FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3463, 1601 aa 1>>>pF1KB3463 1601 - 1601 aa - 1601 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7186+/-0.000464; mu= 7.4511+/- 0.029 mean_var=205.2416+/-40.839, 0's: 0 Z-trim(116.2): 224 B-trim: 41 in 1/51 Lambda= 0.089524 statistics sampled from 26958 (27221) to 26958 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16 Scan time: 14.200 The best scores are: opt bits E(85289) NP_057424 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide ex (1601) 10569 1379.6 0 NP_001157858 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1609) 10543 1376.2 0 NP_001157860 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1504) 9767 1276.0 0 NP_001157861 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1391) 8217 1075.7 0 NP_001157859 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1509) 7039 923.6 0 NP_001157862 (OMIM: 610499) rap guanine 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:::::::::::: .::::. . 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XP_005 SRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIG 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 QSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVD ::::::::: :. .: . .:. ::::::.::::: .:::: :.::::.::::.: XP_005 QSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKAD 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 QQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLA ::: ::.:::::::::::..:..::..:.. : ::::::::::::::::::::::.:::: XP_005 QQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLA 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 DRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNI :::::.:::::::::::::::::::::::..:::.:.:::::.:::::::::.:.::::: XP_005 DRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNI 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 EPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIAL :::::::::::: :::. ..:::::...:::::::::::: :.::::::::::::::::: XP_005 EPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIAL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KB3 HCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNI ::::::::::::::::::::: ::::: ::::::.:::: .:::::.::::::::::::. 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XP_016 DYMDENEE-YFQRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVDPYPMGKPPLPRGYHTECTK 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 --LPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRL ::::.::.:::.. ::::::::::.:::::.::::::::::::::::::.::.::. : XP_016 SQLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 PEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFA :: ::::::..: :.:.: .:::..::.::.::::.: :.::::::::::::::::::: XP_016 PETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVRDCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGN :::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.::::: :::::.::...::::.: : ::: XP_016 NMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGEELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGN 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 SFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEH :::..::.::.::.:..::::::::::::::::: ::::.:::: .:::::::::::.:: XP_016 SFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 RELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLL :::::.::::::::::.: ::: :::.::::.::::.:::::::::::: ::..:: ::: XP_016 RELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 EWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIAC :::. ::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::: ::.:::::::::: XP_016 EWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIAC 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVN ::::: : ..: : :::.:: : : :::::::::::..:. ::::...::::::::.::: XP_016 AAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVN 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 GQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKS ::::::: . ::.:::::::::..:::::.::::::: : .:....:.::.:::.. ::. 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XP_016 SRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIG 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 QSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVD ::::::::: :. .: . .:. ::::::.::::: .:::: :.::::.::::.: XP_016 QSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKAD 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 QQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLA ::: ::.:::::::::::..:..::..:.. : ::::::::::::::::::::::.:::: XP_016 QQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLA 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 DRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNI :::::.:::::::::::::::::::::::..:::.:.:::::.:::::::::.:.::::: XP_016 DRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNI 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 EPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIAL :::::::::::: :::. ..:::::...:::::::::::: :.::::::::::::::::: XP_016 EPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIAL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KB3 HCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNI ::::::::::::::::::::: ::::: ::::::.:::: .:::::.::::::::::::. 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XP_016 PPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQA 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB3 EDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSM ::::: ::: ::::.:::.::.::::: ::. ::.:::.::::::::::::: : ::. 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