Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3463, 1601 aa
1>>>pF1KB3463 1601 - 1601 aa - 1601 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7530+/-0.0011; mu= 12.7573+/- 0.066
mean_var=163.9518+/-31.596, 0's: 0 Z-trim(108.4): 101 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.100165
statistics sampled from 10082 (10184) to 10082 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 5.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 10569 1541.0 0
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 10543 1537.2 0
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 9767 1425.1 0
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 8217 1201.1 0
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 7039 1030.9 0
CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 ( 827) 5477 804.9 0
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 4629 682.6 2.6e-195
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 591 98.9 7.1e-20
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 591 98.9 7.5e-20
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 591 98.9 7.6e-20
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 591 98.9 7.7e-20
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 591 98.9 8.6e-20
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 ( 730) 551 93.1 3.7e-18
CCDS11363.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 456) 512 87.3 1.3e-16
CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 505) 512 87.3 1.4e-16
CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 511) 512 87.3 1.4e-16
CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 881) 505 86.5 4.3e-16
CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 923) 505 86.5 4.4e-16
>>CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601 aa)
initn: 10569 init1: 10569 opt: 10569 Z-score: 8258.6 bits: 1541.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10569; 99.9% identity (100.0% similar) in 1601 aa overlap (1-1601:1-1601)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 VQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 LTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 PALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 LSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDHS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 QHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 NPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKSWTSSSSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKSWTSSSSLS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 DTYEPNYGTVKRRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 YREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600
pF1KB3 CVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKLGDVTDADSEADENEQVSAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKLGDVTDADSEADENEQVSAV
1570 1580 1590 1600
>>CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609 aa)
initn: 7093 init1: 7043 opt: 10543 Z-score: 8238.3 bits: 1537.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10543; 99.4% identity (99.5% similar) in 1609 aa overlap (1-1601:1-1609)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS54 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 STNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB3 QWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB3 RKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB3 IPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB3 ASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB3 HDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB3 WTSSSSLSDTYEPNYGTVKRRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KB3 TSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600
pF1KB3 SLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKLGDVTDADSEADENEQVSAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKLGDVTDADSEADENEQVSAV
1570 1580 1590 1600
>>CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504 aa)
initn: 7093 init1: 7043 opt: 9767 Z-score: 7632.7 bits: 1425.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9767; 99.4% identity (99.5% similar) in 1496 aa overlap (1-1488:1-1496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS54 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 STNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB3 QWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB3 RKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB3 IPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB3 ASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB3 HDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB3 WTSSSSLSDTYEPNYGTVKRRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KB3 TSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPA
CCDS54 VSAV
>>CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391 aa)
initn: 8208 init1: 8208 opt: 8217 Z-score: 6422.6 bits: 1201.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8217; 99.1% identity (99.6% similar) in 1265 aa overlap (1-1265:1-1264)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 VQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 LTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 PALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..: : .:..
CCDS54 PALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKVGSII-SDHSSK
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 LSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDHS
.: .:
CCDS54 ISGQSCPGIGGAYLQKKILQITRSTAKRTDSTEKATEENRDRTSCENTTRKRMTSPFRRL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509 aa)
initn: 7686 init1: 4949 opt: 7039 Z-score: 5502.1 bits: 1030.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9737; 99.0% identity (99.1% similar) in 1501 aa overlap (1-1488:1-1501)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKE
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKE
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 VVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNME
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 TETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKT
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 GNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIIS
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 GLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPV
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 VKKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB3 SLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB3 QMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 NLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB3 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB3 EKTEHASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EKTEHASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KB3 CSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB3 LERKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKRRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGL
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LERKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KB3 IVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHTHLKPPDYSVAVQRSKMMHNSLS
:
CCDS54 IENEQVSAV
>>CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (827 aa)
initn: 5477 init1: 5477 opt: 5477 Z-score: 4285.9 bits: 804.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5477; 100.0% identity (100.0% similar) in 827 aa overlap (1-827:1-827)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGR
790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHL
>>CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499 aa)
initn: 5636 init1: 2409 opt: 4629 Z-score: 3620.0 bits: 682.6 E(32554): 2.6e-195
Smith-Waterman score: 5925; 65.0% identity (82.9% similar) in 1470 aa overlap (165-1582:20-1478)
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
:::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS43 MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
:.::::::::::::::::::.::.::. ::: ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS43 ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS43 DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS43 ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS43 QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
290 300 310 320 330 340
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
::::::::::.::: ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS43 AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
350 360 370 380 390 400
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS43 FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
410 420 430 440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS43 VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
470 480 490 500 510 520
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
:::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .: . .:. ::::::.:
CCDS43 GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
530 540 550 560 570 580
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS43 DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
590 600 610 620 630 640
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
: ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS43 DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
650 660 670 680 690 700
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS43 ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
710 720 730 740 750 760
920 930 940 950 960 970
pF1KB3 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS43 TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
770 780 790 800 810 820
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB3 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
:::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS43 KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
830 840 850 860 870 880
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDV-
:::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: : ::::::::...:::
CCDS43 VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
890 900 910 920 930 940
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
: :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS43 QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
950 960 970 980 990 1000
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB3 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
:: ..:. .:: : ::: :...: : :: :...: ::::::.:.: ::
CCDS43 PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB3 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
: .:: : .. . :: :.:. .:: : ::..::::: ::: ::::.:::.::.
CCDS43 KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB3 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
::::: ::. ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS43 KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB3 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
. :. . : :. . : . . .: .: :: :.::.::.. ..::::::
CCDS43 GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
::::::::.::::.:.. . .::. : . :::.: :: : :. .: ..
CCDS43 GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKRRVLE--STPAESSEGL---
.: . ::: : ::.::.. .. : . ::.::: . : ::::
CCDS43 KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 --DPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPH
. : . :.. .:.::: ::::. .:. ::::::::::::.:: ..:. :: :
CCDS43 TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIA------RKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEG-H
1370 1380 1390 1400 1410
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB3 TH--LKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKL
.: :::::.::.:::.:. : . :.:... . :. :..:: :. . :.:
CCDS43 SHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRL
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1590 1600
pF1KB3 GDVTDADSEADENEQVSAV
CCDS43 APYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
1480 1490
>>CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (791 aa)
initn: 829 init1: 303 opt: 591 Z-score: 470.3 bits: 98.9 E(32554): 7.1e-20
Smith-Waterman score: 694; 25.8% identity (52.2% similar) in 854 aa overlap (225-1060:76-751)
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEE-DEEIDRTDPL---QGRD
..:. .:....: :::.. : : .: :
CCDS74 LEDGVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPD
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300
pF1KB3 L-VRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIIL
.: :.: :...: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:.::: ..:....
CCDS74 AHMRMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLF
110 120 130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 EDGQELDSWYVILNGTVEIS-HPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQF
..:.: :::.::.:.:.. . : : .: :..:: .. . . . :.:.:
CCDS74 NQGEEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHF
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKG-------HIVIKATP
. . ..:. ::: :: :: ...:. . :.: :. .. .: . :...::
CCDS74 LRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTP
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDS-LRDKVTRIVLL
:... : :: : : ::. :. . :: : : . ..
CCDS74 EKILEH---------------FLETIR--LEATLNEAT--------DSVLNDFIMMHCVF
290 300 310 320
490 500 510 520 530
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMT-RFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRE
:... ::.. .. . .. :. ::. : : . ..::: :.
CCDS74 MPNTQLC-----PALVAHYHAQPSQGTEQEKMD-------YALNNKRRVIRLVLQWAAM-
330 340 350 360
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILR
:: ..: .... : .:
CCDS74 ----------------------------------YGDLLQE------DDVS-MAFLE---
370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 NNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEK
.. ..:. . .. : : .:.. :: ..: :..
CCDS74 ---EFYVSVSDDARMIAAL-------KEQLPELEKI----------------VKQISEDA
390 400 410
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 GSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIM
. . : .:.: . :. : : . :.
CCDS74 KAPQKK-----------HKVLLQQ---------FNTG-------DERAQKRQ--------
420 430 440
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVI-RVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVF
:: :. :.:. .:. .:. : . :..:::.
CCDS74 PIRGS-------------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
450 460 470
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 HAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETET
.. ..: ... . ..: : :. . :.. : .. . .::: . . ..
CCDS74 AVADKLG---SGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDS
480 490 500 510 520 530
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 LCSDEDAQELVKESQLSMLQL-STIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLF-KLNSKTG
: . :: . .. ..: :. ..: :... :..:: .. : : : . : :
CCDS74 L-TPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKT
540 550 560 570 580
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 NTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISG
...: : :. :::..:: .. ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. :
CCDS74 TANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMG
590 600 610 620 630 640
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVV
:. ..:.:: ::::::::..: ......::::: :: :. ...::.::..:..
CCDS74 LSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLL
650 660 670 680 690 700
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 KKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNS
::::: :::: . .:.::::::.:::.. : : . : ..:
CCDS74 IKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYV
710 720 730 740 750 760
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 NMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEP
CCDS74 RQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
770 780 790
>>CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (840 aa)
initn: 829 init1: 303 opt: 591 Z-score: 469.9 bits: 98.9 E(32554): 7.5e-20
Smith-Waterman score: 694; 25.8% identity (52.2% similar) in 854 aa overlap (225-1060:125-800)
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEE-DEEIDRTDPL---QGRD
..:. .:....: :::.. : : .: :
CCDS63 LEDGVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPD
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300
pF1KB3 L-VRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIIL
.: :.: :...: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:.::: ..:....
CCDS63 AHMRMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLF
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 EDGQELDSWYVILNGTVEIS-HPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQF
..:.: :::.::.:.:.. . : : .: :..:: .. . . . :.:.:
CCDS63 NQGEEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHF
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKG-------HIVIKATP
. . ..:. ::: :: :: ...:. . :.: :. .. .: . :...::
CCDS63 LRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTP
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDS-LRDKVTRIVLL
:... : :: : : ::. :. . :: : : . ..
CCDS63 EKILEH---------------FLETIR--LEATLNEAT--------DSVLNDFIMMHCVF
340 350 360
490 500 510 520 530
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMT-RFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRE
:... ::.. .. . .. :. ::. : : . ..::: :.
CCDS63 MPNTQLC-----PALVAHYHAQPSQGTEQEKMD-------YALNNKRRVIRLVLQWAAM-
370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILR
:: ..: .... : .:
CCDS63 ----------------------------------YGDLLQE------DDVS-MAFLE---
420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 NNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEK
.. ..:. . .. : : .:.. :: ..: :..
CCDS63 ---EFYVSVSDDARMIAAL-------KEQLPELEKI----------------VKQISEDA
440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 GSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIM
. . : .:.: . :. : : . :.
CCDS63 KAPQKK-----------HKVLLQQ---------FNTG-------DERAQKRQ--------
470 480 490
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVI-RVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVF
:: :. :.:. .:. .:. : . :..:::.
CCDS63 PIRGS-------------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
500 510 520
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 HAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETET
.. ..: ... . ..: : :. . :.. : .. . .::: . . ..
CCDS63 AVADKLG---SGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDS
530 540 550 560 570
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 LCSDEDAQELVKESQLSMLQL-STIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLF-KLNSKTG
: . :: . .. ..: :. ..: :... :..:: .. : : : . : :
CCDS63 L-TPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKT
580 590 600 610 620 630
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 NTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISG
...: : :. :::..:: .. ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. :
CCDS63 TANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMG
640 650 660 670 680 690
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVV
:. ..:.:: ::::::::..: ......::::: :: :. ...::.::..:..
CCDS63 LSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLL
700 710 720 730 740 750
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 KKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNS
::::: :::: . .:.::::::.:::.. : : . : ..:
CCDS63 IKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYV
760 770 780 790 800 810
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 NMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEP
CCDS63 RQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
820 830 840
>>CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (858 aa)
initn: 829 init1: 303 opt: 591 Z-score: 469.8 bits: 98.9 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 694; 25.8% identity (52.2% similar) in 854 aa overlap (225-1060:143-818)
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEE-DEEIDRTDPL---QGRD
..:. .:....: :::.. : : .: :
CCDS63 LEDGVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPD
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300
pF1KB3 L-VRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIIL
.: :.: :...: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:.::: ..:....
CCDS63 AHMRMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLF
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 EDGQELDSWYVILNGTVEIS-HPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQF
..:.: :::.::.:.:.. . : : .: :..:: .. . . . :.:.:
CCDS63 NQGEEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHF
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKG-------HIVIKATP
. . ..:. ::: :: :: ...:. . :.: :. .. .: . :...::
CCDS63 LRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTP
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDS-LRDKVTRIVLL
:... : :: : : ::. :. . :: : : . ..
CCDS63 EKILEH---------------FLETIR--LEATLNEAT--------DSVLNDFIMMHCVF
360 370 380
490 500 510 520 530
pF1KB3 WVNNHFNDFEGDPAMT-RFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRE
:... ::.. .. . .. :. ::. : : . ..::: :.
CCDS63 MPNTQLC-----PALVAHYHAQPSQGTEQEKMD-------YALNNKRRVIRLVLQWAAM-
390 400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILR
:: ..: .... : .:
CCDS63 ----------------------------------YGDLLQE------DDVS-MAFLE---
440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 NNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEK
.. ..:. . .. : : .:.. :: ..: :..
CCDS63 ---EFYVSVSDDARMIAAL-------KEQLPELEKI----------------VKQISEDA
460 470 480
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 GSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIM
. . : .:.: . :. : : . :.
CCDS63 KAPQKK-----------HKVLLQQ---------FNTG-------DERAQKRQ--------
490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVI-RVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVF
:: :. :.:. .:. .:. : . :..:::.
CCDS63 PIRGS-------------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
510 520 530 540
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 HAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETET
.. ..: ... . ..: : :. . :.. : .. . .::: . . ..
CCDS63 AVADKLG---SGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDS
550 560 570 580 590
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 LCSDEDAQELVKESQLSMLQL-STIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLF-KLNSKTG
: . :: . .. ..: :. ..: :... :..:: .. : : : . : :
CCDS63 L-TPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKT
600 610 620 630 640 650
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 NTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISG
...: : :. :::..:: .. ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. :
CCDS63 TANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMG
660 670 680 690 700 710
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVV
:. ..:.:: ::::::::..: ......::::: :: :. ...::.::..:..
CCDS63 LSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLL
720 730 740 750 760 770
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 KKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNS
::::: :::: . .:.::::::.:::.. : : . : ..:
CCDS63 IKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYV
780 790 800 810 820 830
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 NMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEP
CCDS63 RQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
840 850
1601 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 07:05:25 2016 done: Sat Nov 5 07:05:26 2016
Total Scan time: 5.130 Total Display time: 0.760
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]