Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3240, 873 aa
1>>>pF1KB3240 873 - 873 aa - 873 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2681+/-0.0011; mu= 15.3075+/- 0.067
mean_var=191.3232+/-40.033, 0's: 0 Z-trim(109.5): 14 B-trim: 475 in 1/51
Lambda= 0.092724
statistics sampled from 10902 (10907) to 10902 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 ( 873) 5719 778.4 0
CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 ( 837) 600 93.6 1.6e-18
CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 ( 956) 511 81.7 6.8e-15
>>CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 (873 aa)
initn: 5719 init1: 5719 opt: 5719 Z-score: 4146.5 bits: 778.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5719; 100.0% identity (100.0% similar) in 873 aa overlap (1-873:1-873)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASRRKSTTPCMVLASEQDPDLELISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHESVDSDN
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CCDS63 MASRRKSTTPCMVLASEQDPDLELISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHESVDSDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 QQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEH
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CCDS63 QQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVSSSGISISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVSSSGISISK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASESNTSTSIVN
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CCDS63 TPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASESNTSTSIVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 HTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQTCQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQTCQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETSPADESGAPKSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETSPADESGAPKSGS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TGKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TGKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 KWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAERQRRSELGIELFEENEEEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAERQRRSELGIELFEENEEEDE
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB3 VIDDQEEDEEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VIDDQEEDEEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
850 860 870
>>CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 (837 aa)
initn: 1730 init1: 464 opt: 600 Z-score: 445.9 bits: 93.6 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 1887; 39.9% identity (66.4% similar) in 890 aa overlap (1-858:1-811)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
:::.::::::::: .: ::: :. ..: : : .. :. :...::
CCDS63 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
: . ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.:: :::.:::: ::
CCDS63 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
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CCDS63 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
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CCDS63 DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEG---TARLV
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
. .. :..:. . :..:. .:. : ::.::: .:.:. ::.:
CCDS63 TDTAEILSRLGGV--------ELLQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
::.: ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
CCDS63 LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB3 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
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CCDS63 KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
.::.:.:::: .... . .: : : . .: : :: : . ..: :
CCDS63 CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: :: ::. .
CCDS63 KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
:....: ..:. ...... .... .:::.:::::::: :...:. :::
CCDS63 HITSESL------AKDQL----AIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
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CCDS63 KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
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CCDS63 GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
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CCDS63 RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810
pF1KB3 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
:.: .. .:: : : :.::..::.. ..: : ..
CCDS63 ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
730 740 750 760
820 830 840 850 860
pF1KB3 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
: ..:.. : . .:::: . :.: : :.. .: ::.:
CCDS63 KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEE-SSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
770 780 790 800 810 820
870
pF1KB3 SKSDD
CCDS63 LAESDSDCVPAEAGQA
830
>>CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 (956 aa)
initn: 1627 init1: 417 opt: 511 Z-score: 380.8 bits: 81.7 E(32554): 6.8e-15
Smith-Waterman score: 1652; 36.2% identity (61.5% similar) in 940 aa overlap (1-821:1-886)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MASRRKSTTPCMVLASE---QDPDLEL--ISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHES
:::.::::::::. .. :: ..: : ::: : : . : : .... :
CCDS13 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEGPQQDLPPEASAASSEAAQNP--SS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VDSD---NQQNKKVEGG-YECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLT
.:.. : . . ..: : :::: :.. :...:. :..::: . . ..:: :.::.
CCDS13 TDGSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KRYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEV
: ..:: :: : :: .: ...: .:... ::.: . : ... : .:: :..
CCDS13 KTPEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADG---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB3 SSSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPD----REEIVENPSS
.. : :.::::::.::.:.: :.: :. :.:: . .: : . :. :. :
CCDS13 -QAEIIITKTPIMKIMKGKAEAKKI---HTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB3 ----SASESNTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLP-GLAQVIT-----AVSAQQN-----
.. :..:.: .. : ... . : . ::: :.:: .. : ::..
CCDS13 FINGAVPVSQASASSAKNPHAANGPLIGT-VPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 --SNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKI
.. .:::.::..::::::::.:.: .: :...:::::: .:. :.. .:: :::.::
CCDS13 PTAKALPKVMIPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB3 WFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTVHTVPQ-TITVIPTHISTGSNGLPSILQTC-
::.:::::.:.::.:::.:.::.:.:: ....::: ::::. : . ...... ..:.
CCDS13 WFTAQRLKQGISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAAL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 --QIVGQP-----GLVLTQVAGTNTLPVTA-PIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAET
..:::: ::..:: .: : .:. :. :::..::.: .. .. .. :. .
CCDS13 PGHVVGQPEGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAV
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 KPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKI
: ..:: . :. . :. . ::..:::. :: :. .:::: .::. .: :.
CCDS13 KVVNAAQSLLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKV
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KB3 TGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIIIDSSDETTESP----------
:::. :..::::: ::. :: :... . . .: :. ::::: :.. ::
CCDS13 TGLSTREVRKWFSDRRYHCRNLKGSRAM-IPGDHSS-IIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCI
540 550 560 570 580
560 570 580 590 600
pF1KB3 -TVGT--AQP---KQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNRLRAQ
:..: ..: .:::. ::::: :.::.. ::::.:..:: .. . ::::.:::..
CCDS13 PTTATLATHPSAKRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSE
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640
pF1KB3 TKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGE------------------
::.::::::.::.:..: :. :: . .: ::.. .:::.:
CCDS13 TKMTRREIDSWFSERRK-KVNAEETKKAEE-NASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGEN
650 660 670 680 690 700
650 660
pF1KB3 ---------------TSPA----------------------------DESGAPKSGSTGK
.:: :::. ::
CCDS13 GSLEMPSSHILAERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGK
710 720 730 740 750 760
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 I-CKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKW
. :::: .: :.:.. ::.::::: ..::.. ..:: : ..: ::::.::: :::.:::
CCDS13 VSCKKTAQQRHLLRQLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKW
770 780 790 800 810 820
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 YYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKTGT
: : ::: . :.:. . :.
CCDS13 YEDY---------------KRG-------------------------NFPPGLLVIAPGN
830 840
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 -AILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEV
.:.:::. ::.: :.::..: .:..:. .::..::::.
CCDS13 RELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAEKMGEETRAVADTGSEDQGPGT
850 860 870 880 890 900
850 860 870
pF1KB3 IDDQEEDEEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
CCDS13 GELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTSSPQAGRQLETD
910 920 930 940 950
873 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 02:28:06 2016 done: Sat Nov 5 02:28:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]