Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3411, 899 aa
1>>>pF1KB3411 899 - 899 aa - 899 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7016+/- 0.001; mu= 7.3750+/- 0.061
mean_var=265.8676+/-54.481, 0's: 0 Z-trim(113.9): 108 B-trim: 669 in 1/49
Lambda= 0.078658
statistics sampled from 14392 (14501) to 14392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 899) 6027 698.0 2e-200
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CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 587) 523 73.2 1.6e-12
CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 619) 520 72.9 2e-12
CCDS12642.2 BCL3 gene_id:602|Hs108|chr19 ( 454) 508 71.4 4.2e-12
CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 ( 579) 477 68.0 5.7e-11
>>CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 (899 aa)
initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027 Z-score: 3711.8 bits: 698.0 E(32554): 2e-200
Smith-Waterman score: 6027; 100.0% identity (100.0% similar) in 899 aa overlap (1-899:1-899)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
850 860 870 880 890
>>CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 (900 aa)
initn: 5942 init1: 5747 opt: 6015 Z-score: 3704.4 bits: 696.6 E(32554): 5.1e-200
Smith-Waterman score: 6015; 99.9% identity (99.9% similar) in 900 aa overlap (1-899:1-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
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550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPST-EVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTAEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
850 860 870 880 890 900
>>CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 (968 aa)
initn: 1759 init1: 463 opt: 923 Z-score: 581.2 bits: 118.8 E(32554): 4.7e-26
Smith-Waterman score: 2240; 44.8% identity (68.5% similar) in 899 aa overlap (17-858:18-899)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETA---DGPYLVIVEQPKQRGFRFRYG
: .:. .: .:. :. : ::::: :.::::::::::::
CCDS54 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTDGPYLQILEQPKQRGFRFRYV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 CEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSE
::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::.. . ::::::::.: :
CCDS54 CEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC-E
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB3 LGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLT--------E
:::.:..:::::.. : :::.::::::... :. .. . .:. :: .
CCDS54 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB3 AE---QRELEQEAKEL--------KKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPI
:: .:.: .. ::: : ::::.::: :.::: : :::. :.::.:. :
CCDS54 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 HDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENG--WQAFGD
.:::.:.:::::: :::.::: : ::.:.::::::::::::..::::..::: :..:::
CCDS54 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEV
:::::::.:.::::.:: :. ..: .:..::.::.:: ..:. : : ::: ..:::::
CCDS54 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB3 QRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLG----F----FPS--SLAY
::::.: .:.::. ::::: :.:.:: :. ::.:: :: : : ::. ....
CCDS54 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420
pF1KB3 SP--YQSGAG-------------PMGCYPGGGGGA--QMAATVPSRDSGEEAAEPSAP--
: .:.:: : :: . .. .. .. . .. .: .: ..
CCDS54 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 --SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLTAQ
. : . . . . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: ..:
CCDS54 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVS
:::::. ::::::: ......... : . ..:. : :.:::::::::: : .::
CCDS54 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 FLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLYPV
:::.::: .:::: :.:..::: : : ..: ::. :. :: :. .:: .
CCDS54 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLNAI
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 HLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVNAR
:::. . : :: ::: .::.:.: :...::::::::.: ....:. :. . :.:..
CCDS54 HLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDST
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 TFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEKDT
:. :.::::.::: : :. :: :::: .:: ::: : :.. :. .:
CCDS54 TYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPL--------YDLDDSWENAGED-
720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 RSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQLL
.. : ::::.. : .: .: :. . .:: .: . : .:.. . .: .::
CCDS54 EGVVPGTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLL
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 DGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGLEE
. :. . .:: ::..::: : ...: . .:: .:. .::..:: . :.::: .:: :
CCDS54 EIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTE
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890
pF1KB3 GVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
....... . : :
CCDS54 AIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLT
890 900 910 920 930 940
>>CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 (969 aa)
initn: 1769 init1: 463 opt: 923 Z-score: 581.2 bits: 118.8 E(32554): 4.7e-26
Smith-Waterman score: 2249; 44.9% identity (68.6% similar) in 893 aa overlap (20-858:26-900)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFR
.: . .:. : ::::::: :.:::::::::::
CCDS36 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALP-TADGPYLQILEQPKQRGFRFR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 YGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQC
: ::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::.. . ::::::::.:
CCDS36 YVCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB3 SELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLT-------
: :::.:..:::::.. : :::.::::::... :. .. . .:. ::
CCDS36 -EDGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB3 -EAE---QRELEQEAKEL--------KKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQ
.:: .:.: .. ::: : ::::.::: :.::: : :::. :.::.:.
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180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 PIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENG--WQAF
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CCDS36 AIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 GDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKE
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CCDS36 GDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
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CCDS36 EVQRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGI
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390 400 410 420
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CCDS36 TFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVG
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ----SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLT
. : . . . . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: .
CCDS36 NGEVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTA
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pF1KB3 AQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSV
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CCDS36 VQDENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDV
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pF1KB3 VSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLY
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CCDS36 VEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLN
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pF1KB3 PVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVN
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CCDS36 AIHLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVD
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670 680 690 700 710 720
pF1KB3 ARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEK
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CCDS36 STTYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDL------DDSWENAGEDE
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730 740 750 760 770 780
pF1KB3 DTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQ
. : ::::.. : .: .: :. . .:: .: . : .:.. . .: .
CCDS36 GVVP---GTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYK
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790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
::. :. . .:: ::..::: : ...: . .:: .:. .::..:: . :.::: .::
CCDS36 LLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGY
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850 860 870 880 890
pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
:....... . : :
CCDS36 TEAIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTES
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70 80 90 100 110 120
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.:: : . .:::...: :: : .:... :::..:: . : :.::::.: . : .
CCDS74 IPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRD-GYYEAEF
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: . :.:::. : ::.. ..: .. . : .. : . ..:.
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pF1KB3 MDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGD
::..::: :..:: :... : ::.:.::.:...:....:.: :..:. :::::::
CCDS74 CDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGD
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pF1KB3 EVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVT
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CCDS74 EIFLLCDKVQKDDIEVRFVLND---WEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKA-ITEPVT
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pF1KB3 VFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAA
: .::.: .::.: .: : : .: . :..:. :.. .:..
CCDS74 VKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFQKLC--QDHVNFPERPRP
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pF1KB3 GGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYS------PYQSGAGPMGCYPGGG----GGAQMAATVPSR
: :. : : . :. .... : .. . ::. : : .. :. .:
CCDS74 GLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLP
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pF1KB3 DSGEEAAEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALL
.:. .. .: :. . .:
CCDS74 SSSWSSVAHPTP-RSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNAD
380 390 400 410 420 430
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pF1KB3 YNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGPSHGG
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pF1KB3 LPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSV
.:: : . .:::...: :: : .:... :::..:: . : :.::::.: . : .
CCDS18 IPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRD-GYYEAEF
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CCDS18 GQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAIITRIKAG---INPFNVPEKQLNDIED--------
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::..::: :..:: :... : ::.:.::.:...:....:.: :..:. :::::::
CCDS18 CDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGD
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CCDS18 EIFLLCDKVQKDDIEVRFVLND---WEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKA-ITEPVT
210 220 230 240 250
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: .::.: .::.: .: : : .: . :..:. :..
CCDS18 VKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFQKLCQDHVETGFRHVDQD
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CCDS18 GLELLTSGDPPTLASQSAGITVNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPT
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pF1KB3 LFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVY
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pF1KB3 VIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALR
... : ... :.:.:::::::::: ::: .:. .::.: :::::..: ::: .
CCDS12 LFQ--QGGRELDIYNNLRQTPLHLAVITTLPSVVRLLVTAGASPMALDRHGQTAAHLACE
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pF1KB3 AGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEAT
.: :::::.:.::.. .: . ...:: .:.:: .. : ..::.. ::...:.
CCDS12 HR--SPTCLRALLDSAAPGTLDL-EARNYDGLTALHVAVNTECQETVQLLLERGADIDAV
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pF1KB3 ERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLK
. ..::. : :.: . :..: .:. . :::::. ..:.. :: :.: : :.: :..
CCDS12 DIKSGRSPLIHAVENNSLSMV-QLLLQHGANVNAQMYSGSSALHSASGRGLLPLVRTLVR
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 AGADIHAENEEPLCPL---------------PSPPTSDSDSDSEGPEKDTRSSFRGHTPL
.::: .: . :: . :.: :. : .:.... .: :
CCDS12 SGADSSLKNCHNDTPLMVARSRRVIDILRGKATRPASTSQPDP-SPDRSANTS-----P-
340 350 360 370 380
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pF1KB3 DLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQLLDGPEAQGSWAEL
:..... : .:. . : .:: ::. .
CCDS12 --ESSSRLSSNGLLSASPSSSPSQSPPRDP-PGFPMAPPNFFLPSPSPPAFLPFAGVLRG
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pF1KB3 AERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGLEEGVRLLRGPETRD
CCDS12 PGRPVPPSPAPGGS
450
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pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEG
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CCDS46 AASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEG
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pF1KB3 PSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVD--LVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSEL
: :.. : :: .. :: :.... . : ..:: :: .. : :.: ::::::.:..
CCDS46 RSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTD-
150 160 170 180 190 200
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pF1KB3 GICAVSVGPK-DMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQ
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CCDS46 GICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQ--------LGIDPYNAGSLKN
210 220 230 240 250
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pF1KB3 EAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKT
. . .:...::. :.: : ..:.. . ::.:.:..:.:: ..:.:.: :..:
CCDS46 HQE-----VDMNVVRICFQASYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKE
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 AGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHK
.: ::.:.:::::::::.:: : : .. .:.. .::: .:::.: ::::.::::.
CCDS46 SGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVF---SRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYED
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..: .:::: . :.: : :. ::: : .:. :..::....: :.:
CCDS46 LEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPH
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pF1KB3 GGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSP-YQSGAGPM-GCYPGGGGGAQMA
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CCDS46 GIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPF-LPPSALLPDPDFFSGTVSLPGLEPPGG------
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pF1KB3 ATVPSR-DSGEEAAEPSAPSRTPQCE--PQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYG
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CCDS46 ---PDLLDDGF-AYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLD
490 500 510 520 530
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pF1KB3 VTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNH
CCDS46 SYQAPGPGDGGTASLVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
540 550 560 570
899 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:13:41 2016 done: Thu Nov 3 13:13:42 2016
Total Scan time: 4.040 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]