FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3264, 847 aa
1>>>pF1KB3264 847 - 847 aa - 847 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3249+/-0.0013; mu= 6.5372+/- 0.077
mean_var=245.0575+/-52.766, 0's: 0 Z-trim(107.1): 176 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.081929
statistics sampled from 9197 (9377) to 9197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 847) 5737 692.8 6.6e-199
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CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 813) 2416 300.2 9.4e-81
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 2290 285.3 2.9e-76
CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 287) 1914 240.4 3.4e-63
>>CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 (847 aa)
initn: 5737 init1: 5737 opt: 5737 Z-score: 3684.5 bits: 692.8 E(32554): 6.6e-199
Smith-Waterman score: 5737; 99.9% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ALATGIRPFPTEESINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKAE
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CCDS78 EAHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPC
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pF1KB3 VPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIK
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pF1KB3 ILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRA
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pF1KB3 GNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPS
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 TYVEEDE
:::::::
CCDS78 TYVEEDE
>>CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (845 aa)
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Smith-Waterman score: 3429; 58.7% identity (82.6% similar) in 849 aa overlap (1-846:1-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
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CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
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CCDS12 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
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CCDS12 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
130 140 150 160 170
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pF1KB3 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
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CCDS12 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
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CCDS12 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
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pF1KB3 SKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA
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pF1KB3 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
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CCDS12 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
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CCDS12 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM
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pF1KB3 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
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CCDS12 EVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKP
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pF1KB3 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK
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CCDS12 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
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pF1KB3 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG
::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:
CCDS12 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP
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pF1KB3 NRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGW
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CCDS12 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW
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840
pF1KB3 FPSTYVEEDE
::..:::::
CCDS12 FPANYVEEDYSEYC
840
>>CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 (878 aa)
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pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
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CCDS48 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
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CCDS48 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEH--DLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKV
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: ..:: :.: :.::: ::..:: :: .:::.::: .:.::. :. :..
CCDS48 E-VQQPMIRYMQKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADM
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pF1KB3 DSVFINIPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISS
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CCDS48 AAVFINLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNT
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pF1KB3 LDYISKSKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEK
:. . :.:: . :.:::. ....::: :.:::::::::::::::::.::..:... :.
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pF1KB3 ANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITT
.:: ::.::.:::.:.::::::.::::.:..:: :::::. . ::::. :::... .
CCDS48 QQLKEALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRS
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pF1KB3 LDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKK-----WS
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CCDS48 IVNHTKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKSHGKMWS
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pF1KB3 YGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTS
::::::: ::..:..:.:::.:.:.::.::::::.:::.:: :..: :.:.:.:: ..:.
CCDS48 YGFYLIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTN
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pF1KB3 CKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRT
::.:.:.:::::::::.: :::. :::::: . : : :.
CCDS48 CKACKMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPC---------------KFTSPADLD
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pF1KB3 PKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHEGPP-LQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASG
. . :: ::: ...:: :.: : : : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . .
CCDS48 ASGAGPG-PKMVAMQNYHGNPAPP---GKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTR
590 600 610 620 630
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pF1KB3 EVGFFPSDAVKPCPCVPKP---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLV
. :.:::..::::: .: .::. ::.:: ::: :... : .....:::.
CCDS48 KSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLI
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pF1KB3 RHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFR
:.: :. ..:::::.:.:.::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:.
CCDS48 RERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFK
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pF1KB3 TLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNS---------------------------LLSPKV
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CCDS48 QLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPASCASYNFSFLSPQGLSFASQGPSAPFWSVFTPRV
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-GWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE
.: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... :::.::.:::.::::::::::.
CCDS48 IGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGI
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CCDS48 Q
>>CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (823 aa)
initn: 3081 init1: 1631 opt: 2674 Z-score: 1728.0 bits: 330.7 E(32554): 6.3e-90
Smith-Waterman score: 3315; 57.6% identity (80.8% similar) in 849 aa overlap (1-846:1-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
:: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.:::::::::::::: :.:::.:.
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
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CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
: :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::.
CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
.: . .: : : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::
CCDS59 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
: .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: ..
CCDS59 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
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CCDS59 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
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pF1KB3 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
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CCDS59 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
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pF1KB3 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. ::
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CCDS59 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT
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pF1KB3 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM
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CCDS59 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM
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pF1KB3 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
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840
pF1KB3 FPSTYVEEDE
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CCDS59 FPANYVEEDYSEYC
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CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
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CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
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CCDS59 SEPVSMP-------------------------------HFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
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pF1KB3 PELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKS
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CCDS59 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
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CCDS59 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
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CCDS59 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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pF1KB3 ERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQN
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CCDS59 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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CCDS59 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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pF1KB3 VIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPC
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pF1KB3 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
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pF1KB3 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
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CCDS59 IKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-
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pF1KB3 RAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWF
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CCDS59 ----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWF
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840
pF1KB3 PSTYVEEDE
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CCDS59 PANYVEEDYSEYC
810
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pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
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CCDS69 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
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CCDS69 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
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CCDS69 NLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
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CCDS69 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG
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CCDS69 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPC---------------KFTSPADLDASGAGPG-PK
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pF1KB3 MQVIRNYSGTPPPALHEGPP-LQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAV
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CCDS69 KPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERF
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CCDS69 AISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPY
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pF1KB3 KEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-G
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CCDS69 KSRERSASRASSRS--PVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQG
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pF1KB3 WWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE
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CCDS69 WWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
820 830
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pF1KB3 YQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQ
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CCDS44 VIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPC
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pF1KB3 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
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CCDS44 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
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pF1KB3 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
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CCDS44 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
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CCDS44 RAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWF
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pF1KB3 PSTYVEEDE
:::::::::
CCDS44 PSTYVEEDE
280
847 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:05:15 2016 done: Sat Nov 5 01:05:16 2016
Total Scan time: 3.190 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]