Result of FASTA (omim) for
pF1KB3272
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3272, 1265 aa
1>>>pF1KB3272 1265 - 1265 aa - 1265 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6913+/-0.000705; mu= 11.7508+/- 0.043
mean_var=307.0681+/-70.480, 0's: 0 Z-trim(109.9): 333 B-trim: 34 in 1/50
Lambda= 0.073191
statistics sampled from 17775 (18163) to 17775 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 13.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002652 (OMIM: 600220,614468,614878) 1-phosphati (1265) 8502 914.4 0
XP_011527169 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati ( 906) 1745 200.7 3.8e-50
NP_877963 (OMIM: 172420) 1-phosphatidylinositol 4, (1290) 1745 200.9 4.6e-50
NP_002651 (OMIM: 172420) 1-phosphatidylinositol 4, (1291) 1745 200.9 4.6e-50
XP_005260495 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati (1330) 1745 200.9 4.7e-50
XP_011527167 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati (1151) 1217 145.1 2.6e-33
NP_055999 (OMIM: 614276) inactive phospholipase C- (1001) 710 91.5 3.2e-17
XP_016861514 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1001) 710 91.5 3.2e-17
XP_006713136 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1022) 710 91.5 3.2e-17
NP_001137854 (OMIM: 614276) inactive phospholipase (1127) 710 91.5 3.4e-17
XP_016861513 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127) 710 91.5 3.4e-17
XP_016861511 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127) 710 91.5 3.4e-17
XP_016861512 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127) 710 91.5 3.4e-17
NP_588614 (OMIM: 608795) 1-phosphatidylinositol 4, ( 789) 674 87.5 3.9e-16
XP_016862111 (OMIM: 151600,602142) PREDICTED: 1-ph ( 698) 666 86.6 6.5e-16
NP_006216 (OMIM: 151600,602142) 1-phosphatidylinos ( 756) 666 86.6 6.8e-16
NP_001124436 (OMIM: 151600,602142) 1-phosphatidyli ( 777) 666 86.6 6.9e-16
XP_016859829 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph ( 997) 661 86.3 1.1e-15
XP_016859828 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016) 661 86.3 1.2e-15
XP_005246701 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016) 661 86.3 1.2e-15
XP_011509653 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016) 661 86.3 1.2e-15
XP_005246700 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1021) 661 86.3 1.2e-15
NP_006217 (OMIM: 600597) inactive phospholipase C- (1095) 661 86.3 1.2e-15
NP_001124433 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol (1002) 654 85.5 1.9e-15
XP_016861418 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1002) 654 85.5 1.9e-15
XP_016861417 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1014) 654 85.5 1.9e-15
XP_011510869 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1014) 654 85.5 1.9e-15
XP_016861416 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1021) 654 85.6 1.9e-15
NP_055811 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol 4, (1655) 654 85.9 2.5e-15
XP_005247296 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1673) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510867 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510868 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675) 654 85.9 2.6e-15
XP_016861415 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675) 654 85.9 2.6e-15
XP_016861414 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1681) 654 85.9 2.6e-15
XP_016861413 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1684) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510866 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1685) 654 85.9 2.6e-15
NP_001124432 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol (1693) 654 85.9 2.6e-15
XP_016861412 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1704) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510864 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510863 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705) 654 85.9 2.6e-15
XP_005247295 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705) 654 85.9 2.6e-15
XP_011510862 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705) 654 85.9 2.6e-15
XP_016860608 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 675) 641 83.9 4e-15
XP_016860607 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 716) 641 84.0 4.1e-15
NP_116115 (OMIM: 605939) 1-phosphatidylinositol 4, ( 762) 641 84.0 4.3e-15
XP_005246970 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 788) 641 84.0 4.3e-15
XP_016860605 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 794) 641 84.0 4.4e-15
XP_016860604 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820) 641 84.0 4.4e-15
XP_016860603 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820) 641 84.0 4.4e-15
XP_011510314 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820) 641 84.0 4.4e-15
>>NP_002652 (OMIM: 600220,614468,614878) 1-phosphatidyli (1265 aa)
initn: 8502 init1: 8502 opt: 8502 Z-score: 4875.8 bits: 914.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8502; 100.0% identity (100.0% similar) in 1265 aa overlap (1-1265:1-1265)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTTVNVDSLAEYEKSQIKRALELGTVMTVFSFRKSTPERRTVQVIMETRQVAWSKTADK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSTTVNVDSLAEYEKSQIKRALELGTVMTVFSFRKSTPERRTVQVIMETRQVAWSKTADK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 IEGFLDIMEIKEIRPGKNSKDFERAKAVRQKEDCCFTILYGTQFVLSTLSLAADSKEDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IEGFLDIMEIKEIRPGKNSKDFERAKAVRQKEDCCFTILYGTQFVLSTLSLAADSKEDAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NWLSGLKILHQEAMNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLINFKVSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NWLSGLKILHQEAMNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLINFKVSSA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KFLKDKFVEIGAHKDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGNTDRPDASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KFLKDKFVEIGAHKDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGNTDRPDASA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VYLHDFQRFLIHEQQEHWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VYLHDFQRFLIHEQQEHWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IWDEKYDAVDMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSPEAYIRCLRMGCRCIELDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IWDEKYDAVDMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSPEAYIRCLRMGCRCIELDC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 WDGPDGKPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEHCSVEQQRHMAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WDGPDGKPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEHCSVEQQRHMAKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FKEVFGDLLLTKPTEASADQLPSPSQLREKIIIKHKKLGPRGDVDVNMEDKKDEHKQQGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FKEVFGDLLLTKPTEASADQLPSPSQLREKIIIKHKKLGPRGDVDVNMEDKKDEHKQQGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTMEEEVPQDIPPTELHFGEKWFHKKVEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTMEEEVPQDIPPTELHFGEKWFHKKVEKR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 TSAEKLLQEYCMETGGKDGTFLVRESETFPNDYTLSFWRSGRVQHCRIRSTMEGGTLKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TSAEKLLQEYCMETGGKDGTFLVRESETFPNDYTLSFWRSGRVQHCRIRSTMEGGTLKYY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LTDNLTFSSIYALIQHYRETHLRCAEFELRLTDPVPNPNPHESKPWYYDSLSRGEAEDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LTDNLTFSSIYALIQHYRETHLRCAEFELRLTDPVPNPNPHESKPWYYDSLSRGEAEDML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 MRIPRDGAFLIRKREGSDSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVSYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRIPRDGAFLIRKREGSDSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVSYY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 EKHSLYRKMRLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSMPQRTVKALYDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EKHSLYRKMRLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSMPQRTVKALYDY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 KAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISTADFEELEKQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISTADFEELEKQII
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 EDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDRVEELFEWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDRVEELFEWF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 QSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 TKADSIIRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TKADSIIRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 MQMNHALFSLNGRTGYVLQPESMRTEKYDPMPPESQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MQMNHALFSLNGRTGYVLQPESMRTEKYDPMPPESQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 ACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPIWAPTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPIWAPTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEED
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 MFSDPNFLAHATYPIKAVKSGFRSVPLKNGYSEDIELASLLVFCEMRPVLESEEELYSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MFSDPNFLAHATYPIKAVKSGFRSVPLKNGYSEDIELASLLVFCEMRPVLESEEELYSSC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 RQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNANRDALVKEFSVNENQLQLYQEKCNKRLREKRVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNANRDALVKEFSVNENQLQLYQEKCNKRLREKRVSN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 SKFYS
:::::
NP_002 SKFYS
>>XP_011527169 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphatidyli (906 aa)
initn: 2438 init1: 1133 opt: 1745 Z-score: 1021.3 bits: 200.7 E(85289): 3.8e-50
Smith-Waterman score: 3043; 53.0% identity (77.9% similar) in 883 aa overlap (11-866:18-891)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSTTVNVDSLAEYEKSQIKRALELGTVMTVFSFRKST-PERRTVQVIMETRQV
.. : .. :.::.:::::.: .:: :::.: :: .::::.
XP_011 MAGAASPCANGCGPGAPSDAEVLHLCRSLEVGTVMTLFYSKKSQRPERKTFQVKLETRQI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB3 AWSKTADKIEGFLDIMEIKEIRPGKNSKDFERAK---AVRQKEDCCFTILYGTQFVLSTL
.::. :::::: .:: :::::::::.:.::.: . : : .. ::.:::: .: :.::
XP_011 TWSRGADKIEGAIDIREIKEIRPGKTSRDFDRYQEDPAFRPDQSHCFVILYGMEFRLKTL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 SLAADSKEDAVN-WLSGLKILHQEAMNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKT
:: : : :: :: :..:: : .....: :: :: :::::.::::..:.. :: ..::.
XP_011 SLQATS-EDEVNMWIKGLTWLMEDTLQAPTPLQIERWLRKQFYSVDRNREDRISAKDLKN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 ILPLINFKVSSAKFLKDKFVEIGAHKDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVF
.: .:..: . .::....... .. .... :: .:..::. ::.. : . :.
XP_011 MLSQVNYRVPNMRFLRERLTDLEQRSGDITYGQFAQLYRSLMYSAQKTMDLPFLEAST--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 ILGNTDRPDASAVYLHDFQRFLIHEQQEHWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVD
: .::. : : .::.::. : : :: : .:.: : .:. : .:: ::..:.:
XP_011 -LRAGERPELCRVSLPEFQQFLLDYQGELWAVDRLQVQEFMLSFLRDPLREIEEPYFFLD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 EFLTYLFSRENSIWDEKYDAVDMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSPEAYIRC
::.:.:::.:::.:. . ::: . ::::::::::::::::::::::. :::: ::: ::
XP_011 EFVTFLFSKENSVWNSQLDAVCPDTMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQFSSESSLEAYARC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LRMGCRCIELDCWDGPDGKPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEH
:::::::::::::::::: :::::: : ::::::.::...::.::::.: .:::::::.:
XP_011 LRMGCRCIELDCWDGPDGMPVIYHGHTLTTKIKFSDVLHTIKEHAFVASEYPVILSIEDH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 CSVEQQRHMAKAFKEVFGDLLLTKPTEASADQLPSPSQLREKIIIKHKKLGPRG---DVD
::. :::.::. ::.:.:: :::::.: ::: ::::.::..::.::::::. . .:
XP_011 CSIAQQRNMAQYFKKVLGDTLLTKPVEISADGLPSPNQLKRKILIKHKKLAEGSAYEEVP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB3 VNM---EDKKDEHKQQGELYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDI--EQTME-EEVPQ
..: :. .. ..: ::. : ....: :: .....:. .:.. .: : :: :.
XP_011 TSMMYSENDISNSIKNGILYLEDPVNHEWYPHYFVLTSSKIYYSEETSSDQGNEDEEEPK
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 DIPP-TELHFGEKWFHKKV----EKRTSAEKLLQEYCMETGGKDGTFLVRESETFPNDYT
.. :::: .::::: :. . : ::.:: :::.:::. ::.::::::::: .:::
XP_011 EVSSSTELHSNEKWFHGKLGAGRDGRHIAERLLTEYCIETGAPDGSFLVRESETFVGDYT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 LSFWRSGRVQHCRIRSTMEGGTLKYYLTDNLTFSSIYALIQHYRETHLRCAEFELRLTDP
:::::.:.::::::.: ...:: :..:::::.:.:.: :: ::... ::: :::.::..:
XP_011 LSFWRNGKVQHCRIHSRQDAGTPKFFLTDNLVFDSLYDLITHYQQVPLRCNEFEMRLSEP
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 VPNPNPHESKPWYYDSLSRGEAEDMLMRIPRDGAFLIRKREGSDSYAITFRARGKVKHCR
::. : :::: ::. ::.:..:: ::::.:::::::.:::. .::::.:::.::.::::
XP_011 VPQTNAHESKEWYHASLTRAQAEHMLMRVPRDGAFLVRKRNEPNSYAISFRAEGKIKHCR
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NP_001 AITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRENMQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]