FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3384, 699 aa 1>>>pF1KB3384 699 - 699 aa - 699 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6682+/-0.00105; mu= -5.0953+/- 0.065 mean_var=445.5264+/-90.334, 0's: 0 Z-trim(116.5): 38 B-trim: 58 in 1/52 Lambda= 0.060763 statistics sampled from 17088 (17126) to 17088 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16 Scan time: 3.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34724.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7 ( 699) 4804 435.5 1.2e-121 CCDS5735.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7 ( 688) 4653 422.3 1.2e-117 CCDS47415.1 SRPK1 gene_id:6732|Hs108|chr6 ( 655) 1527 148.2 3.5e-35 CCDS55537.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX ( 533) 1434 140.0 8.7e-33 CCDS55538.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX ( 566) 1434 140.0 9.1e-33 CCDS35441.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX ( 567) 1425 139.2 1.6e-32 >>CCDS34724.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7 (699 aa) initn: 4804 init1: 4804 opt: 4804 Z-score: 2297.2 bits: 435.5 E(32554): 1.2e-121 Smith-Waterman score: 4804; 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