FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3338, 1161 aa
1>>>pF1KB3338 1161 - 1161 aa - 1161 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6504+/-0.000466; mu= 20.1886+/- 0.029
mean_var=74.6060+/-15.020, 0's: 0 Z-trim(109.3): 179 B-trim: 453 in 1/54
Lambda= 0.148487
statistics sampled from 17216 (17416) to 17216 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 15.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 7665 1652.6 0
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 7653 1650.1 0
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 7647 1648.8 0
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 6109 1319.3 0
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 5293 1144.5 0
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 4978 1077.0 0
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 4975 1076.4 0
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 4479 970.1 0
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 4467 967.5 0
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 4173 904.5 0
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 3761 816.3 0
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 3749 813.7 0
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 3749 813.7 0
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 3749 813.7 0
XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917) 3657 794.0 0
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 3483 756.7 1.3e-217
XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103) 3236 703.8 1.5e-201
XP_011544156 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 614) 2864 624.0 8.7e-178
XP_006721108 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 613) 2693 587.4 9.3e-167
XP_011544153 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 622) 2689 586.5 1.7e-166
XP_011544150 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 690) 2378 519.9 2.1e-146
XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790) 2378 519.9 2.4e-146
XP_011544147 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 813) 2378 520.0 2.4e-146
XP_011544146 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 998) 2378 520.0 2.9e-146
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 2378 520.0 3.3e-146
XP_011544149 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 778) 2367 517.6 1.2e-145
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 1799 396.0 7.2e-109
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 1776 391.1 2.2e-107
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 1712 377.3 2.7e-103
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 1529 338.1 1.7e-91
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 1506 333.2 5.3e-90
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180) 1443 319.7 6.5e-86
XP_011522125 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1217) 1261 280.8 3.7e-74
XP_011522129 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1163) 1259 280.3 4.7e-74
XP_011522127 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1185) 1256 279.7 7.5e-74
NP_002199 (OMIM: 604682) integrin alpha-E precurso (1179) 1255 279.5 8.7e-74
XP_016880075 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1191) 1255 279.5 8.7e-74
XP_011522130 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1137) 1253 279.0 1.1e-73
XP_016880076 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al ( 848) 1108 247.9 2e-64
NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188) 1101 246.5 7.4e-64
XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086) 1094 245.0 2e-63
XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002) 1062 238.1 2.1e-61
NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024) 1062 238.1 2.2e-61
NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036) 1062 238.1 2.2e-61
XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100) 1062 238.1 2.3e-61
XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105) 1062 238.1 2.3e-61
NP_003628 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isoform (1167) 1062 238.1 2.4e-61
XP_016858111 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1181) 1062 238.1 2.4e-61
XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119) 976 219.7 8.1e-56
XP_016858117 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 796) 956 215.3 1.2e-54
>>NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform 2 pr (1161 aa)
initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665 Z-score: 8867.0 bits: 1652.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7665; 100.0% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KB3 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:::::::::::::::::::::
NP_005 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
1150 1160
>>NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform 1 (1162 aa)
initn: 4356 init1: 4356 opt: 7653 Z-score: 8853.1 bits: 1650.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7653; 99.9% identity (99.9% similar) in 1162 aa overlap (1-1161:1-1162)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQ
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 RDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSI
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 ADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 QEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160
pF1KB3 PEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
::::::::::::::::::::::
NP_001 PEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
1150 1160
>>XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1160 aa)
initn: 5517 init1: 5517 opt: 7647 Z-score: 8846.1 bits: 1648.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7647; 99.9% identity (99.9% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1160)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_011 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQ-QPHQSA
790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160
pF1KB3 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:::::::::::::::::::::
XP_011 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
1140 1150 1160
>>XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1179 aa)
initn: 4840 init1: 3310 opt: 6109 Z-score: 7065.4 bits: 1319.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7609; 98.5% identity (98.5% similar) in 1179 aa overlap (1-1161:1-1179)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KB3 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISR-----------------QEESTKYFNFATSDE
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
XP_011 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRCPVPGLPLGPLAFLYAWQEESTKYFNFATSDE
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 KKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQH
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 SDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 SVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160
pF1KB3 YKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
1150 1160 1170
>>XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1173 aa)
initn: 6709 init1: 4356 opt: 5293 Z-score: 6120.7 bits: 1144.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7621; 99.0% identity (99.0% similar) in 1173 aa overlap (1-1161:1-1173)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB3 M-----------DGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTE
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSLPSPGILSSQDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSD
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 GSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLG
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLG
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 DVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 GGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 GDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIH
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 CETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNC
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 GQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRR
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 VSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLG
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KB3 DRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEA
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 EHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQ
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 ISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEIT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 FDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160
pF1KB3 KRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
1150 1160 1170
>>NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 1 (1169 aa)
initn: 4949 init1: 2496 opt: 4978 Z-score: 5756.1 bits: 1077.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4978; 65.3% identity (84.6% similar) in 1163 aa overlap (2-1159:4-1165)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA
: ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...::
NP_001 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS
:::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.:
NP_001 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG
: : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::..
NP_001 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL
::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .:
NP_001 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ
:: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. .
NP_001 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA
::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::..
NP_001 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN
.: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_001 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV
::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: ::
NP_001 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL
.::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::
NP_001 VIGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ
.::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :.
NP_001 VDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYID
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 KSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL
: : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...:::
NP_001 KRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG
:.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:.
NP_001 PSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP
.::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.... .:::::.: :. .:::
NP_001 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQG
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS
. .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :.
NP_001 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN
.::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.:::
NP_001 VSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNN
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM
:.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:.
NP_001 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY
:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: ::::::::::::::
NP_001 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE
::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.:::
NP_001 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160
pF1KB3 MLEDKPEDTATFSGDDF-SCVAPNVPLS
:.:. . : .: . : .:. :
NP_001 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
1140 1150 1160
>>NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 2 pr (1163 aa)
initn: 4949 init1: 2496 opt: 4975 Z-score: 5752.6 bits: 1076.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4975; 65.7% identity (85.0% similar) in 1151 aa overlap (2-1148:4-1153)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA
: ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...::
NP_000 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS
:::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.:
NP_000 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG
: : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::..
NP_000 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL
::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .:
NP_000 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ
:: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. .
NP_000 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA
::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::..
NP_000 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN
.: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_000 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_000 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV
::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: ::
NP_000 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL
.::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::
NP_000 VIGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ
.::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :.
NP_000 VDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYID
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 KSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL
: : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...:::
NP_000 KRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG
:.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:.
NP_000 PSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP
.::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.... .:::::.: :. .:::
NP_000 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQG
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS
. .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :.
NP_000 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN
.::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.:::
NP_000 VSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNN
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM
:.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:.
NP_000 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY
:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: ::::::::::::::
NP_000 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE
::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.:::
NP_000 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160
pF1KB3 MLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:.:. . : .:
NP_000 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPSEK
1140 1150 1160
>>NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M isofo (1152 aa)
initn: 4326 init1: 2331 opt: 4479 Z-score: 5178.4 bits: 970.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4479; 59.9% identity (82.6% similar) in 1140 aa overlap (6-1138:5-1143)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::..:. ::::::.:. :::.: ::::::::. :::.::::: :.:::::
NP_000 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
: ::.: .:: :.:: :.. :::::::::.:::.:. .:::::::.:..:.::.:
NP_000 RGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 KGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQ
:: :.:.:: . : :.: ::... ::.::::::::: .:: .:: ::..:: :
NP_000 KGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 FEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLF
.. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::.:: : : ::::: :: .::
NP_000 LKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 HHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQE
. :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. :.:::.:::: ::.. .:::
NP_000 NITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTAL
::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.::::. .::::.:::::::::.:.
NP_000 LNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 TMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNL
: .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . ::.:
NP_000 TSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGA
::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.:::::::::::::.:::::.::::
NP_000 VLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA
:::::::::::::::::::::..::::::: ::::.:::::::::::::::: ::: :::
NP_000 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM
::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.::::::::::.::::::::.:::.
NP_000 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK
::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..: .. .. :::.. ::: .::
NP_000 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 SSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLP
:. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: : . ..::: :::::: ::
NP_000 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 DCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGD
.:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .: :::: .:::::::.:..:. :
NP_000 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPH
:..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : :....: ::.:.:: :.:
NP_000 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 QSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRA
: . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. :: .::::. ::.::...:..:
NP_000 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 SASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVN
...:::: ..:. :::::::::::: ... . ::::.:: :..:. . .:.:.:.
NP_000 NVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNF-TASENTSRVMQHQYQVS
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 NLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--CVSERKPPQHSDFLTQISRSP
::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..: : .... :.:::::... ..:
NP_000 NLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAP
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 MLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSV
...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: : .: ....:.::.::: :. ::
NP_000 VVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 YSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYK
.. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.:::::::::.:::::::::.::
NP_000 FTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160
pF1KB3 EMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
.:. .
NP_000 DMMSEGGPPGAEPQ
1140 1150
>>NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M is (1153 aa)
initn: 3564 init1: 1515 opt: 4467 Z-score: 5164.5 bits: 967.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4467; 59.9% identity (82.6% similar) in 1141 aa overlap (6-1138:5-1144)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
::::..:. ::::::.:. :::.: ::::::::. :::.::::: :.:::::
NP_001 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
: ::.: .:: :.:: :.. :::::::::.:::.:. .:::::::.:..:.::.:
NP_001 RGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 KGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQ
:: :.:.:: . : :.: ::... ::.::::::::: .:: .:: ::..:: :
NP_001 KGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 FEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLF
.. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::.:: : : ::::: :: .::
NP_001 LKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 HHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQE
. :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. :.:::.:::: ::.. .:::
NP_001 NITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTAL
::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.::::. .::::.:::::::::.:.
NP_001 LNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 TMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNL
: .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . ::.:
NP_001 TSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGA
::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.:::::::::::::.:::::.::::
NP_001 VLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV
:::::::::::::::::::: :..::::::: ::::.:::::::::::::::: ::: ::
NP_001 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL
:::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.::::::::::.::::::::.:::
NP_001 AIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ
.::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..: .. .. :::.. ::: .:
NP_001 VDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQ
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 KSSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL
::. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: : . ..::: :::::: :
NP_001 KSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG
:.:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .: :::: .:::::::.:..:.
NP_001 PNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP
::..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : :....: ::.:.:: :.:
NP_001 DLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQR
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 HQSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMR
: . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. :: .::::. ::.::...:..
NP_001 SQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 ASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRV
:...:::: ..:. :::::::::::: ... . ::::.:: :..:. . .:.:.:
NP_001 ANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNF-TASENTSRVMQHQYQV
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 NNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--CVSERKPPQHSDFLTQISRS
.::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..: : .... :.:::::... ..
NP_001 SNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKA
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 PMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTS
:...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: : .: ....:.::.::: :. :
NP_001 PVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 VYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHY
:.. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.:::::::::.:::::::::.:
NP_001 VFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQY
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160
pF1KB3 KEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
:.:. .
NP_001 KDMMSEGGPPGAEPQ
1140 1150
>>XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: integrin (1091 aa)
initn: 3255 init1: 1515 opt: 4173 Z-score: 4824.5 bits: 904.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4173; 59.4% identity (82.4% similar) in 1076 aa overlap (72-1138:8-1082)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 FGGSRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRP-EAVNMSLGLTLAASTNG
:. .:: . : :::::::::.:::.:.
XP_011 MRAHPPAGVTMPISVPAVPVEAVNMSLGLSLAATTSP
10 20 30
110 120 130 140 150
pF1KB3 SRLLACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSG
.:::::::.:..:.::.: :: :.:.:: . : :.: ::... ::.:::::::
XP_011 PQLLACGPTVHQTCSENTYVKGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSG
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 SIDQNDFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIV
:: .:: .:: ::..:: :.. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::.
XP_011 SIIPHDFRRMKEFVSTVMEQLKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPIT
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 QLKGLTFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAG
:: : : ::::: :: .::. :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. :
XP_011 QLLGRTHTATGIRKVVRELFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREG
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 IIRYAIGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQ
.:::.:::: ::.. .:::::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.::::
XP_011 VIRYVIGVGDAFRSEKSRQELNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQ
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SRASSSFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDM
. .::::.:::::::::.:.: .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . ::
XP_011 TGSSSSFEHEMSQEGFSAAITSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDM
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 RDSYLGYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGA
:.::::.. . : . ::.:::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.::::
XP_011 NDAYLGYAAAIILRNRVQSLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGA
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 SLCSVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWG
:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::: :..::::::: ::::.:::
XP_011 SLCSVDVDSNGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWG
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 RFGAALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSP
::::::::::::: ::: :::::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.:::
XP_011 RFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSP
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 RLQYFGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRC
:::::::.::::::::.:::.::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..:
XP_011 RLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFEC
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 WEEKPSALEAGDATVCLTIQKSSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPT
.. .. :::.. ::: .:::. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: :
XP_011 NDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNST
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 LTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQD
. ..::: :::::: ::.:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .:
XP_011 RRQTQVLGLTQTCETLKLQLPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQR
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 LFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVV
:::: .:::::::.:..:. ::..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : :
XP_011 LFTALFPFEKNCGNDNICQDDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQV
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 SLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGT
....: ::.:.:: :.: : . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. :
XP_011 TFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVT
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910 920 930
pF1KB3 FIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKY
: .::::. ::.::...:..:...:::: ..:. :::::::::::: ... . ::::
XP_011 FNITFDVDSKASLGNKLLLKANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKY
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 FNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--
.:: :..:. . .:.:.:.::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..:
XP_011 LNF-TASENTSRVMQHQYQVSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSST
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 CVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVR
: .... :.:::::... ..:...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: :
XP_011 CHTKERLPSHSDFLAELRKAPVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYI
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 ETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGAL
.: ....:.::.::: :. ::.. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.:
XP_011 KTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 LLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
::::::::.:::::::::.::.:. .
XP_011 LLLALITAALYKLGFFKRQYKDMMSEGGPPGAEPQ
1060 1070 1080 1090
1161 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:56:36 2016 done: Thu Nov 3 12:56:38 2016
Total Scan time: 15.880 Total Display time: 0.540
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]