQHLYTFSCQL
      660       670       680       690       700       710        

         600        610       620         
pF1KB3 AQPVCPTFTVWNK-CLTIITGLPIPDHLDCTEQLP
        . : : :.. .  :: . .:. .: :.       
CCDS45 HEFVHPCFSLEKPGCLKVHNGISMPKHVTFY    
      720       730       740             




629 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 12:36:00 2016 done: Thu Nov  3 12:36:00 2016
 Total Scan time:  3.500 Total Display time:  0.150

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com