Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3253
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3253, 621 aa
1>>>pF1KB3253 621 - 621 aa - 621 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7086+/-0.00111; mu= 17.7146+/- 0.067
mean_var=80.9442+/-15.878, 0's: 0 Z-trim(103.7): 30 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.142555
statistics sampled from 7516 (7542) to 7516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 4182 870.4 0
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 2460 516.3 5.2e-146
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 2391 502.1 1e-141
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 1278 273.1 7e-73
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 1278 273.2 7.7e-73
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 1244 266.1 9.3e-71
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 1212 259.6 9.7e-69
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 1212 259.6 9.8e-69
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 1145 245.8 1.2e-64
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 761 167.0 1.3e-40
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 761 167.0 1.3e-40
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 761 167.0 1.3e-40
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 751 164.9 5.4e-40
CCDS78513.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 363) 429 98.4 1.8e-20
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 426 98.2 1e-19
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 391 90.8 7.4e-18
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 394 91.6 9.8e-18
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 375 87.5 6.6e-17
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 372 86.9 1.1e-16
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 313 74.7 4.3e-13
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 313 74.7 4.6e-13
>>CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 (621 aa)
initn: 4182 init1: 4182 opt: 4182 Z-score: 4649.2 bits: 870.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4182; 99.8% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHHIASVEKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHHIASVEKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQNDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQNDSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRIASKPIIVGSSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRIASKPIIVGSSKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVMDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVMDTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVNGTKGLSVNDFYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVNGTKGLSVNDFYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 GLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSYYRT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 GLESSGWLRHIKAVMDAAIFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSYYRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEVSPVFTQFLECVWHLTEQFPQAFEFSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 IKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEVSPVFTQFLECVWHLTEQFPQAFEFSEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQKKYLNPLYSSESHRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQKKYLNPLYSSESHRF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEKDIKDLESKIKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 TVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEKDIKDLESKIKQR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTIEGSSPADNRYSEYAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTIEGSSPADNRYSEYAE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB3 EFSKSEPAVVSLEYGVARMTC
:::::::::::::::::::::
CCDS93 EFSKSEPAVVSLEYGVARMTC
610 620
>>CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 (660 aa)
initn: 2448 init1: 2171 opt: 2460 Z-score: 2734.8 bits: 516.3 E(32554): 5.2e-146
Smith-Waterman score: 2471; 57.3% identity (81.5% similar) in 634 aa overlap (1-621:1-632)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSH---QKETWILHHHIASVE
:::::: :::.:.:.:: : .. .: :::::::::..:... .::::::: .:...:
CCDS34 MEHIRTPKVENVRLVDRVSPKKAAL-GTLYLTATHVIFVENSPDPRKETWILHSQISTIE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 KLALTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQN
: : :..::::.:.::::. ...:.:.::::::.: ::..:.. .:::.:: ::.:: .
CCDS34 KQATTATGCPLLIRCKNFQIIQLIIPQERDCHDVYISLIRLARPVKYEELYCFSFNPMLD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 DSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRIASKPIIVGS
:: ::: ::::.::: :::.:: .:::::.::::..:..:: :::::. :. :::::
CCDS34 KEEREQGWVLIDLSEEYTRMGLPNHYWQLSDVNRDYRVCDSYPTELYVPKSATAHIIVGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVM
:::::. ::::::::..:..:.::: :::::::::::::::..:::: :::: . ..::.
CCDS34 SKFRSRRRFPVLSYYYKDNHASICRSSQPLSGFSARCLEDEQMLQAIRKANPGSDFVYVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVNGTKGLSVND
:::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::.::: :. :..:
CCDS34 DTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIKFQFIGIENIHVMRNSLQKMLEVCELKSPSMSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 FYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSY
: :::.:::::::::.:::..:.:::.. :.::::::::::::::.::::..::::: .
CCDS34 FLWGLENSGWLRHIKAIMDAGIFIAKAVSEEGASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASLLLDPH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 YRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEVSPVFTQFLECVWHLTEQFPQAFEF
:::.::::::::::::::::::..: :.:::::::.:::. ::.::::.: :::: ::::
CCDS34 YRTLKGFMVLIEKDWISFGHKFNHRYGNLDGDPKEISPVIDQFIECVWQLMEQFPCAFEF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 SEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQKKYLNPLYSSES
.: ::..:..::.:::::::: : ::::.:::..:.::::: : ... :::::. ..
CCDS34 NERFLIHIQHHIYSCQFGNFLCNSQKERRELKIQERTYSLWAHLWKNRADYLNPLFRADH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 HRF--TVLEPNT-VSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEKDIKDLE
. :. :.: .: .::: .::..:.. ..::::: . .: ..:...:::.... ::
CCDS34 SQTQGTLHLPTTPCNFMYKFWSGMYNRFEKGMQPRQSVTDYLMAVKEETQQLEEELEALE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTIEGSSPA---
.... .. : . .: .: . ...:: .: . .... . ::.
CCDS34 ERLEKIQKVQLNCTKVKSK-QSEPSKHSGFSTSDNSIANTPQDYSGNMKSFPSRSPSQGD
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KB3 -DNRYSEYAEEFSKSEP---AVVSLEYGVARMTC
:. .....:.: : . : :: ..:
CCDS34 EDSALILTQDNLKSSDPDLSANSDQESGVEDLSCRSPSGGEHAPSEDSGKDRDSDEAVFL
600 610 620 630 640 650
CCDS34 TA
660
>>CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX (704 aa)
initn: 2363 init1: 2086 opt: 2391 Z-score: 2657.7 bits: 502.1 E(32554): 1e-141
Smith-Waterman score: 2391; 59.3% identity (83.8% similar) in 575 aa overlap (1-570:1-572)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSH---QKETWILHHHIASVE
:.:: . :::.:::.::. .:.: .: ::::::::..... .::::: ::::.::
CCDS14 MDHITVPKVENVKLVDRY-VSKKPANGILYLTATHLIYVEASGAARKETWIALHHIATVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 KLALTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQN
:: .:. ::::...:::::..::.. . ::..: :::.::. : :::::::::::..
CCDS14 KLPITSLGCPLTLRCKNFRVAHFVLDSDLVCHEVYISLLKLSQPALPEDLYAFSYNPKSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 DSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRIASKPIIVGS
: .::.::: .. :::.:: .: ..::::.:.:: ::: :. ::. .. .:::
CCDS14 KEMRESGWKLIDPISDFGRMGIPNRNWTITDANRNYEICSTYPPEIVVPKSVTLGTVVGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVM
:::::: : ::::: .....::::::::::::: .::..:: ::.:::..:: ...:::.
CCDS14 SKFRSKERVPVLSYLYKENNAAICRCSQPLSGFYTRCVDDELLLEAISQTNPGSQFMYVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVNGTKGLSVND
::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::::::::::::::::: : ....
CCDS14 DTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYANIRFRFMGIENIHVMRSSLQKLLEVCELKTPTMSE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 FYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSY
: ::::::::::::::.:::..:..::. ::.::::::::::::::.::::..:.::: .
CCDS14 FLSGLESSGWLRHIKAIMDAGIFITKAVKVEKASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASILLDPF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 YRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEVSPVFTQFLECVWHLTEQFPQAFEF
:::.::.:.::::.:::.:::::.:::.:::: :::::.:::::.:.:.: :::: ::::
CCDS14 YRTFKGLMILIEKEWISMGHKFSQRCGHLDGDSKEVSPIFTQFLDCIWQLMEQFPCAFEF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 SEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQKKYLNPLYSSES
.: :::.::.:. :::::::::::::.::.:.. :::.:.::::.. . . ::::.. .
CCDS14 NENFLLEIHDHVFSCQFGNFLGNCQKDREDLRVYEKTHSVWPFLVQRKPDFRNPLYKGFT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 HRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEKDIKDLESKI
. ::.:.:: .:..:: .::..::. :.:.::... ......: .:: :...::.:.
CCDS14 M-YGVLNPSTVPYNIQFWCGMYNRFDKGLQPKQSMLESLLEIKKQRAMLETDVHELEKKL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 KQRKNKQTDGILTKEL--LHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTIEGSSPADNRY
: : . . ..: . : : :: : . : :
CCDS14 KVRDEPPEEICTCSQLGNILSQHLGSP-LTNPLGFMGINGDLNTLMENGTLSREGGLRAQ
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KB3 SEYAEEFSKSEPAVVSLEYGVARMTC
CCDS14 MDQVKSQGADLHHNCCEIVGSLRAINISGDVGISEAMGISGDMCTFEATGFSKDLGICGA
600 610 620 630 640 650
>>CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (571 aa)
initn: 851 init1: 556 opt: 1278 Z-score: 1421.9 bits: 273.1 E(32554): 7e-73
Smith-Waterman score: 1278; 38.2% identity (70.2% similar) in 534 aa overlap (24-546:28-555)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHH---I
.. ::: .: .: : . .. ..: :
CCDS83 MEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB3 ASVEKLALTTS----GCPLVIQCKNFRTVHFI-VPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLY
:::.. ..: . : ::..:...: :. : ..:...:.. . .. ..:
CCDS83 NRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVS-NNLP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 AFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRI
:... :. : .::.: : ::.:.:.:: :... :. :..:.::: : ::
CCDS83 LFAFEYKEVFPE--NGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPAN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 ASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSA-RCLEDEHLLQAISKA
. ..:::.::.::::. : ...:.: :::::. : :. : :::. :::: .
CCDS83 IPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 NPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEV
: .. ....:.::..::.::.: : :::.:: :.: .. :. :.:::::: ::.:: :.
CCDS83 NAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 NGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVC
.. . . :.:::. ::.::: .. .:. .: . ..::.::::::::::.:.
CCDS83 V-YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 SLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQFLECVW
::. :.::.:::::.:: ::.::.:.::::.:. : :. : . .. :::: ::..:::
CCDS83 SLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 HLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQ
..:.::: ::::.: ::. : .:..:: ::.:: : ...: . .: ..: ::: .. .
CCDS83 QMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 KKYLNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQ
. . ::::.: :.. :: : . ....: ..: ... ..:.. . : .. . .
CCDS83 EDFTNPLYGSYSNH--VLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 LEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTI
:.: ...:. .:..:......
CCDS83 LQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
540 550 560 570
>>CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (643 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHH-
.. ::: .: .: : . .. ..:
CCDS83 LAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASL
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100
pF1KB3 --IASVEKLALTTS----GCPLVIQCKNFRTVHFI-VPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYE
: :::.. ..: . : ::..:...: :. : ..:...:.. . .. .
CCDS83 GVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVS-N
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 DLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYV
.: :... :. : .::.: : ::.:.:.:: :... :. :..:.::: : :
CCDS83 NLPLFAFEYKEVFPE--NGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVV
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
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: . ..:::.::.::::. : ...:.: :::::. : :. : :::. ::::
CCDS83 PANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAI
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230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKL
.: .. ....:.::..::.::.: : :::.:: :.: .. :. :.:::::: ::.::
CCDS83 MDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKL
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 LEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTS
:. .. . . :.:::. ::.::: .. .:. .: . ..::.::::::::::.
CCDS83 KEIV-YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTA
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350 360 370 380 390 400
pF1KB3 QVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQFLE
:. ::. :.::.:::::.:: ::.::.:.::::.:. : :. : . .. :::: ::..
CCDS83 QLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFID
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410 420 430 440 450 460
pF1KB3 CVWHLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLL
:::..:.::: ::::.: ::. : .:..:: ::.:: : ...: . .: ..: ::: ..
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470 480 490 500 510 520
pF1KB3 EDQKKYLNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQ
. . . ::::.: :.. :: : . ....: ..: ... ..:.. . : .. .
CCDS83 SQLEDFTNPLYGSYSNH--VLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAK
550 560 570 580 590 600
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pF1KB3 NKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDAL
.:.: ...:. .:..:......
CCDS83 RAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
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>>CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX (603 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHH
: . : .:.: .: . . . . ::
CCDS14 GVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDV
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60 70 80 90 100
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:. .::.. .:: . : : ::..:...: . .: .. .:... : . . :
CCDS14 PLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLA
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110 120 130 140 150 160
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. :.:: . : : ..:: . . .:::.:.:.:: ::... :. :..:.:::
CCDS14 HSLPLFAFLNEEKFN----VDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPAL
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170 180 190 200 210 220
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: :: :: . . :::..:.::::. : .....: :::::: :.:. : .::. :
CCDS14 LVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYL
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230 240 250 260 270 280
pF1KB3 QAISKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSL
..: ..: . ..:.::..::.::.:.: :::..: : : .. :. :.:::::: ::
CCDS14 DVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESL
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 QKLLEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWD
.:. .. .. . . :.:::. ::.::: :. .:. .: .. ..:::::::::::
CCDS14 KKVKDIV-YPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWD
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390
pF1KB3 RTSQVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQ
::.:. ::. :.:::.::.:.:: .:..:.::::::::. : :. : . .. ::.: :
CCDS14 RTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQ
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400 410 420 430 440 450
pF1KB3 FLECVWHLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWP
:..:::....::: ::::.: ::. : .:..::.::.:: ::.. ::. :. :.: :::
CCDS14 FIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWS
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460 470 480 490 500 510
pF1KB3 FLLEDQKKYLNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNM
.. ...:. ::.:..: .: :: : . ....: :.: ... .. .:
CCDS14 LINSNKEKFKNPFYTKEINR--VLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYM
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 NEQNKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVN
CCDS14 ELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
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>>CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (665 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHH-
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CCDS14 LAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMGAVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPL
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100
pF1KB3 --IASVEKLALTTSG---CPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCH-DIYNSLLQLS-KQAKYE
:. :::.. . : : . : ::..:.... .:.. . :...: . . .. .
CCDS14 GVISRVEKIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQ
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110 120 130 140 150 160
pF1KB3 DLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYV
:.::::. : ..::.. : . ::::.:.:: :..: : .:..:.::: . :
CCDS14 ALFAFSYKEK----FPINGWKVYDPVSEYKRQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVV
220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 PRIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFS-ARCLEDEHLLQAI
: .. . . ::.::: ::::. : ...:.: :::::: : . :: :::. ::.:
CCDS14 PTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTI
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKL
:: .. . ..:.: . : .:.. : :::.:. : : .. :. :.:::::: ::.::
CCDS14 MDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKL
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 LEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTS
:. ... . :..... ::..:. .. .:: .: : ..::.::::::::::.
CCDS14 KEIV-YPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTA
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 QVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQFLE
:. ::. :.::::::::::: .:.::.::::::.:. : :. . . .. ::.: ::..
CCDS14 QLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVD
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pF1KB3 CVWHLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLL
:::..:.:::.::::.: ::. : .:..:: ::.:: ::...: . . :: ::: ..
CCDS14 CVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYIN
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pF1KB3 EDQKKYLNPLYSS-ESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNE
. .. ::.. . :.: :: : . ....: :.: ... ..:.. . . . ..
CCDS14 SQLDEFSNPFFVNYENH---VLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLA
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pF1KB3 QNKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDA
.:.: .. :. .. :
CCDS14 VRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSVHTSV
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>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHH-
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CCDS78 LAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMGAVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPL
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pF1KB3 --IASVEKLALTTSG---CPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCH-DIYNSLLQLS-KQAKYE
:. :::.. . : : . : ::..:.... .:.. . :...: . . .. .
CCDS78 GVISRVEKIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQ
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 DLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYV
:.::::. : ..::.. : . ::::.:.:: :..: : .:..:.::: . :
CCDS78 ALFAFSYKEK----FPINGWKVYDPVSEYKRQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVV
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 PRIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFS-ARCLEDEHLLQAI
: .. . . ::.::: ::::. : ...:.: :::::: : . :: :::. ::.:
CCDS78 PTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTI
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKL
:: .. . ..:.: . : .:.. : :::.:. : : .. :. :.:::::: ::.::
CCDS78 MDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 LEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTS
:. ... . :..... ::..:. .. .:: .: : ..::.::::::::::.
CCDS78 KEIV-YPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTA
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pF1KB3 QVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQFLE
:. ::. :.::::::::::: .:.::.::::::.:. : :. . . .. ::.: ::..
CCDS78 QLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVD
460 470 480 490 500 510
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:::..:.:::.::::.: ::. : .:..:: ::.:: ::...: . . :: ::: ..
CCDS78 CVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYIN
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pF1KB3 EDQKKYLNPLYSS-ESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNE
. .. ::.. . :.: :: : . ....: :.: ... ..:.. . . . ..
CCDS78 SQLDEFSNPFFVNYENH---VLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLA
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pF1KB3 QNKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDA
.:.: .. :. .. :
CCDS78 VRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSVHTSV
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>>CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 (549 aa)
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pF1KB3 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQ---KETWILHHHIA
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CCDS59 MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFY---PAVEGTLCLTGHHLI-LSSRQDNTEELWLLHSNID
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pF1KB3 SVEKLALTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNP
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CCDS59 AIDKRFVGSLGT-IIIKCKDFRIIQLDIPGMEECLNIASSIEALSTLDSITLMYPFFYRP
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pF1KB3 KQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRELYVPRIASKPII
. : .::. . .:.. .. .:.:.:: .:... .: .:: . ::. . .
CCDS59 MFEVIE--DGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYVNKEFAVCPSYPPIVTVPKSIDDEAL
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pF1KB3 VGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSAR-CLEDEHLLQAISKANPVNRY
. :: ::::::::::. . .: : .:::.: ..: : :::.:..: .: ..
CCDS59 RKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDEKLINATLRA---GKR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 MYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVNGTKGL
:..::: :. .:: : :.:.: .: . : .:: :... :: ::.:. . .
CCDS59 GYIIDTRSLNVAQQTRAKGGGFEQEAHYPQWRRIHKSIERYHILQESLIKLVEACNDQTH
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 SVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAVFLAKAITVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLL
... . : ::.:.:: ::: .. .: . :. : :.::.:.: ..: : : :: ::....
CCDS59 NMDRWLSKLEASNWLTHIKEILTTACLAAQCIDREGASILIHGTEGTDSTLQVTSLAQII
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 LDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQ---LDGDPKEVSPVFTQFLECVWHLTEQ
:. :::.:: .:::..:.. :: :..::.: . : .::: ::.:::.. .:
CCDS59 LEPRSRTIRGFEALIEREWLQAGHPFQQRCAQSAYCNTKQKWEAPVFLLFLDCVWQILRQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 FPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLEDQK--KY
:: .:::.: ::... :: .. :::.:::: ..:: .:::..::.::: .. . .. :.
CCDS59 FPCSFEFNENFLIMLFEHAYASQFGTFLGNNESERCKLKLQQKTMSLWSWVNQPSELSKF
420 430 440 450 460 470
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pF1KB3 LNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEK
:::. ... :. :... .. .:.... ...:. . . ... ..:. : ::.:.
CCDS59 TNPLFEANN---LVIWPSVAPQSLPLWEGIFLRWNRSSKYLDEAYEEMVNIIEYNKELQA
480 490 500 510 520
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pF1KB3 DIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVNDALRTIEGS
.. :. .. . ... ::.
CCDS59 KVNILRRQLAELETE--DGMQESP
530 540
>>CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KB3 FIDSHQKETWILHHHIASVEKLALTTSGCPLVIQCKNFRTVHFIVPRERDCHDIYNSLLQ
: . ::. .... ..:.. . : .
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