FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3233, 780 aa 1>>>pF1KB3233 780 - 780 aa - 780 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3496+/-0.00106; mu= 19.4658+/- 0.063 mean_var=59.3320+/-11.407, 0's: 0 Z-trim(101.9): 25 B-trim: 0 in 0/47 Lambda= 0.166506 statistics sampled from 6700 (6714) to 6700 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16 Scan time: 3.840 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 ( 780) 5164 1249.6 0 CCDS53786.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 ( 851) 5164 1249.6 0 CCDS7059.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10 ( 784) 3788 919.0 0 CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21 ( 780) 3761 912.5 0 CCDS55698.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10 ( 776) 3446 836.9 0 >>CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 (780 aa) initn: 5164 init1: 5164 opt: 5164 Z-score: 6694.9 bits: 1249.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5164; 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CCDS70 MDADDSRAPKGSLRKFLEHLSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRMGIYVGAKVYFI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 HEGYQGLVDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGIT .:::::.::::..: :: ::::: .::.:::.::::::. :: :::::.:: ::..:::: CCDS70 YEGYQGMVDGGSNIAEADWESVSSILQVGGTIIGSARCQAFRTREGRLKAACNLLQRGIT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 NLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCG ::::::::::::::. ::.::: :: .: . :.: : . : .:::.::.:::::::::: CCDS70 NLCVIGGDGSLTGANLFRKEWSGLLEELARNGQIDKEAVQKYAYLNVVGMVGSIDNDFCG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 TDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIP ::::::::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::::::::..:.:::::::.: CCDS70 TDMTIGTDSALHRIIEVVDAIMTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALACGADWVFLP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 ECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDT : ::.. :::..: .:::.:.: .::::::::::::: ..:::::: ::.::: .::::: CCDS70 ESPPEEGWEEQMCVKLSENRARKKRLNIIIVAEGAIDTQNKPITSEKIKELVVTQLGYDT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 RVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMEC :::.:::::::::::::::::.::::::::.::::.:::::::::::.::.::::::::: CCDS70 RVTILGHVQRGGTPSAFDRILASRMGVEAVIALLEATPDTPACVVSLNGNHAVRLPLMEC 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KB3 VQVTKDVTKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPP---VSKSGSHTVAVMNV ::.:.:: :::::..:..:..:::::: .: ..:: :: .. : . :.. . :::.:: CCDS70 VQMTQDVQKAMDERRFQDAVRLRGRSFAGNLNTYKRLA-IKLPDDQIPKTNCN-VAVINV 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 GAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLG :::::::::::::.::.:. .:.:.:...:::.:.:::::.: ::. :::::::::: :: CCDS70 GAPAAGMNAAVRSAVRVGIADGHRMLAIYDGFDGFAKGQIKEIGWTDVGGWTGQGGSILG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 TKRTLPKKSFEQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPAT :::.:: : .:.:.... .:..:.:::::::: : ::: .:.. .:.:.:.:..::: CCDS70 TKRVLPGKYLEEIATQMRTHSINALLIIGGFEAYLGLLELSAAREKHEEFCVPMVMVPAT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 VSNNVPGSDFSVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAA :::::::::::.::::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::: CCDS70 VSNNVPGSDFSIGADTALNTITDTCDRIKQSASGTKRRVFIIETMGGYCGYLANMGGLAA 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 GADAAYIFEEPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEG :::::::::::: :::::.:::::..:::::..::::::::.:.::::::::..:::::: CCDS70 GADAAYIFEEPFDIRDLQSNVEHLTEKMKTTIQRGLVLRNESCSENYTTDFIYQLYSEEG 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 KGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSG ::.:: ::::::::::::.:.::::::.::..:.::.:...:.::. :. :. : :: CCDS70 KGVFDCRKNVLGHMQQGGAPSPFDRNFGTKISARAMEWITAKLKEARGRGKKFT-TDDSI 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KB3 CVLGMRKRALVFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLE ::::. :: ..:::::::: :::::::::::::::::::..::::::. . :.:: ..:: CCDS70 CVLGISKRNVIFQPVAELKKQTDFEHRIPKEQWWLKLRPLMKILAKYKASYDVSDSGQLE 720 730 740 750 760 770 770 780 pF1KB3 HITRKRSGEAAV :. CCDS70 HVQPWSV 780 >>CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21 (780 aa) initn: 3744 init1: 2020 opt: 3761 Z-score: 4873.5 bits: 912.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3761; 70.3% identity (91.1% similar) in 761 aa overlap (13-773:13-772) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVD : ::::.::::::::::::::::::.:.::..::.::...:::.:::. CCDS33 MAAVDLEKLRASGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGLVE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 GGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDG ::..::.:.: ::: ..:::::.::::::: : :::: ::::::..:::::::::::: CCDS33 GGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGGDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 SLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS :::::. :::::..:: .: :::.. : :.:::.::::::::::::::::::::: CCDS33 SLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 ALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWE :::::::..:::::::::::::::::::::::::::::..:. ::::.:::: ::.: :: CCDS33 ALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDGWE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 EHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQ . .:.::.:::.:::::::::.::::::.:::::.: .:.:::.:::.::::::::::: CCDS33 NFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGHVQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 RGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTK ::::::::::::.:.::.::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.::.: : CCDS33 RGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEVQK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 AMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR :::.:.:::: .::: :: :::..:::::: .:: :: . ..:..:::::::::::::: CCDS33 AMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKS-NFSLAILNVGAPAAGMNAAVR 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 STVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQ :.:: :. .:. : :::::::::::::..:.:: :.:: :.::: ::::::::: ..:. 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