FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3475, 492 aa 1>>>pF1KB3475 492 - 492 aa - 492 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0399+/-0.000443; mu= 19.5021+/- 0.027 mean_var=69.5925+/-15.097, 0's: 0 Z-trim(110.3): 202 B-trim: 1002 in 1/47 Lambda= 0.153742 statistics sampled from 18453 (18675) to 18453 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16 Scan time: 7.250 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carr ( 492) 3206 720.8 2.2e-207 NP_001033 (OMIM: 138190) solute carrier family 2, ( 509) 2133 482.8 1e-135 NP_008862 (OMIM: 138170) solute carrier family 2, ( 496) 2121 480.1 6.2e-135 NP_703150 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, ( 520) 2064 467.5 4.1e-131 NP_001273162 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 520) 2064 467.5 4.1e-131 XP_016874334 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 2055 465.5 1.6e-130 XP_016874332 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 2055 465.5 1.6e-130 XP_016874331 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 2055 465.5 1.6e-130 XP_016874330 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 2055 465.5 1.6e-130 XP_016874333 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 2055 465.5 1.6e-130 NP_001273164 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_016874336 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_005253374 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_016874335 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_011518864 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_011518865 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 XP_005253372 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 NP_001273163 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 2051 464.6 2.9e-130 NP_001273166 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 535) 2051 464.6 3.1e-130 XP_011511389 (OMIM: 125853,138160,227810) PREDICTE ( 509) 1736 394.7 3.2e-109 NP_000331 (OMIM: 125853,138160,227810) solute carr ( 524) 1736 394.7 3.3e-109 XP_011518866 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 411) 1713 389.5 9.4e-108 XP_011518867 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 411) 1713 389.5 9.4e-108 NP_001273165 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 411) 1713 389.5 9.4e-108 NP_001265587 (OMIM: 125853,138160,227810) solute c ( 405) 1637 372.7 1.1e-102 XP_011511391 (OMIM: 125853,138160,227810) PREDICTE ( 351) 1452 331.6 2.2e-90 NP_001265588 (OMIM: 125853,138160,227810) solute c ( 351) 1452 331.6 2.2e-90 NP_001315548 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857630 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857624 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_005263548 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857627 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857626 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857623 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857622 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857629 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 NP_003030 (OMIM: 138230) solute carrier family 2, ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 XP_016857625 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1340 306.9 8.8e-83 NP_997303 (OMIM: 610371) solute carrier family 2, ( 512) 1296 297.1 7.7e-80 XP_011512162 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 537) 1258 288.7 2.8e-77 NP_001001290 (OMIM: 606142,612076) solute carrier ( 511) 1256 288.3 3.6e-77 NP_064425 (OMIM: 606142,612076) solute carrier fam ( 540) 1256 288.3 3.8e-77 XP_011512161 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 538) 1253 287.6 6e-77 XP_006714031 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 563) 1253 287.6 6.2e-77 XP_016863946 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 609) 1253 287.6 6.6e-77 NP_001315549 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 457) 1232 282.9 1.3e-75 XP_011539126 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 517) 1183 272.1 2.7e-72 XP_016863947 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 487) 1171 269.4 1.7e-71 XP_011512163 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 486) 1157 266.3 1.4e-70 XP_011512160 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 586) 1156 266.1 1.9e-70 >>NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carrier (492 aa) initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206 Z-score: 3844.1 bits: 720.8 E(85289): 2.2e-207 Smith-Waterman score: 3206; 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NP_008 MGTQKVTPALIFAITVATIGSFQFGYNTGVINAPEKIIKEFINKTLTDKGNAPPSEVL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 LTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLMMNLLAFVSAVLMGFSKLGKSFE ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::: ... .::. :..:: : NP_008 LTSLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNLLAVTGGCFMGLCKVAKSVE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 MLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGTLHQLGIVVGILIAQVFGLDSIM ::::::..::..::: :::::::.::.::::::::.:::.:::::::::.::.:::. :. NP_008 MLILGRLVIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVVGILVAQIFGLEFIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 GNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRAKSVLKKLRGTADVTHD :...::::::.. ..::.:: .:::::::::::::::.::. ::..:..: :: ::..: NP_008 GSEELWPLLLGFTILPAILQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLWGTQDVSQD 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 LQEMKEESRQMMREKKVTILELFRSPAYRQPILIAVVLQLSQQLSGINAVFYYSTSIFEK .::::.:: .: .::.::.::::: .:::::.:..:::::::::::::::::::.::. NP_008 IQEMKDESARMSQEKQVTVLELFRVSSYRQPIIISIVLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKD 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 AGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHLIGLAGMAGCAILMTIALALLEQ ::::.:.:::::.:.::: :::::::.::::::::::.:::.::: :. :::..: : .. NP_008 AGVQEPIYATIGAGVVNTIFTVVSLFLVERAGRRTLHMIGLGGMAFCSTLMTVSLLLKDN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 LPWMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAIAVAGFSNWTSNFIVGM ::.. : ::. ::::::.::::::::::::::::::::::.:::: :::::::.::. NP_008 YNGMSFVCIGAILVFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAMAVAGCSNWTSNFLVGL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 CFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVLFFIFTYFKVPETKGRTFDEIASGFRQGGASQSDKTPE : . . : ::::::: .:. :. ::.::::::.::::..:. .: .: : .:.. . NP_008 LFPSAAHYLGAYVFIIFTGFLITFLAFTFFKVPETRGRTFEDITRAF-EGQAHGADRSGK 420 430 440 450 460 470 490 pF1KB3 ELFHPLGADSQV . NP_008 DGVMEMNSIEPAKETTTNV 480 490 >>NP_703150 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, faci (520 aa) initn: 2016 init1: 2016 opt: 2064 Z-score: 2474.8 bits: 467.5 E(85289): 4.1e-131 Smith-Waterman score: 2064; 63.6% identity (85.9% similar) in 481 aa overlap (1-481:23-502) 10 20 30 pF1KB3 MEPSSKKLTGRLMLAVGGAVLGSLQFGYNTGVINAPQK :.: . .: :..:. :..::.::::::::::::. NP_703 MEFHNGGHVSGIGGFLVSLTSRMKPHTLAVTPALIFAITVATIGSFQFGYNTGVINAPET 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB3 VIEEFYNQTWVHRYGESILPTTLTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLM .:.:: :.: . . . . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::. NP_703 IIKEFINKTLTDKANAPPSEVLLTNLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 MNLLAFVSAVLMGFSKLGKSFEMLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGT .:::: ... :::. :...: :::::::..::..::: :::::::.::.::::::::.:: NP_703 VNLLAATGGCLMGLCKIAESVEMLILGRLVIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGT 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 LHQLGIVVGILIAQVFGLDSIMGNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINR :.:::::.:::.::.:::. :.:...:::.::.. ..::.:: .:: :::::::::::: NP_703 LNQLGIVIGILVAQIFGLELILGSEELWPVLLGFTILPAILQSAALPCCPESPRFLLINR 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 NEENRAKSVLKKLRGTADVTHDLQEMKEESRQMMREKKVTILELFRSPAYRQPILIAVVL ..:. : .:..: :: ::..:.::::.:: .: .::.::.::::: .:::::.:..:: NP_703 KKEENATRILQRLWGTQDVSQDIQEMKDESARMSQEKQVTVLELFRVSSYRQPIIISIVL 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 QLSQQLSGINAVFYYSTSIFEKAGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHL :::::::::::::::::.::. ::::::.::::..:.::: ::..:::.::::::::::. 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NP_703 TFEDITRAF-EGQAHGADRSGKDGVMGMNSIEPAKETTTNV 490 500 510 520 >>NP_001273162 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, f (520 aa) initn: 2016 init1: 2016 opt: 2064 Z-score: 2474.8 bits: 467.5 E(85289): 4.1e-131 Smith-Waterman score: 2064; 63.6% identity (85.9% similar) in 481 aa overlap (1-481:23-502) 10 20 30 pF1KB3 MEPSSKKLTGRLMLAVGGAVLGSLQFGYNTGVINAPQK :.: . .: :..:. :..::.::::::::::::. NP_001 MEFHNGGHVSGIGGFLVSLTSRMKPHTLAVTPALIFAITVATIGSFQFGYNTGVINAPET 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB3 VIEEFYNQTWVHRYGESILPTTLTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLM .:.:: :.: . . . . ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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XP_016 RTFEDITRAF-EGQAHGADRSGKDGVMGMNSIEPAKETTTNV 490 500 510 520 >>XP_016874333 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carrier (521 aa) initn: 2016 init1: 2016 opt: 2055 Z-score: 2464.0 bits: 465.5 E(85289): 1.6e-130 Smith-Waterman score: 2055; 64.2% identity (86.3% similar) in 475 aa overlap (7-481:30-503) 10 20 30 pF1KB3 MEPSSKKLTGRLMLAVGGAVLGSLQFGYNTGVINAPQ :.: :..:. :..::.::::::::::::. 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