FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3338, 1161 aa 1>>>pF1KB3338 1161 - 1161 aa - 1161 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6504+/-0.000466; mu= 20.1886+/- 0.029 mean_var=74.6060+/-15.020, 0's: 0 Z-trim(109.3): 179 B-trim: 453 in 1/54 Lambda= 0.148487 statistics sampled from 17216 (17416) to 17216 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 15.880 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 7665 1652.6 0 NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 7653 1650.1 0 XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 7647 1648.8 0 XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 6109 1319.3 0 XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 5293 1144.5 0 NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 4978 1077.0 0 NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 4975 1076.4 0 NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 4479 970.1 0 NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 4467 967.5 0 XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 4173 904.5 0 XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 3761 816.3 0 XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 3749 813.7 0 XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 3749 813.7 0 XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 3749 813.7 0 XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917) 3657 794.0 0 XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 3483 756.7 1.3e-217 XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103) 3236 703.8 1.5e-201 XP_011544156 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 614) 2864 624.0 8.7e-178 XP_006721108 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 613) 2693 587.4 9.3e-167 XP_011544153 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 622) 2689 586.5 1.7e-166 XP_011544150 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 690) 2378 519.9 2.1e-146 XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790) 2378 519.9 2.4e-146 XP_011544147 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 813) 2378 520.0 2.4e-146 XP_011544146 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 998) 2378 520.0 2.9e-146 XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 2378 520.0 3.3e-146 XP_011544149 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 778) 2367 517.6 1.2e-145 NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 1799 396.0 7.2e-109 XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 1776 391.1 2.2e-107 XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 1712 377.3 2.7e-103 XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 1529 338.1 1.7e-91 NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 1506 333.2 5.3e-90 XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180) 1443 319.7 6.5e-86 XP_011522125 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1217) 1261 280.8 3.7e-74 XP_011522129 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1163) 1259 280.3 4.7e-74 XP_011522127 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1185) 1256 279.7 7.5e-74 NP_002199 (OMIM: 604682) integrin alpha-E precurso (1179) 1255 279.5 8.7e-74 XP_016880075 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1191) 1255 279.5 8.7e-74 XP_011522130 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1137) 1253 279.0 1.1e-73 XP_016880076 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al ( 848) 1108 247.9 2e-64 NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188) 1101 246.5 7.4e-64 XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086) 1094 245.0 2e-63 XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002) 1062 238.1 2.1e-61 NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024) 1062 238.1 2.2e-61 NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036) 1062 238.1 2.2e-61 XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100) 1062 238.1 2.3e-61 XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105) 1062 238.1 2.3e-61 NP_003628 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isoform (1167) 1062 238.1 2.4e-61 XP_016858111 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1181) 1062 238.1 2.4e-61 XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119) 976 219.7 8.1e-56 XP_016858117 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 796) 956 215.3 1.2e-54 >>NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform 2 pr (1161 aa) initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665 Z-score: 8867.0 bits: 1652.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7665; 100.0% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB3 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB3 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KB3 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB3 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB3 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB3 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::: NP_005 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1150 1160 >>NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform 1 (1162 aa) initn: 4356 init1: 4356 opt: 7653 Z-score: 8853.1 bits: 1650.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7653; 99.9% identity (99.9% similar) in 1162 aa overlap (1-1161:1-1162) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS 850 860 870 880 890 900 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQ 910 920 930 940 950 960 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 RDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSI 970 980 990 1000 1010 1020 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB3 ADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB3 QEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 QEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDK 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1140 1150 1160 pF1KB3 PEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS :::::::::::::::::::::: NP_001 PEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1150 1160 >>XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1160 aa) initn: 5517 init1: 5517 opt: 7647 Z-score: 8846.1 bits: 1648.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7647; 99.9% identity (99.9% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1160) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB3 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB3 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: XP_011 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQ-QPHQSA 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 pF1KB3 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB3 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB3 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB3 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 pF1KB3 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::: XP_011 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1140 1150 1160 >>XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1179 aa) initn: 4840 init1: 3310 opt: 6109 Z-score: 7065.4 bits: 1319.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7609; 98.5% identity (98.5% similar) in 1179 aa overlap (1-1161:1-1179) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDC 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLG 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQS 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASS 850 860 870 880 890 900 900 910 920 930 940 pF1KB3 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISR-----------------QEESTKYFNFATSDE :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: XP_011 ENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRCPVPGLPLGPLAFLYAWQEESTKYFNFATSDE 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KB3 KKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQH 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB3 SDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVV 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB3 SVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 YKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1150 1160 1170 >>XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin alpha- (1173 aa) initn: 6709 init1: 4356 opt: 5293 Z-score: 6120.7 bits: 1144.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7621; 99.0% identity (99.0% similar) in 1173 aa overlap (1-1161:1-1173) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 M-----------DGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTE : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MSLPSPGILSSQDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTE 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 LALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSD 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 GSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLG :::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLG 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 DVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALS 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 GGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEA 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 GDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIH 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KB3 CETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 CETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNC 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KB3 GQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRR 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KB3 VSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLG 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KB3 DRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEA 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KB3 EHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQ 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB3 ISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEIT 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB3 FDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFF 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 KRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1150 1160 1170 >>NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 1 (1169 aa) initn: 4949 init1: 2496 opt: 4978 Z-score: 5756.1 bits: 1077.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4978; 65.3% identity (84.6% similar) in 1163 aa overlap (2-1159:4-1165) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA : ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...:: NP_001 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS :::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.: NP_001 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG : : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::.. NP_001 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL ::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .: NP_001 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ :: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. . NP_001 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA ::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::.. NP_001 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN .: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. NP_001 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_001 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV ::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: :: NP_001 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL .::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: :::::::::::::::::::: NP_001 VIGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ .::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :. NP_001 VDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYID 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 KSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL : : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...::: NP_001 KRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG :.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:. NP_001 PSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQD 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP .::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.... .:::::.: :. .::: NP_001 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQG 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS . .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :. NP_001 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN .::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.::: NP_001 VSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNN 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM :.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:. NP_001 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB3 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: :::::::::::::: NP_001 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB3 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE ::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.::: NP_001 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 MLEDKPEDTATFSGDDF-SCVAPNVPLS :.:. . : .: . : .:. : NP_001 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV 1140 1150 1160 >>NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 2 pr (1163 aa) initn: 4949 init1: 2496 opt: 4975 Z-score: 5752.6 bits: 1076.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4975; 65.7% identity (85.0% similar) in 1151 aa overlap (2-1148:4-1153) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA : ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...:: NP_000 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS :::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.: NP_000 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG : : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::.. NP_000 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL ::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .: NP_000 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ :: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. . NP_000 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA ::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::.. NP_000 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN .: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. NP_000 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_000 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV ::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: :: NP_000 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL .::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: :::::::::::::::::::: NP_000 VIGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ .::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :. NP_000 VDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYID 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 KSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL : : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...::: NP_000 KRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG :.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:. NP_000 PSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQD 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP .::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.... .:::::.: :. .::: NP_000 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQG 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS . .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :. NP_000 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN .::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.::: NP_000 VSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNN 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM :.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:. NP_000 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB3 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: :::::::::::::: NP_000 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB3 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE ::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.::: NP_000 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 MLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS :.:. . : .: NP_000 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPSEK 1140 1150 1160 >>NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M isofo (1152 aa) initn: 4326 init1: 2331 opt: 4479 Z-score: 5178.4 bits: 970.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4479; 59.9% identity (82.6% similar) in 1140 aa overlap (6-1138:5-1143) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ ::::..:. ::::::.:. :::.: ::::::::. :::.::::: :.::::: NP_000 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS : ::.: .:: :.:: :.. :::::::::.:::.:. .:::::::.:..:.::.: NP_000 RGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB3 KGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQ :: :.:.:: . : :.: ::... ::.::::::::: .:: .:: ::..:: : NP_000 KGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 FEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLF .. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::.:: : : ::::: :: .:: NP_000 LKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 HHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQE . :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. :.:::.:::: ::.. .::: NP_000 NITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 LNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTAL ::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.::::. .::::.:::::::::.:. NP_000 LNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 TMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNL : .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . ::.: NP_000 TSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGA ::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.:::::::::::::.:::::.:::: NP_000 VLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVA :::::::::::::::::::::..::::::: ::::.:::::::::::::::: ::: ::: NP_000 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 IGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLM ::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.::::::::::.::::::::.:::. NP_000 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 DLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQK ::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..: .. .. :::.. ::: .:: NP_000 DLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQK 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 SSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLP :. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: : . ..::: :::::: :: NP_000 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 DCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGD .:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .: :::: .:::::::.:..:. : NP_000 NCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQDD 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 LGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPH :..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : :....: ::.:.:: :.: NP_000 LSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQRS 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 QSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRA : . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. :: .::::. ::.::...:..: NP_000 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 SASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVN ...:::: ..:. :::::::::::: ... . ::::.:: :..:. . .:.:.:. NP_000 NVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNF-TASENTSRVMQHQYQVS 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 NLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--CVSERKPPQHSDFLTQISRSP ::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..: : .... :.:::::... ..: NP_000 NLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAP 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB3 MLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSV ...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: : .: ....:.::.::: :. :: NP_000 VVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB3 YSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYK .. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.:::::::::.:::::::::.:: NP_000 FTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 EMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS .:. . NP_000 DMMSEGGPPGAEPQ 1140 1150 >>NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M is (1153 aa) initn: 3564 init1: 1515 opt: 4467 Z-score: 5164.5 bits: 967.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4467; 59.9% identity (82.6% similar) in 1141 aa overlap (6-1138:5-1144) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ ::::..:. ::::::.:. :::.: ::::::::. :::.::::: :.::::: NP_001 MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS : ::.: .:: :.:: :.. :::::::::.:::.:. .:::::::.:..:.::.: NP_001 RGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB3 KGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQ :: :.:.:: . : :.: ::... ::.::::::::: .:: .:: ::..:: : NP_001 KGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 FEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLF .. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::.:: : : ::::: :: .:: NP_001 LKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRELF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 HHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQE . :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. :.:::.:::: ::.. .::: NP_001 NITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 LNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTAL ::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.::::. .::::.:::::::::.:. NP_001 LNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSAAI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 TMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNL : .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . :: :.::::.. . : . ::.: NP_001 TSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGA ::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.:::::::::::::.:::::.:::: NP_001 VLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLIGA 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV :::::::::::::::::::: :..::::::: ::::.:::::::::::::::: ::: :: NP_001 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 AIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGL :::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.::::::::::.::::::::.::: NP_001 AIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 MDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQ .::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..: .. .. :::.. ::: .: NP_001 VDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLHVQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 KSSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLL ::. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: : . ..::: :::::: : NP_001 KSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG :.:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .: :::: .:::::::.:..:. NP_001 PNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNICQD 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP ::..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : :....: ::.:.:: :.: NP_001 DLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQNQR 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 HQSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMR : . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. :: .::::. ::.::...:.. NP_001 SQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLK 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 ASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRV :...:::: ..:. :::::::::::: ... . ::::.:: :..:. . .:.:.: NP_001 ANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNF-TASENTSRVMQHQYQV 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 NNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--CVSERKPPQHSDFLTQISRS .::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..: : .... :.:::::... .. NP_001 SNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKA 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB3 PMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTS :...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: : .: ....:.::.::: :. : NP_001 PVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB3 VYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHY :.. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.:::::::::.:::::::::.: NP_001 VFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQY 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 KEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS :.:. . NP_001 KDMMSEGGPPGAEPQ 1140 1150 >>XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: integrin (1091 aa) initn: 3255 init1: 1515 opt: 4173 Z-score: 4824.5 bits: 904.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4173; 59.4% identity (82.4% similar) in 1076 aa overlap (72-1138:8-1082) 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 FGGSRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRP-EAVNMSLGLTLAASTNG :. .:: . : :::::::::.:::.:. XP_011 MRAHPPAGVTMPISVPAVPVEAVNMSLGLSLAATTSP 10 20 30 110 120 130 140 150 pF1KB3 SRLLACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSG .:::::::.:..:.::.: :: :.:.:: . : :.: ::... ::.::::::: XP_011 PQLLACGPTVHQTCSENTYVKGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 SIDQNDFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIV :: .:: .:: ::..:: :.. . :::.:::::. ..::::: .:...:. .::: ::. XP_011 SIIPHDFRRMKEFVSTVMEQLKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPIT 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 QLKGLTFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAG :: : : ::::: :: .::. :::::.: :::.:::::.:. ::: : ::::.:.. : XP_011 QLLGRTHTATGIRKVVRELFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREG 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 IIRYAIGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQ .:::.:::: ::.. .:::::::.: ::.::::.:.:: :: .::.::.:::.:.:::: XP_011 VIRYVIGVGDAFRSEKSRQELNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQ 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 SRASSSFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDM . .::::.:::::::::.:.: .: .:..:::..:.::.::: . . :::::.. . :: XP_011 TGSSSSFEHEMSQEGFSAAITSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDM 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 RDSYLGYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGA :.::::.. . : . ::.:::::::::: : ...: : . .:...:.: :::::.:::: XP_011 NDAYLGYAAAIILRNRVQSLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGA 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KB3 SLCSVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWG :::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::: :..::::::: ::::.::: XP_011 SLCSVDVDSNGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWG 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 RFGAALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSP ::::::::::::: ::: :::::::::..::::::::::.: ::::::::::::.:.::: XP_011 RFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSP 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KB3 RLQYFGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRC :::::::.::::::::.:::.::.:::.:.:::::: :::.: . :.:.: :::. :..: XP_011 RLQYFGQSLSGGQDLTMDGLVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFEC 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 pF1KB3 WEEKPSALEAGDATVCLTIQKSSLDQL--GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPT .. .. :::.. ::: .:::. :.: :.::: : .::::: :: :::.:::::: : XP_011 NDQVVKGKEAGEVRVCLHVQKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNST 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 LTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQD . ..::: :::::: ::.:.:: ::::.:.:::::: :. . ::::::: .: XP_011 RRQTQVLGLTQTCETLKLQLPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQR 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 LFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVV :::: .:::::::.:..:. ::..:.:: .:. :.::. :.:: ::: : ::::: : : XP_011 LFTALFPFEKNCGNDNICQDDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQV 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 SLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVP-TEDEG-LRSSRCSVNHPIFHEGSNGT ....: ::.:.:: :.: : . :::::.. :: : :.:. ::.::::: :.:. : XP_011 TFFFPLDLSYRKVSTLQNQRSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVT 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 FIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKY : .::::. ::.::...:..:...:::: ..:. :::::::::::: ... . :::: XP_011 FNITFDVDSKASLGNKLLLKANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKY 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 990 pF1KB3 FNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP-- .:: :..:. . .:.:.:.::.::.: ::. : ::: :: ...:: . . :..: XP_011 LNF-TASENTSRVMQHQYQVSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSST 880 890 900 910 920 930 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB3 CVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVR : .... :.:::::... ..:...:::: : ...::.: :..:::.. :::::::: : XP_011 CHTKERLPSHSDFLAELRKAPVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYI 940 950 960 970 980 990 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB3 ETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGAL .: ....:.::.::: :. ::.. :::: ::.:.: : .: :: : .:.:.:::::.: XP_011 KTSHNHLLIVSTAEILFNDSVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 LLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::.:::::::::.::.:. . XP_011 LLLALITAALYKLGFFKRQYKDMMSEGGPPGAEPQ 1060 1070 1080 1090 1161 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:56:36 2016 done: Thu Nov 3 12:56:38 2016 Total Scan time: 15.880 Total Display time: 0.540 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]