Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3419, 800 aa
1>>>pF1KB3419 800 - 800 aa - 800 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2262+/-0.00125; mu= -9.1556+/- 0.073
mean_var=311.6858+/-68.276, 0's: 0 Z-trim(108.1): 628 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.072647
statistics sampled from 9288 (10015) to 9288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42777.1 ZAK gene_id:51776|Hs108|chr2 ( 800) 5398 580.7 3.3e-165
CCDS2251.1 ZAK gene_id:51776|Hs108|chr2 ( 455) 2221 247.5 3.6e-65
CCDS8860.1 MAP3K12 gene_id:7786|Hs108|chr12 ( 859) 739 92.4 3.5e-18
CCDS55831.1 MAP3K12 gene_id:7786|Hs108|chr12 ( 892) 739 92.4 3.6e-18
CCDS3270.1 MAP3K13 gene_id:9175|Hs108|chr3 ( 966) 714 89.8 2.3e-17
CCDS61488.1 MAP3K9 gene_id:4293|Hs108|chr14 (1104) 704 88.8 5.4e-17
CCDS32112.1 MAP3K9 gene_id:4293|Hs108|chr14 (1118) 704 88.8 5.4e-17
CCDS8107.1 MAP3K11 gene_id:4296|Hs108|chr11 ( 847) 693 87.6 9.7e-17
CCDS12549.1 MAP3K10 gene_id:4294|Hs108|chr19 ( 954) 691 87.4 1.2e-16
CCDS56298.1 MAP3K13 gene_id:9175|Hs108|chr3 ( 759) 624 80.3 1.3e-14
CCDS1598.1 MLK4 gene_id:84451|Hs108|chr1 (1036) 601 78.0 9.1e-14
CCDS5030.1 MAP3K7 gene_id:6885|Hs108|chr6 ( 491) 571 74.6 4.4e-13
CCDS5029.1 MAP3K7 gene_id:6885|Hs108|chr6 ( 518) 571 74.6 4.6e-13
CCDS5027.1 MAP3K7 gene_id:6885|Hs108|chr6 ( 579) 571 74.7 5e-13
CCDS5028.1 MAP3K7 gene_id:6885|Hs108|chr6 ( 606) 571 74.7 5.2e-13
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 559 73.6 1.9e-12
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 559 73.6 2e-12
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 559 73.6 2e-12
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 559 73.6 2e-12
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 559 73.6 2.1e-12
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 559 73.6 2.1e-12
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 559 73.6 2.1e-12
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 528 70.2 1.1e-11
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 535 71.1 1.2e-11
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 535 71.1 1.2e-11
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 499 67.1 8.8e-11
>>CCDS42777.1 ZAK gene_id:51776|Hs108|chr2 (800 aa)
initn: 5398 init1: 5398 opt: 5398 Z-score: 3079.4 bits: 580.7 E(32554): 3.3e-165
Smith-Waterman score: 5398; 99.9% identity (99.9% similar) in 800 aa overlap (1-800:1-800)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQDKEVAVKKLLKIEKEAEILSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQDKEVAVKKLLKIEKEAEILSVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSNRSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSNRSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASRFHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASRFHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAWLVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAWLVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDTSLPDKCNSFLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDTSLPDKCNSFLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFEIGAWTEDDVYCWVQQLVRKGDSSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFEIGAWTEDDVYCWVQQLVRKGDSSAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MSVYASLFKENNITGKRLLLLEEEDLKDMGIVSKGHIIHFKSAIEKLTHDYINLFHFPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSVYASLFKENNITGKRLLLLEEEDLKDMGIVSKGHIIHFKSAIEKLTHDYINLFHFPPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 IKDSGGEPEENEEKIVNLELVFGFHLKPGTGPQDCKWKMYMEMDGDEIAITYIKDVTFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IKDSGGEPEENEEKIVNLELVFGFHLKPGTGPQDCKWKMYMEMDGDEIAITYIKDVTFNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NLPDAEILKMTKPPFVMEKWIVGIAKSQTVECTVTYESDVRTPKSTKHVHSIQWSRTKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NLPDAEILKMTKPPFVMEKWIVGIAKSQTVECTVTYESDVRTPKSTKHVHSIQWSRTKPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DEVKAVQLAIQTLFTNSDGNPGSRSDSSADCQWLDTLRMRQIASNTSLQRSQSNPILGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DEVKAVQLAIQTLFTNSDGNPGSRSDSSADCQWLDTLRMRQIASNTSLQRSQSNPILGSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 FFSHFDGQDSYAAAVRRPQVPIKYQQITPVNQSRSSSPTQYGLTKNFSSLHLNSRDSGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FFSHFDGQDSYAAAVRRPQVPIKYQQITPVNQSRSSSPTQYGLTKNFSSLHLNSRDSGFS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SGNTDTSSERGRYSDRSRNKYGRGSISLNSSPRGRYSGKSQHSTPSRGRYPGKFYRVSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SGNTDTSSERGRYSDRSRNKYGRGSISLNSSPRGRYSGKSQHSTPSRGRYPGKFYRVSQS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 ALNPHQSPDFKRSPRDLHQPNTIPGMPLHPETDSRASEEDSKVSEGGWTKVEYRKKPHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALNPHQSPDFKRSPRDLHQPNTIPGMPLHPETDSRASEEDSKVSEGGWTKVEYRKKPHRP
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB3 SPATTNKERARGDHRGWRNF
::: ::::::::::::::::
CCDS42 SPAKTNKERARGDHRGWRNF
790 800
>>CCDS2251.1 ZAK gene_id:51776|Hs108|chr2 (455 aa)
initn: 2215 init1: 2215 opt: 2221 Z-score: 1283.5 bits: 247.5 E(32554): 3.6e-65
Smith-Waterman score: 2226; 78.2% identity (86.6% similar) in 455 aa overlap (1-454:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQDKEVAVKKLLKIEKEAEILSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQDKEVAVKKLLKIEKEAEILSVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSNRSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSNRSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASRFHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASRFHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAWLVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAWLVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDTSLPDKCNSFLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDTSLPDKCNSFLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFEIGAWTEDDVYCWVQQLVRKGDSSAE
::::::::::::::::::::::::::::::: . ..: .. : . . ..:::
CCDS22 LSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLL--LPLAARMSEESYFESKT---EESNSAE
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MSVYASLFKENNITGKRLLLLEEEDLKDMGIVSKGHIIHFKSAIEKLTHDYINLFHFPPL
:: .. .: :. . . .:. : ... : :. ...: . :. ...
CCDS22 MS--CQITATSNGEGHGM----NPSLQAMMLMGFGDIFSMNKA-GAVMHSGMQINM--QA
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KB3 IKDSGGEPEENEEKIVNLELVFG-FHLKPGTGPQDCKWKMYMEMDGDEIAITYIKDVTFN
..:. . . : ::. : :. : :. : .:
CCDS22 KQNSSKTTSKRRGKKVNMALGFSDFDLSEGDDDDDDDGEEEDNDMDNSE
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TNLPDAEILKMTKPPFVMEKWIVGIAKSQTVECTVTYESDVRTPKSTKHVHSIQWSRTKP
>>CCDS8860.1 MAP3K12 gene_id:7786|Hs108|chr12 (859 aa)
initn: 432 init1: 376 opt: 739 Z-score: 440.0 bits: 92.4 E(32554): 3.5e-18
Smith-Waterman score: 739; 39.9% identity (70.5% similar) in 308 aa overlap (10-313:119-416)
10 20 30
pF1KB3 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQD
.. :... .. :.:. :.:. ... .
CCDS88 EGLFGCLRPVWTMIGKAYSTEHKQQQEDLWEVPFEEILDLQWVGSGAQGAVFLGRF--HG
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 KEVAVKKLLKIEKEAEI--LSVLSHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSN
.::::::. . ::..: : :.: ::: : :: . : : :. :. . :.::. . ..
CCDS88 EEVAVKKVRDL-KETDIKHLRKLKHPNIITFKGVCTQAPCYCILMEFCAQGQLYEVLRAG
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100 110 120 130 140 150
pF1KB3 RSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHYLHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASR-
: .. .. :. .: ::.:::.. :.::::::: :..:. : :.:: :::.:.
CCDS88 RPVTPSL--LVDWSMGIAGGMNYLHLH---KIIHRDLKSPNMLITYDDVVKISDFGTSKE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 FHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQSLPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAW
. ...:.::..:: :::::::.. :::: : .:.::::::.:: :.:.: ... . :
CCDS88 LSDKSTKMSFAGTVAWMAPEVIRNEPVSEKVDIWSFGVVLWELLTGEIPYKDVDSSAIIW
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLHQCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDT-SLPDKCNS
: .. .: .::::: .: ::.:::.. ..::::.::. :. : :. : :.. .
CCDS88 GVGSNSLHLPVPSSCPDGFKILLRQCWNSKPRNRPSFRQILLHLDIASADVLSTPQE--T
330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERDLSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFE
.....:::: :.. .:..:. : :.:: :.:
CCDS88 YFKSQAEWREEVKLHFEKIKSEGTCLHRLEEELVMRRREELRHALDIREHYERKLERANN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 IGAWTEDDVYCWVQQLVRKGDSSAEMSVYASLFKENNITGKRLLLLEEEDLKDMGIVSKG
CCDS88 LYMELNALMLQLELKERELLRREQALERRCPGLLKPHPSRGLLHGNTMEKLIKKRNVPQK
440 450 460 470 480 490
>>CCDS55831.1 MAP3K12 gene_id:7786|Hs108|chr12 (892 aa)
initn: 404 init1: 376 opt: 739 Z-score: 439.8 bits: 92.4 E(32554): 3.6e-18
Smith-Waterman score: 739; 39.9% identity (70.5% similar) in 308 aa overlap (10-313:152-449)
10 20 30
pF1KB3 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQD
.. :... .. :.:. :.:. ... .
CCDS55 EGLFGCLRPVWTMIGKAYSTEHKQQQEDLWEVPFEEILDLQWVGSGAQGAVFLGRF--HG
130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 KEVAVKKLLKIEKEAEI--LSVLSHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSN
.::::::. . ::..: : :.: ::: : :: . : : :. :. . :.::. . ..
CCDS55 EEVAVKKVRDL-KETDIKHLRKLKHPNIITFKGVCTQAPCYCILMEFCAQGQLYEVLRAG
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 RSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHYLHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASR-
: .. .. :. .: ::.:::.. :.::::::: :..:. : :.:: :::.:.
CCDS55 RPVTPSL--LVDWSMGIAGGMNYLHLH---KIIHRDLKSPNMLITYDDVVKISDFGTSKE
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 FHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQSLPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAW
. ...:.::..:: :::::::.. :::: : .:.::::::.:: :.:.: ... . :
CCDS55 LSDKSTKMSFAGTVAWMAPEVIRNEPVSEKVDIWSFGVVLWELLTGEIPYKDVDSSAIIW
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLHQCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDT-SLPDKCNS
: .. .: .::::: .: ::.:::.. ..::::.::. :. : :. : :.. .
CCDS55 GVGSNSLHLPVPSSCPDGFKILLRQCWNSKPRNRPSFRQILLHLDIASADVLSTPQE--T
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERDLSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFE
.....:::: :.. .:..:. : :.:: :.:
CCDS55 YFKSQAEWREEVKLHFEKIKSEGTCLHRLEEELVMRRREELRHALDIREHYERKLERANN
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 IGAWTEDDVYCWVQQLVRKGDSSAEMSVYASLFKENNITGKRLLLLEEEDLKDMGIVSKG
CCDS55 LYMELNALMLQLELKERELLRREQALERRCPGLLKPHPSRGLLHGNTMEKLIKKRNVPQK
480 490 500 510 520 530
>>CCDS3270.1 MAP3K13 gene_id:9175|Hs108|chr3 (966 aa)
initn: 600 init1: 335 opt: 714 Z-score: 425.1 bits: 89.8 E(32554): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 714; 37.5% identity (70.7% similar) in 307 aa overlap (10-313:162-459)
10 20 30
pF1KB3 MSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQD
.. :.... .. :.:. :.:. .:. .
CCDS32 EGLFGCLRPVWNIIGKAYSTDYKLQQQDTWEVPFEEISELQWLGSGAQGAVFLGKF--RA
140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 KEVAVKKLLKIEKEAEI--LSVLSHRNIIQFYGVILEPPNYGIVTEYASLGSLYDYINSN
.:::.::. . ..:..: : :.: ::: : :: . : : :. :: . :.::. . ..
CCDS32 EEVAIKKV-REQNETDIKHLRKLKHPNIIAFKGVCTQAPCYCIIMEYCAHGQLYEVLRAG
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 RSEEMDMDHIMTWATDVAKGMHYLHMEAPVKVIHRDLKSRNVVIAADGVLKICDFGASR-
: .. .. :.: .:.::.:::.. :.::::::: ::... ..:: :::.:.
CCDS32 R--KITPRLLVDWSTGIASGMNYLHLH---KIIHRDLKSPNVLVTHTDAVKISDFGTSKE
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 FHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQSLPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAW
. ...:.::..:: :::::::.. :::: : .:.::::::.:: :.:.: ... . :
CCDS32 LSDKSTKMSFAGTVAWMAPEVIRNEPVSEKVDIWSFGVVLWELLTGEIPYKDVDSSAIIW
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLHQCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDTSLPDKCNSF
: .. .: .::.:: .: :..: :.. ..::::.: . :. : :. : ...
CCDS32 GVGSNSLHLPVPSTCPDGFKILMKQTWQSKPRNRPSFRQTLMHLDIASADV-LATPQETY
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LHNKAEWRCEIEATLERLKKLERDLSFKEQELKERERRLKMWEQKLTEQSNTPLLPSFEI
....:::: :.. .:..:. . ..:: .:.:
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]