Result of FASTA (omim) for
pF1KB3283
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3283, 1189 aa
1>>>pF1KB3283 1189 - 1189 aa - 1189 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9629+/-0.000357; mu= 12.3302+/- 0.022
mean_var=214.5285+/-44.268, 0's: 0 Z-trim(121.9): 93 B-trim: 671 in 1/52
Lambda= 0.087565
statistics sampled from 39025 (39136) to 39025 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16
Scan time: 17.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005135 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1189) 8569 1096.2 0
XP_005273626 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1190) 8557 1094.7 0
NP_060881 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1134) 7754 993.2 0
XP_006716430 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1135) 7742 991.7 0
XP_016865073 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1512) 301 51.8 3.8e-05
XP_005272075 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1561) 301 51.9 3.9e-05
XP_011541791 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1713) 301 51.9 4.2e-05
XP_011541790 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1717) 301 51.9 4.2e-05
NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethyla (1761) 301 51.9 4.2e-05
XP_006712114 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec ( 661) 291 50.2 5.1e-05
XP_016859983 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1036) 291 50.4 7e-05
NP_001140160 (OMIM: 611512) lysine-specific demeth (1321) 291 50.5 8.3e-05
NP_060903 (OMIM: 611512) lysine-specific demethyla (1321) 291 50.5 8.3e-05
XP_016859982 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1321) 291 50.5 8.3e-05
XP_016871388 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252) 246 45.1 0.0062
XP_016871392 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252) 246 45.1 0.0062
NP_001305082 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2252) 246 45.1 0.0062
XP_016871391 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252) 246 45.1 0.0062
XP_016871389 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252) 246 45.1 0.0062
XP_016871390 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252) 246 45.1 0.0062
XP_011537805 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2317) 246 45.1 0.0063
NP_001309187 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2321) 246 45.1 0.0063
NP_001309183 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2321) 246 45.1 0.0063
NP_001269877 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358) 246 45.1 0.0064
XP_016871386 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2358) 246 45.1 0.0064
XP_016871387 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2358) 246 45.1 0.0064
NP_001305083 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358) 246 45.1 0.0064
NP_001309181 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2502) 246 45.1 0.0067
NP_116165 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-cont (2540) 246 45.1 0.0068
>>NP_005135 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysine-s (1189 aa)
initn: 8569 init1: 8569 opt: 8569 Z-score: 5859.6 bits: 1096.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8569; 99.9% identity (99.9% similar) in 1189 aa overlap (1-1189:1-1189)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NLGYQLGPPATPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGDLGPCGKCQEGLEGGASGASEPSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_005 NLGYQLGPPATPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGGLGPCGKCQEGLEGGASGASEPSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQGPAVTEDSPGIPRCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQGPAVTEDSPGIPRCC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQP
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730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 APVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 APVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRLP
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850 860 870 880 890 900
pF1KB3 PPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQA
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910 920 930 940 950 960
pF1KB3 LSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPLP
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pF1KB3 EYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVHA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 DTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGAL
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pF1KB3 EPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KB3 LSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
1150 1160 1170 1180
>>XP_005273626 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) PREDI (1190 aa)
initn: 8555 init1: 4294 opt: 8557 Z-score: 5851.4 bits: 1094.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8557; 99.8% identity (99.8% similar) in 1190 aa overlap (1-1189:1-1190)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
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pF1KB3 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
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pF1KB3 NLGYQLGPPATPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGDLGPCGKCQEGLEGGASGASEPSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
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370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
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pF1KB3 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
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490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
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pF1KB3 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQRE-GQGPAVTEDSPGIPRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_005 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREAGQGPAVTEDSPGIPRC
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pF1KB3 CSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSL
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pF1KB3 MLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQ
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pF1KB3 PSCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMA
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780 790 800 810 820 830
pF1KB3 FAPVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FAPVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRL
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840 850 860 870 880 890
pF1KB3 PPPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQ
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPL
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 PEYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVH
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 ADTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 LEPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB3 FLSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
1150 1160 1170 1180 1190
>>NP_060881 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysine-s (1134 aa)
initn: 7754 init1: 7754 opt: 7754 Z-score: 5303.4 bits: 993.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8049; 95.3% identity (95.3% similar) in 1189 aa overlap (1-1189:1-1134)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
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: . ..:: : :: : . . . :. ...: . : . :: . .
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.. . :::. .. : .. . :.: ..:: .. ..: . :.
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pF1KB3 TPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGDLGPCGKCQEGLEGGASGASE----PSEEVNKAS
:. : :.. : .. : : . . :. . :. .. . :. : : :.. :
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. :: . .. .. :. ::.. : . :. ...: : ..
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.:. :. : : :: .: : : :::.. .. .:.: .:
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pF1KB3 LQDIPCLALPAKLAQCQSC--------AQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLG--GELQQEED
::: :. . .: .:. : . . . ::. . :: . : :. :
XP_016 LQDGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGF
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pF1KB3 TATNSSSEEGPGSG-PDSRLSTGL----AKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQG
. ..:. .. . :.: :. :. .:..:...::..:.:. :.::. .. :
XP_016 LSPQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVE-PHQK
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pF1KB3 PAVTEDSPGIPRCCSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAE
: . :. . :. :. ::: :: : .:. .:. : :. ..: .. .:.. :
XP_016 VAWKRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLR---KSRPRSETEEMGDE
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pF1KB3 E------CTQEAGHAACSLMLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPC--QADARV
: :.. .: .:: ::.. . :: ... .: . :. :...::: . . :
XP_016 EVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSV
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pF1KB3 WAPG-------------DAGQQKESTQKTPPTPQPSCNGDT-HRTKS----IKEETP---
:. .:.. .:.: . : : . . : :. :. : :
XP_016 LRPAVTNGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKT
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pF1KB3 DSA--ETPAEDRAGRGPLPC---PS-----LCELLASTA---------VKLCLGHERIHM
::. .. .: .: : : : :: : .: .. : .. :..: :
XP_016 DSSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKES-HS
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pF1KB3 AF-----------APVTPAL----------------------------------PSDDRI
: .:.:: : : : :
XP_016 PFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGI
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pF1KB3 T-------------------NILDSIIAQVVERKIQEKAL--GPGLRAGPGLRKGLGLPL
:.:: :::.::: : : . .: : . . :
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pF1KB3 SPVRPRLPPP----GALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGT
. . :. : :: :..:. . ....:.: :.:::::::::... :...::
XP_016 NVLDPHTSHSWLCDGRLLCLHDPS--NKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KB3 EALGA-LGGQ-VQALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLH-------
::.. .: : :. .. . :.. ::.:: : .:..:. ..:.
XP_016 EAFSQEFGDQDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KB3 RALGDEDTSRVENLAASLPLPEYCALHGKLNLASYLPPGLALRP-LEPQLWAAYG-VSPH
. . : .: :.: .:::::: :.::::: :: . .:: : :... ::: .. .
XP_016 EDFRDMMPTRFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYF-VRPDLGPKMYNAYGLITAE
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pF1KB3 RGHLGTKNLCVEVADLVSILVHADTPLPAWHRAQKDFLSGLD-GE-----------GLWS
..:: :: ..:.: :...:.. :. . ... :. .: :. : .
XP_016 DRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAH-DEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEK
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pF1KB3 PGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGALEPGA-P---GSCYLDAGLRRRLREE
::. .::.. :.::..::..:. : . : : : ::: ::.:: ::
XP_016 PGA----LWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEE
1370 1380 1390 1400 1410
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.::. :...: :.::..::::::::..: : ..:.. :.::: .: .. :
XP_016 YGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSN
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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:.:: :::.::: : : . .: : . . :
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. . :. : :: :..:. . ....:.: :.:::::::::... :...::
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::.. .: : :. .. . :.. ::.:: : .:..:. ..:.
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. . : .: :.: .:::::: :.::::: :: . .:: : :... ::: .. .
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..:: :: ..:.: :...:.. :. . ... :. .: :. : .
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1189 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:43:32 2016 done: Thu Nov 3 12:43:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]