FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3230, 629 aa 1>>>pF1KB3230 629 - 629 aa - 629 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6807+/-0.00124; mu= 7.4508+/- 0.074 mean_var=149.8931+/-31.958, 0's: 0 Z-trim(105.1): 136 B-trim: 161 in 2/51 Lambda= 0.104757 statistics sampled from 8090 (8238) to 8090 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 3.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 2978 462.9 6.2e-130 CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 2310 362.0 1.6e-99 CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 228) 1472 235.0 8.6e-62 CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 540) 1279 206.1 1e-52 CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 1223 197.7 4.7e-50 CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 497) 457 81.8 2.4e-15 CCDS75870.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 508) 457 81.8 2.5e-15 CCDS83391.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 509) 457 81.8 2.5e-15 CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 530) 452 81.1 4.3e-15 CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 749) 436 78.7 3e-14 CCDS61738.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 ( 704) 433 78.3 3.9e-14 >>CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (667 aa) initn: 2977 init1: 2977 opt: 2978 Z-score: 2446.2 bits: 462.9 E(32554): 6.2e-130 Smith-Waterman score: 4123; 94.3% identity (94.3% similar) in 661 aa overlap (7-629:7-667) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL :: :::::::::::::::::::: CCDS14 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 LAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFD 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTI 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLK 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGR 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 HYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KB3 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHL 610 620 630 640 650 660 pF1KB3 DCTEQLP ::::::: CCDS14 DCTEQLP >>CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (705 aa) initn: 3422 init1: 2308 opt: 2310 Z-score: 1900.3 bits: 362.0 E(32554): 1.6e-99 Smith-Waterman score: 3266; 71.2% identity (87.4% similar) in 659 aa overlap (7-627:27-685) 10 20 30 40 pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVS :::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS14 MGESPASVVLNASGGLFSLKMETLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 HCATNESVESITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET :...::.: ::::::::::.::.:..::::::::::::::::::::::::::::::::. 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CCDS14 FTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH 670 680 690 700 >>CCDS75953.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (228 aa) initn: 1472 init1: 1472 opt: 1472 Z-score: 1222.9 bits: 235.0 E(32554): 8.6e-62 Smith-Waterman score: 1472; 98.6% identity (99.5% similar) in 218 aa overlap (1-218:1-218) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::.. : CCDS75 EKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQHVELECSVLFPRVAQWG 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 IIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITER >>CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX (540 aa) initn: 2392 init1: 1279 opt: 1279 Z-score: 1059.8 bits: 206.1 E(32554): 1e-52 Smith-Waterman score: 2395; 81.5% identity (81.5% similar) in 480 aa overlap (1-391:1-480) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 HVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 FCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHED 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 EK--------------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETL :: :::::::::::::::::::: CCDS75 EKVNMYCVTDDQLICALCKLVGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETL 190 200 210 220 230 240 210 pF1KB3 LAKLIQTCQHVE------------------------------------------------ :::::::::::: CCDS75 LAKLIQTCQHVETVKDQKVIGREKQQYYPRNRRKWVSNSLQARLMGRRCISRRERKLTLD 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 ---VNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VEKVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERS 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 ASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSRE 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 KKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVS 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLD CCDS75 EYLMAYLFLSLVAFFRLIAFLNLNFKGRQGRKEHTIFIDLSFLNKKVIALTCTTLVKTAG 490 500 510 520 530 540 >>CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX (735 aa) initn: 3406 init1: 1221 opt: 1223 Z-score: 1012.2 bits: 197.7 E(32554): 4.7e-50 Smith-Waterman score: 2971; 66.8% identity (82.9% similar) in 659 aa overlap (37-627:57-715) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVESITAFQCPTCRHVITLS :::: :...::.: ::::::::::.::.:. CCDS14 ELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFSCAHRILVSSCSSGESIEPITAFQCPTCRYVISLN 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 QRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDP .::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. .: :.:.. ::::.::: CCDS14 HRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSESRRERTYRPTTAMSSERIACQFCEQDP 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 AQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEK---- .::::::.::::::::.::.::::::::::.:::.::.::.:.::. ::.::.:: CCDS14 PRDAVKTCITCEVSYCDRCLRATHPNKKPFTSHRLVEPVPDTHLRGITCLDHENEKVNMY 150 160 170 180 190 200 190 200 pF1KB3 ----------------------------------QNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ :.:: :::::.:::.:::. .::::: CCDS14 CVSDDQLICALCKLVGRHRDHQVASLNDRFEKLKQTLEMNLTNLVKRNSELENQMAKLIQ 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI ::.::::.. .:::: :::: :.::::::.:.:..:::: :::.:::::::.:::.::. CCDS14 ICQQVEVNTAMHEAKLMEECDELVEIIQQRKQMIAVKIKETKVMKLRKLAQQVANCRQCL 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF :::. ::.:::: :::::.:::::.::::.:::.:::::::::::.::.::.:..::::: CCDS14 ERSTVLINQAEHILKENDQARFLQSAKNIAERVAMATASSQVLIPDINFNDAFENFALDF 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQAN :::::::: ::::::::::.:::::::::.::::::: ::::::. :::::::::::::: CCDS14 SREKKLLEGLDYLTAPNPPSIREELCTASHDTITVHWISDDEFSISSYELQYTIFTGQAN 390 400 410 420 430 440 390 400 410 pF1KB3 VVS------------------------------LCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG .: : ::.:::::::::::::::::::::: CCDS14 FISKSWCSWGLWPEIRKCKEAVSCSRLAGAPRGLYNSVDSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSG 450 460 470 480 490 500 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 TKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSKKS :.:::.::::::::::.::: .::::::::::::: .:.:::.:.:.: .:.:::: ::: CCDS14 TRYIFIVKAINQAGSRNSEPTRLKTNSQPFKLDPKMTHKKLKISNDGLQMEKDESSLKKS 510 520 530 540 550 560 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 HTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWA ::::::.. : ::.:::.::::: ::::::...:::::::.:::::::.::::::..::. CCDS14 HTPERFSGTGCYGAAGNIFIDSGCHYWEVVMGSSTWYAIGIAYKSAPKNEWIGKNASSWV 570 580 590 600 610 620 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 LCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQP . :::.:.:::::.::. .. :::.:.:.::::::. ..::: ::.::.::::.: : CCDS14 FSRCNSNFVVRHNNKEMLVDVPPHLKRLGVLLDYDNNMLSFYDPANSLHLHTFDVTFILP 630 640 650 660 670 680 600 610 620 pF1KB3 VCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP ::::::.::: : :..::: :: .: :. CCDS14 VCPTFTIWNKSLMILSGLPAPDFIDYPERQECNCRPQESPYVSGMKTCH 690 700 710 720 730 >>CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 (497 aa) initn: 460 init1: 136 opt: 457 Z-score: 389.0 bits: 81.8 E(32554): 2.4e-15 Smith-Waterman score: 739; 31.1% identity (61.9% similar) in 483 aa overlap (179-619:2-471) 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 THPNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQ ...:. :. ...: ..: :..... : . CCDS67 MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLHH 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 TCQHVEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCI : . :. :.: ..: :: : : :... .. . . ::. .. . ..: .::..:.. . 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CCDS83 TLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEVKESMINCIKQEQARKSQELQSQISQCNNAL 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 ERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDF : : :. : .:: .. .: ..:..: .::.::.: : :... :.. . .:: CCDS83 ENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDF 100 110 120 130 140 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 SREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTG :.:...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : : CCDS83 SQERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDG 150 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 QANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKT : .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.: CCDS83 LPRV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLET 210 220 230 240 250 260 450 460 470 480 pF1KB3 NSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK--------------------KSHT--- .. :.:: .:.: .::: .. :: : ...: :.:: CCDS83 KALNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGSVHVTSLKKHTRSG 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 pF1KB3 -P------------------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLA : .:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.: CCDS83 TPSPKRTSVGSRPPAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVA 330 340 350 360 370 380 530 540 550 560 570 pF1KB3 YKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDN ::. : . .::...:: : :::. ..::.: .. .: ...:.. :.:. 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CCDS47 SEELLEFATRSLDIKEPEEFSKAARQIKDRVTMASAFRLSLKPKVS--DNMTHLMVDFSQ 130 140 150 160 170 180 340 350 360 370 380 pF1KB3 EKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTITVHWTSDDEFSVVSY---ELQYTIFTGQA :...:. : .: .:. : : : .. ...:: : .: . ... : . : : : CCDS47 ERQMLQTLKFLPVPKAPEIDPVECLVADNSVTVAWRMPEEDNKIDHFILEHRKTNFDGLP 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 NVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTVHGLQSGTKYI-FMVKAINQA-GSRSSEPGKLKTNS : .. : :. ::: ..::. ::. .::. : :.: :.: ... :.: :.:.. CCDS47 RV----KDERCWEIIDNIKGTEYTLSGLKFDSKYMNFRVRACNKAVAGEYSDPVTLETKA 250 260 270 280 290 450 460 470 480 pF1KB3 QPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-------------KSHTP----------- :.:: .:.: .::: .. :: : ...: .: :: CCDS47 LNFNLDNSSSHLNLKV--EDTCVEWDPTGGKGQESKIKGKENKGRSGTPSPKRTSVGSRP 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 pF1KB3 -------ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTW-YAIGLAYKSAPKHEWIGKN .:::.. :: : :.. :.::.::::: . . :..:.:::. : . .::. CCDS47 PAVRGSRDRFTGE-SYTVLGDTAIESGQHYWEVKAQKDCKSYSVGVAYKTLGKFDQLGKT 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 580 pF1KB3 SASWALCRCNNNWV-----VRHNSKEIPIE-PAPHLRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIH ..:: : :::. ..::.: .. .:. ..:.. :.:.:...:::: .. CCDS47 NTSW--CIHVNNWLQNTFAAKHNNKVKALDVTVPE--KIGVFCDFDGGQLSFYDANSKQL 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 pF1KB3 LYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTIITGLPIPDHLDCTEQLP ::.: . :.::: : : :: :.. ::. .: CCDS47 LYSFKTKFTQPVLPGFMVWCGGLSLSTGMQVPSAVRTLQKSENGMTGSASSLNNVVTQ 480 490 500 510 520 530 >>CCDS45332.1 FSD2 gene_id:123722|Hs108|chr15 (749 aa) initn: 331 init1: 118 opt: 436 Z-score: 369.2 bits: 78.7 E(32554): 3e-14 Smith-Waterman score: 440; 23.9% identity (50.7% similar) in 598 aa overlap (123-622:171-746) 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 GPNSPSETRRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATHPN :.. : :. ::::.. ..: CCDS45 GQCQDLREAYRYTHGRASEEYECYVIPEEEDEEEAADVF--CVTCKTP-----IRAF--- 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 KKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQH .: : :. : :: . :. :.....:. .: :. :.:.. .: .. CCDS45 QKVFDEHKEHEVIP-------LNEALESAKDEIHKNMYKLEKQIIEMENFANHLEEVFIT 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 VEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIANCKQCIERSA :: : ..:: .. . . ..: . :. . . : : .:. : :...: . .. CCDS45 VEENFGKQEQNFESHYNEILETLAQKYEEKIQALGEKKKEKLEALYGQLVSCGENLDTCK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 SLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLIPEINLNDTFDTFALDFSREK :. :. .: ... :.. : ...:.. .. . ::. . :. .:::: . CCDS45 ELMETIEEMCHE-EKVDFIKDAVAMADRLGKFLKTKTDV--EISAQPEFEDQTLDFSDVE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 pF1KB3 KLLECLDYLTAPNPPTIREEL-CTASYDTITVHWT--SDD-------------------- .:. .. . ::. :.: .. .:. ... : :. ::: CCDS45 QLMGSINTIPAPSAPVINPQVPNSATGSSVRVCWSLYSDDTVESYQLSYRPVQDSSPGTD 370 380 390 400 410 420 370 380 pF1KB3 --EFSVVSYEL-----------QYTIFTGQAN---------------------------- ::.:. : :: ... : CCDS45 QAEFTVTVKETYCSVTNLVPNTQYEFWVTAHNRAGPSPSSERAVYMTAPSPPIIKTKEIR 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 pF1KB3 ----VVSLC------NSADSWMI------VPNIKQNHYTVHG---------LQSGTKYIF .: .: : .::. . :. . .: : :: : .::. CCDS45 SCEEAVLICWESGNLNPVDSYTVELTQAESPEASGVTESVVGIPTCESVVQLQPGRSYII 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 MVKAINQAG-SRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVSHDNLTVERDESSSK-KSHTP .:.:.:..: : :::. ..: .. :.:. . : : .:.:.::. :.: . . .: CCDS45 YVRALNMGGPSVRSEPATVHTIGSYFRLNKDTCHPWLTISEDGLTAVRSERRTPARELSP 550 560 570 580 590 600 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 ERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGSTWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCR .: ::.. :.::::: .. : .:.:. .. :.: .: : :: : CCDS45 SDTHFTRCVAVMGNLIPVRGHHYWEVEVDEHLDYRVGVAFADVRKQEDLGANCLSW--CM 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 pF1KB3 CNNNWVVRHNSKEIPIEPAPHLR------RVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAF .. ::. . . . .: .: ..::::::......:... : :::::. . CCDS45 RHTFASSRHKYEFLHNRTTPDIRITVPPKKIGILLDYEHSKLSFFNVDLSQHLYTFSCQL 660 670 680 690 700 710 600 610 620 pF1KB3 AQPVCPTFTVWNK-CLTIITGLPIPDHLDCTEQLP . : : :.. . :: . .:. .: :. CCDS45 HEFVHPCFSLEKPGCLKVHNGISMPKHVTFY 720 730 740 629 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:36:00 2016 done: Thu Nov 3 12:36:00 2016 Total Scan time: 3.500 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]