Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3324, 605 aa
1>>>pF1KB3324 605 - 605 aa - 605 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7695+/-0.0012; mu= 11.0693+/- 0.070
mean_var=129.5059+/-28.296, 0's: 0 Z-trim(105.8): 167 B-trim: 340 in 2/48
Lambda= 0.112701
statistics sampled from 8393 (8612) to 8393 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 605) 4142 685.8 4.1e-197
CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 569) 3790 628.6 6.7e-180
CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 579) 3608 599.0 5.5e-171
CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 542) 3049 508.1 1.2e-143
CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 508) 3026 504.3 1.5e-142
CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 529) 3026 504.3 1.6e-142
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 ( 415) 458 86.7 6.4e-17
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 589) 450 85.5 2.1e-16
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 627) 450 85.6 2.2e-16
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 707) 450 85.6 2.4e-16
CCDS75680.1 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7 ( 248) 386 74.8 1.4e-13
CCDS5925.2 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7 ( 376) 386 75.0 2e-13
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10 ( 800) 378 73.9 8.7e-13
CCDS1581.1 TAF5L gene_id:27097|Hs108|chr1 ( 589) 374 73.2 1.1e-12
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9 ( 334) 369 72.2 1.2e-12
CCDS3108.1 COPB2 gene_id:9276|Hs108|chr3 ( 906) 354 70.1 1.4e-11
CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16 ( 655) 348 69.0 2.2e-11
CCDS45619.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17 ( 752) 339 67.6 6.7e-11
CCDS11291.1 NLE1 gene_id:54475|Hs108|chr17 ( 485) 335 66.8 7.6e-11
CCDS11199.3 FBXW10 gene_id:10517|Hs108|chr17 (1052) 340 67.9 7.8e-11
CCDS73996.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17 ( 714) 337 67.2 8.1e-11
>>CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 (605 aa)
initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142 Z-score: 3652.2 bits: 685.8 E(32554): 4.1e-197
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 TYISR
:::::
CCDS75 TYISR
>>CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 (569 aa)
initn: 3790 init1: 3790 opt: 3790 Z-score: 3343.3 bits: 628.6 E(32554): 6.7e-180
Smith-Waterman score: 3801; 94.0% identity (94.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
:::::::::::::::: ::::::::
CCDS75 MDPAEAVLQEKALKFM------------------------------------NSSEREDC
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 TYISR
:::::
CCDS75 TYISR
>>CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 (579 aa)
initn: 3608 init1: 3608 opt: 3608 Z-score: 3183.3 bits: 599.0 E(32554): 5.5e-171
Smith-Waterman score: 3899; 95.7% identity (95.7% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQ--------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ------------------TYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 TYISR
:::::
CCDS73 TYISR
>>CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 2304 init1: 2160 opt: 3049 Z-score: 2692.4 bits: 508.1 E(32554): 1.2e-143
Smith-Waterman score: 3074; 76.2% identity (85.8% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
:.: ..:...:....:::.::::::::..:..:: .: :: .
CCDS34 MEP-DSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQS------------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
.: :.: :: ...:::::.::
CCDS34 ---------MP---SVR----------------CL--------------QISNGTSSVIV
50
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
..: ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS34 SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.
CCDS34 ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
::.::::: ::::::.: :: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.:::
CCDS34 GLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRS
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
:.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::
CCDS34 ENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGS
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.::::::::::::::::: :::::::
CCDS34 SDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRR
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS34 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPR
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
:::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: : . . :::::::
CCDS34 APASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTY
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TYISR
:::::
CCDS34 TYISR
540
>>CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (508 aa)
initn: 2160 init1: 2160 opt: 3026 Z-score: 2672.6 bits: 504.3 E(32554): 1.5e-142
Smith-Waterman score: 3026; 86.7% identity (94.8% similar) in 503 aa overlap (103-605:8-508)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 KNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEK
:. . . ..:::::.:: ..: ..:.:
CCDS47 MEPDSVIEDKTIELMISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQK
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 EKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHI
::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .:::::
CCDS47 EKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHI
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 AENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYL
::::::::::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: :::
CCDS47 AENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 FKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYD
:::.: :: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.::::::::::
CCDS47 FKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYD
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNT
:.::.::::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 DEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNT
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 GEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVV
::.::::::: ::::::::.::.::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS47 GEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVV
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 DFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::::
CCDS47 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600
pF1KB3 EHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
::::::::::::::::.::::::::::::::: : . . ::::::::::::
CCDS47 EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
460 470 480 490 500
>>CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (529 aa)
initn: 2160 init1: 2160 opt: 3026 Z-score: 2672.4 bits: 504.3 E(32554): 1.6e-142
Smith-Waterman score: 3026; 87.7% identity (95.6% similar) in 496 aa overlap (110-605:36-529)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 YNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVK
...:::::.:: ..: ..:.:::.::.:
CCDS47 VIEDKTIELMNTSVMEDQNEDESPKKNTLWQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIK
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 YFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSY
::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::
CCDS47 YFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSY
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPD
:::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: ::::::.: :
CCDS47 LDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTD
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSG
: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.:::::::::::.::.::
CCDS47 G--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISG
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 LRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTL
::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS47 LRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTL
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 IHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI
::: ::::::::.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI
310 320 330 340 350 360
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 VSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACL
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACL
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 RVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 RVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVF
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600
pF1KB3 RLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
:::::::::.::::::::::::::: : . . ::::::::::::
CCDS47 RLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
490 500 510 520
>>CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 (415 aa)
initn: 406 init1: 128 opt: 458 Z-score: 417.2 bits: 86.7 E(32554): 6.4e-17
Smith-Waterman score: 507; 29.9% identity (64.6% similar) in 291 aa overlap (306-580:137-414)
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 IQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDD---QKIVSGLRDNTIKIWDKNT
:: . ... .::..: :.: :.:. .:
CCDS24 FITGSYDRTCKLWDTASGEELNTLEGHRNVVYAIAFNNPYGDKIATGSFDKTCKLWSVET
110 120 130 140 150 160
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 LECKRILTGHTGSVLCLQYDER--VIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLR
.: . . :::. ..::... . .. ::: :.:...::...:: . :: : .. :
CCDS24 GKCYHTFRGHTAEIVCLSFNPQSTLVATGSMDTTAKLWDIQNGEEVYTLRGHSAEIISLS
170 180 190 200 210 220
400 410 420 430 440
pF1KB3 FNNG--MMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDF--DDKYIVSASGDR
::.. ..: : :....::: . .. .:.:: : .. ..: : . :...: :.
CCDS24 FNTSGDRIITGSFDHTVVVWDADTGRKVN---ILIGHCAEISSASFNWDCSLILTGSMDK
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 TIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGI--ACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEG
: :.:.... . : ::.:: : .:..: .:....:.:.: :... :. :::
CCDS24 TCKLWDATNGKCVATLTGHDDEILDSCFDYTGKLIATASADGTARIFSAATRKCIAKLEG
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 HEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQ
:: . : :. . ....:. : ..:: : .: ::..: :. ..:
CCDS24 HEGEISKISFNPQGNHLLTGSSDKTARIWD--------AQTGQ-CLQVLEGHTDEIFSCA
350 360 370 380 390
570 580 590 600
pF1KB3 FDEFQ---IVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
:. .. ....:.:.: ::
CCDS24 FN-YKGNIVITGSKDNTCRIWR
400 410
>>CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (589 aa)
initn: 1016 init1: 413 opt: 450 Z-score: 408.1 bits: 85.5 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 776; 32.7% identity (63.1% similar) in 447 aa overlap (122-563:102-514)
100 110 120 130 140
pF1KB3 TVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQ
.::. .: . : .:.:..:: ..
CCDS34 VSEYTSTTGLVPCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEK
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 VEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAE
. ...::.. : :. . ..:..:::::. :: ..: .::.:. :.: :
CCDS34 LLALDELIDSCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLP----KELALYVLSFLEPKDLLQAA
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYR
.:. : .. :..::. :. . ... . : .: . ..: : ..: .: :
CCDS34 QTCRYWRILAEDNLLWR---EK-CKEEGIDEPLHIKR---RKVIK--PGFIHSPWKSAY-
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWD
: : . :..::: :. . .. ... .. . :::. ..:::: :::.:.:.
CCDS34 -----IRQ--HRIDTNWRRGELKSPKV-LKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWS
240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 KNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHL
: .: : :.::::.: :. . .::.::.: :..::...::: ..:: : .: .
CCDS34 AVTGKCLRTLVGHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCM
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 RFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIK
.... .:. :.: .. :::. . . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:
CCDS34 HLHEKRVVSGSRDATLRVWDIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVK
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 VWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELV
::. : ..::.:: . ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.
CCDS34 VWDPETETCLHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLT
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 RCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEF
... .. .::: :. .:.::. .: ::.:: .:.. : :::
CCDS34 SGMELKDNILVSGNADSTVKIWDI--------KTGQ-CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKN
470 480 490 500 510
570 580 590 600
pF1KB3 QIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
CCDS34 FVITSSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEET
520 530 540 550 560 570
>>CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (627 aa)
initn: 1016 init1: 413 opt: 450 Z-score: 407.8 bits: 85.6 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 778; 29.7% identity (58.7% similar) in 562 aa overlap (19-563:25-552)
10 20 30 40
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLAD-----SMP--SLRCLYNPGTGA
.: .: : :.. .: .: : :.. .
CCDS37 MCVPRSGLILSCICLYCGVLLPVLLPNLPFLTCLSMSTLESVTYLPEKGLYCQRLPSSRT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LTAFQNSSEREDCNNG-EPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTEN--
. .. . .. : : :.: : . . ..: .: . : .: .: .
CCDS37 HGGTESLKGKNTENMGFYGTLKMIFYKMKRKLDHGSEVRSFSLGKKPCKVSEYTSTTGLV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 -CVAK-TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQVEFVEHLISQM
: : : ... .. .::. .: . : .:.:..:: ... ...::..
CCDS37 PCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 CHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTS
: :. . ..:..:::::. :: . .: .::.:. :.: : .:. : ..
CCDS37 EPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYWRILAE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIE
:..::.. .. . : .:: . . :: ..: .: : : : .
CCDS37 DNLLWREKCKEEGIDEPLH---IKRR---KVI---KPGFIHSPWKSAY------IRQ--H
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 TIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILT
:..::: :. . .. ... .. . :::. ..:::: :::.:.:. : .: : :.
CCDS37 RIDTNWRRGELKSPKV-LKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLV
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 GHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCS
::::.: :. . .::.::.: :..::...::: ..:: : .: ..... .:. :
CCDS37 GHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGS
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 KDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVR
.: .. :::. . . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:::. : ..
CCDS37 RDATLRVWDIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLH
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 TLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIV
::.:: . ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :. ... .. .:
CCDS37 TLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILV
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KB3 SGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTI
:: :. .:.::. .: ::.:: .:.. : :::
CCDS37 SGNADSTVKIWDI--------KTGQ-CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTV
520 530 540 550 560
580 590 600
pF1KB3 LIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
CCDS37 KLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDM
570 580 590 600 610 620
>>CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (707 aa)
initn: 1016 init1: 413 opt: 450 Z-score: 407.0 bits: 85.6 E(32554): 2.4e-16
Smith-Waterman score: 776; 32.7% identity (63.1% similar) in 447 aa overlap (122-563:220-632)
100 110 120 130 140
pF1KB3 TVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQ
.::. .: . : .:.:..:: ..
CCDS37 VSEYTSTTGLVPCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEK
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 VEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAE
. ...::.. : :. . ..:..:::::. :: ..: .::.:. :.: :
CCDS37 LLALDELIDSCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLP----KELALYVLSFLEPKDLLQAA
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYR
.:. : .. :..::. :. . ... . : .: . ..: : ..: .: :
CCDS37 QTCRYWRILAEDNLLWR---EK-CKEEGIDEPLHIKR---RKVIK--PGFIHSPWKSAY-
310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWD
: : . :..::: :. . .. ... .. . :::. ..:::: :::.:.:.
CCDS37 -----IRQ--HRIDTNWRRGELKSPKV-LKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWS
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 KNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHL
: .: : :.::::.: :. . .::.::.: :..::...::: ..:: : .: .
CCDS37 AVTGKCLRTLVGHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCM
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 RFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIK
.... .:. :.: .. :::. . . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:
CCDS37 HLHEKRVVSGSRDATLRVWDIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVK
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 VWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELV
::. : ..::.:: . ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.
CCDS37 VWDPETETCLHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLT
530 540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 RCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEF
... .. .::: :. .:.::. .: ::.:: .:.. : :::
CCDS37 SGMELKDNILVSGNADSTVKIWDI--------KTGQ-CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKN
590 600 610 620 630
570 580 590 600
pF1KB3 QIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
CCDS37 FVITSSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEET
640 650 660 670 680 690
605 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:36:43 2016 done: Sat Nov 5 19:36:44 2016
Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]