FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3472, 783 aa 1>>>pF1KB3472 783 - 783 aa - 783 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6244+/-0.00135; mu= 1.6126+/- 0.081 mean_var=275.1613+/-54.609, 0's: 0 Z-trim(108.5): 75 B-trim: 14 in 1/52 Lambda= 0.077318 statistics sampled from 10218 (10278) to 10218 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16 Scan time: 3.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 5128 586.4 6e-167 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 4703 539.0 1e-152 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 2676 312.9 1.2e-84 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 732 96.0 2.3e-19 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 732 96.0 2.3e-19 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 725 95.2 3.5e-19 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 725 95.2 3.5e-19 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 696 91.9 3.1e-18 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 696 92.0 3.6e-18 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 696 92.0 3.7e-18 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 696 92.0 3.7e-18 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 694 91.9 5.7e-18 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 694 91.9 5.7e-18 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 686 90.8 7.5e-18 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 661 88.0 5.1e-17 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 650 86.8 1.2e-16 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 632 84.9 6.1e-16 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 629 84.6 8.1e-16 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 618 83.3 1.7e-15 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 591 80.1 8.2e-15 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 596 80.9 9.9e-15 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 596 80.9 9.9e-15 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 566 77.5 8e-14 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 566 77.5 8.1e-14 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 566 77.5 8.1e-14 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 543 74.7 3.3e-13 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 536 73.9 5.7e-13 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 534 73.9 9.2e-13 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 526 73.1 2.1e-12 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 504 70.4 7.7e-12 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 504 70.5 9.1e-12 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 484 68.3 4.4e-11 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 479 67.7 6.3e-11 >>CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 (783 aa) initn: 5128 init1: 5128 opt: 5128 Z-score: 3110.8 bits: 586.4 E(32554): 6e-167 Smith-Waterman score: 5128; 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CCDS72 KSETR-ENGVTDDLDAPKAKKSKMKEKLNGDTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGDID 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 pF1KB3 PSEAASEE-----------SNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFP : :.. :....:. . ::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS72 EYEKKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFP 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 IQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRE ::.::: :: ::::::::::::::::::::::::.:. . . :..:.:.::::::::: CCDS72 IQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRE 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 LANQVSKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLT :::::.:::.:::.::::::::::: : .:....:::::::::::::::::.:.:.:::. CCDS72 LANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLS 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 KLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMK ::.::::::::::::.:::.:::.:. .:: ::::::::::::::::.::..::::::: CCDS72 KLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMK 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 STYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEA : ::::::.:: :::.: :::::::.:::.:: ::::::..:::: .::.::::::::.. CCDS72 SRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNV 350 360 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 pF1KB3 QELSQNSAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ :...: :::.:: ::::: :.::::::::::.::: :::::::::::::::::::::: CCDS72 TEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 SSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEI ::::.:::::::::::::::::::.:::::: .:. :: ::::::: :::.::::. .. CCDS72 SSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDL 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 pF1KB3 IKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLIN .:..: :::: : :: .:.. :. ::..::::::::.::::::::::::.: . ::::. CCDS72 VKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLIT 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 pF1KB3 SNVGFVTMILQCSIEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVT :. ::::: :. :. ..: :::::...:. . :.. : .:::..::::::::. CCDS72 SDKGFVTMTLESLEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESE 590 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 pF1KB3 EIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREG--------YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRR ..: .:::: : ::: .. ::.: .: .:. . : : : : :.:.: CCDS72 RLQAEWHDSD-WILSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGRS 650 660 670 680 690 700 750 760 770 780 pF1KB3 FRGQREGSR-GPR--GQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ : .:.::: : : :.: .: :. :::.. :.:::: CCDS72 GRQSRQGSRSGSRQDGRRRSG-NR-NRSRSGGHKRSFD 710 720 730 >>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa) initn: 737 init1: 240 opt: 732 Z-score: 461.1 bits: 96.0 E(32554): 2.3e-19 Smith-Waterman score: 732; 30.2% identity (61.7% similar) in 533 aa overlap (41-556:28-540) 20 30 40 50 60 70 pF1KB3 LESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMN : . : :.:.. : : . . :: : CCDS33 MPTGFVAPILCVLLPSPTREAATVASATGDSASERESAAPAAAPTAEAPPPSVVTRP 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 SPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKP :.. . . : :. : ..: . . . . . ... : CCDS33 EPQALPSPAIRAP-LPDLYP-FGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGE 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 pF1KB3 KKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGF--PHPE-PDCNPSEAASEESNSEIE-QEIPVEQKEG . ::. ... . ::....: ::: .: :. . ..:: . : : CCDS33 RLRKKKWDLS-----ELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 -AF--SNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIP :: .::: . .. .: . : ::: . : . ::.:... :.::.:::... .: CCDS33 FAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLP 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 LIEKLHGELQDR-KRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGG : .: . : .:: .: ::::::::::.::.. .: : .:. .:.:::.: : CCDS33 AI--VHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGP 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 QFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVA :.. .. :..: ..::::. : ...:: .: . ..::::.:.:::::: :...:.. CCDS33 QIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-Q 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 YKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHW . : :::..::: :. : ..:. .... : :.. .:. .. .. ... : CCDS33 IRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YTQIN-VGNLELSANHNILQIVDVCME 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 pF1KB3 TQRAAVIGDVIR-VYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQR ... . .... ... ....:::: :::.. ..:.. ...: :. .::: : .: CCDS33 SEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR--MRRDGWPAMCIHGDKSQPER 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 EITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGV . .:. ::.:. .:.::.::.::::. .: .::. . :.. :.:.:: :::.:. :. CCDS33 DWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 CICFYQH---KEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISH :. :. .:..: ..: CCDS33 AYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPN 520 530 540 550 560 570 >>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa) initn: 708 init1: 240 opt: 732 Z-score: 461.0 bits: 96.0 E(32554): 2.3e-19 Smith-Waterman score: 732; 30.2% identity (61.7% similar) in 533 aa overlap (41-556:28-540) 20 30 40 50 60 70 pF1KB3 LESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMN : . : :.:.. : : . . :: : CCDS46 MPTGFVAPILCVLLPSPTREAATVASATGDSASERESAAPAAAPTAEAPPPSVVTRP 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 SPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKP :.. . . : :. : ..: . . . . . ... : CCDS46 EPQALPSPAIRAP-LPDLYP-FGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGE 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 pF1KB3 KKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGF--PHPE-PDCNPSEAASEESNSEIE-QEIPVEQKEG . ::. ... . ::....: ::: .: :. . ..:: . : : CCDS46 RLRKKKWDLS-----ELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 -AF--SNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIP :: .::: . .. .: . : ::: . : . ::.:... :.::.:::... .: CCDS46 FAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLP 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 LIEKLHGELQDR-KRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGG : .: . : .:: .: ::::::::::.::.. .: : .:. .:.:::.: : CCDS46 AI--VHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGP 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 QFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVA :.. .. :..: ..::::. : ...:: .: . ..::::.:.:::::: :...:.. CCDS46 QIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-Q 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 YKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHW . : :::..::: :. : ..:. .... : :.. .:. .. .. ... : CCDS46 IRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YTQIN-VGNLELSANHNILQIVDVCME 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 pF1KB3 TQRAAVIGDVIR-VYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQR ... . .... ... ....:::: :::.. ..:.. ...: :. .::: : .: CCDS46 SEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR--MRRDGWPAMCIHGDKSQPER 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 EITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGV . .:. ::.:. .:.::.::.::::. .: .::. . :.. :.:.:: :::.:. :. CCDS46 DWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 CICFYQH---KEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISH :. :. .:..: ..: CCDS46 AYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANN 520 530 540 550 560 570 >>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 650 init1: 238 opt: 725 Z-score: 457.8 bits: 95.2 E(32554): 3.5e-19 Smith-Waterman score: 725; 32.3% identity (67.0% similar) in 452 aa overlap (121-556:30-463) 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 KTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKL : ... : : .::. ... . ::. CCDS82 MKAGRFEADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD-----ELPKF 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 pF1KB3 KNGFPHPEPDC---NPSEAASEESNSEIE---QEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGR ...: . .:: . .:. . . ..:: .. : . .::: . .. .. . CCDS82 EKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPAN--VMDVIARQ 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 GVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDR-KRGRAPQV . : :::. . . :: :... :.::.:::.:. .: : .: . : .:: .: CCDS82 NFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAI--VHINHQPFLERGDGPIC 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 LVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKD ::::::::::.::.. .. . .:. .:.:::.: : :.. .. :..: ..::::. : CCDS82 LVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLID 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 HIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHW .. :: .: . ..::::.:.:::::: :...:.. . : :::..::: :. CCDS82 FLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-QIRPDR----QTLMWSATWPKE 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 VFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQR-AAVIGDVIRVYSGHQGR : ..:. ..:. : ... :: .. .. ... :: ... .: . ...: .... CCDS82 VRQLAEDFLKD-YIHIN-IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENK 290 300 310 320 330 340 450 460 470 480 490 pF1KB3 TIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVA ::.: :::.. .::... ...: :...::: :..:. .:. :..:. .:.::.:: CCDS82 TIVFVETKRRCDELTRK--MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVA 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 ARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQH---KEEYQLVQVEQ .::::. .: .::. . :.. :.:::: :::.:. .::. :. :. .:..: . CCDS82 SRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLR 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 KAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAA .: CCDS82 EANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSL 470 480 490 500 510 520 >>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 650 init1: 238 opt: 725 Z-score: 457.8 bits: 95.2 E(32554): 3.5e-19 Smith-Waterman score: 725; 32.3% identity (67.0% similar) in 452 aa overlap (121-556:30-463) 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 KTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKL : ... : : .::. ... . ::. CCDS11 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD-----ELPKF 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 pF1KB3 KNGFPHPEPDC---NPSEAASEESNSEIE---QEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGR ...: . .:: . .:. . . ..:: .. : . .::: . .. .. . CCDS11 EKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPAN--VMDVIARQ 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 GVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDR-KRGRAPQV . : :::. . . :: :... :.::.:::.:. .: : .: . : .:: .: CCDS11 NFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAI--VHINHQPFLERGDGPIC 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 LVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKD ::::::::::.::.. .. . .:. .:.:::.: : :.. .. :..: ..::::. : CCDS11 LVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLID 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 HIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHW .. :: .: . ..::::.:.:::::: :...:.. . : :::..::: :. CCDS11 FLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-QIRPDR----QTLMWSATWPKE 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 VFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQR-AAVIGDVIRVYSGHQGR : ..:. ..:. : ... :: .. .. ... :: ... .: . ...: .... CCDS11 VRQLAEDFLKD-YIHIN-IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENK 290 300 310 320 330 340 450 460 470 480 490 pF1KB3 TIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVA ::.: :::.. .::... ...: :...::: :..:. .:. :..:. .:.::.:: CCDS11 TIVFVETKRRCDELTRK--MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVA 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 ARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQH---KEEYQLVQVEQ .::::. .: .::. . :.. :.:::: :::.:. .::. :. :. .:..: . CCDS11 SRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLR 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 KAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAA .: CCDS11 EANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSL 470 480 490 500 510 520 >>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (575 aa) initn: 693 init1: 263 opt: 696 Z-score: 440.7 bits: 91.9 E(32554): 3.1e-18 Smith-Waterman score: 708; 31.4% identity (64.2% similar) in 506 aa overlap (70-551:20-505) 40 50 60 70 80 90 pF1KB3 KTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISP-----KTKS ..: ... .:. ..::..: .: . CCDS54 MGSRNLFLTNSPESSNDCEDNPTRNRGFSKR--GDNDLDPDECMQRTGG 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 LRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETRE-KSPKLKNG : ...:. . . .. :.. ... ::.. . :.: : .::. . ..::. . CCDS54 LFGSRRPVLSGTGNGDTSQ-SRSGSGSERD-------SWKSEAE-GGESSDTQGPKV-TY 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 pF1KB3 FPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL---LKGR .: : :. . : : ... .... :. .. :. .: .. : . CCDS54 IPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNNIAKA 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 GVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR-KRGRAP : : : :.: .. . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : : .: :. . : CCDS54 GYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEP 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KB3 QVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGR . ...::::::.::. .. :: . . .. .:::: : ..... .: .:: .:::: CCDS54 ECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGR 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KB3 IKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATC . : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......: :... :::.:::: CCDS54 LMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQTLMFSATF 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KB3 PHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG :. . .: ...::.: : .: . . :: ... ....: .. ...: . CCDS54 PEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-EILRNIGD 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KB3 HQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATN . ::..: ::::.:. .. : .. :.::: :..:: .: :: :. :::::. CCDS54 E--RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATS 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 VAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQK :::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : :: : :.. . . .:.: CCDS54 VAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVK 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 AGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAAL CCDS54 VLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPV 510 520 530 540 550 560 >>CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (690 aa) initn: 693 init1: 263 opt: 696 Z-score: 439.7 bits: 92.0 E(32554): 3.6e-18 Smith-Waterman score: 713; 31.0% identity (64.1% similar) in 513 aa overlap (70-551:119-620) 40 50 60 70 80 90 pF1KB3 KTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISP-----KTKS ..: ... .:. ..::..: .: . CCDS47 KSFGNRGFSNSRFEDGDSSGFWRESSNDCEDNPTRNRGFSKR--GDNDLDPDECMQRTGG 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 pF1KB3 LRKKKEPIEKKVV---SSKTKKVTKNEEPS----EEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETRE-K : ...:. . . .:.... . .:. . .::. . . :. : . .::. . . CCDS47 LFGSRRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQ 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 SPKLKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL .::. . .: : :. . : : ... .... :. .. :. .: .. : CCDS47 GPKV-TYIPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTL 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 pF1KB3 ---LKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR . : : : :.: .. . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : : .: CCDS47 NNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASR 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 pF1KB3 -KRGRAPQVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDI :. . :. ...::::::.::. .. :: . . .. .:::: : ..... .: .: CCDS47 FKELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNI 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 pF1KB3 LVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQT : .::::. : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......: :... :: CCDS47 LCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQT 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 pF1KB3 LLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGD :.:::: :. . .: ...::.: : .: . . :: ... ....: .. . CCDS47 LMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-E 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 VIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSF ..: . . ::..: ::::.:. .. : .. :.::: :..:: .: :: :. CCDS47 ILRNIGDE--RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKC 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 GVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQ :::::.:::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : :: : :.. . . . CCDS47 PVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNH 560 570 580 590 600 610 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 LVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAV :.: CCDS47 LAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSS 620 630 640 650 660 670 >>CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (704 aa) initn: 633 init1: 263 opt: 696 Z-score: 439.6 bits: 92.0 E(32554): 3.7e-18 Smith-Waterman score: 711; 33.8% identity (64.7% similar) in 450 aa overlap (121-551:195-634) 100 110 120 130 140 pF1KB3 KTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETRE-KSPK .:: : . .. :.: : .::. . ..:: CCDS54 RRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAE-GGESSDTQGPK 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 LKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL--- . .: : :. . : : ... .... :. .. :. .: .. : CCDS54 VTY-IPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNN 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 pF1KB3 LKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR-KR . : : : :.: .. . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : : .: :. CCDS54 IAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKE 290 300 310 320 330 340 260 270 280 290 300 310 pF1KB3 GRAPQVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVG . :. ...::::::.::. .. :: . . .. .:::: : ..... .: .:: . CCDS54 LQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCA 350 360 370 380 390 400 320 330 340 350 360 370 pF1KB3 TPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLF ::::. : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......: :... :::.: CCDS54 TPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQTLMF 410 420 430 440 450 460 380 390 400 410 420 430 pF1KB3 SATCPHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIR ::: :. . .: ...::.: : .: . . :: ... ....: .. ...: CCDS54 SATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-EILR 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 pF1KB3 VYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVL : . ::..: ::::.:. .. : .. :.::: :..:: .: :: :. :: CCDS54 NI-GDE-RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVL 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 VATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQ :::.:::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : :: : :.. . . .:.: CCDS54 VATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQ 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 VEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEAL CCDS54 PLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQA 640 650 660 670 680 690 783 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 07:06:13 2016 done: Sat Nov 5 07:06:14 2016 Total Scan time: 3.720 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]